MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.06

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019775	TCT	2	6	30	35	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019775	ATT	2	6	168	173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019775	GTT	2	6	280	285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019775	TGG	2	6	376	381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019775	ATT	2	6	452	457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019775	TAA	2	6	477	482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685391
7	NC_019775	TTC	2	6	504	509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685391
8	NC_019775	GCT	2	6	679	684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685391
9	NC_019775	ACC	2	6	917	922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685391
10	NC_019775	TCT	2	6	953	958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685391
11	NC_019775	TTA	2	6	1018	1023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685391
12	NC_019775	TAT	2	6	1055	1060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019775	AAC	2	6	1156	1161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685392
14	NC_019775	AGC	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685392
15	NC_019775	TCC	2	6	1200	1205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440685392
16	NC_019775	CAT	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
17	NC_019775	TGC	2	6	1302	1307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
18	NC_019775	TGA	2	6	1344	1349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685392
19	NC_019775	TAT	2	6	1558	1563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
20	NC_019775	CAA	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685392
21	NC_019775	TCT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
22	NC_019775	CTT	2	6	1810	1815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
23	NC_019775	AGC	2	6	1865	1870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685392
24	NC_019775	TTG	2	6	1898	1903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685392
25	NC_019775	AGC	2	6	1946	1951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685392
26	NC_019775	CTT	2	6	2089	2094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
27	NC_019775	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685392
28	NC_019775	GGC	2	6	2198	2203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440685392
29	NC_019775	CTT	2	6	2209	2214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
30	NC_019775	ATC	2	6	2270	2275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
31	NC_019775	TTA	2	6	2358	2363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
32	NC_019775	TCA	2	6	2400	2405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
33	NC_019775	TTC	2	6	2513	2518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
34	NC_019775	CAG	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685392
35	NC_019775	TCT	2	6	2554	2559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
36	NC_019775	TTC	2	6	2615	2620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
37	NC_019775	CTC	2	6	2621	2626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440685392
38	NC_019775	TAA	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
39	NC_019775	TCT	2	6	2670	2675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
40	NC_019775	TTA	2	6	2694	2699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
41	NC_019775	CGT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
42	NC_019775	TTA	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
43	NC_019775	AAT	2	6	3001	3006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
44	NC_019775	ACT	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
45	NC_019775	TAA	2	6	3161	3166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
46	NC_019775	GTT	2	6	3347	3352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685392
47	NC_019775	CGT	2	6	3409	3414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
48	NC_019775	ACC	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685392
49	NC_019775	TGA	2	6	3456	3461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685392
50	NC_019775	AGT	2	6	3471	3476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685392
51	NC_019775	TCT	2	6	3588	3593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
52	NC_019775	AGA	2	6	3833	3838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685392
53	NC_019775	TCT	2	6	3873	3878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
54	NC_019775	GGA	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440685392
55	NC_019775	TCA	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
56	NC_019775	ATC	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
57	NC_019775	TAT	2	6	4138	4143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
58	NC_019775	AAG	2	6	4182	4187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685392
59	NC_019775	CTA	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
60	NC_019775	GCT	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
61	NC_019775	TGG	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440685392
62	NC_019775	CTA	2	6	4585	4590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
63	NC_019775	ACC	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685392
64	NC_019775	TGC	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
65	NC_019775	TTC	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
66	NC_019775	AAT	2	6	4875	4880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
67	NC_019775	AAT	2	6	4998	5003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
68	NC_019775	CGT	2	6	5067	5072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019775	ACC	2	6	5088	5093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_019775	GTG	2	6	5136	5141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019775	TGG	2	6	5146	5151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019775	TGT	2	6	5153	5158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019775	TAG	2	6	5190	5195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019775	CTA	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019775	CTG	2	6	5539	5544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019775	CGG	2	6	5556	5561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019775	CTA	2	6	5663	5668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019775	AAT	2	6	5740	5745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019775	TAT	2	6	5858	5863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019775	AGC	3	9	5917	5925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685393
81	NC_019775	ATC	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685393
82	NC_019775	TAG	2	6	6174	6179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685393
83	NC_019775	AGT	2	6	6188	6193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685393
84	NC_019775	ATC	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685394
85	NC_019775	TGT	2	6	6420	6425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685394
86	NC_019775	TAG	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019775	ACG	2	6	6805	6810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685395
88	NC_019775	TGA	2	6	6826	6831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685395
89	NC_019775	CAC	2	6	6990	6995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685395
90	NC_019775	AGC	2	6	7147	7152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685395
91	NC_019775	GAT	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685396
92	NC_019775	CTG	2	6	7446	7451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685396
93	NC_019775	TGG	2	6	7540	7545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440685396
94	NC_019775	ATT	2	6	7613	7618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685396
95	NC_019775	GAA	2	6	7628	7633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685396
96	NC_019775	AAC	2	6	7788	7793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685396
97	NC_019775	GAT	2	6	7832	7837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685396
98	NC_019775	AGC	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685396
99	NC_019775	CAG	2	6	7882	7887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685396
100	NC_019775	TAC	2	6	7958	7963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019775	ACG	2	6	8027	8032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019775	CAA	2	6	8056	8061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019775	GCT	2	6	8254	8259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685397
104	NC_019775	TTG	2	6	8290	8295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685397
105	NC_019775	TTA	2	6	8428	8433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685397
106	NC_019775	AAC	2	6	8446	8451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685397
107	NC_019775	TAC	2	6	8492	8497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685397
108	NC_019775	GCT	2	6	8666	8671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685398
109	NC_019775	TAA	2	6	8716	8721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685398
110	NC_019775	ACT	2	6	8754	8759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685398
111	NC_019775	AAC	2	6	8800	8805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685398
112	NC_019775	CTT	2	6	9255	9260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019775	CAG	2	6	9277	9282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685399
114	NC_019775	AGA	2	6	9477	9482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685399
115	NC_019775	GCA	2	6	9487	9492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685399
116	NC_019775	TTG	2	6	9661	9666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685399
117	NC_019775	TAA	2	6	9680	9685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685399
118	NC_019775	AGC	2	6	9716	9721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685399
119	NC_019775	TAG	2	6	9743	9748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685399
120	NC_019775	ATT	2	6	9836	9841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685400
121	NC_019775	CAG	2	6	9852	9857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685400
122	NC_019775	TCT	2	6	9903	9908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685400
123	NC_019775	TAC	2	6	10009	10014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685400
124	NC_019775	AGA	2	6	10046	10051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685400
125	NC_019775	TAT	2	6	10084	10089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685400
126	NC_019775	AGA	2	6	10196	10201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685400
127	NC_019775	AGC	2	6	10280	10285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685400
128	NC_019775	ATT	2	6	10398	10403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685400
129	NC_019775	AGC	2	6	10439	10444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685400
130	NC_019775	ACC	2	6	10450	10455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685400
131	NC_019775	ACT	2	6	10522	10527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685400
132	NC_019775	AGG	2	6	10552	10557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440685400
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249	NC_019775	AAT	2	6	20759	20764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_019775	ACA	2	6	21170	21175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685413
256	NC_019775	CTA	2	6	21182	21187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685413
257	NC_019775	GTA	2	6	21326	21331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685413
258	NC_019775	TCT	2	6	21338	21343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685413
259	NC_019775	ACT	2	6	21397	21402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685413
260	NC_019775	ACT	2	6	21474	21479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685413
261	NC_019775	ACC	2	6	21562	21567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_019775	GGT	2	6	21585	21590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
263	NC_019775	AAT	2	6	21771	21776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_019775	AGA	2	6	21909	21914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_019775	ATA	2	6	22037	22042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_019775	TGG	2	6	22090	22095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440685414
267	NC_019775	ATG	2	6	22250	22255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685414
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270	NC_019775	GTC	2	6	22464	22469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_019775	CCA	2	6	22672	22677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_019775	TAT	2	6	22725	22730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.