MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019777	TTGTT	2	10	77	86	0 %	80 %	20 %	0 %	428771775
2	NC_019777	TTTTA	2	10	2141	2150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019777	GGCAA	2	10	5155	5164	40 %	0 %	40 %	20 %	428771780
4	NC_019777	AATAA	2	10	6260	6269	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019777	AAATG	2	10	6343	6352	60 %	20 %	20 %	0 %	428771781
6	NC_019777	GAAGG	2	10	9488	9497	40 %	0 %	60 %	0 %	428771783
7	NC_019777	TAAAA	2	10	9676	9685	80 %	20 %	0 %	0 %	428771783
8	NC_019777	AATTT	2	10	10793	10802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019777	TTTTG	2	10	10985	10994	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019777	ATCAA	2	10	12031	12040	60 %	20 %	0 %	20 %	428771786
11	NC_019777	TATAA	2	10	12970	12979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019777	GTTGA	2	10	15627	15636	20 %	40 %	40 %	0 %	428771789
13	NC_019777	TAATT	2	10	18472	18481	40 %	60 %	0 %	0 %	428771794
14	NC_019777	AATAA	2	10	19392	19401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019777	TCTGT	2	10	20712	20721	0 %	60 %	20 %	20 %	428771797
16	NC_019777	ATCTT	2	10	21074	21083	20 %	60 %	0 %	20 %	428771797
17	NC_019777	AGATT	2	10	21353	21362	40 %	40 %	20 %	0 %	428771797
18	NC_019777	ATTAT	2	10	22013	22022	40 %	60 %	0 %	0 %	428771797
19	NC_019777	ACATA	2	10	22381	22390	60 %	20 %	0 %	20 %	428771797
20	NC_019777	ATTAA	2	10	22391	22400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019777	AAAAG	2	10	22958	22967	80 %	0 %	20 %	0 %	428771798
22	NC_019777	GTTTT	2	10	25684	25693	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019777	TTTAA	2	10	25897	25906	40 %	60 %	0 %	0 %	428771799
24	NC_019777	GTTTG	2	10	27119	27128	0 %	60 %	40 %	0 %	428771800
25	NC_019777	GGAAA	2	10	30416	30425	60 %	0 %	40 %	0 %	428771804
26	NC_019777	AAACT	2	10	30626	30635	60 %	20 %	0 %	20 %	428771804
27	NC_019777	TATTT	2	10	31187	31196	20 %	80 %	0 %	0 %	428771805
28	NC_019777	GTTTT	2	10	32691	32700	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019777	CTGAC	2	10	33056	33065	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_019777	TCTGC	2	10	34361	34370	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_019777	AAAAT	2	10	36228	36237	80 %	20 %	0 %	0 %	428771806
32	NC_019777	TTAAT	2	10	37628	37637	40 %	60 %	0 %	0 %	428771807
33	NC_019777	TTATC	2	10	38519	38528	20 %	60 %	0 %	20 %	428771807
34	NC_019777	TTAAT	2	10	41535	41544	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019777	GTAAA	2	10	41943	41952	60 %	20 %	20 %	0 %	428771813
36	NC_019777	AGAAA	2	10	42158	42167	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019777	ATTAA	2	10	42181	42190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019777	TAGTA	2	10	50699	50708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019777	TAATC	2	10	51006	51015	40 %	40 %	0 %	20 %	428771823
40	NC_019777	CTTTG	2	10	52462	52471	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019777	CCATG	2	10	52849	52858	20 %	20 %	20 %	40 %	428771827
42	NC_019777	TAAAA	2	10	53919	53928	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019777	ATGAA	2	10	54237	54246	60 %	20 %	20 %	0 %	428771828
44	NC_019777	TATCA	2	10	56696	56705	40 %	40 %	0 %	20 %	428771834
45	NC_019777	AGGAA	2	10	58377	58386	60 %	0 %	40 %	0 %	428771838
46	NC_019777	TTAAT	2	10	59089	59098	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019777	AATTA	2	10	61549	61558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019777	GAAAA	2	10	61561	61570	80 %	0 %	20 %	0 %	428771844
49	NC_019777	ATATT	2	10	62040	62049	40 %	60 %	0 %	0 %	428771846

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.