MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanobacterium stanieri PCC 7202 chromosome

Total Repeats: 486

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019778	AAGAT	2	10	1798	1807	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019778	AGATG	2	10	2331	2340	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019778	TGCTT	2	10	2429	2438	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019778	GGTTT	2	10	9848	9857	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019778	GTTTT	2	10	21452	21461	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019778	ATTCT	2	10	26728	26737	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019778	AAATT	2	10	34884	34893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019778	GTGAA	2	10	41323	41332	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019778	TTACT	2	10	43942	43951	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_019778	AATAG	2	10	47665	47674	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019778	ACTTT	2	10	49430	49439	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019778	TAATT	2	10	62206	62215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019778	GAATT	2	10	63594	63603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019778	TTCAC	2	10	66374	66383	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_019778	TATTT	2	10	71168	71177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019778	ATCAA	2	10	85222	85231	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019778	GATTA	2	10	91946	91955	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019778	AGTGA	2	10	92085	92094	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019778	ATTTT	2	10	94826	94835	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019778	AAGGG	2	10	97041	97050	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019778	AGTGA	2	10	99977	99986	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019778	AAATA	2	10	114156	114165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019778	AATCA	2	10	117660	117669	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019778	AATTA	2	10	123483	123492	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019778	AATCT	2	10	126038	126047	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019778	TAGGG	2	10	129570	129579	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019778	AATAT	2	10	130938	130947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019778	TTTAT	2	10	146172	146181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019778	CCTCT	2	10	156129	156138	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_019778	TTTTA	2	10	166207	166216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019778	AACTA	2	10	167350	167359	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019778	AATTA	2	10	172836	172845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019778	TGATT	2	10	176880	176889	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019778	TCAAA	2	10	179197	179206	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019778	TTTTA	2	10	179266	179275	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019778	ATTTT	2	10	179565	179574	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019778	TAAAA	2	10	183025	183034	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019778	GTTTT	2	10	194456	194465	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019778	TTCAC	2	10	203421	203430	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_019778	ATAAA	2	10	210476	210485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019778	TCAAT	2	10	221228	221237	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019778	TAACT	2	10	232179	232188	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019778	ATTAA	2	10	232615	232624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019778	CCCTA	2	10	243941	243950	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_019778	GAGGT	2	10	244079	244088	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019778	TAATT	2	10	259918	259927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019778	TACCA	2	10	262947	262956	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_019778	TAATA	2	10	265731	265740	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019778	TGATT	2	10	274180	274189	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019778	TTTAT	2	10	292144	292153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019778	AACTA	2	10	292828	292837	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019778	GTTAA	2	10	292891	292900	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019778	TTCAT	2	10	303076	303085	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019778	ATCTT	2	10	313135	313144	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_019778	ATTTT	2	10	318080	318089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019778	ATTTA	2	10	333840	333849	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019778	TTTAC	2	10	342216	342225	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019778	TTAAT	2	10	367872	367881	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019778	TTGGT	2	10	396889	396898	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019778	TAAAA	2	10	409003	409012	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019778	ATTGA	2	10	411609	411618	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019778	ATTTT	2	10	412175	412184	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019778	CAACC	2	10	416728	416737	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_019778	CAACC	2	10	416802	416811	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_019778	CAACC	2	10	416887	416896	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_019778	CAACC	2	10	416969	416978	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_019778	CAACC	2	10	417052	417061	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_019778	ACTTT	2	10	422969	422978	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019778	ATACT	2	10	424708	424717	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019778	TATCT	2	10	432886	432895	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_019778	TGATT	2	10	434310	434319	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019778	TATTT	2	10	434644	434653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019778	AAATT	2	10	434678	434687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019778	TTATC	2	10	449814	449823	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019778	AAAAT	2	10	462231	462240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019778	AAAGG	2	10	483671	483680	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019778	TCAAA	2	10	520021	520030	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019778	ATTTA	2	10	524358	524367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019778	GTTTT	2	10	527897	527906	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019778	ATCAT	2	10	538010	538019	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_019778	ATTTT	2	10	550170	550179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019778	GAAAA	2	10	550303	550312	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019778	CAAAA	2	10	554172	554181	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_019778	AGTGA	2	10	561138	561147	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019778	AGGCA	2	10	563602	563611	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019778	TTTTA	2	10	568365	568374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019778	AAGAA	2	10	572262	572271	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019778	CTTGT	2	10	576253	576262	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_019778	TATCT	2	10	594937	594946	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_019778	GGGGA	2	10	595064	595073	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019778	CTCTC	2	10	600698	600707	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
92	NC_019778	TCAAT	2	10	601318	601327	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_019778	AAAAG	2	10	602534	602543	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019778	TTTTA	2	10	604197	604206	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019778	TACCT	2	10	605126	605135	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_019778	TTTAA	2	10	611724	611733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019778	ATTTT	2	10	615238	615247	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019778	AAATG	2	10	616061	616070	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019778	TCTTT	2	10	618208	618217	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_019778	TTTTA	2	10	627017	627026	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019778	ATTTG	2	10	628643	628652	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019778	TAAAA	2	10	661901	661910	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019778	TTCTA	2	10	667157	667166	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019778	TTTAT	2	10	674595	674604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019778	TTTAG	2	10	678082	678091	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019778	ATAAG	2	10	691709	691718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019778	TTTTA	2	10	691765	691774	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019778	AGTGA	2	10	708973	708982	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019778	AATCA	2	10	718488	718497	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019778	CCTTC	2	10	720611	720620	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_019778	AATTG	2	10	731448	731457	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019778	ATTTA	2	10	735891	735900	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019778	TCATT	2	10	737323	737332	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019778	AAATT	2	10	737408	737417	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019778	TTTCT	2	10	746698	746707	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_019778	ACAAT	2	10	749563	749572	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_019778	CTCAT	2	10	749615	749624	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_019778	AATAA	2	10	749628	749637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019778	ATTTT	2	10	750062	750071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019778	GGTTA	2	10	755568	755577	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019778	ATTAG	2	10	768226	768235	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019778	TTTTA	2	10	776472	776481	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019778	TTTAG	2	10	778768	778777	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019778	CAACC	2	10	783108	783117	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_019778	TAACC	2	10	783573	783582	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_019778	GGGCA	2	10	785836	785845	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_019778	TCTAA	2	10	796781	796790	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_019778	TTCTT	2	10	797459	797468	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_019778	TTAAA	2	10	799191	799200	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019778	ATCCA	2	10	816333	816342	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_019778	AAATA	2	10	817286	817295	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019778	TAATT	2	10	842127	842136	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019778	TCATA	2	10	848167	848176	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_019778	TTTTA	2	10	851136	851145	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019778	ATTTT	2	10	854291	854300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019778	TTTAT	2	10	868532	868541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019778	TATAT	2	10	870322	870331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019778	TAATA	2	10	874305	874314	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019778	TGTTT	2	10	878200	878209	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019778	ATTTT	2	10	880572	880581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019778	AAATT	2	10	888529	888538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019778	CATAC	2	10	894200	894209	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_019778	CAAAA	2	10	909255	909264	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_019778	TTGTA	2	10	915969	915978	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019778	CTTTG	2	10	924204	924213	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019778	ATTAT	2	10	924852	924861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019778	TTCAC	2	10	939623	939632	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_019778	TAATG	2	10	944668	944677	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.