MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Dactylococcopsis salina PCC 8305 chromosome

Total Repeats: 919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019780	ACCCT	2	10	10695	10704	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_019780	CATTT	2	10	12861	12870	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019780	GCGAA	2	10	13012	13021	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019780	AATCT	2	10	19381	19390	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019780	AAAAT	2	10	20343	20352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019780	TAGGA	2	10	23576	23585	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019780	GAAAC	2	10	25415	25424	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_019780	GGTTG	2	10	29144	29153	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019780	GGTTG	2	10	29220	29229	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019780	GGTTG	2	10	29296	29305	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019780	TCTAT	2	10	29476	29485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019780	GGTTG	2	10	29492	29501	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019780	GGTTG	2	10	29635	29644	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019780	GTTTC	2	10	33499	33508	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019780	AAAGA	2	10	50092	50101	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019780	GTTTC	2	10	59808	59817	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019780	TTCAG	2	10	59894	59903	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019780	AGTTA	2	10	63261	63270	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019780	GCAAG	2	10	65529	65538	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019780	CTGGT	2	10	66893	66902	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019780	TTTGG	2	10	70292	70301	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019780	GTTCC	2	10	70318	70327	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_019780	GAAAG	2	10	70579	70588	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019780	ATCAA	2	10	74073	74082	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019780	TAATA	2	10	81155	81164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019780	TTTCA	2	10	85088	85097	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019780	GGTTT	2	10	95499	95508	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019780	GTTTC	2	10	95541	95550	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019780	GTTTC	2	10	95625	95634	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019780	GTTTC	2	10	95666	95675	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019780	TGAAA	3	15	116755	116769	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019780	CCACC	2	10	119367	119376	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
33	NC_019780	CCACC	2	10	119406	119415	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
34	NC_019780	CCACC	2	10	119445	119454	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
35	NC_019780	CCACC	2	10	119484	119493	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
36	NC_019780	GCTCG	2	10	121587	121596	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_019780	TTGGT	2	10	122816	122825	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019780	GAGAA	2	10	122955	122964	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019780	AGCGA	2	10	124928	124937	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019780	GGGTT	2	10	137845	137854	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019780	TCAAG	2	10	138189	138198	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019780	TTAAG	2	10	139783	139792	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019780	GAAAC	2	10	142339	142348	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019780	GAAAC	2	10	142448	142457	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_019780	TCAAC	2	10	148934	148943	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_019780	TTTCC	2	10	149790	149799	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_019780	CCAAA	2	10	151246	151255	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_019780	ATGGG	2	10	160099	160108	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019780	TGATC	2	10	165662	165671	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_019780	ATCTT	2	10	170135	170144	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019780	TCAAG	2	10	172547	172556	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019780	AACCC	2	10	175034	175043	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_019780	AACCC	2	10	175175	175184	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_019780	TTAGG	2	10	179433	179442	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019780	GGAAA	2	10	180418	180427	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019780	GCCTT	2	10	186073	186082	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_019780	GAAAC	2	10	196650	196659	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019780	TTTCA	2	10	196708	196717	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019780	ATCAG	2	10	196997	197006	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019780	GTTTC	2	10	197151	197160	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019780	GTTTC	2	10	197201	197210	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019780	GGGAT	2	10	213344	213353	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019780	GTTTC	2	10	214247	214256	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019780	AGAGA	2	10	214959	214968	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019780	CGAAT	2	10	222584	222593	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_019780	TCGCT	2	10	231983	231992	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_019780	TCGGT	2	10	236376	236385	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019780	AAACC	2	10	238381	238390	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_019780	CATTT	2	10	244514	244523	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019780	AAATC	2	10	258188	258197	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_019780	GTTTG	2	10	261906	261915	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019780	GTGTA	2	10	261916	261925	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019780	TTTGA	2	10	268369	268378	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019780	ATTTA	2	10	275001	275010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019780	CCTAA	2	10	289425	289434	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_019780	AAAGG	2	10	290675	290684	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019780	CCTAA	2	10	291031	291040	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_019780	AAAGG	2	10	295614	295623	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019780	AAAGT	2	10	301936	301945	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019780	TTGCC	2	10	302074	302083	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_019780	TTGCC	2	10	313328	313337	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_019780	GTGGG	2	10	315586	315595	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019780	TCGCT	2	10	316694	316703	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_019780	GAAAC	2	10	318999	319008	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_019780	GAAAC	2	10	319155	319164	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019780	TCGCT	2	10	364977	364986	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_019780	GGTTG	2	10	368230	368239	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019780	ATTAA	2	10	369195	369204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019780	TCGCT	2	10	369814	369823	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_019780	TTTGA	2	10	371065	371074	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019780	ACTTT	2	10	373747	373756	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_019780	GTTAA	2	10	373827	373836	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019780	CCCCT	2	10	376331	376340	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
94	NC_019780	ATCCT	2	10	386305	386314	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_019780	AGGAG	2	10	393409	393418	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019780	TAAAA	2	10	395170	395179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019780	GTTTC	2	10	395640	395649	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_019780	GTTTC	2	10	395688	395697	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_019780	GTTTC	2	10	395788	395797	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_019780	TCCCA	2	10	400215	400224	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_019780	CTTCA	2	10	400604	400613	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_019780	CTTCA	2	10	400814	400823	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_019780	GGAAA	2	10	402300	402309	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019780	TAACT	2	10	405292	405301	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_019780	TATGA	2	10	406736	406745	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019780	CAATA	2	10	426487	426496	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019780	CTTTT	2	10	426499	426508	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019780	GGCAA	2	10	439091	439100	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_019780	ACTAG	2	10	446259	446268	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019780	GTGAT	2	10	450224	450233	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019780	TTGCC	2	10	453165	453174	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_019780	AGCGA	2	10	453269	453278	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019780	GGTTT	2	10	455043	455052	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019780	TGAGG	2	10	467138	467147	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019780	TTTCC	2	10	471832	471841	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_019780	AGGGC	2	10	472608	472617	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_019780	AAACT	2	10	473045	473054	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_019780	ATTTA	2	10	474873	474882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019780	AGGAG	2	10	476752	476761	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019780	AGCGA	2	10	479521	479530	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019780	AGGGC	2	10	479657	479666	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019780	TCACT	2	10	480981	480990	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_019780	TTCAC	2	10	481028	481037	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_019780	TTCAC	2	10	481069	481078	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019780	GGGTT	2	10	481095	481104	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019780	TTCAC	2	10	481110	481119	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_019780	AAAGT	2	10	494050	494059	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019780	ATAAA	2	10	498470	498479	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019780	TTGCC	2	10	503475	503484	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_019780	AGATG	2	10	506452	506461	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019780	AACAG	2	10	506488	506497	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019780	AGCCG	2	10	509112	509121	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_019780	AGATG	2	10	509367	509376	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019780	CATTT	2	10	513512	513521	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_019780	CCATA	2	10	515717	515726	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_019780	AACGA	2	10	516110	516119	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_019780	TCGCT	2	10	527619	527628	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_019780	TAACT	2	10	531085	531094	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019780	GGCAA	2	10	531123	531132	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_019780	ACCTA	2	10	531355	531364	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_019780	GGTTG	2	10	542981	542990	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019780	ACGTT	2	10	552345	552354	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_019780	TATGC	2	10	553240	553249	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_019780	GAAGC	2	10	564903	564912	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_019780	TTTTA	2	10	566758	566767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019780	ACCGA	2	10	566972	566981	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_019780	ACCGA	2	10	567009	567018	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_019780	TTCCT	2	10	571418	571427	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_019780	AACTG	2	10	572213	572222	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_019780	CGAAT	2	10	572432	572441	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_019780	CCCCT	2	10	572543	572552	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
152	NC_019780	GGTTG	2	10	577729	577738	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_019780	GGCAA	2	10	677012	677021	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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258	NC_019780	TAATG	2	10	960482	960491	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_019780	GATCA	2	10	1009518	1009527	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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274	NC_019780	GATTT	2	10	1011978	1011987	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
275	NC_019780	AGTCA	2	10	1016965	1016974	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
276	NC_019780	CTGAA	2	10	1018464	1018473	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
277	NC_019780	AATTA	2	10	1020666	1020675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_019780	CTGAA	2	10	1042967	1042976	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_019780	ATCAT	2	10	1080188	1080197	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
286	NC_019780	CAATT	2	10	1081170	1081179	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_019780	TTCAG	2	10	1081710	1081719	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
288	NC_019780	ACTTT	2	10	1089800	1089809	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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479	NC_019780	TTCAG	2	10	1895917	1895926	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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494	NC_019780	TTCGG	2	10	1988638	1988647	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
495	NC_019780	AACCA	2	10	1988856	1988865	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
496	NC_019780	TAAAC	2	10	1989565	1989574	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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