MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Cyanobacterium stanieri PCC 7202 chromosome

Total Repeats: 1551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019778	ATTTGT	2	12	632	643	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428771849
2	NC_019778	GAATTA	2	12	3146	3157	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428771852
3	NC_019778	ATAAGA	2	12	9962	9973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428771857
4	NC_019778	TCTGCT	2	12	10147	10158	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428771857
5	NC_019778	AGTTAC	2	12	11051	11062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019778	CATCAC	2	12	24446	24457	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428771868
7	NC_019778	CTTTTT	2	12	25229	25240	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428771869
8	NC_019778	TCGCCA	2	12	27656	27667	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428771871
9	NC_019778	ATTAGA	2	12	32280	32291	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428771873
10	NC_019778	AGGATT	2	12	32655	32666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771873
11	NC_019778	TAAATA	2	12	34143	34154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019778	GGCTTA	2	12	34421	34432	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428771875
13	NC_019778	CCCATG	2	12	36251	36262	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428771877
14	NC_019778	GTTGAT	2	12	39826	39837	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019778	CAAAAC	2	12	41188	41199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771881
16	NC_019778	ATTAAT	2	12	42148	42159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019778	CTCCGA	2	12	42791	42802	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428771883
18	NC_019778	TATCCG	2	12	48674	48685	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428771887
19	NC_019778	AACTCT	2	12	49214	49225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019778	CCTTTT	2	12	49318	49329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019778	TTCAAC	2	12	50411	50422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771888
22	NC_019778	GTTTTT	2	12	54094	54105	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	428771893
23	NC_019778	ATTAAT	2	12	54730	54741	50 %	50 %	0 %	0 %	428771893
24	NC_019778	TCCATC	2	12	59221	59232	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428771897
25	NC_019778	GTTGAT	2	12	61439	61450	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019778	CACCGA	2	12	61504	61515	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428771900
27	NC_019778	AATTGA	2	12	63235	63246	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428771901
28	NC_019778	ATTTAA	2	12	63940	63951	50 %	50 %	0 %	0 %	428771902
29	NC_019778	GCGATC	2	12	64975	64986	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428771903
30	NC_019778	ACATCA	2	12	66068	66079	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428771903
31	NC_019778	ACAAAA	2	12	68126	68137	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	428771905
32	NC_019778	TGGCAA	2	12	73467	73478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428771908
33	NC_019778	TCCATG	2	12	78500	78511	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428771911
34	NC_019778	TTGATT	2	12	80880	80891	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428771912
35	NC_019778	TATAAA	2	12	82139	82150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019778	TTTATG	2	12	83557	83568	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428771915
37	NC_019778	GGATTA	2	12	83892	83903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771915
38	NC_019778	TGGATG	2	12	89517	89528	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428771920
39	NC_019778	CAAAAA	2	12	90191	90202	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	428771920
40	NC_019778	AAAGTC	2	12	92261	92272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428771922
41	NC_019778	TAATAC	2	12	97331	97342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428771928
42	NC_019778	AATAGA	2	12	97638	97649	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428771928
43	NC_019778	GTGATG	2	12	99179	99190	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428771930
44	NC_019778	TAAGAA	2	12	100361	100372	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019778	AGGATT	2	12	102590	102601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771931
46	NC_019778	GTTACC	2	12	104589	104600	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428771934
47	NC_019778	AAATAG	2	12	105119	105130	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019778	ATGCCA	2	12	106290	106301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428771936
49	NC_019778	ATGGCG	2	12	107394	107405	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428771936
50	NC_019778	AATGAT	2	12	112905	112916	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428771944
51	NC_019778	CTTTAC	2	12	113900	113911	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428771945
52	NC_019778	TCAGCC	2	12	117099	117110	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428771948
53	NC_019778	TTTAAT	2	12	117603	117614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019778	TAATAT	2	12	120230	120241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019778	TCGATG	2	12	121849	121860	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428771954
56	NC_019778	TCCTGT	2	12	122214	122225	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428771954
57	NC_019778	AAAAGC	2	12	126274	126285	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019778	AAGGTA	2	12	132486	132497	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428771967
59	NC_019778	CATCAC	2	12	138880	138891	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428771972
60	NC_019778	ACTACC	2	12	138963	138974	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428771972
61	NC_019778	TCGATT	2	12	139203	139214	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428771972
62	NC_019778	TCCCTT	2	12	141049	141060	0 %	50 %	0 %	50 %	428771974
63	NC_019778	CTTTTA	2	12	141468	141479	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428771974
64	NC_019778	AATCTC	2	12	142964	142975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771977
65	NC_019778	TAAATC	2	12	145884	145895	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428771981
66	NC_019778	GGCAGG	2	12	147734	147745	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	428771982
67	NC_019778	GGCTGT	2	12	147746	147757	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428771982
68	NC_019778	ATTTTA	2	12	147807	147818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771982
69	NC_019778	TGAGAG	2	12	148475	148486	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428771983
70	NC_019778	ATTAAA	2	12	149970	149981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019778	CTTTAT	2	12	151949	151960	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019778	AAAATC	2	12	152341	152352	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428771988
73	NC_019778	GTAGCC	2	12	152730	152741	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428771988
74	NC_019778	AGGGCA	2	12	163340	163351	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428771993
75	NC_019778	ATGAGG	2	12	164130	164141	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428771993
76	NC_019778	CTGCCC	2	12	169932	169943	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	428772000
77	NC_019778	CCTAAT	2	12	170426	170437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428772001
78	NC_019778	CTTGAG	2	12	178343	178354	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428772010
79	NC_019778	TATCAA	2	12	181547	181558	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019778	CCATCC	2	12	182483	182494	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428772016
81	NC_019778	GAAGTA	2	12	186667	186678	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428772019
82	NC_019778	AATCAA	2	12	189210	189221	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428772022
83	NC_019778	ATCATG	2	12	189713	189724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428772023
84	NC_019778	AAATTA	2	12	192175	192186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428772027
85	NC_019778	GGTTTT	2	12	194419	194430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019778	CTTGGG	2	12	198219	198230	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428772032
87	NC_019778	GGGCAG	2	12	198321	198332	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	428772032
88	NC_019778	GATAAT	2	12	198493	198504	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428772032
89	NC_019778	ATTAAT	2	12	200643	200654	50 %	50 %	0 %	0 %	428772033
90	NC_019778	ACCTGA	2	12	201677	201688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428772033
91	NC_019778	GAACCG	2	12	201705	201716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428772033
92	NC_019778	GAACCT	2	12	201717	201728	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428772033
93	NC_019778	GAGCCT	2	12	201729	201740	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428772033
94	NC_019778	GAACCT	2	12	201747	201758	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428772033
95	NC_019778	GAGCCT	2	12	201759	201770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428772033
96	NC_019778	GAACCC	2	12	201771	201782	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428772033
97	NC_019778	GAACCG	2	12	201795	201806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428772033
98	NC_019778	TGATCC	2	12	201881	201892	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428772033
99	NC_019778	TAATGA	2	12	202529	202540	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428772033
100	NC_019778	TTGGCT	2	12	204698	204709	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428772034
101	NC_019778	ATTTCA	2	12	208188	208199	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428772037
102	NC_019778	TATCCA	2	12	208291	208302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428772037
103	NC_019778	AATCGT	2	12	208462	208473	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428772037
104	NC_019778	CAGACT	2	12	210590	210601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428772041
105	NC_019778	AGACGA	2	12	210929	210940	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428772041
106	NC_019778	GTTTCT	2	12	213327	213338	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428772044
107	NC_019778	CAGGTT	2	12	213517	213528	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428772044
108	NC_019778	TAAATA	2	12	214853	214864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019778	TTAATT	2	12	224154	224165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019778	TAGTAA	2	12	227837	227848	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019778	TACCAT	2	12	232925	232936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428772062
112	NC_019778	AACAAA	2	12	236235	236246	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_019778	GATGTA	2	12	245220	245231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428772075
114	NC_019778	GGTTAG	2	12	246802	246813	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428772076
115	NC_019778	GGGTAA	2	12	247303	247314	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428772077
116	NC_019778	ATGGTG	2	12	247974	247985	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428772077
117	NC_019778	CCCATT	2	12	248741	248752	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428772078
118	NC_019778	TTACCT	2	12	253310	253321	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428772082
119	NC_019778	TGGTTC	2	12	253741	253752	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428772083
120	NC_019778	TCAAGA	2	12	255003	255014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428772084
121	NC_019778	AAAAGA	2	12	257007	257018	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428772084
122	NC_019778	AACCTA	2	12	259211	259222	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428772085
123	NC_019778	GTCTTC	2	12	261188	261199	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428772087
124	NC_019778	GTGAAT	2	12	261394	261405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428772087
125	NC_019778	CTTTGA	2	12	265614	265625	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428772090
126	NC_019778	TTTACC	2	12	267132	267143	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428772092
127	NC_019778	ATTAAT	2	12	269416	269427	50 %	50 %	0 %	0 %	428772094
128	NC_019778	AAACTT	2	12	270769	270780	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_019778	AGCCCA	2	12	270878	270889	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428772096
130	NC_019778	CGGGTA	2	12	271132	271143	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428772096
131	NC_019778	TGTTGG	2	12	274997	275008	0 %	50 %	50 %	0 %	428772100
132	NC_019778	AGCTTG	2	12	278377	278388	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428772102
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137	NC_019778	AGATTA	2	12	285336	285347	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428772112
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140	NC_019778	CTTTCC	2	12	297251	297262	0 %	50 %	0 %	50 %	428772121
141	NC_019778	AATTAG	2	12	298618	298629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428772122
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149	NC_019778	GTCATT	2	12	324572	324583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428772137
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151	NC_019778	TGCCAT	2	12	325568	325579	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428772138
152	NC_019778	TTGACA	2	12	325965	325976	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428772139
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189	NC_019778	CATCAG	2	12	389204	389215	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428772188
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223	NC_019778	TGGTTT	2	12	453129	453140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428772243
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227	NC_019778	TAAAAA	2	12	457617	457628	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	428772248
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229	NC_019778	AAAAAG	2	12	462432	462443	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428772251
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232	NC_019778	TTTGTT	2	12	470326	470337	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	428772257
233	NC_019778	TAATTC	2	12	470961	470972	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428772258
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346	NC_019778	ATCCTC	2	12	674682	674693	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428772435
347	NC_019778	GTAATA	2	12	675473	675484	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428772435
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350	NC_019778	TTTTGG	2	12	683514	683525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428772445
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