MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Dactylococcopsis salina PCC 8305 chromosome

Total Repeats: 2865

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019780	ATCGC	2	10	1539	1548	20 %	20 %	20 %	40 %	428778397
2	NC_019780	CGCAA	2	10	3684	3693	40 %	0 %	20 %	40 %	428778400
3	NC_019780	GATAG	2	10	4410	4419	40 %	20 %	40 %	0 %	428778401
4	NC_019780	CAATA	2	10	4762	4771	60 %	20 %	0 %	20 %	428778401
5	NC_019780	ATAAA	2	10	6225	6234	80 %	20 %	0 %	0 %	428778402
6	NC_019780	TCGCT	2	10	6928	6937	0 %	40 %	20 %	40 %	428778403
7	NC_019780	CTTTG	2	10	8626	8635	0 %	60 %	20 %	20 %	428778404
8	NC_019780	GGAAG	2	10	8770	8779	40 %	0 %	60 %	0 %	428778404
9	NC_019780	TTTCG	2	10	9926	9935	0 %	60 %	20 %	20 %	428778404
10	NC_019780	ACCCT	2	10	10695	10704	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_019780	ATGAA	2	10	11305	11314	60 %	20 %	20 %	0 %	428778406
12	NC_019780	CATTT	2	10	12861	12870	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019780	GCGAA	2	10	13012	13021	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019780	AAATC	2	10	16620	16629	60 %	20 %	0 %	20 %	428778411
15	NC_019780	AGCCA	2	10	16849	16858	40 %	0 %	20 %	40 %	428778411
16	NC_019780	AATCT	2	10	19381	19390	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019780	AAAAT	2	10	20343	20352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019780	CTAAA	2	10	22914	22923	60 %	20 %	0 %	20 %	428778417
19	NC_019780	TAGGA	2	10	23576	23585	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019780	CTGAT	2	10	23843	23852	20 %	40 %	20 %	20 %	428778418
21	NC_019780	TGAGA	2	10	24441	24450	40 %	20 %	40 %	0 %	428778418
22	NC_019780	GAAAC	2	10	25415	25424	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019780	CTCAT	2	10	28066	28075	20 %	40 %	0 %	40 %	428778423
24	NC_019780	GGTTG	2	10	29144	29153	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019780	GGTTG	2	10	29220	29229	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019780	GGTTG	2	10	29296	29305	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019780	TCTAT	2	10	29476	29485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019780	GGTTG	2	10	29492	29501	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019780	GGTTG	2	10	29635	29644	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019780	GTTTC	2	10	33499	33508	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019780	GAGTA	2	10	36672	36681	40 %	20 %	40 %	0 %	428778430
32	NC_019780	CAAAC	2	10	38935	38944	60 %	0 %	0 %	40 %	428778435
33	NC_019780	TCCCA	2	10	39161	39170	20 %	20 %	0 %	60 %	428778435
34	NC_019780	AAGGT	2	10	41748	41757	40 %	20 %	40 %	0 %	428778437
35	NC_019780	CTTGA	2	10	45409	45418	20 %	40 %	20 %	20 %	428778439
36	NC_019780	GTTGA	2	10	47058	47067	20 %	40 %	40 %	0 %	428778441
37	NC_019780	CGAGG	2	10	47847	47856	20 %	0 %	60 %	20 %	428778441
38	NC_019780	AAAGA	2	10	50092	50101	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019780	TTGGT	2	10	50234	50243	0 %	60 %	40 %	0 %	428778443
40	NC_019780	GCGGT	2	10	58486	58495	0 %	20 %	60 %	20 %	428778449
41	NC_019780	GTTTC	2	10	59808	59817	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019780	TTCAG	2	10	59894	59903	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019780	AGTTT	2	10	61535	61544	20 %	60 %	20 %	0 %	428778452
44	NC_019780	CGTTT	2	10	61593	61602	0 %	60 %	20 %	20 %	428778452
45	NC_019780	AGTTA	2	10	63261	63270	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019780	GCAAG	2	10	65529	65538	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019780	CGGGA	2	10	65807	65816	20 %	0 %	60 %	20 %	428778456
48	NC_019780	CTGGT	2	10	66893	66902	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_019780	ACTCA	2	10	67643	67652	40 %	20 %	0 %	40 %	428778458
50	NC_019780	CCCAA	2	10	68146	68155	40 %	0 %	0 %	60 %	428778458
51	NC_019780	TTTGG	2	10	70292	70301	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019780	GTTCC	2	10	70318	70327	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_019780	GAAAG	2	10	70579	70588	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019780	AAGGC	2	10	71240	71249	40 %	0 %	40 %	20 %	428778461
55	NC_019780	TAAAC	2	10	72011	72020	60 %	20 %	0 %	20 %	428778462
56	NC_019780	TCCCC	2	10	73287	73296	0 %	20 %	0 %	80 %	428778463
57	NC_019780	ATCAA	2	10	74073	74082	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019780	TTTTC	2	10	79616	79625	0 %	80 %	0 %	20 %	428778468
59	NC_019780	GGTTT	2	10	80454	80463	0 %	60 %	40 %	0 %	428778469
60	NC_019780	ATTTT	2	10	80655	80664	20 %	80 %	0 %	0 %	428778469
61	NC_019780	TTTTA	2	10	80777	80786	20 %	80 %	0 %	0 %	428778469
62	NC_019780	TAATA	2	10	81155	81164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019780	GAAAT	2	10	81992	82001	60 %	20 %	20 %	0 %	428778470
64	NC_019780	TAATA	2	10	82475	82484	60 %	40 %	0 %	0 %	428778470
65	NC_019780	AATAA	2	10	83218	83227	80 %	20 %	0 %	0 %	428778471
66	NC_019780	GCCAC	2	10	83473	83482	20 %	0 %	20 %	60 %	428778471
67	NC_019780	GGACG	2	10	84000	84009	20 %	0 %	60 %	20 %	428778471
68	NC_019780	TTTCA	2	10	85088	85097	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019780	AACCA	2	10	89849	89858	60 %	0 %	0 %	40 %	428778477
70	NC_019780	GGGTT	2	10	90738	90747	0 %	40 %	60 %	0 %	428778478
71	NC_019780	ATTTT	2	10	91778	91787	20 %	80 %	0 %	0 %	428778479
72	NC_019780	GAATA	2	10	93346	93355	60 %	20 %	20 %	0 %	428778482
73	NC_019780	GGTTT	2	10	95499	95508	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019780	GTTTC	2	10	95541	95550	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019780	GTTTC	2	10	95625	95634	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019780	GTTTC	2	10	95666	95675	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019780	TGCGG	2	10	95731	95740	0 %	20 %	60 %	20 %	428778485
78	NC_019780	TGGGA	2	10	97971	97980	20 %	20 %	60 %	0 %	428778485
79	NC_019780	CGCAT	2	10	98454	98463	20 %	20 %	20 %	40 %	428778486
80	NC_019780	GCGGT	2	10	99552	99561	0 %	20 %	60 %	20 %	428778486
81	NC_019780	TTGGG	2	10	99567	99576	0 %	40 %	60 %	0 %	428778486
82	NC_019780	GCGAC	2	10	99762	99771	20 %	0 %	40 %	40 %	428778486
83	NC_019780	CGACC	2	10	100282	100291	20 %	0 %	20 %	60 %	428778486
84	NC_019780	GCTAT	2	10	103625	103634	20 %	40 %	20 %	20 %	428778489
85	NC_019780	TTTCA	2	10	107730	107739	20 %	60 %	0 %	20 %	428778494
86	NC_019780	ATCTC	2	10	108939	108948	20 %	40 %	0 %	40 %	428778495
87	NC_019780	GAATG	2	10	109129	109138	40 %	20 %	40 %	0 %	428778495
88	NC_019780	GCTTT	2	10	109642	109651	0 %	60 %	20 %	20 %	428778495
89	NC_019780	CATTT	2	10	111936	111945	20 %	60 %	0 %	20 %	428778496
90	NC_019780	CAAGC	2	10	112289	112298	40 %	0 %	20 %	40 %	428778497
91	NC_019780	ATGAC	2	10	112460	112469	40 %	20 %	20 %	20 %	428778497
92	NC_019780	AACCA	2	10	114710	114719	60 %	0 %	0 %	40 %	428778500
93	NC_019780	TGAAA	3	15	116755	116769	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019780	ATCAT	2	10	118323	118332	40 %	40 %	0 %	20 %	428778502
95	NC_019780	TAACT	2	10	118428	118437	40 %	40 %	0 %	20 %	428778502
96	NC_019780	CCACC	2	10	119367	119376	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
97	NC_019780	CCACC	2	10	119406	119415	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
98	NC_019780	CCACC	2	10	119445	119454	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
99	NC_019780	CCACC	2	10	119484	119493	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
100	NC_019780	GCTCG	2	10	121587	121596	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_019780	TTGGT	2	10	122816	122825	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019780	GAGAA	2	10	122955	122964	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019780	TTTAT	2	10	124566	124575	20 %	80 %	0 %	0 %	428778507
104	NC_019780	AGCGA	2	10	124928	124937	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_019780	ATTTT	2	10	126118	126127	20 %	80 %	0 %	0 %	428778510
106	NC_019780	TAAAC	2	10	126738	126747	60 %	20 %	0 %	20 %	428778511
107	NC_019780	AAGAA	2	10	127233	127242	80 %	0 %	20 %	0 %	428778511
108	NC_019780	AAATT	2	10	127786	127795	60 %	40 %	0 %	0 %	428778512
109	NC_019780	AATCA	2	10	128561	128570	60 %	20 %	0 %	20 %	428778512
110	NC_019780	ACACC	2	10	129660	129669	40 %	0 %	0 %	60 %	428778513
111	NC_019780	TGGGA	2	10	131086	131095	20 %	20 %	60 %	0 %	428778514
112	NC_019780	TGAGT	2	10	132454	132463	20 %	40 %	40 %	0 %	428778515
113	NC_019780	GCTTC	2	10	134188	134197	0 %	40 %	20 %	40 %	428778518
114	NC_019780	GTATG	2	10	136880	136889	20 %	40 %	40 %	0 %	428778521
115	NC_019780	GGGTT	2	10	137845	137854	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019780	TCAAG	2	10	138189	138198	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_019780	TTAAG	2	10	139783	139792	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019780	ATTTG	2	10	140913	140922	20 %	60 %	20 %	0 %	428778524
119	NC_019780	TCAAG	2	10	142176	142185	40 %	20 %	20 %	20 %	428778525
120	NC_019780	GAAAC	2	10	142339	142348	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019780	GAAAC	2	10	142448	142457	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019780	ATTAG	2	10	143832	143841	40 %	40 %	20 %	0 %	428778527
123	NC_019780	TTGGT	2	10	146761	146770	0 %	60 %	40 %	0 %	428778529
124	NC_019780	TTTGT	2	10	147906	147915	0 %	80 %	20 %	0 %	428778530
125	NC_019780	TCAAC	2	10	148934	148943	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_019780	TTTCC	2	10	149790	149799	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_019780	TGAGA	2	10	150409	150418	40 %	20 %	40 %	0 %	428778531
128	NC_019780	CCAAA	2	10	151246	151255	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_019780	TGACC	2	10	154463	154472	20 %	20 %	20 %	40 %	428778535
130	NC_019780	ATGGG	2	10	160099	160108	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019780	GTAAT	2	10	160597	160606	40 %	40 %	20 %	0 %	428778540
132	NC_019780	AGAAC	2	10	161440	161449	60 %	0 %	20 %	20 %	428778541
133	NC_019780	ATCGC	2	10	162785	162794	20 %	20 %	20 %	40 %	428778543
134	NC_019780	TAAAA	2	10	163200	163209	80 %	20 %	0 %	0 %	428778543
135	NC_019780	TGATC	2	10	165662	165671	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019780	CGAAA	2	10	165913	165922	60 %	0 %	20 %	20 %	428778547
137	NC_019780	CCGAT	2	10	168634	168643	20 %	20 %	20 %	40 %	428778548
138	NC_019780	ATCTT	2	10	170135	170144	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019780	AAAAT	2	10	170839	170848	80 %	20 %	0 %	0 %	428778551
140	NC_019780	TCAAG	2	10	172547	172556	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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257	NC_019780	GAAAC	2	10	319155	319164	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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