MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 55377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019779	TAT	2	6	25	30	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019779	TGG	2	6	215	220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774687
3	NC_019779	GGA	2	6	327	332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428774687
4	NC_019779	TCT	2	6	360	365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774688
5	NC_019779	CTG	2	6	379	384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774688
6	NC_019779	GTG	2	6	459	464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774688
7	NC_019779	TAT	2	6	674	679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774688
8	NC_019779	GCT	2	6	722	727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774688
9	NC_019779	CGA	2	6	944	949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774689
10	NC_019779	TGC	2	6	979	984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774689
11	NC_019779	AAT	2	6	1045	1050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774689
12	NC_019779	ATA	2	6	1090	1095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774689
13	NC_019779	AGA	2	6	1228	1233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774689
14	NC_019779	AGA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774689
15	NC_019779	TTG	2	6	1387	1392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774689
16	NC_019779	TCG	2	6	1426	1431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774689
17	NC_019779	AAC	2	6	1474	1479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774689
18	NC_019779	TCT	2	6	1484	1489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774689
19	NC_019779	TCT	2	6	1514	1519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774689
20	NC_019779	AAT	2	6	1540	1545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774689
21	NC_019779	TAT	2	6	1602	1607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774689
22	NC_019779	TTC	2	6	1651	1656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774689
23	NC_019779	TAA	2	6	1666	1671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774689
24	NC_019779	TCT	2	6	1718	1723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774689
25	NC_019779	AAT	3	9	1750	1758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774689
26	NC_019779	TCT	2	6	1775	1780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774689
27	NC_019779	TCT	2	6	1811	1816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774689
28	NC_019779	AAT	2	6	1917	1922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774689
29	NC_019779	GCA	2	6	2003	2008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774689
30	NC_019779	TCT	2	6	2009	2014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774689
31	NC_019779	TCT	2	6	2072	2077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774689
32	NC_019779	TCA	2	6	2143	2148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019779	AAT	2	6	2152	2157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774690
34	NC_019779	GCA	2	6	2182	2187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774690
35	NC_019779	AAT	2	6	2267	2272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774690
36	NC_019779	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774690
37	NC_019779	GAA	2	6	2423	2428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774690
38	NC_019779	GTG	2	6	2440	2445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774690
39	NC_019779	TGT	2	6	2533	2538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774690
40	NC_019779	AAT	2	6	2546	2551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774690
41	NC_019779	TTA	2	6	2651	2656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774690
42	NC_019779	ACA	2	6	2767	2772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774690
43	NC_019779	AAG	2	6	2850	2855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774690
44	NC_019779	GTT	2	6	2940	2945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774690
45	NC_019779	TTC	2	6	3024	3029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774690
46	NC_019779	ATC	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774690
47	NC_019779	TTG	2	6	3072	3077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774690
48	NC_019779	GTT	2	6	3248	3253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774690
49	NC_019779	ACA	2	6	3407	3412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774690
50	NC_019779	GTT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774690
51	NC_019779	TCT	2	6	3656	3661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774691
52	NC_019779	CTA	2	6	3738	3743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774691
53	NC_019779	AAT	2	6	3833	3838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774691
54	NC_019779	TGA	2	6	3893	3898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774691
55	NC_019779	TTC	2	6	4006	4011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774691
56	NC_019779	CCT	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428774691
57	NC_019779	TTG	2	6	4132	4137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774691
58	NC_019779	CGT	2	6	4147	4152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774691
59	NC_019779	TGT	2	6	4153	4158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774691
60	NC_019779	TTG	2	6	4186	4191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774691
61	NC_019779	AGT	2	6	4205	4210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774691
62	NC_019779	CTT	2	6	4234	4239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774691
63	NC_019779	TGA	2	6	4371	4376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774691
64	NC_019779	TTC	2	6	4387	4392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774691
65	NC_019779	TCA	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774691
66	NC_019779	TGC	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774691
67	NC_019779	AAT	2	6	4431	4436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774691
68	NC_019779	ATG	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774691
69	NC_019779	ATC	2	6	4579	4584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774691
70	NC_019779	TGT	2	6	4601	4606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774691
71	NC_019779	GTC	2	6	4786	4791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019779	AAC	2	6	4876	4881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019779	GAA	2	6	4900	4905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019779	GAA	2	6	4914	4919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019779	AAT	2	6	4981	4986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019779	TGA	2	6	4993	4998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019779	GAA	2	6	5031	5036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019779	TAC	2	6	5159	5164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774692
79	NC_019779	AGA	3	9	5250	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774692
80	NC_019779	AAC	2	6	5357	5362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774692
81	NC_019779	TGG	2	6	5419	5424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774692
82	NC_019779	CAG	2	6	5459	5464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774692
83	NC_019779	CAG	2	6	5512	5517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774692
84	NC_019779	TGG	2	6	5642	5647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774692
85	NC_019779	TGG	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774692
86	NC_019779	GAA	2	6	5665	5670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774692
87	NC_019779	TGG	2	6	5757	5762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774692
88	NC_019779	TGC	2	6	6096	6101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774692
89	NC_019779	GAC	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774692
90	NC_019779	AGC	2	6	6273	6278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774692
91	NC_019779	TTA	2	6	6324	6329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774692
92	NC_019779	ATC	2	6	6363	6368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774692
93	NC_019779	TTG	2	6	6481	6486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774693
94	NC_019779	AAT	2	6	6583	6588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774693
95	NC_019779	TCA	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774693
96	NC_019779	AAT	2	6	7021	7026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774693
97	NC_019779	GAC	2	6	7164	7169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774693
98	NC_019779	AAT	2	6	7170	7175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774693
99	NC_019779	ATA	2	6	7450	7455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774693
100	NC_019779	TGG	2	6	7678	7683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774693
101	NC_019779	TTG	2	6	7720	7725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774693
102	NC_019779	ACC	2	6	7950	7955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428774693
103	NC_019779	TCC	2	6	7969	7974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428774693
104	NC_019779	AGC	2	6	8006	8011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774693
105	NC_019779	TTG	2	6	8068	8073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774693
106	NC_019779	AAT	2	6	8085	8090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774693
107	NC_019779	TTC	2	6	8146	8151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774693
108	NC_019779	TGG	2	6	8379	8384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774693
109	NC_019779	GGA	2	6	8385	8390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428774693
110	NC_019779	GTG	2	6	8453	8458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774693
111	NC_019779	ATT	2	6	8533	8538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428774693
112	NC_019779	CTT	2	6	8559	8564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774693
113	NC_019779	GAG	2	6	8584	8589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428774693
114	NC_019779	CCA	2	6	8607	8612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428774693
115	NC_019779	GCT	3	9	8624	8632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428774693
116	NC_019779	ATG	2	6	8713	8718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774693
117	NC_019779	AAG	2	6	8816	8821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774693
118	NC_019779	ACA	2	6	8847	8852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774693
119	NC_019779	CAT	2	6	8896	8901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428774693
120	NC_019779	GTT	2	6	9285	9290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019779	TAG	2	6	9343	9348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019779	ATA	2	6	9354	9359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019779	TGG	2	6	9377	9382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019779	GCA	2	6	9585	9590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428774694
125	NC_019779	AGA	2	6	9596	9601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774694
126	NC_019779	TGT	2	6	9634	9639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428774694
127	NC_019779	AAT	2	6	9762	9767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428774694
128	NC_019779	CTT	2	6	9769	9774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428774694
129	NC_019779	ACA	2	6	9794	9799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428774694
130	NC_019779	AGA	2	6	9863	9868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428774694
131	NC_019779	TGA	2	6	10025	10030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428774694
132	NC_019779	GTG	2	6	10048	10053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428774694
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