MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019777	TTTTA	2	10	2141	2150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019777	AATAA	2	10	6260	6269	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019777	AATTT	2	10	10793	10802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019777	TTTTG	2	10	10985	10994	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019777	TATAA	2	10	12970	12979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019777	AATAA	2	10	19392	19401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019777	ATTAA	2	10	22391	22400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019777	GTTTT	2	10	25684	25693	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019777	GTTTT	2	10	32691	32700	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019777	CTGAC	2	10	33056	33065	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_019777	TCTGC	2	10	34361	34370	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_019777	TTAAT	2	10	41535	41544	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019777	AGAAA	2	10	42158	42167	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019777	ATTAA	2	10	42181	42190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019777	TAGTA	2	10	50699	50708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019777	CTTTG	2	10	52462	52471	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019777	TAAAA	2	10	53919	53928	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019777	TTAAT	2	10	59089	59098	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019777	AATTA	2	10	61549	61558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.