MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Dactylococcopsis salina PCC 8305 chromosome

Total Repeats: 1946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019780	ATCGC	2	10	1539	1548	20 %	20 %	20 %	40 %	428778397
2	NC_019780	CGCAA	2	10	3684	3693	40 %	0 %	20 %	40 %	428778400
3	NC_019780	GATAG	2	10	4410	4419	40 %	20 %	40 %	0 %	428778401
4	NC_019780	CAATA	2	10	4762	4771	60 %	20 %	0 %	20 %	428778401
5	NC_019780	ATAAA	2	10	6225	6234	80 %	20 %	0 %	0 %	428778402
6	NC_019780	TCGCT	2	10	6928	6937	0 %	40 %	20 %	40 %	428778403
7	NC_019780	CTTTG	2	10	8626	8635	0 %	60 %	20 %	20 %	428778404
8	NC_019780	GGAAG	2	10	8770	8779	40 %	0 %	60 %	0 %	428778404
9	NC_019780	TTTCG	2	10	9926	9935	0 %	60 %	20 %	20 %	428778404
10	NC_019780	ATGAA	2	10	11305	11314	60 %	20 %	20 %	0 %	428778406
11	NC_019780	AAATC	2	10	16620	16629	60 %	20 %	0 %	20 %	428778411
12	NC_019780	AGCCA	2	10	16849	16858	40 %	0 %	20 %	40 %	428778411
13	NC_019780	CTAAA	2	10	22914	22923	60 %	20 %	0 %	20 %	428778417
14	NC_019780	CTGAT	2	10	23843	23852	20 %	40 %	20 %	20 %	428778418
15	NC_019780	TGAGA	2	10	24441	24450	40 %	20 %	40 %	0 %	428778418
16	NC_019780	CTCAT	2	10	28066	28075	20 %	40 %	0 %	40 %	428778423
17	NC_019780	GAGTA	2	10	36672	36681	40 %	20 %	40 %	0 %	428778430
18	NC_019780	CAAAC	2	10	38935	38944	60 %	0 %	0 %	40 %	428778435
19	NC_019780	TCCCA	2	10	39161	39170	20 %	20 %	0 %	60 %	428778435
20	NC_019780	AAGGT	2	10	41748	41757	40 %	20 %	40 %	0 %	428778437
21	NC_019780	CTTGA	2	10	45409	45418	20 %	40 %	20 %	20 %	428778439
22	NC_019780	GTTGA	2	10	47058	47067	20 %	40 %	40 %	0 %	428778441
23	NC_019780	CGAGG	2	10	47847	47856	20 %	0 %	60 %	20 %	428778441
24	NC_019780	TTGGT	2	10	50234	50243	0 %	60 %	40 %	0 %	428778443
25	NC_019780	GCGGT	2	10	58486	58495	0 %	20 %	60 %	20 %	428778449
26	NC_019780	AGTTT	2	10	61535	61544	20 %	60 %	20 %	0 %	428778452
27	NC_019780	CGTTT	2	10	61593	61602	0 %	60 %	20 %	20 %	428778452
28	NC_019780	CGGGA	2	10	65807	65816	20 %	0 %	60 %	20 %	428778456
29	NC_019780	ACTCA	2	10	67643	67652	40 %	20 %	0 %	40 %	428778458
30	NC_019780	CCCAA	2	10	68146	68155	40 %	0 %	0 %	60 %	428778458
31	NC_019780	AAGGC	2	10	71240	71249	40 %	0 %	40 %	20 %	428778461
32	NC_019780	TAAAC	2	10	72011	72020	60 %	20 %	0 %	20 %	428778462
33	NC_019780	TCCCC	2	10	73287	73296	0 %	20 %	0 %	80 %	428778463
34	NC_019780	TTTTC	2	10	79616	79625	0 %	80 %	0 %	20 %	428778468
35	NC_019780	GGTTT	2	10	80454	80463	0 %	60 %	40 %	0 %	428778469
36	NC_019780	ATTTT	2	10	80655	80664	20 %	80 %	0 %	0 %	428778469
37	NC_019780	TTTTA	2	10	80777	80786	20 %	80 %	0 %	0 %	428778469
38	NC_019780	GAAAT	2	10	81992	82001	60 %	20 %	20 %	0 %	428778470
39	NC_019780	TAATA	2	10	82475	82484	60 %	40 %	0 %	0 %	428778470
40	NC_019780	AATAA	2	10	83218	83227	80 %	20 %	0 %	0 %	428778471
41	NC_019780	GCCAC	2	10	83473	83482	20 %	0 %	20 %	60 %	428778471
42	NC_019780	GGACG	2	10	84000	84009	20 %	0 %	60 %	20 %	428778471
43	NC_019780	AACCA	2	10	89849	89858	60 %	0 %	0 %	40 %	428778477
44	NC_019780	GGGTT	2	10	90738	90747	0 %	40 %	60 %	0 %	428778478
45	NC_019780	ATTTT	2	10	91778	91787	20 %	80 %	0 %	0 %	428778479
46	NC_019780	GAATA	2	10	93346	93355	60 %	20 %	20 %	0 %	428778482
47	NC_019780	TGCGG	2	10	95731	95740	0 %	20 %	60 %	20 %	428778485
48	NC_019780	TGGGA	2	10	97971	97980	20 %	20 %	60 %	0 %	428778485
49	NC_019780	CGCAT	2	10	98454	98463	20 %	20 %	20 %	40 %	428778486
50	NC_019780	GCGGT	2	10	99552	99561	0 %	20 %	60 %	20 %	428778486
51	NC_019780	TTGGG	2	10	99567	99576	0 %	40 %	60 %	0 %	428778486
52	NC_019780	GCGAC	2	10	99762	99771	20 %	0 %	40 %	40 %	428778486
53	NC_019780	CGACC	2	10	100282	100291	20 %	0 %	20 %	60 %	428778486
54	NC_019780	GCTAT	2	10	103625	103634	20 %	40 %	20 %	20 %	428778489
55	NC_019780	TTTCA	2	10	107730	107739	20 %	60 %	0 %	20 %	428778494
56	NC_019780	ATCTC	2	10	108939	108948	20 %	40 %	0 %	40 %	428778495
57	NC_019780	GAATG	2	10	109129	109138	40 %	20 %	40 %	0 %	428778495
58	NC_019780	GCTTT	2	10	109642	109651	0 %	60 %	20 %	20 %	428778495
59	NC_019780	CATTT	2	10	111936	111945	20 %	60 %	0 %	20 %	428778496
60	NC_019780	CAAGC	2	10	112289	112298	40 %	0 %	20 %	40 %	428778497
61	NC_019780	ATGAC	2	10	112460	112469	40 %	20 %	20 %	20 %	428778497
62	NC_019780	AACCA	2	10	114710	114719	60 %	0 %	0 %	40 %	428778500
63	NC_019780	ATCAT	2	10	118323	118332	40 %	40 %	0 %	20 %	428778502
64	NC_019780	TAACT	2	10	118428	118437	40 %	40 %	0 %	20 %	428778502
65	NC_019780	TTTAT	2	10	124566	124575	20 %	80 %	0 %	0 %	428778507
66	NC_019780	ATTTT	2	10	126118	126127	20 %	80 %	0 %	0 %	428778510
67	NC_019780	TAAAC	2	10	126738	126747	60 %	20 %	0 %	20 %	428778511
68	NC_019780	AAGAA	2	10	127233	127242	80 %	0 %	20 %	0 %	428778511
69	NC_019780	AAATT	2	10	127786	127795	60 %	40 %	0 %	0 %	428778512
70	NC_019780	AATCA	2	10	128561	128570	60 %	20 %	0 %	20 %	428778512
71	NC_019780	ACACC	2	10	129660	129669	40 %	0 %	0 %	60 %	428778513
72	NC_019780	TGGGA	2	10	131086	131095	20 %	20 %	60 %	0 %	428778514
73	NC_019780	TGAGT	2	10	132454	132463	20 %	40 %	40 %	0 %	428778515
74	NC_019780	GCTTC	2	10	134188	134197	0 %	40 %	20 %	40 %	428778518
75	NC_019780	GTATG	2	10	136880	136889	20 %	40 %	40 %	0 %	428778521
76	NC_019780	ATTTG	2	10	140913	140922	20 %	60 %	20 %	0 %	428778524
77	NC_019780	TCAAG	2	10	142176	142185	40 %	20 %	20 %	20 %	428778525
78	NC_019780	ATTAG	2	10	143832	143841	40 %	40 %	20 %	0 %	428778527
79	NC_019780	TTGGT	2	10	146761	146770	0 %	60 %	40 %	0 %	428778529
80	NC_019780	TTTGT	2	10	147906	147915	0 %	80 %	20 %	0 %	428778530
81	NC_019780	TGAGA	2	10	150409	150418	40 %	20 %	40 %	0 %	428778531
82	NC_019780	TGACC	2	10	154463	154472	20 %	20 %	20 %	40 %	428778535
83	NC_019780	GTAAT	2	10	160597	160606	40 %	40 %	20 %	0 %	428778540
84	NC_019780	AGAAC	2	10	161440	161449	60 %	0 %	20 %	20 %	428778541
85	NC_019780	ATCGC	2	10	162785	162794	20 %	20 %	20 %	40 %	428778543
86	NC_019780	TAAAA	2	10	163200	163209	80 %	20 %	0 %	0 %	428778543
87	NC_019780	CGAAA	2	10	165913	165922	60 %	0 %	20 %	20 %	428778547
88	NC_019780	CCGAT	2	10	168634	168643	20 %	20 %	20 %	40 %	428778548
89	NC_019780	AAAAT	2	10	170839	170848	80 %	20 %	0 %	0 %	428778551
90	NC_019780	ATTTC	2	10	173377	173386	20 %	60 %	0 %	20 %	428778554
91	NC_019780	ATCGA	2	10	175771	175780	40 %	20 %	20 %	20 %	428778556
92	NC_019780	TTGGA	2	10	177731	177740	20 %	40 %	40 %	0 %	428778561
93	NC_019780	CGCAA	2	10	182742	182751	40 %	0 %	20 %	40 %	428778565
94	NC_019780	AACAG	2	10	185630	185639	60 %	0 %	20 %	20 %	428778568
95	NC_019780	AAAAT	2	10	185800	185809	80 %	20 %	0 %	0 %	428778568
96	NC_019780	ATTTC	2	10	191996	192005	20 %	60 %	0 %	20 %	428778578
97	NC_019780	GATCG	2	10	192599	192608	20 %	20 %	40 %	20 %	428778579
98	NC_019780	TCGAG	2	10	195818	195827	20 %	20 %	40 %	20 %	428778580
99	NC_019780	GAAAA	2	10	197498	197507	80 %	0 %	20 %	0 %	428778582
100	NC_019780	AAACT	2	10	197936	197945	60 %	20 %	0 %	20 %	428778582
101	NC_019780	CTTGA	2	10	198320	198329	20 %	40 %	20 %	20 %	428778582
102	NC_019780	AATGC	2	10	199224	199233	40 %	20 %	20 %	20 %	428778583
103	NC_019780	AGTTA	2	10	199565	199574	40 %	40 %	20 %	0 %	428778583
104	NC_019780	TCACT	2	10	200166	200175	20 %	40 %	0 %	40 %	428778584
105	NC_019780	AGCAA	2	10	200977	200986	60 %	0 %	20 %	20 %	428778585
106	NC_019780	CCTCA	2	10	202687	202696	20 %	20 %	0 %	60 %	428778588
107	NC_019780	GGGTG	2	10	205783	205792	0 %	20 %	80 %	0 %	428778590
108	NC_019780	GTTGG	2	10	208735	208744	0 %	40 %	60 %	0 %	428778592
109	NC_019780	TGGTT	2	10	209102	209111	0 %	60 %	40 %	0 %	428778592
110	NC_019780	TTTTC	2	10	209847	209856	0 %	80 %	0 %	20 %	428778592
111	NC_019780	GATCA	2	10	211951	211960	40 %	20 %	20 %	20 %	428778593
112	NC_019780	GTTTC	2	10	213877	213886	0 %	60 %	20 %	20 %	428778594
113	NC_019780	CTTTT	2	10	217008	217017	0 %	80 %	0 %	20 %	428778595
114	NC_019780	TTCTT	2	10	220274	220283	0 %	80 %	0 %	20 %	428778598
115	NC_019780	TCCTT	2	10	221573	221582	0 %	60 %	0 %	40 %	428778599
116	NC_019780	TGGGT	2	10	222334	222343	0 %	40 %	60 %	0 %	428778599
117	NC_019780	ACCGG	2	10	223323	223332	20 %	0 %	40 %	40 %	428778600
118	NC_019780	ATTTT	2	10	225569	225578	20 %	80 %	0 %	0 %	428778601
119	NC_019780	CGGTG	2	10	227886	227895	0 %	20 %	60 %	20 %	428778603
120	NC_019780	TTGGC	2	10	230311	230320	0 %	40 %	40 %	20 %	428778605
121	NC_019780	TTAGA	2	10	232061	232070	40 %	40 %	20 %	0 %	428778608
122	NC_019780	CCAAA	2	10	233324	233333	60 %	0 %	0 %	40 %	428778609
123	NC_019780	AATAA	2	10	233752	233761	80 %	20 %	0 %	0 %	428778609
124	NC_019780	ATCCC	2	10	233812	233821	20 %	20 %	0 %	60 %	428778609
125	NC_019780	ACCGT	2	10	237588	237597	20 %	20 %	20 %	40 %	428778612
126	NC_019780	CTCGT	2	10	240021	240030	0 %	40 %	20 %	40 %	428778614
127	NC_019780	AAGTG	2	10	241123	241132	40 %	20 %	40 %	0 %	428778614
128	NC_019780	TGCTG	2	10	246273	246282	0 %	40 %	40 %	20 %	428778617
129	NC_019780	GGGGT	2	10	247709	247718	0 %	20 %	80 %	0 %	428778619
130	NC_019780	CCTTC	2	10	254163	254172	0 %	40 %	0 %	60 %	428778628
131	NC_019780	GTTTG	2	10	254472	254481	0 %	60 %	40 %	0 %	428778629
132	NC_019780	ATCAA	2	10	256965	256974	60 %	20 %	0 %	20 %	428778632
133	NC_019780	GAAAG	2	10	257242	257251	60 %	0 %	40 %	0 %	428778632
134	NC_019780	AATCA	2	10	258943	258952	60 %	20 %	0 %	20 %	428778633
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