MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019777	AAAT	2	8	1616	1623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019777	TAAA	2	8	2013	2020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019777	ATAA	2	8	5982	5989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019777	TCAC	2	8	5991	5998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019777	TATT	2	8	6088	6095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019777	ATAA	2	8	6168	6175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019777	TTCT	2	8	6296	6303	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019777	CAAG	2	8	10887	10894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019777	AGTA	2	8	11137	11144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019777	TAGA	2	8	11362	11369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019777	CTTA	2	8	11442	11449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019777	TGGA	2	8	12992	12999	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019777	ATTT	2	8	13002	13009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019777	ACTA	2	8	14200	14207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019777	ATTT	2	8	15235	15242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019777	GTTT	2	8	19203	19210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019777	CATC	2	8	19291	19298	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019777	TTAA	2	8	19316	19323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019777	TTTA	2	8	19356	19363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019777	AAAT	2	8	19448	19455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019777	CATC	2	8	20195	20202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019777	ACAA	2	8	22429	22436	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019777	AGTT	2	8	22547	22554	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019777	AATC	2	8	25733	25740	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019777	GAAA	2	8	33160	33167	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019777	AGGC	2	8	34146	34153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019777	ATAG	2	8	34214	34221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019777	AAAT	2	8	35404	35411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019777	TAAA	2	8	35794	35801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019777	ATCA	2	8	37334	37341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019777	ATCA	2	8	41462	41469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019777	TAAA	2	8	41505	41512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019777	ATCA	2	8	41527	41534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019777	GAAA	2	8	43629	43636	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019777	ATTA	2	8	50709	50716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019777	ATCA	2	8	52153	52160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019777	TTAT	2	8	53810	53817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019777	ATCG	2	8	54672	54679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019777	ATTT	2	8	56128	56135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019777	ATTA	2	8	56229	56236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019777	CTTC	2	8	58526	58533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019777	AAAG	2	8	60553	60560	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019777	TAAT	2	8	61338	61345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.