MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Cyanobacterium stanieri PCC 7202 chromosome

Total Repeats: 1385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019778	ATTTGT	2	12	632	643	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428771849
2	NC_019778	GAATTA	2	12	3146	3157	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428771852
3	NC_019778	ATAAGA	2	12	9962	9973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428771857
4	NC_019778	TCTGCT	2	12	10147	10158	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428771857
5	NC_019778	CATCAC	2	12	24446	24457	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428771868
6	NC_019778	CTTTTT	2	12	25229	25240	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428771869
7	NC_019778	TCGCCA	2	12	27656	27667	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428771871
8	NC_019778	ATTAGA	2	12	32280	32291	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428771873
9	NC_019778	AGGATT	2	12	32655	32666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771873
10	NC_019778	GGCTTA	2	12	34421	34432	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428771875
11	NC_019778	CCCATG	2	12	36251	36262	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428771877
12	NC_019778	CAAAAC	2	12	41188	41199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771881
13	NC_019778	CTCCGA	2	12	42791	42802	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428771883
14	NC_019778	TATCCG	2	12	48674	48685	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428771887
15	NC_019778	TTCAAC	2	12	50411	50422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771888
16	NC_019778	GTTTTT	2	12	54094	54105	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	428771893
17	NC_019778	ATTAAT	2	12	54730	54741	50 %	50 %	0 %	0 %	428771893
18	NC_019778	TCCATC	2	12	59221	59232	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428771897
19	NC_019778	CACCGA	2	12	61504	61515	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428771900
20	NC_019778	AATTGA	2	12	63235	63246	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428771901
21	NC_019778	ATTTAA	2	12	63940	63951	50 %	50 %	0 %	0 %	428771902
22	NC_019778	GCGATC	2	12	64975	64986	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428771903
23	NC_019778	ACATCA	2	12	66068	66079	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428771903
24	NC_019778	ACAAAA	2	12	68126	68137	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	428771905
25	NC_019778	TGGCAA	2	12	73467	73478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428771908
26	NC_019778	TCCATG	2	12	78500	78511	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428771911
27	NC_019778	TTGATT	2	12	80880	80891	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428771912
28	NC_019778	TTTATG	2	12	83557	83568	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428771915
29	NC_019778	GGATTA	2	12	83892	83903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771915
30	NC_019778	TGGATG	2	12	89517	89528	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428771920
31	NC_019778	CAAAAA	2	12	90191	90202	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	428771920
32	NC_019778	AAAGTC	2	12	92261	92272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428771922
33	NC_019778	TAATAC	2	12	97331	97342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428771928
34	NC_019778	AATAGA	2	12	97638	97649	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428771928
35	NC_019778	GTGATG	2	12	99179	99190	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428771930
36	NC_019778	AGGATT	2	12	102590	102601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771931
37	NC_019778	GTTACC	2	12	104589	104600	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428771934
38	NC_019778	ATGCCA	2	12	106290	106301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428771936
39	NC_019778	ATGGCG	2	12	107394	107405	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428771936
40	NC_019778	AATGAT	2	12	112905	112916	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428771944
41	NC_019778	CTTTAC	2	12	113900	113911	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428771945
42	NC_019778	TCAGCC	2	12	117099	117110	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428771948
43	NC_019778	TCGATG	2	12	121849	121860	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428771954
44	NC_019778	TCCTGT	2	12	122214	122225	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428771954
45	NC_019778	AAGGTA	2	12	132486	132497	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428771967
46	NC_019778	CATCAC	2	12	138880	138891	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428771972
47	NC_019778	ACTACC	2	12	138963	138974	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428771972
48	NC_019778	TCGATT	2	12	139203	139214	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428771972
49	NC_019778	TCCCTT	2	12	141049	141060	0 %	50 %	0 %	50 %	428771974
50	NC_019778	CTTTTA	2	12	141468	141479	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428771974
51	NC_019778	AATCTC	2	12	142964	142975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771977
52	NC_019778	TAAATC	2	12	145884	145895	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428771981
53	NC_019778	GGCAGG	2	12	147734	147745	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	428771982
54	NC_019778	GGCTGT	2	12	147746	147757	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428771982
55	NC_019778	ATTTTA	2	12	147807	147818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771982
56	NC_019778	TGAGAG	2	12	148475	148486	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428771983
57	NC_019778	AAAATC	2	12	152341	152352	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428771988
58	NC_019778	GTAGCC	2	12	152730	152741	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428771988
59	NC_019778	AGGGCA	2	12	163340	163351	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428771993
60	NC_019778	ATGAGG	2	12	164130	164141	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428771993
61	NC_019778	CTGCCC	2	12	169932	169943	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	428772000
62	NC_019778	CCTAAT	2	12	170426	170437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428772001
63	NC_019778	CTTGAG	2	12	178343	178354	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428772010
64	NC_019778	CCATCC	2	12	182483	182494	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428772016
65	NC_019778	GAAGTA	2	12	186667	186678	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428772019
66	NC_019778	AATCAA	2	12	189210	189221	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428772022
67	NC_019778	ATCATG	2	12	189713	189724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428772023
68	NC_019778	AAATTA	2	12	192175	192186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428772027
69	NC_019778	CTTGGG	2	12	198219	198230	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428772032
70	NC_019778	GGGCAG	2	12	198321	198332	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	428772032
71	NC_019778	GATAAT	2	12	198493	198504	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428772032
72	NC_019778	ATTAAT	2	12	200643	200654	50 %	50 %	0 %	0 %	428772033
73	NC_019778	ACCTGA	2	12	201677	201688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428772033
74	NC_019778	GAACCG	2	12	201705	201716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428772033
75	NC_019778	GAACCT	2	12	201717	201728	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428772033
76	NC_019778	GAGCCT	2	12	201729	201740	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428772033
77	NC_019778	GAACCT	2	12	201747	201758	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428772033
78	NC_019778	GAGCCT	2	12	201759	201770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428772033
79	NC_019778	GAACCC	2	12	201771	201782	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428772033
80	NC_019778	GAACCG	2	12	201795	201806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428772033
81	NC_019778	TGATCC	2	12	201881	201892	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428772033
82	NC_019778	TAATGA	2	12	202529	202540	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428772033
83	NC_019778	TTGGCT	2	12	204698	204709	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428772034
84	NC_019778	ATTTCA	2	12	208188	208199	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428772037
85	NC_019778	TATCCA	2	12	208291	208302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428772037
86	NC_019778	AATCGT	2	12	208462	208473	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428772037
87	NC_019778	CAGACT	2	12	210590	210601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428772041
88	NC_019778	AGACGA	2	12	210929	210940	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428772041
89	NC_019778	GTTTCT	2	12	213327	213338	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428772044
90	NC_019778	CAGGTT	2	12	213517	213528	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428772044
91	NC_019778	TACCAT	2	12	232925	232936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428772062
92	NC_019778	GATGTA	2	12	245220	245231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428772075
93	NC_019778	GGTTAG	2	12	246802	246813	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428772076
94	NC_019778	GGGTAA	2	12	247303	247314	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428772077
95	NC_019778	ATGGTG	2	12	247974	247985	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428772077
96	NC_019778	CCCATT	2	12	248741	248752	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428772078
97	NC_019778	TTACCT	2	12	253310	253321	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428772082
98	NC_019778	TGGTTC	2	12	253741	253752	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428772083
99	NC_019778	TCAAGA	2	12	255003	255014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428772084
100	NC_019778	AAAAGA	2	12	257007	257018	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428772084
101	NC_019778	AACCTA	2	12	259211	259222	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428772085
102	NC_019778	GTCTTC	2	12	261188	261199	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428772087
103	NC_019778	GTGAAT	2	12	261394	261405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428772087
104	NC_019778	CTTTGA	2	12	265614	265625	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428772090
105	NC_019778	TTTACC	2	12	267132	267143	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428772092
106	NC_019778	ATTAAT	2	12	269416	269427	50 %	50 %	0 %	0 %	428772094
107	NC_019778	AGCCCA	2	12	270878	270889	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428772096
108	NC_019778	CGGGTA	2	12	271132	271143	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428772096
109	NC_019778	TGTTGG	2	12	274997	275008	0 %	50 %	50 %	0 %	428772100
110	NC_019778	AGCTTG	2	12	278377	278388	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428772102
111	NC_019778	GCCAAA	2	12	279614	279625	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428772103
112	NC_019778	AATCTA	2	12	281448	281459	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428772106
113	NC_019778	GGTAAA	2	12	282761	282772	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428772109
114	NC_019778	GATTAA	2	12	283327	283338	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428772109
115	NC_019778	AGATTA	2	12	285336	285347	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428772112
116	NC_019778	TTGGGG	2	12	286290	286301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428772113
117	NC_019778	TTTACT	2	12	291902	291913	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428772117
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344	NC_019778	CTTGGG	2	12	764574	764585	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428772514
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347	NC_019778	CATCTC	2	12	774644	774655	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428772525
348	NC_019778	GAGGTT	2	12	775324	775335	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428772527
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