MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Dactylococcopsis salina PCC 8305 chromosome

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019780	CATAAA	2	12	6534	6545	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019780	AATTTT	2	12	59082	59093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019780	GTTAAA	2	12	70239	70250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019780	GCGATC	2	12	101662	101673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019780	TTTATT	2	12	121257	121268	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019780	TAAAAC	2	12	133637	133648	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019780	ACCTGA	2	12	137756	137767	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019780	TTCGCC	2	12	142263	142274	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019780	TAACGA	2	12	164979	164990	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019780	GAATAA	2	12	214229	214240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019780	GGTTTC	2	12	215003	215014	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019780	AGGAAG	2	12	215296	215307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019780	CTGTTA	2	12	215682	215693	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019780	CTACGA	2	12	244566	244577	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019780	TGTAAA	2	12	256395	256406	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019780	TATCCC	2	12	299890	299901	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019780	ACCTGA	2	12	301589	301600	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019780	TATTTT	2	12	301796	301807	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019780	TTATGG	2	12	342472	342483	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019780	TCAGGT	2	12	364940	364951	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019780	GATAAA	2	12	365233	365244	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019780	CTTTTT	2	12	365526	365537	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019780	CTTGTT	2	12	365686	365697	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019780	TCCTTA	2	12	377205	377216	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019780	CAGCTT	2	12	413274	413285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019780	CGTCAA	2	12	455005	455016	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019780	CGATCG	2	12	506335	506346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019780	TTGGAA	2	12	507583	507594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019780	TTGGAA	2	12	508836	508847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019780	GGTAAC	2	12	509512	509523	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019780	TGGGGA	2	12	515953	515964	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019780	ACCTGA	2	12	519982	519993	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019780	ACTAAT	2	12	530983	530994	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019780	TATTGA	2	12	553624	553635	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019780	TCCTTA	2	12	573416	573427	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019780	TTGGGT	2	12	573899	573910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019780	GTAATT	2	12	577643	577654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019780	GGAATG	2	12	602653	602664	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019780	GGAATG	2	12	602989	603000	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019780	GGAATG	2	12	603325	603336	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019780	TTACCA	2	12	610011	610022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019780	GTTTTA	2	12	613174	613185	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019780	ATTTTT	2	12	616026	616037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019780	TTTACA	2	12	623490	623501	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019780	AAAAAG	2	12	632749	632760	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019780	AAAAAG	2	12	633843	633854	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019780	ACTCAA	2	12	635618	635629	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019780	TTTACT	2	12	655204	655215	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019780	CGCGAT	2	12	682909	682920	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019780	ACCTGA	2	12	691761	691772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019780	TGGGAA	2	12	701284	701295	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019780	TAAAGA	2	12	786520	786531	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019780	CAATTG	2	12	789890	789901	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019780	TCAGGT	2	12	803468	803479	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019780	TTCTAT	2	12	836705	836716	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019780	TATGGG	2	12	849377	849388	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019780	GTATGG	2	12	851979	851990	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019780	ACGAAA	2	12	877562	877573	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019780	CAATAT	2	12	881388	881399	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019780	CCAGGC	2	12	890021	890032	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019780	CTTGAT	2	12	891153	891164	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_019780	CCAACA	2	12	932071	932082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019780	CCAACA	2	12	932111	932122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019780	TTATGG	2	12	957846	957857	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019780	CTACGG	2	12	973735	973746	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019780	GAAAAT	2	12	975997	976008	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019780	CGCAGC	2	12	989736	989747	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019780	CGATCG	2	12	1020396	1020407	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019780	CGATCG	2	12	1039886	1039897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019780	CAACCT	2	12	1041850	1041861	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019780	AAAGTA	2	12	1068456	1068467	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019780	TCAGTC	2	12	1100137	1100148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019780	GAACGG	2	12	1110855	1110866	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019780	CAAAAC	2	12	1111046	1111057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019780	TCAGGT	2	12	1123438	1123449	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019780	TCAGGT	2	12	1133544	1133555	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019780	TTTAGG	2	12	1154734	1154745	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019780	ACCTGA	2	12	1174885	1174896	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019780	GAAACT	2	12	1187636	1187647	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019780	TCAGGT	2	12	1220151	1220162	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_019780	TTTACA	2	12	1269952	1269963	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_019780	TGTAAA	2	12	1272704	1272715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019780	TCAGGT	2	12	1277804	1277815	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_019780	AATTAA	2	12	1280273	1280284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019780	TTTCAT	2	12	1314352	1314363	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019780	AAATTA	2	12	1314867	1314878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019780	GGCTTC	2	12	1434663	1434674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019780	GACGTA	2	12	1438290	1438301	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019780	TTCTGA	2	12	1438946	1438957	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_019780	CCTCGT	2	12	1439373	1439384	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019780	CTACAT	2	12	1454134	1454145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019780	TTTTCT	2	12	1461384	1461395	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019780	CCAGCA	2	12	1479422	1479433	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019780	AAGTTT	2	12	1509169	1509180	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019780	AGGCGA	2	12	1543234	1543245	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019780	ATTAGG	2	12	1569871	1569882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019780	TGATTT	2	12	1604255	1604266	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019780	GCGATC	2	12	1625193	1625204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019780	CGATCG	2	12	1647550	1647561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019780	GGAATG	2	12	1662770	1662781	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019780	CGATAG	2	12	1694705	1694716	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_019780	ACCTGA	2	12	1701112	1701123	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019780	TAATTT	2	12	1718195	1718206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019780	ACCTGA	2	12	1752316	1752327	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019780	CGAAGC	2	12	1763853	1763864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019780	TCCTGT	2	12	1766283	1766294	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019780	GTAACT	2	12	1804776	1804787	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_019780	ATAAAA	2	12	1805635	1805646	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019780	ATTCAT	2	12	1807682	1807693	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_019780	TTAGGA	2	12	1807780	1807791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019780	ACCTGA	2	12	1849334	1849345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019780	ATCCCT	2	12	1889319	1889330	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019780	TCAGGT	2	12	1908160	1908171	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_019780	CGAAGC	2	12	1912113	1912124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019780	CGATCG	2	12	1935055	1935066	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019780	TTATTT	2	12	1937513	1937524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019780	ATTGAA	2	12	1983583	1983594	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019780	TTGTAG	2	12	2000782	2000793	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019780	TAGGAT	2	12	2016532	2016543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019780	ACATCT	2	12	2029987	2029998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019780	ATCGCG	2	12	2032881	2032892	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019780	CGCGAT	2	12	2089026	2089037	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019780	ATGTTC	2	12	2106326	2106337	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_019780	AGCTTT	2	12	2114811	2114822	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.