MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 chromosome

Total Repeats: 2211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019776	ATTGGG	2	12	256	267	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019776	AAAAGG	2	12	1896	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019776	TATGAT	2	12	4452	4463	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428768418
4	NC_019776	CTAACC	2	12	5037	5048	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428768418
5	NC_019776	GTTTCC	2	12	6190	6201	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428768419
6	NC_019776	TCTCTG	2	12	6602	6613	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428768419
7	NC_019776	TGTTGC	2	12	7500	7511	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428768419
8	NC_019776	GCGATC	2	12	8752	8763	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428768421
9	NC_019776	AAATTA	2	12	12341	12352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768424
10	NC_019776	GAAAAA	2	12	17058	17069	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428768428
11	NC_019776	TTTTTA	2	12	17552	17563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019776	TTTTTA	2	12	17587	17598	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019776	AAAACT	2	12	18047	18058	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428768429
14	NC_019776	TTTAAA	2	12	19738	19749	50 %	50 %	0 %	0 %	428768430
15	NC_019776	ATTACC	2	12	20538	20549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428768431
16	NC_019776	CCGATA	2	12	21890	21901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019776	CAAATG	2	12	26759	26770	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428768435
18	NC_019776	TATGAA	2	12	27575	27586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428768436
19	NC_019776	CTCAAG	2	12	28164	28175	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428768436
20	NC_019776	ATATTA	2	12	28382	28393	50 %	50 %	0 %	0 %	428768436
21	NC_019776	GGGAGA	2	12	29388	29399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019776	TTTACC	2	12	29725	29736	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019776	TTGCCA	2	12	29824	29835	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428768437
24	NC_019776	TAAACC	2	12	29927	29938	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428768437
25	NC_019776	GTAAAG	2	12	31090	31101	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428768438
26	NC_019776	CAAAAC	2	12	36104	36115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428768443
27	NC_019776	AAGGAG	2	12	37357	37368	50 %	0 %	50 %	0 %	428768444
28	NC_019776	TTACTA	2	12	37393	37404	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768444
29	NC_019776	TACTGT	2	12	38012	38023	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428768445
30	NC_019776	ATAAAT	2	12	39464	39475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019776	TCAATA	2	12	41771	41782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428768448
32	NC_019776	TATCAT	2	12	43965	43976	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768451
33	NC_019776	CTTTTT	2	12	44076	44087	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428768451
34	NC_019776	TTTCCA	2	12	44398	44409	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428768452
35	NC_019776	TTTATC	2	12	44922	44933	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019776	TAGCTT	2	12	46249	46260	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428768454
37	NC_019776	ATTAAG	2	12	46477	46488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428768455
38	NC_019776	TAATGA	2	12	47178	47189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428768455
39	NC_019776	TTGCTT	2	12	54408	54419	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428768459
40	NC_019776	ATTAAA	2	12	55258	55269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019776	GCCATT	2	12	56828	56839	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428768463
42	NC_019776	AGCGTT	2	12	57976	57987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428768464
43	NC_019776	ATTTTT	2	12	60999	61010	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019776	ATTTAT	2	12	66128	66139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019776	TTTATA	2	12	66347	66358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428768473
46	NC_019776	TTTAGC	2	12	67854	67865	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428768475
47	NC_019776	TAAAAC	2	12	68552	68563	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019776	AATTAT	2	12	68665	68676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019776	GATCTT	2	12	72164	72175	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019776	ATGGTA	2	12	73987	73998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428768482
51	NC_019776	TTGATA	2	12	75090	75101	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428768483
52	NC_019776	GCTCAA	2	12	77691	77702	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428768485
53	NC_019776	TCTCCC	2	12	78766	78777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_019776	GTGGTA	2	12	80498	80509	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428768486
55	NC_019776	CAGGAG	2	12	82101	82112	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428768487
56	NC_019776	TAAAAT	2	12	91203	91214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768491
57	NC_019776	TTTTTG	2	12	91758	91769	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	428768492
58	NC_019776	TCTCTA	2	12	94379	94390	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428768493
59	NC_019776	CAATTA	2	12	94898	94909	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428768493
60	NC_019776	TGTGAC	2	12	97490	97501	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428768494
61	NC_019776	GCTTTT	2	12	97856	97867	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428768495
62	NC_019776	ATGTAT	2	12	98064	98075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428768495
63	NC_019776	ACAGAT	2	12	98099	98110	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428768495
64	NC_019776	TTTTCT	2	12	102732	102743	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428768499
65	NC_019776	CGATTT	2	12	103222	103233	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428768499
66	NC_019776	GCAATG	2	12	107419	107430	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428768503
67	NC_019776	GAAAAA	2	12	108294	108305	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019776	CCATCT	2	12	108695	108706	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428768504
69	NC_019776	TTTTCT	2	12	109658	109669	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428768504
70	NC_019776	TGGTTT	2	12	111363	111374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428768504
71	NC_019776	ACTATT	2	12	111667	111678	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768504
72	NC_019776	AGTTTT	2	12	115854	115865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428768508
73	NC_019776	AGTTAA	2	12	115962	115973	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019776	TCTCCC	2	12	117655	117666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_019776	CCTAGC	2	12	119131	119142	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428768511
76	NC_019776	TCTATT	2	12	120558	120569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428768512
77	NC_019776	AAATTA	2	12	122515	122526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768514
78	NC_019776	TCTAAT	2	12	124977	124988	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768514
79	NC_019776	AATATA	2	12	127317	127328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768516
80	NC_019776	TAAGGA	2	12	129434	129445	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019776	GATTAG	2	12	129463	129474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019776	ATCATA	2	12	130626	130637	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428768520
83	NC_019776	ACCAAA	2	12	131950	131961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428768522
84	NC_019776	ACCAAT	2	12	133703	133714	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428768523
85	NC_019776	AAAGGT	2	12	136337	136348	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428768525
86	NC_019776	ATTTAG	2	12	138064	138075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428768526
87	NC_019776	ATAAAA	2	12	140212	140223	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	428768528
88	NC_019776	TCTATT	2	12	140957	140968	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428768529
89	NC_019776	AGCATT	2	12	144291	144302	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428768530
90	NC_019776	ACAGAA	2	12	144429	144440	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428768530
91	NC_019776	TTACTC	2	12	145005	145016	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428768531
92	NC_019776	GAAAAA	2	12	145859	145870	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428768532
93	NC_019776	AGCTAG	2	12	146851	146862	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428768532
94	NC_019776	GGGAGA	2	12	147137	147148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019776	GAACCC	2	12	152966	152977	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428768537
96	NC_019776	CTGGTG	2	12	154951	154962	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428768539
97	NC_019776	TTTCTT	2	12	156492	156503	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428768540
98	NC_019776	GCGATC	2	12	164172	164183	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428768545
99	NC_019776	TGGTTT	2	12	166214	166225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428768547
100	NC_019776	TTCTTT	2	12	170370	170381	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428768551
101	NC_019776	AAAAGT	2	12	171203	171214	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428768551
102	NC_019776	CATGGC	2	12	172806	172817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428768552
103	NC_019776	TCCTTT	2	12	174068	174079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768553
104	NC_019776	CTTAAA	2	12	175020	175031	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428768554
105	NC_019776	AAGGAA	2	12	177388	177399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428768556
106	NC_019776	TAAAAT	2	12	178734	178745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019776	AAAATT	2	12	180701	180712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019776	ATTTAT	2	12	181992	182003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019776	GTACCA	2	12	183730	183741	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428768561
110	NC_019776	ATTCTA	2	12	185437	185448	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768563
111	NC_019776	TAATCT	2	12	185932	185943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019776	AGAAAT	2	12	186949	186960	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428768564
113	NC_019776	TTAGAT	2	12	193167	193178	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428768572
114	NC_019776	TCAATT	2	12	194270	194281	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768572
115	NC_019776	TTTTAG	2	12	194506	194517	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428768572
116	NC_019776	AAAATA	2	12	194884	194895	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	428768572
117	NC_019776	TAAATC	2	12	195194	195205	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428768573
118	NC_019776	GGAAAA	2	12	197285	197296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428768574
119	NC_019776	AACTTT	2	12	199493	199504	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768575
120	NC_019776	ATATTG	2	12	199551	199562	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428768575
121	NC_019776	ATTAAG	2	12	203297	203308	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428768579
122	NC_019776	TGGTAT	2	12	203353	203364	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428768579
123	NC_019776	CTTTAT	2	12	204935	204946	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428768580
124	NC_019776	TTCCTT	2	12	206012	206023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768581
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232	NC_019776	CTTCAT	2	12	418537	418548	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428768725
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