MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019777	TC	4	8	405	412	0 %	50 %	0 %	50 %	428771776
2	NC_019777	AC	3	6	1678	1683	50 %	0 %	0 %	50 %	428771778
3	NC_019777	CT	3	6	1838	1843	0 %	50 %	0 %	50 %	428771778
4	NC_019777	TC	3	6	1935	1940	0 %	50 %	0 %	50 %	428771778
5	NC_019777	AG	3	6	3244	3249	50 %	0 %	50 %	0 %	428771780
6	NC_019777	GA	3	6	3313	3318	50 %	0 %	50 %	0 %	428771780
7	NC_019777	AT	3	6	4140	4145	50 %	50 %	0 %	0 %	428771780
8	NC_019777	TC	3	6	4831	4836	0 %	50 %	0 %	50 %	428771780
9	NC_019777	GA	3	6	6777	6782	50 %	0 %	50 %	0 %	428771781
10	NC_019777	CT	3	6	8191	8196	0 %	50 %	0 %	50 %	428771782
11	NC_019777	TA	3	6	8748	8753	50 %	50 %	0 %	0 %	428771782
12	NC_019777	TC	3	6	9171	9176	0 %	50 %	0 %	50 %	428771783
13	NC_019777	AT	3	6	10303	10308	50 %	50 %	0 %	0 %	428771784
14	NC_019777	TA	3	6	10400	10405	50 %	50 %	0 %	0 %	428771784
15	NC_019777	AT	3	6	11988	11993	50 %	50 %	0 %	0 %	428771786
16	NC_019777	AT	3	6	12724	12729	50 %	50 %	0 %	0 %	428771786
17	NC_019777	TA	3	6	16539	16544	50 %	50 %	0 %	0 %	428771791
18	NC_019777	TA	3	6	17059	17064	50 %	50 %	0 %	0 %	428771791
19	NC_019777	TC	3	6	17655	17660	0 %	50 %	0 %	50 %	428771792
20	NC_019777	TC	3	6	18448	18453	0 %	50 %	0 %	50 %	428771794
21	NC_019777	TA	3	6	18767	18772	50 %	50 %	0 %	0 %	428771795
22	NC_019777	TG	3	6	18955	18960	0 %	50 %	50 %	0 %	428771795
23	NC_019777	TA	3	6	21093	21098	50 %	50 %	0 %	0 %	428771797
24	NC_019777	TC	3	6	21472	21477	0 %	50 %	0 %	50 %	428771797
25	NC_019777	CT	3	6	22007	22012	0 %	50 %	0 %	50 %	428771797
26	NC_019777	TC	3	6	24821	24826	0 %	50 %	0 %	50 %	428771798
27	NC_019777	TC	3	6	25176	25181	0 %	50 %	0 %	50 %	428771798
28	NC_019777	AT	3	6	25423	25428	50 %	50 %	0 %	0 %	428771798
29	NC_019777	AT	3	6	26118	26123	50 %	50 %	0 %	0 %	428771799
30	NC_019777	TA	3	6	26996	27001	50 %	50 %	0 %	0 %	428771800
31	NC_019777	AT	3	6	28536	28541	50 %	50 %	0 %	0 %	428771801
32	NC_019777	TC	3	6	28931	28936	0 %	50 %	0 %	50 %	428771802
33	NC_019777	TA	3	6	29089	29094	50 %	50 %	0 %	0 %	428771803
34	NC_019777	TA	3	6	29191	29196	50 %	50 %	0 %	0 %	428771803
35	NC_019777	TC	3	6	29198	29203	0 %	50 %	0 %	50 %	428771803
36	NC_019777	AT	3	6	29388	29393	50 %	50 %	0 %	0 %	428771804
37	NC_019777	TA	3	6	29396	29401	50 %	50 %	0 %	0 %	428771804
38	NC_019777	TA	3	6	31312	31317	50 %	50 %	0 %	0 %	428771805
39	NC_019777	GA	3	6	31637	31642	50 %	0 %	50 %	0 %	428771805
40	NC_019777	AT	3	6	31847	31852	50 %	50 %	0 %	0 %	428771805
41	NC_019777	AG	3	6	31922	31927	50 %	0 %	50 %	0 %	428771805
42	NC_019777	GA	3	6	38414	38419	50 %	0 %	50 %	0 %	428771807
43	NC_019777	AG	3	6	39115	39120	50 %	0 %	50 %	0 %	428771808
44	NC_019777	TA	3	6	39620	39625	50 %	50 %	0 %	0 %	428771810
45	NC_019777	GT	3	6	40705	40710	0 %	50 %	50 %	0 %	428771811
46	NC_019777	TA	3	6	41247	41252	50 %	50 %	0 %	0 %	428771812
47	NC_019777	TA	4	8	42033	42040	50 %	50 %	0 %	0 %	428771813
48	NC_019777	AG	4	8	42476	42483	50 %	0 %	50 %	0 %	428771814
49	NC_019777	CT	3	6	42745	42750	0 %	50 %	0 %	50 %	428771814
50	NC_019777	TA	3	6	42932	42937	50 %	50 %	0 %	0 %	428771815
51	NC_019777	GA	3	6	44653	44658	50 %	0 %	50 %	0 %	428771816
52	NC_019777	CT	3	6	44874	44879	0 %	50 %	0 %	50 %	428771816
53	NC_019777	TC	3	6	44932	44937	0 %	50 %	0 %	50 %	428771816
54	NC_019777	GA	3	6	46252	46257	50 %	0 %	50 %	0 %	428771818
55	NC_019777	TC	3	6	47325	47330	0 %	50 %	0 %	50 %	428771819
56	NC_019777	AC	3	6	47570	47575	50 %	0 %	0 %	50 %	428771820
57	NC_019777	TA	3	6	48636	48641	50 %	50 %	0 %	0 %	428771820
58	NC_019777	TC	3	6	50878	50883	0 %	50 %	0 %	50 %	428771823
59	NC_019777	AT	3	6	52678	52683	50 %	50 %	0 %	0 %	428771827
60	NC_019777	TA	3	6	53550	53555	50 %	50 %	0 %	0 %	428771827
61	NC_019777	AT	3	6	53634	53639	50 %	50 %	0 %	0 %	428771827
62	NC_019777	AT	3	6	53778	53783	50 %	50 %	0 %	0 %	428771827
63	NC_019777	TA	3	6	54113	54118	50 %	50 %	0 %	0 %	428771828
64	NC_019777	AG	4	8	54377	54384	50 %	0 %	50 %	0 %	428771829
65	NC_019777	GA	4	8	54499	54506	50 %	0 %	50 %	0 %	428771829
66	NC_019777	AT	3	6	54609	54614	50 %	50 %	0 %	0 %	428771829
67	NC_019777	TA	3	6	56664	56669	50 %	50 %	0 %	0 %	428771834
68	NC_019777	TC	3	6	57929	57934	0 %	50 %	0 %	50 %	428771837
69	NC_019777	AT	3	6	58883	58888	50 %	50 %	0 %	0 %	428771839
70	NC_019777	TA	3	6	59716	59721	50 %	50 %	0 %	0 %	428771841
71	NC_019777	AT	3	6	61635	61640	50 %	50 %	0 %	0 %	428771844
72	NC_019777	GA	3	6	61665	61670	50 %	0 %	50 %	0 %	428771844
73	NC_019777	GA	3	6	61830	61835	50 %	0 %	50 %	0 %	428771845
74	NC_019777	GA	3	6	62631	62636	50 %	0 %	50 %	0 %	428771847

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.