MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanobacterium stanieri PCC 7202 chromosome

Total Repeats: 8531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019778	ATTG	2	8	1588	1595	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019778	CAAA	2	8	1859	1866	75 %	0 %	0 %	25 %	428771850
3	NC_019778	ATGA	2	8	1877	1884	50 %	25 %	25 %	0 %	428771850
4	NC_019778	AAAG	2	8	2018	2025	75 %	0 %	25 %	0 %	428771850
5	NC_019778	TGAG	2	8	2397	2404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019778	GAAT	2	8	3507	3514	50 %	25 %	25 %	0 %	428771852
7	NC_019778	TGGT	2	8	3762	3769	0 %	50 %	50 %	0 %	428771852
8	NC_019778	CTAC	2	8	3771	3778	25 %	25 %	0 %	50 %	428771852
9	NC_019778	ATCT	2	8	4010	4017	25 %	50 %	0 %	25 %	428771852
10	NC_019778	AATT	2	8	4080	4087	50 %	50 %	0 %	0 %	428771852
11	NC_019778	TAAT	2	8	4597	4604	50 %	50 %	0 %	0 %	428771853
12	NC_019778	GGAT	2	8	4822	4829	25 %	25 %	50 %	0 %	428771853
13	NC_019778	TGGA	2	8	4847	4854	25 %	25 %	50 %	0 %	428771853
14	NC_019778	GTTG	2	8	4991	4998	0 %	50 %	50 %	0 %	428771853
15	NC_019778	CAAT	2	8	5274	5281	50 %	25 %	0 %	25 %	428771853
16	NC_019778	TGGT	2	8	5301	5308	0 %	50 %	50 %	0 %	428771853
17	NC_019778	TTTA	2	8	5363	5370	25 %	75 %	0 %	0 %	428771853
18	NC_019778	CTTT	2	8	5431	5438	0 %	75 %	0 %	25 %	428771853
19	NC_019778	TATT	2	8	5508	5515	25 %	75 %	0 %	0 %	428771853
20	NC_019778	AAGA	2	8	5606	5613	75 %	0 %	25 %	0 %	428771853
21	NC_019778	ATTT	2	8	5664	5671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019778	AGAA	2	8	5825	5832	75 %	0 %	25 %	0 %	428771854
23	NC_019778	GAGG	2	8	5927	5934	25 %	0 %	75 %	0 %	428771854
24	NC_019778	GAAA	2	8	6089	6096	75 %	0 %	25 %	0 %	428771854
25	NC_019778	TCAT	2	8	6958	6965	25 %	50 %	0 %	25 %	428771854
26	NC_019778	AGAA	2	8	8163	8170	75 %	0 %	25 %	0 %	428771855
27	NC_019778	TGAT	2	8	8435	8442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019778	TATC	2	8	8466	8473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019778	GAAA	2	8	8492	8499	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019778	TTCT	2	8	8688	8695	0 %	75 %	0 %	25 %	428771856
31	NC_019778	CTTC	2	8	8776	8783	0 %	50 %	0 %	50 %	428771856
32	NC_019778	CCTA	2	8	9764	9771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019778	TTTC	2	8	9879	9886	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019778	ATTG	2	8	9940	9947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019778	GGGA	2	8	9999	10006	25 %	0 %	75 %	0 %	428771857
36	NC_019778	GATG	2	8	11277	11284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019778	AATA	2	8	11407	11414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019778	ATAA	2	8	11452	11459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019778	ATCA	2	8	12044	12051	50 %	25 %	0 %	25 %	428771859
40	NC_019778	AATT	2	8	13175	13182	50 %	50 %	0 %	0 %	428771861
41	NC_019778	TATT	2	8	13681	13688	25 %	75 %	0 %	0 %	428771861
42	NC_019778	TTAA	2	8	14062	14069	50 %	50 %	0 %	0 %	428771862
43	NC_019778	AAAG	2	8	14392	14399	75 %	0 %	25 %	0 %	428771862
44	NC_019778	TAAA	2	8	14450	14457	75 %	25 %	0 %	0 %	428771862
45	NC_019778	TAGG	2	8	14642	14649	25 %	25 %	50 %	0 %	428771862
46	NC_019778	TATT	2	8	14919	14926	25 %	75 %	0 %	0 %	428771862
47	NC_019778	TCAC	2	8	17842	17849	25 %	25 %	0 %	50 %	428771864
48	NC_019778	TTTC	2	8	17952	17959	0 %	75 %	0 %	25 %	428771864
49	NC_019778	TCTT	2	8	18084	18091	0 %	75 %	0 %	25 %	428771864
50	NC_019778	TTAA	2	8	18565	18572	50 %	50 %	0 %	0 %	428771864
51	NC_019778	TTCT	2	8	18710	18717	0 %	75 %	0 %	25 %	428771864
52	NC_019778	ATTT	2	8	19101	19108	25 %	75 %	0 %	0 %	428771864
53	NC_019778	TAAA	2	8	19124	19131	75 %	25 %	0 %	0 %	428771864
54	NC_019778	AATA	2	8	19322	19329	75 %	25 %	0 %	0 %	428771864
55	NC_019778	GATA	2	8	19500	19507	50 %	25 %	25 %	0 %	428771864
56	NC_019778	CAAA	2	8	19903	19910	75 %	0 %	0 %	25 %	428771865
57	NC_019778	CAAT	2	8	20043	20050	50 %	25 %	0 %	25 %	428771865
58	NC_019778	CAAT	2	8	20064	20071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019778	AAGA	2	8	20196	20203	75 %	0 %	25 %	0 %	428771866
60	NC_019778	ATAA	2	8	20853	20860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019778	CTGT	2	8	21155	21162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019778	GAAA	2	8	21190	21197	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019778	AAGT	2	8	22039	22046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019778	TTCT	2	8	22482	22489	0 %	75 %	0 %	25 %	428771867
65	NC_019778	TTTA	2	8	22630	22637	25 %	75 %	0 %	0 %	428771867
66	NC_019778	TTGT	2	8	22696	22703	0 %	75 %	25 %	0 %	428771867
67	NC_019778	TAGA	2	8	22761	22768	50 %	25 %	25 %	0 %	428771867
68	NC_019778	TAAA	2	8	23183	23190	75 %	25 %	0 %	0 %	428771868
69	NC_019778	GAAT	2	8	23744	23751	50 %	25 %	25 %	0 %	428771868
70	NC_019778	ATTG	2	8	25332	25339	25 %	50 %	25 %	0 %	428771869
71	NC_019778	GGAA	2	8	25798	25805	50 %	0 %	50 %	0 %	428771870
72	NC_019778	CTTT	2	8	26168	26175	0 %	75 %	0 %	25 %	428771870
73	NC_019778	GGGA	2	8	26352	26359	25 %	0 %	75 %	0 %	428771870
74	NC_019778	CTTT	2	8	27624	27631	0 %	75 %	0 %	25 %	428771871
75	NC_019778	CAGG	2	8	27856	27863	25 %	0 %	50 %	25 %	428771871
76	NC_019778	TATC	2	8	27891	27898	25 %	50 %	0 %	25 %	428771871
77	NC_019778	CTTA	2	8	27999	28006	25 %	50 %	0 %	25 %	428771871
78	NC_019778	TCTA	2	8	28150	28157	25 %	50 %	0 %	25 %	428771871
79	NC_019778	TTCT	2	8	28316	28323	0 %	75 %	0 %	25 %	428771871
80	NC_019778	TTTG	2	8	29305	29312	0 %	75 %	25 %	0 %	428771873
81	NC_019778	TATC	2	8	29344	29351	25 %	50 %	0 %	25 %	428771873
82	NC_019778	CAAC	2	8	29463	29470	50 %	0 %	0 %	50 %	428771873
83	NC_019778	CATC	2	8	29736	29743	25 %	25 %	0 %	50 %	428771873
84	NC_019778	ATTC	2	8	30844	30851	25 %	50 %	0 %	25 %	428771873
85	NC_019778	ATTT	2	8	31388	31395	25 %	75 %	0 %	0 %	428771873
86	NC_019778	AAAG	2	8	31417	31424	75 %	0 %	25 %	0 %	428771873
87	NC_019778	AATT	2	8	31469	31476	50 %	50 %	0 %	0 %	428771873
88	NC_019778	AAAG	2	8	31663	31670	75 %	0 %	25 %	0 %	428771873
89	NC_019778	TAAT	2	8	32237	32244	50 %	50 %	0 %	0 %	428771873
90	NC_019778	ACCT	2	8	32807	32814	25 %	25 %	0 %	50 %	428771873
91	NC_019778	TCAA	2	8	32924	32931	50 %	25 %	0 %	25 %	428771873
92	NC_019778	AAAG	2	8	33598	33605	75 %	0 %	25 %	0 %	428771874
93	NC_019778	TCGT	2	8	34404	34411	0 %	50 %	25 %	25 %	428771875
94	NC_019778	AAAG	2	8	34433	34440	75 %	0 %	25 %	0 %	428771875
95	NC_019778	ATTA	2	8	34870	34877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019778	ATAA	2	8	34905	34912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019778	AAAT	2	8	34964	34971	75 %	25 %	0 %	0 %	428771876
98	NC_019778	AGGA	2	8	35005	35012	50 %	0 %	50 %	0 %	428771876
99	NC_019778	TTGC	2	8	35419	35426	0 %	50 %	25 %	25 %	428771877
100	NC_019778	GAGT	2	8	35771	35778	25 %	25 %	50 %	0 %	428771877
101	NC_019778	TTGA	2	8	35793	35800	25 %	50 %	25 %	0 %	428771877
102	NC_019778	TTGA	2	8	36564	36571	25 %	50 %	25 %	0 %	428771878
103	NC_019778	TACA	2	8	36748	36755	50 %	25 %	0 %	25 %	428771878
104	NC_019778	GAAT	2	8	36987	36994	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019778	CACC	2	8	37780	37787	25 %	0 %	0 %	75 %	428771879
106	NC_019778	ATCT	2	8	37982	37989	25 %	50 %	0 %	25 %	428771879
107	NC_019778	TAAT	2	8	38695	38702	50 %	50 %	0 %	0 %	428771879
108	NC_019778	CATC	2	8	39757	39764	25 %	25 %	0 %	50 %	428771879
109	NC_019778	TATT	2	8	39776	39783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019778	CATC	2	8	40404	40411	25 %	25 %	0 %	50 %	428771880
111	NC_019778	AGGC	2	8	41290	41297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019778	GTTT	2	8	41641	41648	0 %	75 %	25 %	0 %	428771882
113	NC_019778	TAAG	2	8	41875	41882	50 %	25 %	25 %	0 %	428771882
114	NC_019778	AAAG	2	8	42636	42643	75 %	0 %	25 %	0 %	428771883
115	NC_019778	CTTA	2	8	42914	42921	25 %	50 %	0 %	25 %	428771883
116	NC_019778	TTGA	2	8	43140	43147	25 %	50 %	25 %	0 %	428771883
117	NC_019778	CTCC	2	8	43199	43206	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_019778	ATTT	2	8	44030	44037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019778	CAAC	2	8	44369	44376	50 %	0 %	0 %	50 %	428771885
120	NC_019778	AGTT	2	8	44648	44655	25 %	50 %	25 %	0 %	428771885
121	NC_019778	GTAA	2	8	45394	45401	50 %	25 %	25 %	0 %	428771886
122	NC_019778	TAAA	2	8	46081	46088	75 %	25 %	0 %	0 %	428771886
123	NC_019778	AACC	2	8	46089	46096	50 %	0 %	0 %	50 %	428771886
124	NC_019778	TTCT	2	8	46766	46773	0 %	75 %	0 %	25 %	428771886
125	NC_019778	ACCT	2	8	48752	48759	25 %	25 %	0 %	50 %	428771887
126	NC_019778	CTTC	2	8	48786	48793	0 %	50 %	0 %	50 %	428771887
127	NC_019778	GAAT	2	8	48815	48822	50 %	25 %	25 %	0 %	428771887
128	NC_019778	GGTT	2	8	49604	49611	0 %	50 %	50 %	0 %	428771888
129	NC_019778	AAGA	3	12	50991	51002	75 %	0 %	25 %	0 %	428771889
130	NC_019778	TTAA	2	8	51150	51157	50 %	50 %	0 %	0 %	428771889
131	NC_019778	TCTT	2	8	51583	51590	0 %	75 %	0 %	25 %	428771891
132	NC_019778	TTAA	2	8	52085	52092	50 %	50 %	0 %	0 %	428771891
133	NC_019778	AATA	2	8	52160	52167	75 %	25 %	0 %	0 %	428771891
134	NC_019778	AGTT	2	8	52575	52582	25 %	50 %	25 %	0 %	428771891
135	NC_019778	CCAT	2	8	52676	52683	25 %	25 %	0 %	50 %	428771891
136	NC_019778	AAAT	2	8	52924	52931	75 %	25 %	0 %	0 %	428771892
137	NC_019778	AATT	2	8	53091	53098	50 %	50 %	0 %	0 %	428771892
138	NC_019778	TTTG	2	8	53144	53151	0 %	75 %	25 %	0 %	428771892
139	NC_019778	TAAC	2	8	53266	53273	50 %	25 %	0 %	25 %	428771892
140	NC_019778	GTTT	2	8	53415	53422	0 %	75 %	25 %	0 %	428771892
141	NC_019778	ATTA	2	8	53695	53702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019778	TCTT	2	8	53829	53836	0 %	75 %	0 %	25 %	428771893
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