MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 chromosome

Total Repeats: 1766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019776	TATGAT	2	12	4452	4463	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428768418
2	NC_019776	CTAACC	2	12	5037	5048	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428768418
3	NC_019776	GTTTCC	2	12	6190	6201	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428768419
4	NC_019776	TCTCTG	2	12	6602	6613	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428768419
5	NC_019776	TGTTGC	2	12	7500	7511	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428768419
6	NC_019776	GCGATC	2	12	8752	8763	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428768421
7	NC_019776	AAATTA	2	12	12341	12352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768424
8	NC_019776	GAAAAA	2	12	17058	17069	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428768428
9	NC_019776	AAAACT	2	12	18047	18058	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428768429
10	NC_019776	TTTAAA	2	12	19738	19749	50 %	50 %	0 %	0 %	428768430
11	NC_019776	ATTACC	2	12	20538	20549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428768431
12	NC_019776	CAAATG	2	12	26759	26770	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428768435
13	NC_019776	TATGAA	2	12	27575	27586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428768436
14	NC_019776	CTCAAG	2	12	28164	28175	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428768436
15	NC_019776	ATATTA	2	12	28382	28393	50 %	50 %	0 %	0 %	428768436
16	NC_019776	TTGCCA	2	12	29824	29835	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428768437
17	NC_019776	TAAACC	2	12	29927	29938	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428768437
18	NC_019776	GTAAAG	2	12	31090	31101	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428768438
19	NC_019776	CAAAAC	2	12	36104	36115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428768443
20	NC_019776	AAGGAG	2	12	37357	37368	50 %	0 %	50 %	0 %	428768444
21	NC_019776	TTACTA	2	12	37393	37404	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768444
22	NC_019776	TACTGT	2	12	38012	38023	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428768445
23	NC_019776	TCAATA	2	12	41771	41782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428768448
24	NC_019776	TATCAT	2	12	43965	43976	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768451
25	NC_019776	CTTTTT	2	12	44076	44087	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428768451
26	NC_019776	TTTCCA	2	12	44398	44409	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428768452
27	NC_019776	TAGCTT	2	12	46249	46260	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428768454
28	NC_019776	ATTAAG	2	12	46477	46488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428768455
29	NC_019776	TAATGA	2	12	47178	47189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428768455
30	NC_019776	TTGCTT	2	12	54408	54419	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428768459
31	NC_019776	GCCATT	2	12	56828	56839	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428768463
32	NC_019776	AGCGTT	2	12	57976	57987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428768464
33	NC_019776	TTTATA	2	12	66347	66358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428768473
34	NC_019776	TTTAGC	2	12	67854	67865	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428768475
35	NC_019776	ATGGTA	2	12	73987	73998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428768482
36	NC_019776	TTGATA	2	12	75090	75101	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428768483
37	NC_019776	GCTCAA	2	12	77691	77702	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428768485
38	NC_019776	GTGGTA	2	12	80498	80509	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428768486
39	NC_019776	CAGGAG	2	12	82101	82112	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428768487
40	NC_019776	TAAAAT	2	12	91203	91214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768491
41	NC_019776	TTTTTG	2	12	91758	91769	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	428768492
42	NC_019776	TCTCTA	2	12	94379	94390	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428768493
43	NC_019776	CAATTA	2	12	94898	94909	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428768493
44	NC_019776	TGTGAC	2	12	97490	97501	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428768494
45	NC_019776	GCTTTT	2	12	97856	97867	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428768495
46	NC_019776	ATGTAT	2	12	98064	98075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428768495
47	NC_019776	ACAGAT	2	12	98099	98110	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428768495
48	NC_019776	TTTTCT	2	12	102732	102743	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428768499
49	NC_019776	CGATTT	2	12	103222	103233	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428768499
50	NC_019776	GCAATG	2	12	107419	107430	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428768503
51	NC_019776	CCATCT	2	12	108695	108706	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428768504
52	NC_019776	TTTTCT	2	12	109658	109669	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428768504
53	NC_019776	TGGTTT	2	12	111363	111374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428768504
54	NC_019776	ACTATT	2	12	111667	111678	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768504
55	NC_019776	AGTTTT	2	12	115854	115865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428768508
56	NC_019776	CCTAGC	2	12	119131	119142	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428768511
57	NC_019776	TCTATT	2	12	120558	120569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428768512
58	NC_019776	AAATTA	2	12	122515	122526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768514
59	NC_019776	TCTAAT	2	12	124977	124988	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768514
60	NC_019776	AATATA	2	12	127317	127328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428768516
61	NC_019776	ATCATA	2	12	130626	130637	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428768520
62	NC_019776	ACCAAA	2	12	131950	131961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428768522
63	NC_019776	ACCAAT	2	12	133703	133714	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428768523
64	NC_019776	AAAGGT	2	12	136337	136348	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428768525
65	NC_019776	ATTTAG	2	12	138064	138075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428768526
66	NC_019776	ATAAAA	2	12	140212	140223	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	428768528
67	NC_019776	TCTATT	2	12	140957	140968	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428768529
68	NC_019776	AGCATT	2	12	144291	144302	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428768530
69	NC_019776	ACAGAA	2	12	144429	144440	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428768530
70	NC_019776	TTACTC	2	12	145005	145016	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428768531
71	NC_019776	GAAAAA	2	12	145859	145870	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428768532
72	NC_019776	AGCTAG	2	12	146851	146862	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428768532
73	NC_019776	GAACCC	2	12	152966	152977	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428768537
74	NC_019776	CTGGTG	2	12	154951	154962	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428768539
75	NC_019776	TTTCTT	2	12	156492	156503	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428768540
76	NC_019776	GCGATC	2	12	164172	164183	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428768545
77	NC_019776	TGGTTT	2	12	166214	166225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428768547
78	NC_019776	TTCTTT	2	12	170370	170381	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428768551
79	NC_019776	AAAAGT	2	12	171203	171214	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428768551
80	NC_019776	CATGGC	2	12	172806	172817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428768552
81	NC_019776	TCCTTT	2	12	174068	174079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768553
82	NC_019776	CTTAAA	2	12	175020	175031	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428768554
83	NC_019776	AAGGAA	2	12	177388	177399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428768556
84	NC_019776	GTACCA	2	12	183730	183741	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428768561
85	NC_019776	ATTCTA	2	12	185437	185448	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768563
86	NC_019776	AGAAAT	2	12	186949	186960	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428768564
87	NC_019776	TTAGAT	2	12	193167	193178	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428768572
88	NC_019776	TCAATT	2	12	194270	194281	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768572
89	NC_019776	TTTTAG	2	12	194506	194517	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428768572
90	NC_019776	AAAATA	2	12	194884	194895	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	428768572
91	NC_019776	TAAATC	2	12	195194	195205	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428768573
92	NC_019776	GGAAAA	2	12	197285	197296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428768574
93	NC_019776	AACTTT	2	12	199493	199504	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768575
94	NC_019776	ATATTG	2	12	199551	199562	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428768575
95	NC_019776	ATTAAG	2	12	203297	203308	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428768579
96	NC_019776	TGGTAT	2	12	203353	203364	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428768579
97	NC_019776	CTTTAT	2	12	204935	204946	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428768580
98	NC_019776	TTCCTT	2	12	206012	206023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428768581
99	NC_019776	CTTTTG	2	12	209009	209020	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428768585
100	NC_019776	AGGAAT	2	12	216768	216779	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428768593
101	NC_019776	GCGATC	2	12	220794	220805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428768595
102	NC_019776	ATTTAT	2	12	224674	224685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428768598
103	NC_019776	GTAACC	2	12	226150	226161	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428768600
104	NC_019776	ATTAAC	2	12	226899	226910	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428768601
105	NC_019776	AAACAA	2	12	228348	228359	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	428768603
106	NC_019776	GAGTAG	2	12	229427	229438	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428768604
107	NC_019776	GAACAA	2	12	230182	230193	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428768606
108	NC_019776	ACCCTT	2	12	230541	230552	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428768606
109	NC_019776	TACCCT	2	12	233917	233928	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428768610
110	NC_019776	TGTTAC	2	12	236330	236341	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428768610
111	NC_019776	ATCAAT	2	12	237000	237011	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428768610
112	NC_019776	CATTAC	2	12	237563	237574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428768610
113	NC_019776	CAATGC	2	12	239657	239668	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428768610
114	NC_019776	TACCAT	2	12	240317	240328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428768610
115	NC_019776	CCCAAT	2	12	241149	241160	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428768610
116	NC_019776	GATGGA	2	12	242778	242789	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428768610
117	NC_019776	TCAATC	2	12	243721	243732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428768610
118	NC_019776	GGTCAA	2	12	243939	243950	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428768610
119	NC_019776	AACCAA	2	12	247968	247979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428768611
120	NC_019776	ACTATT	2	12	251846	251857	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428768614
121	NC_019776	TGTCCT	2	12	258362	258373	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428768615
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123	NC_019776	AAATCA	2	12	260321	260332	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428768616
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