MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.06

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019775	ATCA	2	8	36	43	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019775	TACT	2	8	251	258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019775	AAAC	2	8	348	355	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019775	AGAT	2	8	522	529	50 %	25 %	25 %	0 %	440685391
5	NC_019775	CGTC	2	8	930	937	0 %	25 %	25 %	50 %	440685391
6	NC_019775	TATT	2	8	1291	1298	25 %	75 %	0 %	0 %	440685392
7	NC_019775	CCTT	2	8	1989	1996	0 %	50 %	0 %	50 %	440685392
8	NC_019775	ACCA	2	8	2048	2055	50 %	0 %	0 %	50 %	440685392
9	NC_019775	TCTT	2	8	2628	2635	0 %	75 %	0 %	25 %	440685392
10	NC_019775	TCTT	2	8	2817	2824	0 %	75 %	0 %	25 %	440685392
11	NC_019775	TCTA	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	440685392
12	NC_019775	CTTT	2	8	4166	4173	0 %	75 %	0 %	25 %	440685392
13	NC_019775	AATA	2	8	4698	4705	75 %	25 %	0 %	0 %	440685392
14	NC_019775	AGTG	2	8	5040	5047	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019775	TTCT	2	8	5074	5081	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019775	ATTT	2	8	5226	5233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019775	CAAA	2	8	5458	5465	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019775	TCAA	2	8	5506	5513	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019775	ATAG	2	8	5765	5772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019775	TTTA	2	8	5775	5782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019775	TAGT	2	8	6072	6079	25 %	50 %	25 %	0 %	440685393
22	NC_019775	TTGG	3	12	6219	6230	0 %	50 %	50 %	0 %	440685393
23	NC_019775	ATCT	2	8	6311	6318	25 %	50 %	0 %	25 %	440685394
24	NC_019775	AACT	2	8	6569	6576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019775	AGTA	2	8	6883	6890	50 %	25 %	25 %	0 %	440685395
26	NC_019775	CAGC	2	8	7475	7482	25 %	0 %	25 %	50 %	440685396
27	NC_019775	AACC	2	8	7568	7575	50 %	0 %	0 %	50 %	440685396
28	NC_019775	AATC	2	8	8156	8163	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019775	CAAC	2	8	8498	8505	50 %	0 %	0 %	50 %	440685397
30	NC_019775	ATTA	2	8	8600	8607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019775	CCCT	2	8	8790	8797	0 %	25 %	0 %	75 %	440685398
32	NC_019775	TGAG	2	8	8916	8923	25 %	25 %	50 %	0 %	440685398
33	NC_019775	GACA	2	8	9036	9043	50 %	0 %	25 %	25 %	440685398
34	NC_019775	TTGA	2	8	9134	9141	25 %	50 %	25 %	0 %	440685398
35	NC_019775	ATTA	2	8	9221	9228	50 %	50 %	0 %	0 %	440685398
36	NC_019775	CTAT	2	8	9467	9474	25 %	50 %	0 %	25 %	440685399
37	NC_019775	CTGA	2	8	9960	9967	25 %	25 %	25 %	25 %	440685400
38	NC_019775	GGTA	2	8	10742	10749	25 %	25 %	50 %	0 %	440685400
39	NC_019775	CAAT	2	8	11318	11325	50 %	25 %	0 %	25 %	440685400
40	NC_019775	ATCT	2	8	11603	11610	25 %	50 %	0 %	25 %	440685400
41	NC_019775	TCAA	2	8	11632	11639	50 %	25 %	0 %	25 %	440685400
42	NC_019775	GGTT	2	8	12352	12359	0 %	50 %	50 %	0 %	440685401
43	NC_019775	TAGG	2	8	12395	12402	25 %	25 %	50 %	0 %	440685401
44	NC_019775	TGAG	2	8	12450	12457	25 %	25 %	50 %	0 %	440685401
45	NC_019775	TTCT	2	8	12853	12860	0 %	75 %	0 %	25 %	440685401
46	NC_019775	ATTC	2	8	13084	13091	25 %	50 %	0 %	25 %	440685401
47	NC_019775	GCAA	2	8	13746	13753	50 %	0 %	25 %	25 %	440685403
48	NC_019775	AGTG	2	8	14274	14281	25 %	25 %	50 %	0 %	440685403
49	NC_019775	ATTT	2	8	14407	14414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019775	GGAC	2	8	14872	14879	25 %	0 %	50 %	25 %	440685404
51	NC_019775	TCCT	2	8	15049	15056	0 %	50 %	0 %	50 %	440685405
52	NC_019775	TTAA	2	8	15170	15177	50 %	50 %	0 %	0 %	440685405
53	NC_019775	TTAC	2	8	15357	15364	25 %	50 %	0 %	25 %	440685405
54	NC_019775	CTCG	2	8	15427	15434	0 %	25 %	25 %	50 %	440685405
55	NC_019775	ATCC	2	8	15603	15610	25 %	25 %	0 %	50 %	440685405
56	NC_019775	AACC	2	8	15964	15971	50 %	0 %	0 %	50 %	440685406
57	NC_019775	TACC	2	8	16044	16051	25 %	25 %	0 %	50 %	440685406
58	NC_019775	CAAT	2	8	16065	16072	50 %	25 %	0 %	25 %	440685406
59	NC_019775	ATTT	2	8	17322	17329	25 %	75 %	0 %	0 %	440685408
60	NC_019775	AAAG	2	8	17730	17737	75 %	0 %	25 %	0 %	440685408
61	NC_019775	ATTT	2	8	17868	17875	25 %	75 %	0 %	0 %	440685408
62	NC_019775	GTTT	2	8	18961	18968	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019775	ATTT	2	8	19030	19037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019775	AGCC	2	8	19330	19337	25 %	0 %	25 %	50 %	440685410
65	NC_019775	AAAC	2	8	19345	19352	75 %	0 %	0 %	25 %	440685410
66	NC_019775	GTCA	2	8	19587	19594	25 %	25 %	25 %	25 %	440685410
67	NC_019775	GTTA	2	8	19620	19627	25 %	50 %	25 %	0 %	440685410
68	NC_019775	AATC	2	8	19628	19635	50 %	25 %	0 %	25 %	440685410
69	NC_019775	ATTC	2	8	19727	19734	25 %	50 %	0 %	25 %	440685410
70	NC_019775	GTTA	2	8	20034	20041	25 %	50 %	25 %	0 %	440685410
71	NC_019775	TTAA	2	8	20086	20093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019775	ATCA	2	8	20186	20193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019775	ACTA	2	8	20526	20533	50 %	25 %	0 %	25 %	440685411
74	NC_019775	ATTT	2	8	20718	20725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019775	CTTA	2	8	21155	21162	25 %	50 %	0 %	25 %	440685413
76	NC_019775	CATA	2	8	21544	21551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019775	AGTA	2	8	21686	21693	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019775	TGAT	2	8	21901	21908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019775	ATAG	2	8	22476	22483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.