MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanobacterium stanieri PCC 7202 chromosome

Total Repeats: 2400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019778	AAGAT	2	10	1798	1807	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019778	AGATG	2	10	2331	2340	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019778	TGCTT	2	10	2429	2438	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019778	TTTTA	2	10	5086	5095	20 %	80 %	0 %	0 %	428771853
5	NC_019778	ATCTT	2	10	8787	8796	20 %	60 %	0 %	20 %	428771856
6	NC_019778	GGTTT	2	10	9848	9857	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019778	AGAAA	2	10	11625	11634	80 %	0 %	20 %	0 %	428771858
8	NC_019778	TTTAA	2	10	13906	13915	40 %	60 %	0 %	0 %	428771862
9	NC_019778	ATTAA	2	10	14686	14695	60 %	40 %	0 %	0 %	428771862
10	NC_019778	AGATT	2	10	15196	15205	40 %	40 %	20 %	0 %	428771862
11	NC_019778	TTTGA	2	10	16622	16631	20 %	60 %	20 %	0 %	428771863
12	NC_019778	TTTTG	2	10	17144	17153	0 %	80 %	20 %	0 %	428771864
13	NC_019778	GCCCT	2	10	18419	18428	0 %	20 %	20 %	60 %	428771864
14	NC_019778	TTTTC	2	10	18766	18775	0 %	80 %	0 %	20 %	428771864
15	NC_019778	TAAAA	2	10	19154	19163	80 %	20 %	0 %	0 %	428771864
16	NC_019778	TGTTT	2	10	20389	20398	0 %	80 %	20 %	0 %	428771866
17	NC_019778	GTTTT	2	10	21452	21461	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019778	TAAAT	2	10	23305	23314	60 %	40 %	0 %	0 %	428771868
19	NC_019778	AGTTT	2	10	23830	23839	20 %	60 %	20 %	0 %	428771868
20	NC_019778	TAACT	2	10	24039	24048	40 %	40 %	0 %	20 %	428771868
21	NC_019778	CTTTC	2	10	24397	24406	0 %	60 %	0 %	40 %	428771868
22	NC_019778	TGGGG	2	10	25579	25588	0 %	20 %	80 %	0 %	428771870
23	NC_019778	GATTT	2	10	26020	26029	20 %	60 %	20 %	0 %	428771870
24	NC_019778	ATTCT	2	10	26728	26737	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019778	TGGGA	2	10	27056	27065	20 %	20 %	60 %	0 %	428771871
26	NC_019778	GTATT	2	10	27116	27125	20 %	60 %	20 %	0 %	428771871
27	NC_019778	ACCAT	2	10	30275	30284	40 %	20 %	0 %	40 %	428771873
28	NC_019778	AAACA	2	10	31874	31883	80 %	0 %	0 %	20 %	428771873
29	NC_019778	CATAT	2	10	32378	32387	40 %	40 %	0 %	20 %	428771873
30	NC_019778	AAAAT	2	10	33261	33270	80 %	20 %	0 %	0 %	428771873
31	NC_019778	AAATT	2	10	34884	34893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019778	ATTTA	2	10	40182	40191	40 %	60 %	0 %	0 %	428771880
33	NC_019778	GTGAA	2	10	41323	41332	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019778	TTACT	2	10	43942	43951	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019778	TAAGT	2	10	44415	44424	40 %	40 %	20 %	0 %	428771885
36	NC_019778	CTGCC	2	10	46930	46939	0 %	20 %	20 %	60 %	428771886
37	NC_019778	TTTGT	2	10	47419	47428	0 %	80 %	20 %	0 %	428771886
38	NC_019778	AATAG	2	10	47665	47674	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019778	ACTTT	2	10	49430	49439	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019778	GAAAA	2	10	51193	51202	80 %	0 %	20 %	0 %	428771889
41	NC_019778	ATTTT	2	10	51253	51262	20 %	80 %	0 %	0 %	428771889
42	NC_019778	ATAAA	2	10	53580	53589	80 %	20 %	0 %	0 %	428771892
43	NC_019778	AACTA	2	10	55605	55614	60 %	20 %	0 %	20 %	428771893
44	NC_019778	TACCT	2	10	57050	57059	20 %	40 %	0 %	40 %	428771894
45	NC_019778	TATTT	2	10	57882	57891	20 %	80 %	0 %	0 %	428771895
46	NC_019778	CAAAG	2	10	59290	59299	60 %	0 %	20 %	20 %	428771897
47	NC_019778	CCCCT	2	10	60790	60799	0 %	20 %	0 %	80 %	428771899
48	NC_019778	TGGTA	2	10	61519	61528	20 %	40 %	40 %	0 %	428771900
49	NC_019778	TAATT	2	10	62206	62215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019778	AGCCA	2	10	62343	62352	40 %	0 %	20 %	40 %	428771901
51	NC_019778	TTATT	2	10	62636	62645	20 %	80 %	0 %	0 %	428771901
52	NC_019778	GAATT	2	10	63594	63603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019778	TTCAC	2	10	66374	66383	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_019778	AAAAG	2	10	67312	67321	80 %	0 %	20 %	0 %	428771904
55	NC_019778	AAATT	2	10	67595	67604	60 %	40 %	0 %	0 %	428771905
56	NC_019778	TGATT	2	10	68841	68850	20 %	60 %	20 %	0 %	428771905
57	NC_019778	CCTAG	2	10	69305	69314	20 %	20 %	20 %	40 %	428771906
58	NC_019778	TATTT	2	10	71168	71177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019778	GGGGA	2	10	71959	71968	20 %	0 %	80 %	0 %	428771908
60	NC_019778	TAAAA	2	10	73306	73315	80 %	20 %	0 %	0 %	428771908
61	NC_019778	AAATC	2	10	75231	75240	60 %	20 %	0 %	20 %	428771910
62	NC_019778	AATTT	2	10	75752	75761	40 %	60 %	0 %	0 %	428771910
63	NC_019778	AACCA	2	10	77311	77320	60 %	0 %	0 %	40 %	428771910
64	NC_019778	CCATA	2	10	79526	79535	40 %	20 %	0 %	40 %	428771912
65	NC_019778	AATTA	2	10	80166	80175	60 %	40 %	0 %	0 %	428771912
66	NC_019778	CTAAT	2	10	80210	80219	40 %	40 %	0 %	20 %	428771912
67	NC_019778	ATCAA	2	10	83006	83015	60 %	20 %	0 %	20 %	428771914
68	NC_019778	TATTT	2	10	84341	84350	20 %	80 %	0 %	0 %	428771915
69	NC_019778	ATCAA	2	10	85222	85231	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019778	ATTTA	2	10	87239	87248	40 %	60 %	0 %	0 %	428771917
71	NC_019778	GATTA	2	10	91946	91955	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019778	AGTGA	2	10	92085	92094	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019778	AACTC	2	10	92618	92627	40 %	20 %	0 %	40 %	428771922
74	NC_019778	ATTTT	2	10	94826	94835	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019778	CTTTT	2	10	96342	96351	0 %	80 %	0 %	20 %	428771926
76	NC_019778	GAATT	2	10	96459	96468	40 %	40 %	20 %	0 %	428771926
77	NC_019778	AAGGG	2	10	97041	97050	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019778	AGTGA	2	10	99977	99986	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019778	GGAGA	2	10	100771	100780	40 %	0 %	60 %	0 %	428771931
80	NC_019778	GGAAT	2	10	105429	105438	40 %	20 %	40 %	0 %	428771935
81	NC_019778	ATGTA	2	10	106073	106082	40 %	40 %	20 %	0 %	428771936
82	NC_019778	AAACT	2	10	107440	107449	60 %	20 %	0 %	20 %	428771936
83	NC_019778	TTTGA	2	10	108340	108349	20 %	60 %	20 %	0 %	428771937
84	NC_019778	CCCTT	2	10	110775	110784	0 %	40 %	0 %	60 %	428771940
85	NC_019778	ATCTT	2	10	110956	110965	20 %	60 %	0 %	20 %	428771941
86	NC_019778	TGGAA	2	10	112436	112445	40 %	20 %	40 %	0 %	428771943
87	NC_019778	AAATA	2	10	114156	114165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019778	AATTT	2	10	115272	115281	40 %	60 %	0 %	0 %	428771946
89	NC_019778	AATCA	2	10	117660	117669	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_019778	CTAAA	2	10	117791	117800	60 %	20 %	0 %	20 %	428771949
91	NC_019778	GATCG	2	10	119368	119377	20 %	20 %	40 %	20 %	428771950
92	NC_019778	TCTTT	2	10	119575	119584	0 %	80 %	0 %	20 %	428771950
93	NC_019778	CTTGT	2	10	120431	120440	0 %	60 %	20 %	20 %	428771951
94	NC_019778	CTGCG	2	10	122721	122730	0 %	20 %	40 %	40 %	428771955
95	NC_019778	AATTA	2	10	123483	123492	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019778	TAATG	2	10	124047	124056	40 %	40 %	20 %	0 %	428771957
97	NC_019778	AATCT	2	10	126038	126047	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_019778	CAAAT	2	10	128302	128311	60 %	20 %	0 %	20 %	428771962
99	NC_019778	GGGAT	2	10	128764	128773	20 %	20 %	60 %	0 %	428771964
100	NC_019778	TGATT	2	10	128933	128942	20 %	60 %	20 %	0 %	428771964
101	NC_019778	TAGGG	2	10	129570	129579	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019778	AATAT	2	10	130938	130947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019778	AGCCA	2	10	133847	133856	40 %	0 %	20 %	40 %	428771968
104	NC_019778	GTATC	2	10	133938	133947	20 %	40 %	20 %	20 %	428771968
105	NC_019778	AAAAG	2	10	136782	136791	80 %	0 %	20 %	0 %	428771970
106	NC_019778	AAGAA	2	10	138169	138178	80 %	0 %	20 %	0 %	428771971
107	NC_019778	TTGGG	2	10	139245	139254	0 %	40 %	60 %	0 %	428771972
108	NC_019778	GGATG	2	10	140083	140092	20 %	20 %	60 %	0 %	428771973
109	NC_019778	AAAAT	2	10	140693	140702	80 %	20 %	0 %	0 %	428771974
110	NC_019778	ATATC	2	10	140911	140920	40 %	40 %	0 %	20 %	428771974
111	NC_019778	ATTAG	2	10	141581	141590	40 %	40 %	20 %	0 %	428771974
112	NC_019778	CTGTT	2	10	142061	142070	0 %	60 %	20 %	20 %	428771975
113	NC_019778	ACATT	2	10	142333	142342	40 %	40 %	0 %	20 %	428771975
114	NC_019778	AATTG	2	10	145318	145327	40 %	40 %	20 %	0 %	428771981
115	NC_019778	TTTAT	2	10	146172	146181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019778	CCCTA	2	10	147617	147626	20 %	20 %	0 %	60 %	428771982
117	NC_019778	TGGCT	2	10	148411	148420	0 %	40 %	40 %	20 %	428771983
118	NC_019778	TAATT	2	10	150685	150694	40 %	60 %	0 %	0 %	428771986
119	NC_019778	GATTT	2	10	151269	151278	20 %	60 %	20 %	0 %	428771987
120	NC_019778	AAGAA	2	10	152254	152263	80 %	0 %	20 %	0 %	428771988
121	NC_019778	GGTTT	2	10	153296	153305	0 %	60 %	40 %	0 %	428771988
122	NC_019778	TGAAA	2	10	154239	154248	60 %	20 %	20 %	0 %	428771989
123	NC_019778	AAAAT	2	10	154982	154991	80 %	20 %	0 %	0 %	428771989
124	NC_019778	ATTTA	2	10	155269	155278	40 %	60 %	0 %	0 %	428771989
125	NC_019778	CCTCT	2	10	156129	156138	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_019778	GTTTT	2	10	160948	160957	0 %	80 %	20 %	0 %	428771992
127	NC_019778	CACCC	2	10	164380	164389	20 %	0 %	0 %	80 %	428771994
128	NC_019778	TGTAA	2	10	164929	164938	40 %	40 %	20 %	0 %	428771994
129	NC_019778	TTTTA	2	10	166207	166216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019778	GGTTT	2	10	166615	166624	0 %	60 %	40 %	0 %	428771996
131	NC_019778	TTATC	2	10	166742	166751	20 %	60 %	0 %	20 %	428771996
132	NC_019778	AACTA	2	10	167350	167359	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_019778	CCACT	2	10	169670	169679	20 %	20 %	0 %	60 %	428772000
134	NC_019778	AATTA	2	10	172836	172845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019778	TTGGT	2	10	173454	173463	0 %	60 %	40 %	0 %	428772004
136	NC_019778	TCCCA	2	10	175954	175963	20 %	20 %	0 %	60 %	428772007
137	NC_019778	CCTAC	2	10	176374	176383	20 %	20 %	0 %	60 %	428772007
138	NC_019778	AAAGG	2	10	176430	176439	60 %	0 %	40 %	0 %	428772007
139	NC_019778	CAAGA	2	10	176585	176594	60 %	0 %	20 %	20 %	428772007
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