MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 chromosome

Total Repeats: 12348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019776	CAAT	2	8	748	755	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019776	AATA	2	8	1481	1488	75 %	25 %	0 %	0 %	428768416
3	NC_019776	CAAC	2	8	1733	1740	50 %	0 %	0 %	50 %	428768416
4	NC_019776	TTAA	2	8	1773	1780	50 %	50 %	0 %	0 %	428768416
5	NC_019776	ACTG	2	8	2300	2307	25 %	25 %	25 %	25 %	428768417
6	NC_019776	ATTA	2	8	2419	2426	50 %	50 %	0 %	0 %	428768417
7	NC_019776	GTTA	2	8	2455	2462	25 %	50 %	25 %	0 %	428768417
8	NC_019776	AAAT	2	8	2659	2666	75 %	25 %	0 %	0 %	428768417
9	NC_019776	AATT	2	8	3948	3955	50 %	50 %	0 %	0 %	428768418
10	NC_019776	GAAA	2	8	4355	4362	75 %	0 %	25 %	0 %	428768418
11	NC_019776	ATAA	2	8	4468	4475	75 %	25 %	0 %	0 %	428768418
12	NC_019776	ATTA	2	8	5257	5264	50 %	50 %	0 %	0 %	428768418
13	NC_019776	CTGA	2	8	5622	5629	25 %	25 %	25 %	25 %	428768418
14	NC_019776	TAAA	2	8	5821	5828	75 %	25 %	0 %	0 %	428768418
15	NC_019776	AAGA	2	8	6454	6461	75 %	0 %	25 %	0 %	428768419
16	NC_019776	ACAA	2	8	6534	6541	75 %	0 %	0 %	25 %	428768419
17	NC_019776	TAAT	2	8	7130	7137	50 %	50 %	0 %	0 %	428768419
18	NC_019776	CTCA	2	8	7212	7219	25 %	25 %	0 %	50 %	428768419
19	NC_019776	TAAC	2	8	7325	7332	50 %	25 %	0 %	25 %	428768419
20	NC_019776	AACT	2	8	7365	7372	50 %	25 %	0 %	25 %	428768419
21	NC_019776	CCAG	2	8	7462	7469	25 %	0 %	25 %	50 %	428768419
22	NC_019776	CTTT	2	8	7565	7572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019776	TAAT	2	8	7901	7908	50 %	50 %	0 %	0 %	428768420
24	NC_019776	TAAT	2	8	8036	8043	50 %	50 %	0 %	0 %	428768420
25	NC_019776	AACC	2	8	8885	8892	50 %	0 %	0 %	50 %	428768421
26	NC_019776	AATA	2	8	9087	9094	75 %	25 %	0 %	0 %	428768421
27	NC_019776	AGAA	2	8	9522	9529	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019776	ATGA	2	8	9664	9671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019776	AAAT	2	8	9689	9696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019776	AAAT	2	8	9711	9718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019776	TTTA	2	8	9750	9757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019776	GTTT	2	8	9936	9943	0 %	75 %	25 %	0 %	428768422
33	NC_019776	ATCT	2	8	10264	10271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019776	ATTG	2	8	10344	10351	25 %	50 %	25 %	0 %	428768423
35	NC_019776	TTAA	2	8	10892	10899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019776	TCTG	2	8	11555	11562	0 %	50 %	25 %	25 %	428768424
37	NC_019776	ACTT	2	8	11638	11645	25 %	50 %	0 %	25 %	428768424
38	NC_019776	GTTG	2	8	11928	11935	0 %	50 %	50 %	0 %	428768424
39	NC_019776	TAAA	2	8	12142	12149	75 %	25 %	0 %	0 %	428768424
40	NC_019776	GTTT	2	8	12890	12897	0 %	75 %	25 %	0 %	428768424
41	NC_019776	TAGT	2	8	12914	12921	25 %	50 %	25 %	0 %	428768424
42	NC_019776	CTAA	2	8	13199	13206	50 %	25 %	0 %	25 %	428768424
43	NC_019776	TCTT	2	8	13489	13496	0 %	75 %	0 %	25 %	428768424
44	NC_019776	AAAT	2	8	13831	13838	75 %	25 %	0 %	0 %	428768424
45	NC_019776	AAAT	2	8	14298	14305	75 %	25 %	0 %	0 %	428768425
46	NC_019776	ATCA	2	8	14417	14424	50 %	25 %	0 %	25 %	428768425
47	NC_019776	GATA	2	8	14516	14523	50 %	25 %	25 %	0 %	428768425
48	NC_019776	TAAT	2	8	14542	14549	50 %	50 %	0 %	0 %	428768426
49	NC_019776	TATT	2	8	14717	14724	25 %	75 %	0 %	0 %	428768426
50	NC_019776	GTCA	2	8	14785	14792	25 %	25 %	25 %	25 %	428768426
51	NC_019776	ACAG	2	8	15197	15204	50 %	0 %	25 %	25 %	428768427
52	NC_019776	GAAA	2	8	15725	15732	75 %	0 %	25 %	0 %	428768427
53	NC_019776	GGAA	2	8	15976	15983	50 %	0 %	50 %	0 %	428768428
54	NC_019776	AGAA	2	8	16171	16178	75 %	0 %	25 %	0 %	428768428
55	NC_019776	TTTA	2	8	17383	17390	25 %	75 %	0 %	0 %	428768428
56	NC_019776	TAGT	2	8	17607	17614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019776	TATT	2	8	17699	17706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019776	CCAC	2	8	17955	17962	25 %	0 %	0 %	75 %	428768429
59	NC_019776	CATC	2	8	18232	18239	25 %	25 %	0 %	50 %	428768429
60	NC_019776	TTAC	2	8	18609	18616	25 %	50 %	0 %	25 %	428768429
61	NC_019776	GAAT	2	8	18933	18940	50 %	25 %	25 %	0 %	428768430
62	NC_019776	TAGT	2	8	19224	19231	25 %	50 %	25 %	0 %	428768430
63	NC_019776	TAAA	2	8	19242	19249	75 %	25 %	0 %	0 %	428768430
64	NC_019776	TATT	2	8	19360	19367	25 %	75 %	0 %	0 %	428768430
65	NC_019776	TGTT	2	8	20032	20039	0 %	75 %	25 %	0 %	428768430
66	NC_019776	TTGG	2	8	20454	20461	0 %	50 %	50 %	0 %	428768431
67	NC_019776	CTAT	2	8	21046	21053	25 %	50 %	0 %	25 %	428768431
68	NC_019776	CTAT	2	8	22060	22067	25 %	50 %	0 %	25 %	428768432
69	NC_019776	ATTT	2	8	22205	22212	25 %	75 %	0 %	0 %	428768432
70	NC_019776	TGAT	2	8	23185	23192	25 %	50 %	25 %	0 %	428768433
71	NC_019776	TGAT	2	8	23629	23636	25 %	50 %	25 %	0 %	428768433
72	NC_019776	CAAA	2	8	23686	23693	75 %	0 %	0 %	25 %	428768433
73	NC_019776	TTTA	2	8	24347	24354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019776	TAAT	2	8	24461	24468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019776	ATTT	2	8	24498	24505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019776	AACC	2	8	24563	24570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019776	CTAT	2	8	25409	25416	25 %	50 %	0 %	25 %	428768434
78	NC_019776	TAAA	2	8	25766	25773	75 %	25 %	0 %	0 %	428768434
79	NC_019776	TATT	2	8	26070	26077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019776	ATTA	2	8	26088	26095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019776	TTTA	2	8	26836	26843	25 %	75 %	0 %	0 %	428768435
82	NC_019776	AATT	2	8	26988	26995	50 %	50 %	0 %	0 %	428768435
83	NC_019776	ATTT	2	8	27036	27043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019776	ATTA	2	8	27104	27111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019776	TATT	2	8	27310	27317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019776	CGAT	2	8	28274	28281	25 %	25 %	25 %	25 %	428768436
87	NC_019776	TTAT	2	8	28569	28576	25 %	75 %	0 %	0 %	428768436
88	NC_019776	TAAA	2	8	29989	29996	75 %	25 %	0 %	0 %	428768437
89	NC_019776	ACCA	2	8	30185	30192	50 %	0 %	0 %	50 %	428768437
90	NC_019776	TTAA	2	8	30668	30675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019776	TAAT	2	8	30699	30706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019776	CCCA	2	8	31653	31660	25 %	0 %	0 %	75 %	428768438
93	NC_019776	ACTT	2	8	31856	31863	25 %	50 %	0 %	25 %	428768438
94	NC_019776	TTAA	2	8	32058	32065	50 %	50 %	0 %	0 %	428768439
95	NC_019776	ACTA	2	8	32153	32160	50 %	25 %	0 %	25 %	428768439
96	NC_019776	GATA	2	8	32233	32240	50 %	25 %	25 %	0 %	428768439
97	NC_019776	AAAT	2	8	32760	32767	75 %	25 %	0 %	0 %	428768439
98	NC_019776	AATT	2	8	33038	33045	50 %	50 %	0 %	0 %	428768439
99	NC_019776	GAAA	2	8	33294	33301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019776	CAAA	2	8	33459	33466	75 %	0 %	0 %	25 %	428768440
101	NC_019776	TTGG	2	8	34225	34232	0 %	50 %	50 %	0 %	428768440
102	NC_019776	ATTT	2	8	34302	34309	25 %	75 %	0 %	0 %	428768440
103	NC_019776	AATT	2	8	34546	34553	50 %	50 %	0 %	0 %	428768440
104	NC_019776	TATT	2	8	34591	34598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019776	TTTG	2	8	34932	34939	0 %	75 %	25 %	0 %	428768441
106	NC_019776	ATTT	2	8	35117	35124	25 %	75 %	0 %	0 %	428768441
107	NC_019776	AAAG	2	8	35468	35475	75 %	0 %	25 %	0 %	428768441
108	NC_019776	AGAA	2	8	35543	35550	75 %	0 %	25 %	0 %	428768442
109	NC_019776	AATT	2	8	35578	35585	50 %	50 %	0 %	0 %	428768442
110	NC_019776	AATT	2	8	35843	35850	50 %	50 %	0 %	0 %	428768442
111	NC_019776	TTTA	2	8	36015	36022	25 %	75 %	0 %	0 %	428768443
112	NC_019776	GTGA	2	8	36522	36529	25 %	25 %	50 %	0 %	428768444
113	NC_019776	CGCT	2	8	36845	36852	0 %	25 %	25 %	50 %	428768444
114	NC_019776	AAGA	2	8	36910	36917	75 %	0 %	25 %	0 %	428768444
115	NC_019776	TCAT	2	8	37126	37133	25 %	50 %	0 %	25 %	428768444
116	NC_019776	GGTT	2	8	37416	37423	0 %	50 %	50 %	0 %	428768444
117	NC_019776	TAAC	2	8	37438	37445	50 %	25 %	0 %	25 %	428768444
118	NC_019776	CCTT	2	8	37795	37802	0 %	50 %	0 %	50 %	428768444
119	NC_019776	ATTT	2	8	37881	37888	25 %	75 %	0 %	0 %	428768444
120	NC_019776	TAAA	2	8	38200	38207	75 %	25 %	0 %	0 %	428768445
121	NC_019776	TAGT	2	8	38356	38363	25 %	50 %	25 %	0 %	428768445
122	NC_019776	ATGT	2	8	38547	38554	25 %	50 %	25 %	0 %	428768445
123	NC_019776	TGGT	2	8	38575	38582	0 %	50 %	50 %	0 %	428768445
124	NC_019776	CAAA	2	8	38859	38866	75 %	0 %	0 %	25 %	428768445
125	NC_019776	ATTT	2	8	39360	39367	25 %	75 %	0 %	0 %	428768445
126	NC_019776	AAAT	2	8	39449	39456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019776	TAAC	2	8	39534	39541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019776	CTAG	2	8	40067	40074	25 %	25 %	25 %	25 %	428768446
129	NC_019776	ATTG	2	8	40086	40093	25 %	50 %	25 %	0 %	428768446
130	NC_019776	ATAG	2	8	40119	40126	50 %	25 %	25 %	0 %	428768446
131	NC_019776	AATT	2	8	40162	40169	50 %	50 %	0 %	0 %	428768446
132	NC_019776	GAAG	2	8	40609	40616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019776	TACT	2	8	40730	40737	25 %	50 %	0 %	25 %	428768447
134	NC_019776	GGTC	2	8	40955	40962	0 %	25 %	50 %	25 %	428768447
135	NC_019776	AATT	2	8	41129	41136	50 %	50 %	0 %	0 %	428768447
136	NC_019776	TTGG	2	8	41599	41606	0 %	50 %	50 %	0 %	428768448
137	NC_019776	AAGA	2	8	41701	41708	75 %	0 %	25 %	0 %	428768448
138	NC_019776	TTAT	2	8	42417	42424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019776	GGAT	2	8	42704	42711	25 %	25 %	50 %	0 %	428768450
140	NC_019776	TTTC	2	8	42813	42820	0 %	75 %	0 %	25 %	428768450
141	NC_019776	TTAC	2	8	42832	42839	25 %	50 %	0 %	25 %	428768450
142	NC_019776	ACAA	2	8	43026	43033	75 %	0 %	0 %	25 %	428768450
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