MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 plasmid pDEIPE02

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019790	GC	3	6	947	952	0 %	0 %	50 %	50 %	429221854
2	NC_019790	CG	4	8	3340	3347	0 %	0 %	50 %	50 %	429221856
3	NC_019790	CG	3	6	3773	3778	0 %	0 %	50 %	50 %	429221856
4	NC_019790	CG	3	6	4657	4662	0 %	0 %	50 %	50 %	429221857
5	NC_019790	CG	3	6	4664	4669	0 %	0 %	50 %	50 %	429221857
6	NC_019790	CG	3	6	5729	5734	0 %	0 %	50 %	50 %	429221858
7	NC_019790	GC	3	6	6203	6208	0 %	0 %	50 %	50 %	429221858
8	NC_019790	GC	3	6	7146	7151	0 %	0 %	50 %	50 %	429221859
9	NC_019790	CG	3	6	7275	7280	0 %	0 %	50 %	50 %	429221859
10	NC_019790	GC	3	6	7474	7479	0 %	0 %	50 %	50 %	429221859
11	NC_019790	GC	3	6	8206	8211	0 %	0 %	50 %	50 %	429221860
12	NC_019790	GC	3	6	8406	8411	0 %	0 %	50 %	50 %	429221860
13	NC_019790	CG	3	6	8850	8855	0 %	0 %	50 %	50 %	429221861
14	NC_019790	CG	3	6	8905	8910	0 %	0 %	50 %	50 %	429221861
15	NC_019790	GC	3	6	9851	9856	0 %	0 %	50 %	50 %	429221862
16	NC_019790	CG	3	6	10428	10433	0 %	0 %	50 %	50 %	429221862
17	NC_019790	GC	3	6	10643	10648	0 %	0 %	50 %	50 %	429221863
18	NC_019790	GC	3	6	11002	11007	0 %	0 %	50 %	50 %	429221863
19	NC_019790	GC	3	6	11216	11221	0 %	0 %	50 %	50 %	429221863
20	NC_019790	GC	3	6	11448	11453	0 %	0 %	50 %	50 %	429221863
21	NC_019790	CG	3	6	11783	11788	0 %	0 %	50 %	50 %	429221864
22	NC_019790	CG	3	6	11924	11929	0 %	0 %	50 %	50 %	429221864
23	NC_019790	CA	3	6	11998	12003	50 %	0 %	0 %	50 %	429221864
24	NC_019790	CG	3	6	12029	12034	0 %	0 %	50 %	50 %	429221864
25	NC_019790	TC	3	6	12223	12228	0 %	50 %	0 %	50 %	429221864
26	NC_019790	CG	3	6	12254	12259	0 %	0 %	50 %	50 %	429221864
27	NC_019790	GC	3	6	12412	12417	0 %	0 %	50 %	50 %	429221864
28	NC_019790	GC	3	6	12844	12849	0 %	0 %	50 %	50 %	429221864
29	NC_019790	CG	3	6	13100	13105	0 %	0 %	50 %	50 %	429221865
30	NC_019790	CG	3	6	13198	13203	0 %	0 %	50 %	50 %	429221865
31	NC_019790	CG	3	6	13431	13436	0 %	0 %	50 %	50 %	429221865
32	NC_019790	GC	3	6	16541	16546	0 %	0 %	50 %	50 %	429221866
33	NC_019790	GC	3	6	16592	16597	0 %	0 %	50 %	50 %	429221866
34	NC_019790	CG	3	6	16809	16814	0 %	0 %	50 %	50 %	429221866
35	NC_019790	CT	3	6	17095	17100	0 %	50 %	0 %	50 %	429221867
36	NC_019790	CT	3	6	17901	17906	0 %	50 %	0 %	50 %	429221868
37	NC_019790	GC	3	6	17978	17983	0 %	0 %	50 %	50 %	429221868
38	NC_019790	CG	4	8	19259	19266	0 %	0 %	50 %	50 %	429221869
39	NC_019790	CG	3	6	19272	19277	0 %	0 %	50 %	50 %	429221869
40	NC_019790	CG	3	6	19285	19290	0 %	0 %	50 %	50 %	429221869
41	NC_019790	TG	3	6	19353	19358	0 %	50 %	50 %	0 %	429221869
42	NC_019790	CT	3	6	21732	21737	0 %	50 %	0 %	50 %	429221870
43	NC_019790	TC	4	8	21776	21783	0 %	50 %	0 %	50 %	429221870
44	NC_019790	GT	3	6	22199	22204	0 %	50 %	50 %	0 %	429221870
45	NC_019790	GC	3	6	22393	22398	0 %	0 %	50 %	50 %	429221870
46	NC_019790	GC	3	6	27077	27082	0 %	0 %	50 %	50 %	429221873
47	NC_019790	GC	3	6	28479	28484	0 %	0 %	50 %	50 %	429221874
48	NC_019790	CG	3	6	28878	28883	0 %	0 %	50 %	50 %	429221875
49	NC_019790	CG	3	6	29314	29319	0 %	0 %	50 %	50 %	429221875
50	NC_019790	CG	3	6	29437	29442	0 %	0 %	50 %	50 %	429221875
51	NC_019790	CG	3	6	30350	30355	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
52	NC_019790	CG	4	8	30662	30669	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
53	NC_019790	GC	3	6	30787	30792	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
54	NC_019790	GC	3	6	30875	30880	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
55	NC_019790	CG	3	6	30961	30966	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
56	NC_019790	GC	3	6	31086	31091	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
57	NC_019790	GC	3	6	31535	31540	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
58	NC_019790	GC	3	6	31654	31659	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
59	NC_019790	CG	3	6	31795	31800	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
60	NC_019790	CG	3	6	31976	31981	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
61	NC_019790	GC	3	6	31997	32002	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
62	NC_019790	CG	3	6	32501	32506	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
63	NC_019790	CG	3	6	32564	32569	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
64	NC_019790	GC	3	6	34383	34388	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
65	NC_019790	CG	3	6	34735	34740	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
66	NC_019790	CG	4	8	34797	34804	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
67	NC_019790	CG	3	6	34967	34972	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
68	NC_019790	GC	3	6	35031	35036	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
69	NC_019790	GC	3	6	35147	35152	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
70	NC_019790	GC	3	6	35283	35288	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
71	NC_019790	GC	3	6	35335	35340	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
72	NC_019790	CG	3	6	35367	35372	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
73	NC_019790	GC	3	6	35401	35406	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
74	NC_019790	CG	3	6	35559	35564	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
75	NC_019790	CG	3	6	35760	35765	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
76	NC_019790	GC	3	6	35815	35820	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
77	NC_019790	GC	3	6	36100	36105	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
78	NC_019790	GC	3	6	36129	36134	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
79	NC_019790	CG	3	6	36651	36656	0 %	0 %	50 %	50 %	429221879
80	NC_019790	GC	4	8	36789	36796	0 %	0 %	50 %	50 %	429221879
81	NC_019790	CT	3	6	37643	37648	0 %	50 %	0 %	50 %	429221880
82	NC_019790	AC	3	6	37833	37838	50 %	0 %	0 %	50 %	429221880
83	NC_019790	GC	4	8	39754	39761	0 %	0 %	50 %	50 %	429221883
84	NC_019790	GC	3	6	40331	40336	0 %	0 %	50 %	50 %	429221883
85	NC_019790	CG	4	8	40352	40359	0 %	0 %	50 %	50 %	429221883
86	NC_019790	GC	3	6	40948	40953	0 %	0 %	50 %	50 %	429221884
87	NC_019790	CG	3	6	41124	41129	0 %	0 %	50 %	50 %	429221884
88	NC_019790	CG	3	6	41162	41167	0 %	0 %	50 %	50 %	429221884
89	NC_019790	GC	3	6	41976	41981	0 %	0 %	50 %	50 %	429221885
90	NC_019790	CG	3	6	43118	43123	0 %	0 %	50 %	50 %	429221887
91	NC_019790	AG	3	6	43456	43461	50 %	0 %	50 %	0 %	429221888
92	NC_019790	CT	3	6	46701	46706	0 %	50 %	0 %	50 %	429221890
93	NC_019790	GC	4	8	49511	49518	0 %	0 %	50 %	50 %	429221892
94	NC_019790	GC	3	6	51052	51057	0 %	0 %	50 %	50 %	429221895
95	NC_019790	GC	3	6	52422	52427	0 %	0 %	50 %	50 %	429221897
96	NC_019790	GC	3	6	54109	54114	0 %	0 %	50 %	50 %	429221900
97	NC_019790	GC	3	6	54512	54517	0 %	0 %	50 %	50 %	429221901
98	NC_019790	GC	3	6	56575	56580	0 %	0 %	50 %	50 %	429221904
99	NC_019790	AC	3	6	57367	57372	50 %	0 %	0 %	50 %	429221904
100	NC_019790	CG	3	6	58231	58236	0 %	0 %	50 %	50 %	429221906
101	NC_019790	CG	3	6	58744	58749	0 %	0 %	50 %	50 %	429221906
102	NC_019790	CG	4	8	58971	58978	0 %	0 %	50 %	50 %	429221907
103	NC_019790	CG	4	8	59293	59300	0 %	0 %	50 %	50 %	429221907
104	NC_019790	CG	3	6	59303	59308	0 %	0 %	50 %	50 %	429221907
105	NC_019790	CG	3	6	60270	60275	0 %	0 %	50 %	50 %	429221908
106	NC_019790	GC	3	6	60677	60682	0 %	0 %	50 %	50 %	429221908
107	NC_019790	AG	3	6	61623	61628	50 %	0 %	50 %	0 %	429221908
108	NC_019790	GC	3	6	64504	64509	0 %	0 %	50 %	50 %	429221911
109	NC_019790	CG	3	6	66897	66902	0 %	0 %	50 %	50 %	429221914
110	NC_019790	GC	3	6	66933	66938	0 %	0 %	50 %	50 %	429221914
111	NC_019790	GC	3	6	67052	67057	0 %	0 %	50 %	50 %	429221915
112	NC_019790	GC	4	8	67625	67632	0 %	0 %	50 %	50 %	429221915
113	NC_019790	GC	3	6	67792	67797	0 %	0 %	50 %	50 %	429221915
114	NC_019790	CG	3	6	67966	67971	0 %	0 %	50 %	50 %	429221915
115	NC_019790	GA	3	6	68225	68230	50 %	0 %	50 %	0 %	429221915
116	NC_019790	TG	3	6	69567	69572	0 %	50 %	50 %	0 %	429221916
117	NC_019790	GC	3	6	69710	69715	0 %	0 %	50 %	50 %	429221916
118	NC_019790	CG	4	8	69943	69950	0 %	0 %	50 %	50 %	429221916
119	NC_019790	GA	3	6	70399	70404	50 %	0 %	50 %	0 %	429221916
120	NC_019790	GC	3	6	70988	70993	0 %	0 %	50 %	50 %	429221917
121	NC_019790	CG	3	6	71697	71702	0 %	0 %	50 %	50 %	429221917
122	NC_019790	CG	3	6	71751	71756	0 %	0 %	50 %	50 %	429221917
123	NC_019790	CA	4	8	71788	71795	50 %	0 %	0 %	50 %	429221917
124	NC_019790	CG	3	6	72522	72527	0 %	0 %	50 %	50 %	429221918
125	NC_019790	GC	3	6	72946	72951	0 %	0 %	50 %	50 %	429221918
126	NC_019790	GC	4	8	73678	73685	0 %	0 %	50 %	50 %	429221918
127	NC_019790	TC	3	6	74944	74949	0 %	50 %	0 %	50 %	429221920

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.