MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 2190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019779	TATGG	2	10	294	303	20 %	40 %	40 %	0 %	428774687
2	NC_019779	AATTA	2	10	1345	1354	60 %	40 %	0 %	0 %	428774689
3	NC_019779	AAAAC	2	10	1685	1694	80 %	0 %	0 %	20 %	428774689
4	NC_019779	CCGAG	2	10	1869	1878	20 %	0 %	40 %	40 %	428774689
5	NC_019779	ATTAA	2	10	4646	4655	60 %	40 %	0 %	0 %	428774691
6	NC_019779	AATGT	2	10	8884	8893	40 %	40 %	20 %	0 %	428774693
7	NC_019779	GGTGG	2	10	9802	9811	0 %	20 %	80 %	0 %	428774694
8	NC_019779	TTTCA	2	10	10998	11007	20 %	60 %	0 %	20 %	428774695
9	NC_019779	GAATT	2	10	12868	12877	40 %	40 %	20 %	0 %	428774697
10	NC_019779	TAAAA	3	15	13449	13463	80 %	20 %	0 %	0 %	428774697
11	NC_019779	ATTTT	2	10	15849	15858	20 %	80 %	0 %	0 %	428774699
12	NC_019779	AAATT	2	10	16008	16017	60 %	40 %	0 %	0 %	428774699
13	NC_019779	TAACT	2	10	16244	16253	40 %	40 %	0 %	20 %	428774699
14	NC_019779	CAAAA	2	10	17772	17781	80 %	0 %	0 %	20 %	428774701
15	NC_019779	GAAGA	2	10	21583	21592	60 %	0 %	40 %	0 %	428774703
16	NC_019779	CAAAT	2	10	22123	22132	60 %	20 %	0 %	20 %	428774703
17	NC_019779	AATGT	2	10	22545	22554	40 %	40 %	20 %	0 %	428774703
18	NC_019779	TTGAC	2	10	22768	22777	20 %	40 %	20 %	20 %	428774703
19	NC_019779	ATCAA	2	10	22789	22798	60 %	20 %	0 %	20 %	428774703
20	NC_019779	CAATT	2	10	23182	23191	40 %	40 %	0 %	20 %	428774703
21	NC_019779	AAGGT	2	10	26834	26843	40 %	20 %	40 %	0 %	428774709
22	NC_019779	AATTC	2	10	29036	29045	40 %	40 %	0 %	20 %	428774710
23	NC_019779	TTTCT	2	10	29197	29206	0 %	80 %	0 %	20 %	428774710
24	NC_019779	AGAAA	2	10	31575	31584	80 %	0 %	20 %	0 %	428774711
25	NC_019779	AAAAG	2	10	32480	32489	80 %	0 %	20 %	0 %	428774712
26	NC_019779	AAAAT	2	10	33410	33419	80 %	20 %	0 %	0 %	428774713
27	NC_019779	AACTT	2	10	34055	34064	40 %	40 %	0 %	20 %	428774713
28	NC_019779	TTTAA	2	10	34309	34318	40 %	60 %	0 %	0 %	428774713
29	NC_019779	ATGAA	2	10	34937	34946	60 %	20 %	20 %	0 %	428774713
30	NC_019779	AACAA	2	10	35658	35667	80 %	0 %	0 %	20 %	428774714
31	NC_019779	ATCTT	2	10	36196	36205	20 %	60 %	0 %	20 %	428774714
32	NC_019779	TTATT	2	10	40660	40669	20 %	80 %	0 %	0 %	428774716
33	NC_019779	CGCAC	2	10	40910	40919	20 %	0 %	20 %	60 %	428774716
34	NC_019779	TTTTA	2	10	43031	43040	20 %	80 %	0 %	0 %	428774719
35	NC_019779	TTTGG	2	10	43202	43211	0 %	60 %	40 %	0 %	428774719
36	NC_019779	GAAAG	2	10	43276	43285	60 %	0 %	40 %	0 %	428774719
37	NC_019779	AAGAG	2	10	45446	45455	60 %	0 %	40 %	0 %	428774720
38	NC_019779	TGAAA	2	10	46228	46237	60 %	20 %	20 %	0 %	428774721
39	NC_019779	CCAAA	2	10	51216	51225	60 %	0 %	0 %	40 %	428774725
40	NC_019779	TTATT	2	10	53121	53130	20 %	80 %	0 %	0 %	428774727
41	NC_019779	AACGT	2	10	53393	53402	40 %	20 %	20 %	20 %	428774727
42	NC_019779	GAATT	2	10	58306	58315	40 %	40 %	20 %	0 %	428774731
43	NC_019779	GCTGC	2	10	58684	58693	0 %	20 %	40 %	40 %	428774731
44	NC_019779	ACTGA	2	10	58798	58807	40 %	20 %	20 %	20 %	428774731
45	NC_019779	GGAGA	2	10	59900	59909	40 %	0 %	60 %	0 %	428774733
46	NC_019779	TGCAG	2	10	60739	60748	20 %	20 %	40 %	20 %	428774733
47	NC_019779	GGGGT	2	10	63263	63272	0 %	20 %	80 %	0 %	428774736
48	NC_019779	TGACT	2	10	76044	76053	20 %	40 %	20 %	20 %	428774745
49	NC_019779	TGGAC	2	10	78301	78310	20 %	20 %	40 %	20 %	428774747
50	NC_019779	AGCCA	2	10	84477	84486	40 %	0 %	20 %	40 %	428774748
51	NC_019779	TTTCC	2	10	86400	86409	0 %	60 %	0 %	40 %	428774750
52	NC_019779	TTAAG	2	10	87490	87499	40 %	40 %	20 %	0 %	428774750
53	NC_019779	TCAAC	2	10	87697	87706	40 %	20 %	0 %	40 %	428774751
54	NC_019779	ATTTC	2	10	87877	87886	20 %	60 %	0 %	20 %	428774751
55	NC_019779	TGGGA	2	10	88799	88808	20 %	20 %	60 %	0 %	428774752
56	NC_019779	CTTTA	2	10	95300	95309	20 %	60 %	0 %	20 %	428774753
57	NC_019779	GAATC	2	10	96405	96414	40 %	20 %	20 %	20 %	428774753
58	NC_019779	GAATC	2	10	103448	103457	40 %	20 %	20 %	20 %	428774757
59	NC_019779	ATTTT	2	10	103787	103796	20 %	80 %	0 %	0 %	428774758
60	NC_019779	GATTC	2	10	106851	106860	20 %	40 %	20 %	20 %	428774761
61	NC_019779	TCAAT	2	10	107557	107566	40 %	40 %	0 %	20 %	428774762
62	NC_019779	ATTAG	2	10	107874	107883	40 %	40 %	20 %	0 %	428774762
63	NC_019779	TCTGG	2	10	109168	109177	0 %	40 %	40 %	20 %	428774764
64	NC_019779	GCGTA	2	10	111517	111526	20 %	20 %	40 %	20 %	428774766
65	NC_019779	ATGGC	2	10	111793	111802	20 %	20 %	40 %	20 %	428774767
66	NC_019779	TTTTA	2	10	117277	117286	20 %	80 %	0 %	0 %	428774771
67	NC_019779	CGATC	2	10	118956	118965	20 %	20 %	20 %	40 %	428774773
68	NC_019779	GTGAT	2	10	119432	119441	20 %	40 %	40 %	0 %	428774773
69	NC_019779	TGCTG	2	10	120201	120210	0 %	40 %	40 %	20 %	428774774
70	NC_019779	ATTTA	2	10	120722	120731	40 %	60 %	0 %	0 %	428774774
71	NC_019779	AAGGA	2	10	121854	121863	60 %	0 %	40 %	0 %	428774776
72	NC_019779	AAACT	2	10	128424	128433	60 %	20 %	0 %	20 %	428774781
73	NC_019779	ATTGT	2	10	129776	129785	20 %	60 %	20 %	0 %	428774782
74	NC_019779	GAAAA	2	10	130856	130865	80 %	0 %	20 %	0 %	428774783
75	NC_019779	ACTTT	2	10	131319	131328	20 %	60 %	0 %	20 %	428774783
76	NC_019779	TTTCT	2	10	135247	135256	0 %	80 %	0 %	20 %	428774788
77	NC_019779	CAATA	2	10	138749	138758	60 %	20 %	0 %	20 %	428774792
78	NC_019779	AAAAC	2	10	150575	150584	80 %	0 %	0 %	20 %	428774798
79	NC_019779	AACCA	2	10	154288	154297	60 %	0 %	0 %	40 %	428774803
80	NC_019779	CAAAG	2	10	154320	154329	60 %	0 %	20 %	20 %	428774803
81	NC_019779	TTGGA	2	10	154602	154611	20 %	40 %	40 %	0 %	428774803
82	NC_019779	AGTCG	2	10	155001	155010	20 %	20 %	40 %	20 %	428774803
83	NC_019779	CTTTC	2	10	158036	158045	0 %	60 %	0 %	40 %	428774805
84	NC_019779	GGTGA	2	10	159431	159440	20 %	20 %	60 %	0 %	428774807
85	NC_019779	GAAGT	2	10	160980	160989	40 %	20 %	40 %	0 %	428774807
86	NC_019779	GAGTT	2	10	161822	161831	20 %	40 %	40 %	0 %	428774808
87	NC_019779	ATTTT	2	10	162182	162191	20 %	80 %	0 %	0 %	428774810
88	NC_019779	TCAAA	2	10	165159	165168	60 %	20 %	0 %	20 %	428774814
89	NC_019779	ATGGC	2	10	168185	168194	20 %	20 %	40 %	20 %	428774819
90	NC_019779	TCTGT	2	10	170496	170505	0 %	60 %	20 %	20 %	428774820
91	NC_019779	CCCGT	2	10	171243	171252	0 %	20 %	20 %	60 %	428774820
92	NC_019779	CGCCA	2	10	172809	172818	20 %	0 %	20 %	60 %	428774821
93	NC_019779	TCCTC	2	10	172882	172891	0 %	40 %	0 %	60 %	428774821
94	NC_019779	CGCCT	2	10	173198	173207	0 %	20 %	20 %	60 %	428774822
95	NC_019779	GAGTC	2	10	173302	173311	20 %	20 %	40 %	20 %	428774822
96	NC_019779	CGATC	2	10	173410	173419	20 %	20 %	20 %	40 %	428774822
97	NC_019779	AAAGA	2	10	177390	177399	80 %	0 %	20 %	0 %	428774828
98	NC_019779	TTTTA	2	10	192524	192533	20 %	80 %	0 %	0 %	428774833
99	NC_019779	ATATC	2	10	192836	192845	40 %	40 %	0 %	20 %	428774833
100	NC_019779	CCAAG	2	10	196610	196619	40 %	0 %	20 %	40 %	428774836
101	NC_019779	CGAGA	2	10	199995	200004	40 %	0 %	40 %	20 %	428774839
102	NC_019779	CCCGA	2	10	203508	203517	20 %	0 %	20 %	60 %	428774841
103	NC_019779	TTTAA	2	10	203888	203897	40 %	60 %	0 %	0 %	428774841
104	NC_019779	TGAAT	2	10	207232	207241	40 %	40 %	20 %	0 %	428774844
105	NC_019779	GATTT	2	10	215785	215794	20 %	60 %	20 %	0 %	428774851
106	NC_019779	GAATT	2	10	222011	222020	40 %	40 %	20 %	0 %	428774860
107	NC_019779	CGGCT	2	10	228836	228845	0 %	20 %	40 %	40 %	428774867
108	NC_019779	TGAGT	2	10	229232	229241	20 %	40 %	40 %	0 %	428774867
109	NC_019779	TCCCA	2	10	230595	230604	20 %	20 %	0 %	60 %	428774867
110	NC_019779	AGCCA	2	10	238755	238764	40 %	0 %	20 %	40 %	428774872
111	NC_019779	CGGGA	2	10	238808	238817	20 %	0 %	60 %	20 %	428774872
112	NC_019779	CTTTC	2	10	238902	238911	0 %	60 %	0 %	40 %	428774872
113	NC_019779	ATAAA	2	10	240612	240621	80 %	20 %	0 %	0 %	428774873
114	NC_019779	ATCAA	2	10	244397	244406	60 %	20 %	0 %	20 %	428774877
115	NC_019779	TTTTA	2	10	247077	247086	20 %	80 %	0 %	0 %	428774879
116	NC_019779	GATCA	2	10	247598	247607	40 %	20 %	20 %	20 %	428774880
117	NC_019779	GAAGG	2	10	248946	248955	40 %	0 %	60 %	0 %	428774881
118	NC_019779	CTTGG	2	10	250346	250355	0 %	40 %	40 %	20 %	428774882
119	NC_019779	GATCC	2	10	258169	258178	20 %	20 %	20 %	40 %	428774889
120	NC_019779	CTCAA	2	10	259800	259809	40 %	20 %	0 %	40 %	428774892
121	NC_019779	GAAGA	2	10	260485	260494	60 %	0 %	40 %	0 %	428774892
122	NC_019779	TTAAC	2	10	261260	261269	40 %	40 %	0 %	20 %	428774892
123	NC_019779	GGAAC	2	10	261868	261877	40 %	0 %	40 %	20 %	428774892
124	NC_019779	TCCCC	2	10	263955	263964	0 %	20 %	0 %	80 %	428774895
125	NC_019779	ACCCC	2	10	263968	263977	20 %	0 %	0 %	80 %	428774895
126	NC_019779	CATGG	2	10	265005	265014	20 %	20 %	40 %	20 %	428774896
127	NC_019779	GCGTT	2	10	267244	267253	0 %	40 %	40 %	20 %	428774899
128	NC_019779	AGGCT	2	10	268430	268439	20 %	20 %	40 %	20 %	428774901
129	NC_019779	AACCG	2	10	270458	270467	40 %	0 %	20 %	40 %	428774902
130	NC_019779	TTTCT	2	10	270914	270923	0 %	80 %	0 %	20 %	428774902
131	NC_019779	AGCAG	2	10	280718	280727	40 %	0 %	40 %	20 %	428774908
132	NC_019779	CTGTG	2	10	281247	281256	0 %	40 %	40 %	20 %	428774909
133	NC_019779	GATCG	2	10	282422	282431	20 %	20 %	40 %	20 %	428774910
134	NC_019779	TGGAA	2	10	284325	284334	40 %	20 %	40 %	0 %	428774911
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