MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Dactylococcopsis salina PCC 8305 chromosome

Total Repeats: 1744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019780	GCTAAC	2	12	272	283	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778396
2	NC_019780	TTTATC	2	12	1015	1026	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428778396
3	NC_019780	TCAACA	2	12	3825	3836	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428778400
4	NC_019780	GGTCGC	2	12	3964	3975	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	428778400
5	NC_019780	CATAAA	2	12	6534	6545	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019780	CTGATC	2	12	11446	11457	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428778406
7	NC_019780	AGTTAA	2	12	19973	19984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428778415
8	NC_019780	GAACAA	2	12	21802	21813	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428778416
9	NC_019780	AGCATG	2	12	23209	23220	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428778417
10	NC_019780	TCATGC	2	12	23709	23720	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428778418
11	NC_019780	TTCTCC	2	12	27157	27168	0 %	50 %	0 %	50 %	428778421
12	NC_019780	AGAAAA	2	12	28529	28540	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428778423
13	NC_019780	CAAGAA	2	12	35369	35380	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428778427
14	NC_019780	GTTTCG	2	12	41967	41978	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428778437
15	NC_019780	CCAAGT	2	12	42142	42153	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778437
16	NC_019780	GCACCA	2	12	48355	48366	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428778441
17	NC_019780	CCTTCT	2	12	48865	48876	0 %	50 %	0 %	50 %	428778441
18	NC_019780	CGGCGA	2	12	49553	49564	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	428778442
19	NC_019780	ATCAAG	2	12	50706	50717	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428778444
20	NC_019780	GGCTTA	2	12	52806	52817	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428778445
21	NC_019780	CGACAA	2	12	53646	53657	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428778445
22	NC_019780	GTTCCC	2	12	57382	57393	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428778448
23	NC_019780	GAAAAA	2	12	57903	57914	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428778448
24	NC_019780	AATTTT	2	12	59082	59093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019780	ACTTGC	2	12	62625	62636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428778454
26	NC_019780	TCCGTT	2	12	62821	62832	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428778454
27	NC_019780	GAAGTG	2	12	65192	65203	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428778455
28	NC_019780	GCGATG	2	12	65378	65389	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428778455
29	NC_019780	GCGATC	2	12	65394	65405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428778455
30	NC_019780	ATACTC	2	12	68129	68140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778458
31	NC_019780	GTTAAA	2	12	70239	70250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019780	CACTTC	2	12	71296	71307	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428778461
33	NC_019780	GGAAAA	2	12	82693	82704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778470
34	NC_019780	GAGCAA	2	12	84640	84651	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428778472
35	NC_019780	TGAAAT	2	12	88508	88519	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428778474
36	NC_019780	GTTCCA	2	12	93867	93878	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428778483
37	NC_019780	TTGGGT	2	12	96160	96171	0 %	50 %	50 %	0 %	428778485
38	NC_019780	GCGATC	2	12	96754	96765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428778485
39	NC_019780	GAGTCA	2	12	98526	98537	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428778486
40	NC_019780	GCGATC	2	12	101662	101673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019780	GTCTCT	2	12	105046	105057	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428778489
42	NC_019780	GGGTTT	2	12	105968	105979	0 %	50 %	50 %	0 %	428778490
43	NC_019780	ACGGTA	2	12	108360	108371	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428778495
44	NC_019780	CTAATT	2	12	112152	112163	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428778497
45	NC_019780	CGATCG	2	12	113316	113327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428778497
46	NC_019780	AGCTAA	2	12	113377	113388	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428778497
47	NC_019780	TGGCTT	2	12	115208	115219	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428778501
48	NC_019780	TTTAAC	2	12	116440	116451	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428778501
49	NC_019780	TTTTCA	2	12	116477	116488	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428778501
50	NC_019780	TTTATT	2	12	121257	121268	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019780	ATCAGG	2	12	123149	123160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428778507
52	NC_019780	AATTGG	2	12	125645	125656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778509
53	NC_019780	TAACTC	2	12	127130	127141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778511
54	NC_019780	TCATCT	2	12	131419	131430	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428778514
55	NC_019780	TAAAAC	2	12	133637	133648	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019780	ACCTGA	2	12	137756	137767	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019780	ACAAGT	2	12	139368	139379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428778523
58	NC_019780	TTCGCC	2	12	142263	142274	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019780	CATTGT	2	12	143462	143473	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428778526
60	NC_019780	AAATAG	2	12	147550	147561	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428778530
61	NC_019780	AAAAAT	2	12	153967	153978	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	428778534
62	NC_019780	TTAGAA	2	12	155949	155960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428778535
63	NC_019780	TCTCCC	2	12	157706	157717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428778536
64	NC_019780	GAATCC	2	12	160919	160930	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778540
65	NC_019780	TCGGGT	2	12	161536	161547	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428778541
66	NC_019780	GTTAAA	2	12	163507	163518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428778544
67	NC_019780	TCACCA	2	12	164364	164375	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428778545
68	NC_019780	CATTCC	2	12	164665	164676	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428778545
69	NC_019780	TAACGA	2	12	164979	164990	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_019780	TGACCA	2	12	167538	167549	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778547
71	NC_019780	CACCGA	2	12	168767	168778	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428778548
72	NC_019780	TGATCC	2	12	169903	169914	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428778550
73	NC_019780	CGCGAT	2	12	170993	171004	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428778551
74	NC_019780	ACCATT	2	12	174183	174194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778555
75	NC_019780	CCACTC	2	12	176548	176559	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428778558
76	NC_019780	AAAATG	2	12	178161	178172	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428778562
77	NC_019780	CGGATT	2	12	178506	178517	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428778562
78	NC_019780	CGCGCT	2	12	178686	178697	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	428778562
79	NC_019780	CCACCG	2	12	181735	181746	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428778564
80	NC_019780	GCTGGT	4	24	182925	182948	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428778565
81	NC_019780	TCGGGT	2	12	184269	184280	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428778567
82	NC_019780	GCCAAT	2	12	184363	184374	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778567
83	NC_019780	TCAAAA	2	12	185039	185050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428778567
84	NC_019780	CAATTA	2	12	187687	187698	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428778572
85	NC_019780	TGTTTC	2	12	191060	191071	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428778576
86	NC_019780	GATCAG	2	12	193255	193266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428778579
87	NC_019780	ACGAAG	2	12	193807	193818	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428778580
88	NC_019780	TAACTC	2	12	197637	197648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778582
89	NC_019780	CTAAAA	2	12	199531	199542	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428778583
90	NC_019780	ACCATT	2	12	200496	200507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778585
91	NC_019780	TTAAAA	2	12	204102	204113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778589
92	NC_019780	ACAAGC	2	12	205201	205212	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428778590
93	NC_019780	ACGCCA	2	12	205479	205490	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428778590
94	NC_019780	CACCAA	2	12	210086	210097	50 %	0 %	0 %	50 %	428778593
95	NC_019780	TGATGG	2	12	211541	211552	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428778593
96	NC_019780	GAATAA	2	12	213859	213870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428778594
97	NC_019780	GAATAA	2	12	214229	214240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019780	GGTTTC	2	12	215003	215014	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_019780	AGGAAG	2	12	215296	215307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019780	CTGTTA	2	12	215682	215693	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019780	CTGTTG	2	12	218999	219010	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428778597
102	NC_019780	AGTTGT	2	12	219779	219790	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428778598
103	NC_019780	CGGGAA	2	12	229415	229426	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428778603
104	NC_019780	CGCTAA	2	12	233352	233363	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778609
105	NC_019780	TGTTCT	2	12	234565	234576	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428778609
106	NC_019780	ATAGTA	2	12	238608	238619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428778614
107	NC_019780	AAATGG	2	12	238687	238698	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428778614
108	NC_019780	GAAACC	2	12	238891	238902	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428778614
109	NC_019780	ATGTGG	2	12	240258	240269	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428778614
110	NC_019780	CAAGAA	2	12	243932	243943	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428778616
111	NC_019780	CTACGA	2	12	244566	244577	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019780	TGAGTT	2	12	246109	246120	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428778617
113	NC_019780	GCTGTC	2	12	246654	246665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778617
114	NC_019780	GAAACG	2	12	253265	253276	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428778627
115	NC_019780	TGTAAA	2	12	256395	256406	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019780	CAAGTC	2	12	272040	272051	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778645
117	NC_019780	ATTGAT	2	12	277006	277017	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428778650
118	NC_019780	CTTTAT	2	12	280336	280347	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428778653
119	NC_019780	CTTCCT	2	12	280574	280585	0 %	50 %	0 %	50 %	428778653
120	NC_019780	CGACAA	2	12	285870	285881	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428778656
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122	NC_019780	TATCCC	2	12	299890	299901	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019780	ACCATT	2	12	300199	300210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778677
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125	NC_019780	TATTTT	2	12	301796	301807	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019780	TTCAAT	2	12	302567	302578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428778679
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218	NC_019780	GAGGAA	2	12	494525	494536	50 %	0 %	50 %	0 %	428778833
219	NC_019780	CGATCG	2	12	495124	495135	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428778834
220	NC_019780	ATCTAA	2	12	496203	496214	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428778836
221	NC_019780	ATCAGT	2	12	497524	497535	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428778837
222	NC_019780	GAAAAA	2	12	498636	498647	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428778838
223	NC_019780	TGATTG	2	12	499105	499116	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428778838
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227	NC_019780	CAGCAA	2	12	504991	505002	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428778843
228	NC_019780	CGATCG	2	12	506335	506346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
229	NC_019780	TATGGT	2	12	507022	507033	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428778846
230	NC_019780	AATGGA	2	12	507194	507205	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428778846
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232	NC_019780	TTGGAA	2	12	507583	507594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
233	NC_019780	AATGGA	2	12	508435	508446	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428778847
234	NC_019780	TTGGAA	2	12	508611	508622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778847
235	NC_019780	TTGGAA	2	12	508836	508847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
236	NC_019780	GGTAAC	2	12	509512	509523	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
237	NC_019780	TGCAAT	2	12	509739	509750	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428778848
238	NC_019780	ATCGCA	2	12	509838	509849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778848
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240	NC_019780	ACCTGA	2	12	519982	519993	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_019780	TGGCAC	2	12	524236	524247	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428778860
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256	NC_019780	GTAATT	2	12	577643	577654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_019780	GGAATG	2	12	603325	603336	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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338	NC_019780	CCAATA	2	12	773635	773646	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428779091
339	NC_019780	TAAAAT	2	12	773707	773718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428779092
340	NC_019780	GATCAA	2	12	777873	777884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428779102
341	NC_019780	AAAACC	2	12	778171	778182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428779102
342	NC_019780	AAAGAG	2	12	780674	780685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428779104
343	NC_019780	ACAGCA	2	12	782353	782364	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428779104
344	NC_019780	ACAGCA	2	12	782596	782607	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428779104
345	NC_019780	TAGAAT	2	12	783680	783691	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428779104
346	NC_019780	TGAAAA	2	12	785342	785353	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428779106
347	NC_019780	TAAAGA	2	12	786520	786531	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
348	NC_019780	CAATTG	2	12	789890	789901	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
349	NC_019780	TGCTTC	2	12	790365	790376	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428779108
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462	NC_019780	TGTTGC	2	12	1012106	1012117	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428779301
463	NC_019780	ATTAAC	2	12	1012696	1012707	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428779302
464	NC_019780	CGATCG	2	12	1020396	1020407	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
465	NC_019780	GGCTTA	2	12	1023504	1023515	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428779307
466	NC_019780	CGACAA	2	12	1024344	1024355	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428779307
467	NC_019780	CCATTG	2	12	1031227	1031238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428779314
468	NC_019780	CAGTTT	2	12	1035458	1035469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428779319
469	NC_019780	CGATCG	2	12	1039886	1039897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
470	NC_019780	CCATTG	2	12	1041346	1041357	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428779327
471	NC_019780	CAACCT	2	12	1041850	1041861	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
472	NC_019780	ATAGGA	2	12	1044869	1044880	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428779331
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474	NC_019780	AAGTGC	2	12	1055899	1055910	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428779336
475	NC_019780	AAGTGC	2	12	1057252	1057263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428779336
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480	NC_019780	GTTTCG	2	12	1083479	1083490	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428779356
481	NC_019780	TCGCAA	2	12	1086417	1086428	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428779357
482	NC_019780	AATAAC	2	12	1087554	1087565	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428779358
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487	NC_019780	AGGAGA	2	12	1103821	1103832	50 %	0 %	50 %	0 %	428779372
488	NC_019780	CCTGAT	2	12	1105729	1105740	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428779375
489	NC_019780	CAGTAA	2	12	1106127	1106138	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428779375
490	NC_019780	TAAGTC	2	12	1108429	1108440	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428779378
491	NC_019780	CTTGCG	2	12	1109454	1109465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428779378
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494	NC_019780	CAACAC	2	12	1114449	1114460	50 %	0 %	0 %	50 %	428779386
495	NC_019780	CTGATC	2	12	1118890	1118901	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428779387
496	NC_019780	TCAGAA	2	12	1120508	1120519	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428779390
497	NC_019780	TCAGGT	2	12	1123438	1123449	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
498	NC_019780	ATGTTA	2	12	1125375	1125386	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428779394
499	NC_019780	TTAGAA	2	12	1125816	1125827	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428779394
500	NC_019780	GAGAGG	2	12	1126971	1126982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428779396

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