MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cyanobacterium stanieri PCC 7202 chromosome

Total Repeats: 1914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019778	TTTTA	2	10	5086	5095	20 %	80 %	0 %	0 %	428771853
2	NC_019778	ATCTT	2	10	8787	8796	20 %	60 %	0 %	20 %	428771856
3	NC_019778	AGAAA	2	10	11625	11634	80 %	0 %	20 %	0 %	428771858
4	NC_019778	TTTAA	2	10	13906	13915	40 %	60 %	0 %	0 %	428771862
5	NC_019778	ATTAA	2	10	14686	14695	60 %	40 %	0 %	0 %	428771862
6	NC_019778	AGATT	2	10	15196	15205	40 %	40 %	20 %	0 %	428771862
7	NC_019778	TTTGA	2	10	16622	16631	20 %	60 %	20 %	0 %	428771863
8	NC_019778	TTTTG	2	10	17144	17153	0 %	80 %	20 %	0 %	428771864
9	NC_019778	GCCCT	2	10	18419	18428	0 %	20 %	20 %	60 %	428771864
10	NC_019778	TTTTC	2	10	18766	18775	0 %	80 %	0 %	20 %	428771864
11	NC_019778	TAAAA	2	10	19154	19163	80 %	20 %	0 %	0 %	428771864
12	NC_019778	TGTTT	2	10	20389	20398	0 %	80 %	20 %	0 %	428771866
13	NC_019778	TAAAT	2	10	23305	23314	60 %	40 %	0 %	0 %	428771868
14	NC_019778	AGTTT	2	10	23830	23839	20 %	60 %	20 %	0 %	428771868
15	NC_019778	TAACT	2	10	24039	24048	40 %	40 %	0 %	20 %	428771868
16	NC_019778	CTTTC	2	10	24397	24406	0 %	60 %	0 %	40 %	428771868
17	NC_019778	TGGGG	2	10	25579	25588	0 %	20 %	80 %	0 %	428771870
18	NC_019778	GATTT	2	10	26020	26029	20 %	60 %	20 %	0 %	428771870
19	NC_019778	TGGGA	2	10	27056	27065	20 %	20 %	60 %	0 %	428771871
20	NC_019778	GTATT	2	10	27116	27125	20 %	60 %	20 %	0 %	428771871
21	NC_019778	ACCAT	2	10	30275	30284	40 %	20 %	0 %	40 %	428771873
22	NC_019778	AAACA	2	10	31874	31883	80 %	0 %	0 %	20 %	428771873
23	NC_019778	CATAT	2	10	32378	32387	40 %	40 %	0 %	20 %	428771873
24	NC_019778	AAAAT	2	10	33261	33270	80 %	20 %	0 %	0 %	428771873
25	NC_019778	ATTTA	2	10	40182	40191	40 %	60 %	0 %	0 %	428771880
26	NC_019778	TAAGT	2	10	44415	44424	40 %	40 %	20 %	0 %	428771885
27	NC_019778	CTGCC	2	10	46930	46939	0 %	20 %	20 %	60 %	428771886
28	NC_019778	TTTGT	2	10	47419	47428	0 %	80 %	20 %	0 %	428771886
29	NC_019778	GAAAA	2	10	51193	51202	80 %	0 %	20 %	0 %	428771889
30	NC_019778	ATTTT	2	10	51253	51262	20 %	80 %	0 %	0 %	428771889
31	NC_019778	ATAAA	2	10	53580	53589	80 %	20 %	0 %	0 %	428771892
32	NC_019778	AACTA	2	10	55605	55614	60 %	20 %	0 %	20 %	428771893
33	NC_019778	TACCT	2	10	57050	57059	20 %	40 %	0 %	40 %	428771894
34	NC_019778	TATTT	2	10	57882	57891	20 %	80 %	0 %	0 %	428771895
35	NC_019778	CAAAG	2	10	59290	59299	60 %	0 %	20 %	20 %	428771897
36	NC_019778	CCCCT	2	10	60790	60799	0 %	20 %	0 %	80 %	428771899
37	NC_019778	TGGTA	2	10	61519	61528	20 %	40 %	40 %	0 %	428771900
38	NC_019778	AGCCA	2	10	62343	62352	40 %	0 %	20 %	40 %	428771901
39	NC_019778	TTATT	2	10	62636	62645	20 %	80 %	0 %	0 %	428771901
40	NC_019778	AAAAG	2	10	67312	67321	80 %	0 %	20 %	0 %	428771904
41	NC_019778	AAATT	2	10	67595	67604	60 %	40 %	0 %	0 %	428771905
42	NC_019778	TGATT	2	10	68841	68850	20 %	60 %	20 %	0 %	428771905
43	NC_019778	CCTAG	2	10	69305	69314	20 %	20 %	20 %	40 %	428771906
44	NC_019778	GGGGA	2	10	71959	71968	20 %	0 %	80 %	0 %	428771908
45	NC_019778	TAAAA	2	10	73306	73315	80 %	20 %	0 %	0 %	428771908
46	NC_019778	AAATC	2	10	75231	75240	60 %	20 %	0 %	20 %	428771910
47	NC_019778	AATTT	2	10	75752	75761	40 %	60 %	0 %	0 %	428771910
48	NC_019778	AACCA	2	10	77311	77320	60 %	0 %	0 %	40 %	428771910
49	NC_019778	CCATA	2	10	79526	79535	40 %	20 %	0 %	40 %	428771912
50	NC_019778	AATTA	2	10	80166	80175	60 %	40 %	0 %	0 %	428771912
51	NC_019778	CTAAT	2	10	80210	80219	40 %	40 %	0 %	20 %	428771912
52	NC_019778	ATCAA	2	10	83006	83015	60 %	20 %	0 %	20 %	428771914
53	NC_019778	TATTT	2	10	84341	84350	20 %	80 %	0 %	0 %	428771915
54	NC_019778	ATTTA	2	10	87239	87248	40 %	60 %	0 %	0 %	428771917
55	NC_019778	AACTC	2	10	92618	92627	40 %	20 %	0 %	40 %	428771922
56	NC_019778	CTTTT	2	10	96342	96351	0 %	80 %	0 %	20 %	428771926
57	NC_019778	GAATT	2	10	96459	96468	40 %	40 %	20 %	0 %	428771926
58	NC_019778	GGAGA	2	10	100771	100780	40 %	0 %	60 %	0 %	428771931
59	NC_019778	GGAAT	2	10	105429	105438	40 %	20 %	40 %	0 %	428771935
60	NC_019778	ATGTA	2	10	106073	106082	40 %	40 %	20 %	0 %	428771936
61	NC_019778	AAACT	2	10	107440	107449	60 %	20 %	0 %	20 %	428771936
62	NC_019778	TTTGA	2	10	108340	108349	20 %	60 %	20 %	0 %	428771937
63	NC_019778	CCCTT	2	10	110775	110784	0 %	40 %	0 %	60 %	428771940
64	NC_019778	ATCTT	2	10	110956	110965	20 %	60 %	0 %	20 %	428771941
65	NC_019778	TGGAA	2	10	112436	112445	40 %	20 %	40 %	0 %	428771943
66	NC_019778	AATTT	2	10	115272	115281	40 %	60 %	0 %	0 %	428771946
67	NC_019778	CTAAA	2	10	117791	117800	60 %	20 %	0 %	20 %	428771949
68	NC_019778	GATCG	2	10	119368	119377	20 %	20 %	40 %	20 %	428771950
69	NC_019778	TCTTT	2	10	119575	119584	0 %	80 %	0 %	20 %	428771950
70	NC_019778	CTTGT	2	10	120431	120440	0 %	60 %	20 %	20 %	428771951
71	NC_019778	CTGCG	2	10	122721	122730	0 %	20 %	40 %	40 %	428771955
72	NC_019778	TAATG	2	10	124047	124056	40 %	40 %	20 %	0 %	428771957
73	NC_019778	CAAAT	2	10	128302	128311	60 %	20 %	0 %	20 %	428771962
74	NC_019778	GGGAT	2	10	128764	128773	20 %	20 %	60 %	0 %	428771964
75	NC_019778	TGATT	2	10	128933	128942	20 %	60 %	20 %	0 %	428771964
76	NC_019778	AGCCA	2	10	133847	133856	40 %	0 %	20 %	40 %	428771968
77	NC_019778	GTATC	2	10	133938	133947	20 %	40 %	20 %	20 %	428771968
78	NC_019778	AAAAG	2	10	136782	136791	80 %	0 %	20 %	0 %	428771970
79	NC_019778	AAGAA	2	10	138169	138178	80 %	0 %	20 %	0 %	428771971
80	NC_019778	TTGGG	2	10	139245	139254	0 %	40 %	60 %	0 %	428771972
81	NC_019778	GGATG	2	10	140083	140092	20 %	20 %	60 %	0 %	428771973
82	NC_019778	AAAAT	2	10	140693	140702	80 %	20 %	0 %	0 %	428771974
83	NC_019778	ATATC	2	10	140911	140920	40 %	40 %	0 %	20 %	428771974
84	NC_019778	ATTAG	2	10	141581	141590	40 %	40 %	20 %	0 %	428771974
85	NC_019778	CTGTT	2	10	142061	142070	0 %	60 %	20 %	20 %	428771975
86	NC_019778	ACATT	2	10	142333	142342	40 %	40 %	0 %	20 %	428771975
87	NC_019778	AATTG	2	10	145318	145327	40 %	40 %	20 %	0 %	428771981
88	NC_019778	CCCTA	2	10	147617	147626	20 %	20 %	0 %	60 %	428771982
89	NC_019778	TGGCT	2	10	148411	148420	0 %	40 %	40 %	20 %	428771983
90	NC_019778	TAATT	2	10	150685	150694	40 %	60 %	0 %	0 %	428771986
91	NC_019778	GATTT	2	10	151269	151278	20 %	60 %	20 %	0 %	428771987
92	NC_019778	AAGAA	2	10	152254	152263	80 %	0 %	20 %	0 %	428771988
93	NC_019778	GGTTT	2	10	153296	153305	0 %	60 %	40 %	0 %	428771988
94	NC_019778	TGAAA	2	10	154239	154248	60 %	20 %	20 %	0 %	428771989
95	NC_019778	AAAAT	2	10	154982	154991	80 %	20 %	0 %	0 %	428771989
96	NC_019778	ATTTA	2	10	155269	155278	40 %	60 %	0 %	0 %	428771989
97	NC_019778	GTTTT	2	10	160948	160957	0 %	80 %	20 %	0 %	428771992
98	NC_019778	CACCC	2	10	164380	164389	20 %	0 %	0 %	80 %	428771994
99	NC_019778	TGTAA	2	10	164929	164938	40 %	40 %	20 %	0 %	428771994
100	NC_019778	GGTTT	2	10	166615	166624	0 %	60 %	40 %	0 %	428771996
101	NC_019778	TTATC	2	10	166742	166751	20 %	60 %	0 %	20 %	428771996
102	NC_019778	CCACT	2	10	169670	169679	20 %	20 %	0 %	60 %	428772000
103	NC_019778	TTGGT	2	10	173454	173463	0 %	60 %	40 %	0 %	428772004
104	NC_019778	TCCCA	2	10	175954	175963	20 %	20 %	0 %	60 %	428772007
105	NC_019778	CCTAC	2	10	176374	176383	20 %	20 %	0 %	60 %	428772007
106	NC_019778	AAAGG	2	10	176430	176439	60 %	0 %	40 %	0 %	428772007
107	NC_019778	CAAGA	2	10	176585	176594	60 %	0 %	20 %	20 %	428772007
108	NC_019778	CTGAT	2	10	178795	178804	20 %	40 %	20 %	20 %	428772011
109	NC_019778	AAACA	2	10	179518	179527	80 %	0 %	0 %	20 %	428772012
110	NC_019778	GAAAA	2	10	180448	180457	80 %	0 %	20 %	0 %	428772013
111	NC_019778	AAATC	2	10	182004	182013	60 %	20 %	0 %	20 %	428772016
112	NC_019778	AACCA	2	10	182077	182086	60 %	0 %	0 %	40 %	428772016
113	NC_019778	ATATC	2	10	183836	183845	40 %	40 %	0 %	20 %	428772017
114	NC_019778	CAAAA	2	10	184660	184669	80 %	0 %	0 %	20 %	428772017
115	NC_019778	CCTTG	2	10	187171	187180	0 %	40 %	20 %	40 %	428772020
116	NC_019778	TAAAT	2	10	187318	187327	60 %	40 %	0 %	0 %	428772020
117	NC_019778	GTAAT	2	10	190043	190052	40 %	40 %	20 %	0 %	428772023
118	NC_019778	AATTA	2	10	190091	190100	60 %	40 %	0 %	0 %	428772023
119	NC_019778	TAACC	2	10	193995	194004	40 %	20 %	0 %	40 %	428772029
120	NC_019778	TCTAT	2	10	195458	195467	20 %	60 %	0 %	20 %	428772030
121	NC_019778	AAATC	2	10	196268	196277	60 %	20 %	0 %	20 %	428772031
122	NC_019778	GATCT	2	10	196869	196878	20 %	40 %	20 %	20 %	428772031
123	NC_019778	GATAA	2	10	197046	197055	60 %	20 %	20 %	0 %	428772031
124	NC_019778	GGGGA	2	10	198391	198400	20 %	0 %	80 %	0 %	428772032
125	NC_019778	CAAAA	2	10	203710	203719	80 %	0 %	0 %	20 %	428772034
126	NC_019778	TTTCT	2	10	205167	205176	0 %	80 %	0 %	20 %	428772034
127	NC_019778	ACCAC	2	10	206765	206774	40 %	0 %	0 %	60 %	428772035
128	NC_019778	CTTTA	2	10	207366	207375	20 %	60 %	0 %	20 %	428772036
129	NC_019778	ATTAA	2	10	208101	208110	60 %	40 %	0 %	0 %	428772037
130	NC_019778	AAGTG	2	10	212287	212296	40 %	20 %	40 %	0 %	428772043
131	NC_019778	AAATT	2	10	212492	212501	60 %	40 %	0 %	0 %	428772043
132	NC_019778	ACCTT	2	10	217873	217882	20 %	40 %	0 %	40 %	428772048
133	NC_019778	GAAGG	2	10	218609	218618	40 %	0 %	60 %	0 %	428772048
134	NC_019778	AAGCC	2	10	220763	220772	40 %	0 %	20 %	40 %	428772049
135	NC_019778	TAAAA	2	10	221671	221680	80 %	20 %	0 %	0 %	428772050
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255	NC_019778	GCATG	2	10	406437	406446	20 %	20 %	40 %	20 %	428772201
256	NC_019778	ATACT	2	10	410144	410153	40 %	40 %	0 %	20 %	428772205
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260	NC_019778	TTCTA	2	10	419274	419283	20 %	60 %	0 %	20 %	428772215
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263	NC_019778	TAACC	2	10	421962	421971	40 %	20 %	0 %	40 %	428772220
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