MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.04

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019774	ATCAAT	2	12	2249	2260	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440685331
2	NC_019774	CTTTTC	2	12	2312	2323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685331
3	NC_019774	CATCGA	2	12	4541	4552	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440685332
4	NC_019774	TAAATT	2	12	6005	6016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019774	CAAAAT	2	12	18814	18825	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019774	CTTTCA	2	12	23579	23590	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019774	TCCACC	2	12	26253	26264	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	440685345
8	NC_019774	TAAGCA	2	12	30822	30833	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440685348
9	NC_019774	TGGTTT	2	12	32249	32260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685350
10	NC_019774	AGTAAG	2	12	35192	35203	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440685353
11	NC_019774	TTTAGA	2	12	38095	38106	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440685355
12	NC_019774	AAACTT	2	12	38534	38545	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440685355
13	NC_019774	GCTTTA	2	12	42036	42047	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440685358
14	NC_019774	TTCAGA	2	12	42854	42865	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440685358
15	NC_019774	TTGTCG	2	12	43076	43087	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	440685358
16	NC_019774	AGCACC	2	12	45432	45443	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	440685359
17	NC_019774	ATTAAT	2	12	45987	45998	50 %	50 %	0 %	0 %	440685359
18	NC_019774	ATATTA	2	12	46192	46203	50 %	50 %	0 %	0 %	440685359
19	NC_019774	ATTAAT	2	12	46410	46421	50 %	50 %	0 %	0 %	440685359
20	NC_019774	ATATTA	2	12	46591	46602	50 %	50 %	0 %	0 %	440685359
21	NC_019774	TATTAA	2	12	47831	47842	50 %	50 %	0 %	0 %	440685359
22	NC_019774	ACTTAA	2	12	49010	49021	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019774	TTACTA	2	12	53225	53236	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440685363
24	NC_019774	CAAACC	2	12	54492	54503	50 %	0 %	0 %	50 %	440685365
25	NC_019774	CCCTTT	2	12	61049	61060	0 %	50 %	0 %	50 %	440685368
26	NC_019774	GCAACA	2	12	61138	61149	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	440685368
27	NC_019774	CTGAGA	2	12	63150	63161	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440685369
28	NC_019774	CATCTG	2	12	64676	64687	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440685370
29	NC_019774	GGTGAT	2	12	70560	70571	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	440685377
30	NC_019774	ACTTAA	2	12	72068	72079	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440685378
31	NC_019774	ATAGAC	2	12	74416	74427	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440685381
32	NC_019774	CCCCAA	2	12	74652	74663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685381
33	NC_019774	CACTAC	2	12	77910	77921	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	440685382
34	NC_019774	TGAAAT	2	12	78518	78529	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440685382
35	NC_019774	CATTGC	2	12	78978	78989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440685382
36	NC_019774	GCATCG	2	12	86007	86018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440685386
37	NC_019774	CAGCGC	2	12	87853	87864	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440685386
38	NC_019774	CCACAC	2	12	91117	91128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685386
39	NC_019774	GCCTGC	2	12	92372	92383	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440685386
40	NC_019774	CAGAAA	2	12	94588	94599	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	440685386
41	NC_019774	ACCTGA	2	12	96050	96061	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.