MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Dactylococcopsis salina PCC 8305 chromosome

Total Repeats: 42291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019780	TAA	2	6	15	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778396
2	NC_019780	GAT	2	6	23	28	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778396
3	NC_019780	TAA	3	9	130	138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778396
4	NC_019780	GAA	2	6	287	292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778396
5	NC_019780	TGG	2	6	305	310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428778396
6	NC_019780	TAA	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778396
7	NC_019780	AAT	2	6	413	418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778396
8	NC_019780	TGC	2	6	430	435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778396
9	NC_019780	TTA	2	6	518	523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778396
10	NC_019780	CGC	2	6	658	663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428778396
11	NC_019780	AAG	2	6	717	722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778396
12	NC_019780	GTT	2	6	807	812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428778396
13	NC_019780	GTT	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428778396
14	NC_019780	TTG	2	6	1116	1121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428778396
15	NC_019780	AGA	2	6	1144	1149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778396
16	NC_019780	TAC	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778396
17	NC_019780	GGT	2	6	1363	1368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428778396
18	NC_019780	GAT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778396
19	NC_019780	AAT	2	6	1656	1661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778397
20	NC_019780	CAG	2	6	1719	1724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428778397
21	NC_019780	TAA	2	6	1776	1781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778397
22	NC_019780	TAA	2	6	1845	1850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778397
23	NC_019780	TCA	2	6	1877	1882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778397
24	NC_019780	TGC	2	6	1889	1894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778397
25	NC_019780	AAT	2	6	1905	1910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778397
26	NC_019780	TCT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428778397
27	NC_019780	TGA	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778397
28	NC_019780	TCA	2	6	2118	2123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778397
29	NC_019780	AAC	2	6	2652	2657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428778398
30	NC_019780	CTT	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428778398
31	NC_019780	AAG	2	6	2758	2763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778398
32	NC_019780	TTG	2	6	2837	2842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428778398
33	NC_019780	AAT	2	6	2925	2930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778398
34	NC_019780	TAC	2	6	2949	2954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778398
35	NC_019780	CAA	2	6	2967	2972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428778398
36	NC_019780	AAC	2	6	2995	3000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428778398
37	NC_019780	AGA	2	6	3026	3031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778398
38	NC_019780	AAG	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778398
39	NC_019780	AGT	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778398
40	NC_019780	CGC	2	6	3204	3209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428778399
41	NC_019780	TGG	2	6	3304	3309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428778399
42	NC_019780	CTC	3	9	3435	3443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428778399
43	NC_019780	ATC	2	6	3487	3492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778399
44	NC_019780	TCG	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778400
45	NC_019780	AGG	2	6	3642	3647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428778400
46	NC_019780	GAA	2	6	3667	3672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778400
47	NC_019780	TGA	2	6	3788	3793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778400
48	NC_019780	TGA	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778400
49	NC_019780	TCG	2	6	3819	3824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778400
50	NC_019780	AAC	2	6	3914	3919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428778400
51	NC_019780	TCG	2	6	3948	3953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778400
52	NC_019780	TGA	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778400
53	NC_019780	ATT	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778401
54	NC_019780	ACT	2	6	4364	4369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778401
55	NC_019780	ATT	2	6	4505	4510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778401
56	NC_019780	CTG	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778401
57	NC_019780	ATA	2	6	4553	4558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778401
58	NC_019780	TGT	2	6	4589	4594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428778401
59	NC_019780	ATC	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778401
60	NC_019780	TAA	2	6	4720	4725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778401
61	NC_019780	ATT	2	6	4847	4852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778401
62	NC_019780	ATA	2	6	4916	4921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778401
63	NC_019780	ATC	2	6	4940	4945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778401
64	NC_019780	ATT	2	6	4968	4973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778401
65	NC_019780	CCA	2	6	5046	5051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428778401
66	NC_019780	TCT	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428778401
67	NC_019780	GAT	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778401
68	NC_019780	GAG	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428778401
69	NC_019780	ATT	2	6	5333	5338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778401
70	NC_019780	TGA	2	6	5367	5372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778401
71	NC_019780	TCA	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778401
72	NC_019780	TAA	2	6	5541	5546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778402
73	NC_019780	CTT	2	6	5603	5608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428778402
74	NC_019780	AAC	2	6	5678	5683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428778402
75	NC_019780	AGA	2	6	5766	5771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778402
76	NC_019780	GGA	2	6	5794	5799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428778402
77	NC_019780	ATC	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778402
78	NC_019780	ATT	2	6	5902	5907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778402
79	NC_019780	AAT	2	6	6015	6020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778402
80	NC_019780	TGA	2	6	6039	6044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778402
81	NC_019780	TAA	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778402
82	NC_019780	ATT	2	6	6105	6110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778402
83	NC_019780	TAA	2	6	6135	6140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778402
84	NC_019780	TTC	2	6	6141	6146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428778402
85	NC_019780	TCC	2	6	6321	6326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428778402
86	NC_019780	TAA	2	6	6361	6366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778402
87	NC_019780	TTA	2	6	6634	6639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778403
88	NC_019780	ATC	2	6	6957	6962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778403
89	NC_019780	ATC	2	6	7497	7502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778404
90	NC_019780	CAT	2	6	7556	7561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778404
91	NC_019780	ATC	2	6	7628	7633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778404
92	NC_019780	TTC	2	6	7653	7658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428778404
93	NC_019780	AAT	2	6	7673	7678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778404
94	NC_019780	ACA	2	6	7714	7719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428778404
95	NC_019780	ATC	2	6	7730	7735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778404
96	NC_019780	CAT	2	6	7805	7810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778404
97	NC_019780	ACC	2	6	7967	7972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428778404
98	NC_019780	CCA	2	6	7974	7979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428778404
99	NC_019780	GAC	2	6	8041	8046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428778404
100	NC_019780	TCA	2	6	8220	8225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778404
101	NC_019780	CCG	3	9	8560	8568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428778404
102	NC_019780	TGT	2	6	8609	8614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428778404
103	NC_019780	GAT	2	6	8638	8643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778404
104	NC_019780	CGC	2	6	8874	8879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428778404
105	NC_019780	CTG	2	6	8899	8904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778404
106	NC_019780	TGT	2	6	8916	8921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428778404
107	NC_019780	TGG	2	6	9121	9126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428778404
108	NC_019780	TGC	2	6	9144	9149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778404
109	NC_019780	GCA	2	6	9261	9266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428778404
110	NC_019780	CCA	2	6	9273	9278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428778404
111	NC_019780	GGC	2	6	9342	9347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428778404
112	NC_019780	TAA	2	6	9350	9355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778404
113	NC_019780	GCC	2	6	9375	9380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428778404
114	NC_019780	TGA	2	6	9504	9509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778404
115	NC_019780	CAG	2	6	9646	9651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428778404
116	NC_019780	AGA	2	6	9674	9679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778404
117	NC_019780	TGC	2	6	9821	9826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778404
118	NC_019780	GTT	2	6	9901	9906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428778404
119	NC_019780	TCA	2	6	9981	9986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778404
120	NC_019780	AGA	2	6	10001	10006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778404
121	NC_019780	ATC	2	6	10076	10081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778404
122	NC_019780	TCT	2	6	10443	10448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428778405
123	NC_019780	ATT	2	6	10905	10910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778406
124	NC_019780	CGC	2	6	10913	10918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428778406
125	NC_019780	ATA	2	6	11002	11007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778406
126	NC_019780	TGA	2	6	11048	11053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778406
127	NC_019780	CCG	2	6	11143	11148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428778406
128	NC_019780	GGC	2	6	11178	11183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428778406
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