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Hexa-nucleotide Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 1972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019779	GAAGCA	2	12	765	776	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428774688
2	NC_019779	TTATCA	2	12	3149	3160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428774690
3	NC_019779	CCAGTT	2	12	8778	8789	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428774693
4	NC_019779	AGCAGA	2	12	15245	15256	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428774699
5	NC_019779	TCAACT	2	12	16112	16123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774699
6	NC_019779	AAGAAA	2	12	16297	16308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428774699
7	NC_019779	TGCTTT	2	12	17384	17395	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428774700
8	NC_019779	TTTTGG	2	12	19223	19234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774703
9	NC_019779	ACAGTA	2	12	19876	19887	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428774703
10	NC_019779	TAGCAG	2	12	21685	21696	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428774703
11	NC_019779	TCGACA	2	12	24363	24374	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428774704
12	NC_019779	AAGATG	2	12	25496	25507	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428774707
13	NC_019779	CGATCG	2	12	34521	34532	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428774713
14	NC_019779	AGAACA	2	12	34992	35003	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428774713
15	NC_019779	AAAACT	2	12	35007	35018	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428774713
16	NC_019779	AAACCA	2	12	35781	35792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774714
17	NC_019779	TTCTGG	3	18	38752	38769	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428774715
18	NC_019779	AAATCA	2	12	40743	40754	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428774716
19	NC_019779	GTTAGG	2	12	41062	41073	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428774716
20	NC_019779	GAAGAT	2	12	43480	43491	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428774719
21	NC_019779	AAGGAG	2	12	46098	46109	50 %	0 %	50 %	0 %	428774721
22	NC_019779	GCAGAA	2	12	46987	46998	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428774722
23	NC_019779	CAGTAA	2	12	49558	49569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019779	GATCAG	2	12	52205	52216	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428774726
25	NC_019779	GACTTT	2	12	52866	52877	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428774727
26	NC_019779	GCTTGC	2	12	54347	54358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774727
27	NC_019779	TTAAAA	2	12	56456	56467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774730
28	NC_019779	CCAATC	2	12	58205	58216	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428774731
29	NC_019779	AGGATT	2	12	60931	60942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774733
30	NC_019779	TTAGAA	2	12	61283	61294	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019779	GCAGTC	2	12	61522	61533	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428774734
32	NC_019779	ATTTGA	2	12	64487	64498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019779	ATCCCT	2	12	66713	66724	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019779	ATCCCT	2	12	67712	67723	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019779	ATCCCT	2	12	68681	68692	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019779	ATCCCT	2	12	69639	69650	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019779	ATCCCT	2	12	70609	70620	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019779	ATCCCT	2	12	71566	71577	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019779	ATCCCT	2	12	72560	72571	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019779	GAAAAA	2	12	73836	73847	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019779	ATCCCT	2	12	75386	75397	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019779	CCAAAA	2	12	75785	75796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774745
43	NC_019779	TAATTT	2	12	76344	76355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019779	ACCAGC	2	12	78042	78053	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428774747
45	NC_019779	CCATCA	2	12	78733	78744	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428774747
46	NC_019779	TGTATC	2	12	78858	78869	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428774747
47	NC_019779	CAGCAC	2	12	79337	79348	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428774747
48	NC_019779	CATTAC	2	12	80885	80896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774747
49	NC_019779	AGTGGG	2	12	82466	82477	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019779	CAACGG	2	12	83162	83173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774748
51	NC_019779	AAGGTT	2	12	83770	83781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774748
52	NC_019779	AGCATT	2	12	84258	84269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428774748
53	NC_019779	GAGTTG	2	12	85930	85941	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019779	TTGCCA	2	12	87344	87355	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428774750
55	NC_019779	TTTCCT	2	12	89925	89936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019779	ATTTTA	2	12	90442	90453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774753
57	NC_019779	GATGGC	2	12	92733	92744	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428774753
58	NC_019779	ACCCGA	2	12	92939	92950	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428774753
59	NC_019779	CGATGG	2	12	94748	94759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428774753
60	NC_019779	CCTGAA	4	24	97320	97343	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428774753
61	NC_019779	TTGGTG	2	12	98830	98841	0 %	50 %	50 %	0 %	428774754
62	NC_019779	GCACCA	2	12	98890	98901	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428774754
63	NC_019779	CCGAAC	2	12	99277	99288	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428774754
64	NC_019779	AATAAA	2	12	102130	102141	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	428774756
65	NC_019779	CTGCTT	2	12	103968	103979	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428774758
66	NC_019779	TTTCTT	2	12	104501	104512	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428774759
67	NC_019779	ATCGCG	2	12	108041	108052	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428774763
68	NC_019779	TCGGTT	2	12	113587	113598	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428774768
69	NC_019779	GCATGA	2	12	114061	114072	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428774768
70	NC_019779	TAATCA	2	12	114418	114429	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_019779	TGATAT	2	12	114615	114626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428774769
72	NC_019779	TAATTT	2	12	120991	121002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774775
73	NC_019779	GACTTA	2	12	123025	123036	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428774776
74	NC_019779	GGAACA	2	12	124459	124470	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428774778
75	NC_019779	GGTAAA	2	12	130584	130595	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428774783
76	NC_019779	GTGAAA	2	12	130603	130614	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428774783
77	NC_019779	GTGAGA	2	12	134950	134961	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428774787
78	NC_019779	ATTTAT	2	12	136188	136199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774790
79	NC_019779	GAAGCA	2	12	136323	136334	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428774790
80	NC_019779	GGCTGG	2	12	137128	137139	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428774790
81	NC_019779	ATTCCC	2	12	139633	139644	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428774792
82	NC_019779	TGATGT	2	12	145133	145144	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019779	ATCGCG	2	12	146161	146172	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428774796
84	NC_019779	GGAGGC	2	12	149499	149510	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	428774798
85	NC_019779	TGGGGT	2	12	149534	149545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774798
86	NC_019779	CGCAGT	2	12	150890	150901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428774798
87	NC_019779	CTGATG	2	12	151192	151203	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428774798
88	NC_019779	TCCGAA	2	12	155412	155423	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428774804
89	NC_019779	TAGATT	2	12	156673	156684	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019779	GGAAGA	2	12	158231	158242	50 %	0 %	50 %	0 %	428774806
91	NC_019779	TCCTGA	2	12	159580	159591	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428774807
92	NC_019779	ACCGCA	2	12	165823	165834	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428774815
93	NC_019779	AATCAA	2	12	166039	166050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428774816
94	NC_019779	CCCTTT	2	12	167979	167990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019779	AGCAGT	2	12	174839	174850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428774825
96	NC_019779	TGGCTT	2	12	175779	175790	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428774826
97	NC_019779	ACAAGA	2	12	177970	177981	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428774828
98	NC_019779	GCCTGG	2	12	180089	180100	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019779	CGGGTA	2	12	180224	180235	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_019779	TCGCTT	2	12	181117	181128	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019779	AAAACA	2	12	185494	185505	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	428774829
102	NC_019779	ACGAAA	2	12	185607	185618	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428774829
103	NC_019779	CTTTCA	2	12	188605	188616	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019779	TAGTCA	2	12	190474	190485	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019779	CCAACG	2	12	196352	196363	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428774836
106	NC_019779	GAACCA	3	18	199587	199604	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428774839
107	NC_019779	CAACCA	2	12	199605	199616	50 %	0 %	0 %	50 %	428774839
108	NC_019779	CCGAAG	2	12	199794	199805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774839
109	NC_019779	CCCGAA	2	12	199806	199817	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428774839
110	NC_019779	CCGAAG	2	12	199875	199886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774839
111	NC_019779	CCCGAA	2	12	199887	199898	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428774839
112	NC_019779	CAACTT	2	12	200487	200498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774839
113	NC_019779	ATCGCG	2	12	202280	202291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428774841
114	NC_019779	CTCGCA	2	12	204333	204344	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428774841
115	NC_019779	AGAAGG	2	12	206367	206378	50 %	0 %	50 %	0 %	428774844
116	NC_019779	GGAACA	2	12	212026	212037	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428774846
117	NC_019779	CAACTC	2	12	213154	213165	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019779	CCTCTT	2	12	213777	213788	0 %	50 %	0 %	50 %	428774848
119	NC_019779	TCAAAA	2	12	214903	214914	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428774849
120	NC_019779	ATCTAA	2	12	216667	216678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428774852
121	NC_019779	TTCGGT	2	12	218129	218140	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428774855
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123	NC_019779	AACCAC	2	12	219256	219267	50 %	0 %	0 %	50 %	428774857
124	NC_019779	ATCGCG	2	12	222337	222348	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428774860
125	NC_019779	GATCGC	2	12	223377	223388	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428774860
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234	NC_019779	ATCACA	2	12	429501	429512	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428775043
235	NC_019779	TGCTTG	2	12	429873	429884	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428775043
236	NC_019779	CAGAAG	2	12	431339	431350	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428775045
237	NC_019779	ACAATG	2	12	431659	431670	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428775046
238	NC_019779	TCTCCC	2	12	432474	432485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428775046
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241	NC_019779	ATCCGA	2	12	442240	442251	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428775057
242	NC_019779	TTGTAG	2	12	443862	443873	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428775058
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244	NC_019779	CAGTCA	2	12	448424	448435	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428775061
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246	NC_019779	ATCGCG	2	12	450802	450813	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428775065
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251	NC_019779	AAAAAT	2	12	463757	463768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_019779	GCCCAA	2	12	466285	466296	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428775079
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255	NC_019779	GCTGTT	2	12	474117	474128	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_019779	CCTGTA	2	12	478275	478286	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428775086
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259	NC_019779	TTGACC	2	12	483856	483867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428775089
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261	NC_019779	TGTTTG	2	12	485966	485977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_019779	GGCGGA	2	12	487513	487524	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	428775090
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302	NC_019779	TTCCCG	2	12	552938	552949	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428775153
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320	NC_019779	ACCAGA	2	12	609276	609287	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428775212
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331	NC_019779	GCTTCT	2	12	622020	622031	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428775221
332	NC_019779	ATCGCG	2	12	622104	622115	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428775221
333	NC_019779	TAAACT	2	12	623044	623055	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428775221
334	NC_019779	ACCATG	2	12	625903	625914	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
335	NC_019779	AGTGCG	2	12	629488	629499	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428775224
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337	NC_019779	GGTAAC	2	12	630265	630276	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428775224
338	NC_019779	AAAGGT	2	12	634211	634222	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428775225
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340	NC_019779	TGTGGT	2	12	636074	636085	0 %	50 %	50 %	0 %	428775225
341	NC_019779	GATCGC	2	12	636481	636492	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428775225
342	NC_019779	CATCAA	2	12	638077	638088	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428775225
343	NC_019779	ATCAAT	2	12	639401	639412	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428775225
344	NC_019779	TCGCCA	2	12	639441	639452	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428775225
345	NC_019779	GGTCGA	2	12	645098	645109	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428775227
346	NC_019779	ATCGCG	2	12	646303	646314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428775228
347	NC_019779	CCCGAT	2	12	647990	648001	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428775230
348	NC_019779	TTGCCG	2	12	652951	652962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775235
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