MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019777	TC	4	8	405	412	0 %	50 %	0 %	50 %	428771776
2	NC_019777	AC	3	6	1678	1683	50 %	0 %	0 %	50 %	428771778
3	NC_019777	CT	3	6	1838	1843	0 %	50 %	0 %	50 %	428771778
4	NC_019777	TC	3	6	1935	1940	0 %	50 %	0 %	50 %	428771778
5	NC_019777	AT	3	6	2059	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019777	AG	3	6	3244	3249	50 %	0 %	50 %	0 %	428771780
7	NC_019777	GA	3	6	3313	3318	50 %	0 %	50 %	0 %	428771780
8	NC_019777	AT	3	6	4140	4145	50 %	50 %	0 %	0 %	428771780
9	NC_019777	TC	3	6	4831	4836	0 %	50 %	0 %	50 %	428771780
10	NC_019777	AT	3	6	6176	6181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019777	GA	3	6	6777	6782	50 %	0 %	50 %	0 %	428771781
12	NC_019777	CT	3	6	8191	8196	0 %	50 %	0 %	50 %	428771782
13	NC_019777	TA	3	6	8748	8753	50 %	50 %	0 %	0 %	428771782
14	NC_019777	TC	3	6	9171	9176	0 %	50 %	0 %	50 %	428771783
15	NC_019777	AT	3	6	10303	10308	50 %	50 %	0 %	0 %	428771784
16	NC_019777	TA	3	6	10400	10405	50 %	50 %	0 %	0 %	428771784
17	NC_019777	AG	3	6	11088	11093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019777	TA	3	6	11448	11453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019777	AT	3	6	11988	11993	50 %	50 %	0 %	0 %	428771786
20	NC_019777	AT	3	6	12724	12729	50 %	50 %	0 %	0 %	428771786
21	NC_019777	TG	4	8	13816	13823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019777	TA	3	6	14745	14750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019777	GA	3	6	15028	15033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019777	TA	3	6	16539	16544	50 %	50 %	0 %	0 %	428771791
25	NC_019777	TA	3	6	17059	17064	50 %	50 %	0 %	0 %	428771791
26	NC_019777	TC	3	6	17655	17660	0 %	50 %	0 %	50 %	428771792
27	NC_019777	TC	3	6	18448	18453	0 %	50 %	0 %	50 %	428771794
28	NC_019777	TA	3	6	18767	18772	50 %	50 %	0 %	0 %	428771795
29	NC_019777	TG	3	6	18955	18960	0 %	50 %	50 %	0 %	428771795
30	NC_019777	GA	3	6	19526	19531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019777	TA	3	6	21093	21098	50 %	50 %	0 %	0 %	428771797
32	NC_019777	TC	3	6	21472	21477	0 %	50 %	0 %	50 %	428771797
33	NC_019777	CT	3	6	22007	22012	0 %	50 %	0 %	50 %	428771797
34	NC_019777	TC	3	6	24821	24826	0 %	50 %	0 %	50 %	428771798
35	NC_019777	TC	3	6	25176	25181	0 %	50 %	0 %	50 %	428771798
36	NC_019777	AT	3	6	25423	25428	50 %	50 %	0 %	0 %	428771798
37	NC_019777	AT	3	6	26118	26123	50 %	50 %	0 %	0 %	428771799
38	NC_019777	TA	3	6	26996	27001	50 %	50 %	0 %	0 %	428771800
39	NC_019777	CT	3	6	27809	27814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019777	AT	3	6	28536	28541	50 %	50 %	0 %	0 %	428771801
41	NC_019777	AT	3	6	28662	28667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019777	TC	3	6	28931	28936	0 %	50 %	0 %	50 %	428771802
43	NC_019777	TA	3	6	29089	29094	50 %	50 %	0 %	0 %	428771803
44	NC_019777	TA	3	6	29191	29196	50 %	50 %	0 %	0 %	428771803
45	NC_019777	TC	3	6	29198	29203	0 %	50 %	0 %	50 %	428771803
46	NC_019777	AT	3	6	29388	29393	50 %	50 %	0 %	0 %	428771804
47	NC_019777	TA	3	6	29396	29401	50 %	50 %	0 %	0 %	428771804
48	NC_019777	TA	3	6	31312	31317	50 %	50 %	0 %	0 %	428771805
49	NC_019777	GA	3	6	31637	31642	50 %	0 %	50 %	0 %	428771805
50	NC_019777	AT	3	6	31847	31852	50 %	50 %	0 %	0 %	428771805
51	NC_019777	AG	3	6	31922	31927	50 %	0 %	50 %	0 %	428771805
52	NC_019777	TC	3	6	32507	32512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019777	AT	4	8	32759	32766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019777	TC	3	6	32794	32799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019777	TC	3	6	33020	33025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019777	TC	4	8	33093	33100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019777	TC	3	6	33475	33480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019777	TC	3	6	33709	33714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019777	CT	3	6	34077	34082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019777	TC	3	6	34458	34463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019777	TC	3	6	34533	34538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019777	TC	3	6	34606	34611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019777	TC	3	6	34682	34687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019777	GA	3	6	35192	35197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019777	TC	3	6	35207	35212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019777	GA	3	6	35709	35714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019777	TC	3	6	35963	35968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019777	GA	3	6	38414	38419	50 %	0 %	50 %	0 %	428771807
69	NC_019777	AG	3	6	39115	39120	50 %	0 %	50 %	0 %	428771808
70	NC_019777	TA	3	6	39620	39625	50 %	50 %	0 %	0 %	428771810
71	NC_019777	GT	3	6	40705	40710	0 %	50 %	50 %	0 %	428771811
72	NC_019777	TA	3	6	41247	41252	50 %	50 %	0 %	0 %	428771812
73	NC_019777	TA	4	8	42033	42040	50 %	50 %	0 %	0 %	428771813
74	NC_019777	AG	4	8	42476	42483	50 %	0 %	50 %	0 %	428771814
75	NC_019777	CT	3	6	42745	42750	0 %	50 %	0 %	50 %	428771814
76	NC_019777	TA	3	6	42932	42937	50 %	50 %	0 %	0 %	428771815
77	NC_019777	GA	3	6	44653	44658	50 %	0 %	50 %	0 %	428771816
78	NC_019777	CT	3	6	44874	44879	0 %	50 %	0 %	50 %	428771816
79	NC_019777	TC	3	6	44932	44937	0 %	50 %	0 %	50 %	428771816
80	NC_019777	GA	3	6	46252	46257	50 %	0 %	50 %	0 %	428771818
81	NC_019777	TC	3	6	47325	47330	0 %	50 %	0 %	50 %	428771819
82	NC_019777	AC	3	6	47570	47575	50 %	0 %	0 %	50 %	428771820
83	NC_019777	TA	3	6	48636	48641	50 %	50 %	0 %	0 %	428771820
84	NC_019777	TC	3	6	50878	50883	0 %	50 %	0 %	50 %	428771823
85	NC_019777	AT	3	6	52678	52683	50 %	50 %	0 %	0 %	428771827
86	NC_019777	TA	3	6	53550	53555	50 %	50 %	0 %	0 %	428771827
87	NC_019777	AT	3	6	53634	53639	50 %	50 %	0 %	0 %	428771827
88	NC_019777	AT	3	6	53778	53783	50 %	50 %	0 %	0 %	428771827
89	NC_019777	TA	3	6	54113	54118	50 %	50 %	0 %	0 %	428771828
90	NC_019777	AG	4	8	54377	54384	50 %	0 %	50 %	0 %	428771829
91	NC_019777	GA	4	8	54499	54506	50 %	0 %	50 %	0 %	428771829
92	NC_019777	AT	3	6	54609	54614	50 %	50 %	0 %	0 %	428771829
93	NC_019777	GT	3	6	54798	54803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019777	CT	3	6	55454	55459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019777	AG	3	6	56490	56495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019777	TA	3	6	56664	56669	50 %	50 %	0 %	0 %	428771834
97	NC_019777	CT	3	6	57559	57564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019777	TC	3	6	57929	57934	0 %	50 %	0 %	50 %	428771837
99	NC_019777	AT	3	6	58883	58888	50 %	50 %	0 %	0 %	428771839
100	NC_019777	TA	3	6	59483	59488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019777	TA	3	6	59716	59721	50 %	50 %	0 %	0 %	428771841
102	NC_019777	TC	3	6	59805	59810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019777	AT	3	6	61635	61640	50 %	50 %	0 %	0 %	428771844
104	NC_019777	GA	3	6	61665	61670	50 %	0 %	50 %	0 %	428771844
105	NC_019777	GA	3	6	61830	61835	50 %	0 %	50 %	0 %	428771845
106	NC_019777	GA	3	6	62631	62636	50 %	0 %	50 %	0 %	428771847

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.