MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.04

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019774	AGTTC	2	10	1228	1237	20 %	40 %	20 %	20 %	440685331
2	NC_019774	CATGG	2	10	4662	4671	20 %	20 %	40 %	20 %	440685332
3	NC_019774	CTTTT	2	10	7468	7477	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019774	ATTTT	2	10	13122	13131	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019774	CCCAA	2	10	14164	14173	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_019774	ATATT	2	10	15834	15843	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019774	ATAGC	2	10	17900	17909	40 %	20 %	20 %	20 %	440685340
8	NC_019774	ACTGC	2	10	18567	18576	20 %	20 %	20 %	40 %	440685340
9	NC_019774	AAGCA	2	10	18956	18965	60 %	0 %	20 %	20 %	440685341
10	NC_019774	AAAAC	2	10	21305	21314	80 %	0 %	0 %	20 %	440685343
11	NC_019774	GTTTA	2	10	22432	22441	20 %	60 %	20 %	0 %	440685343
12	NC_019774	TTTAC	2	10	24457	24466	20 %	60 %	0 %	20 %	440685344
13	NC_019774	CCATC	2	10	25504	25513	20 %	20 %	0 %	60 %	440685344
14	NC_019774	TAACA	2	10	25999	26008	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019774	TTATA	2	10	26491	26500	40 %	60 %	0 %	0 %	440685345
16	NC_019774	TAATT	2	10	27811	27820	40 %	60 %	0 %	0 %	440685346
17	NC_019774	TTTAG	2	10	28064	28073	20 %	60 %	20 %	0 %	440685347
18	NC_019774	TAATT	2	10	30016	30025	40 %	60 %	0 %	0 %	440685347
19	NC_019774	TCAAG	2	10	31099	31108	40 %	20 %	20 %	20 %	440685348
20	NC_019774	TAATT	2	10	33006	33015	40 %	60 %	0 %	0 %	440685351
21	NC_019774	AATAT	2	10	33761	33770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019774	ATTAA	2	10	34807	34816	60 %	40 %	0 %	0 %	440685352
23	NC_019774	ATCAA	2	10	38032	38041	60 %	20 %	0 %	20 %	440685355
24	NC_019774	TAAAA	2	10	42323	42332	80 %	20 %	0 %	0 %	440685358
25	NC_019774	AGTTT	2	10	43968	43977	20 %	60 %	20 %	0 %	440685358
26	NC_019774	AATCA	2	10	44198	44207	60 %	20 %	0 %	20 %	440685358
27	NC_019774	TAATT	2	10	44825	44834	40 %	60 %	0 %	0 %	440685359
28	NC_019774	AATGC	2	10	50740	50749	40 %	20 %	20 %	20 %	440685361
29	NC_019774	TTTTA	2	10	51952	51961	20 %	80 %	0 %	0 %	440685362
30	NC_019774	CTTAA	2	10	52409	52418	40 %	40 %	0 %	20 %	440685362
31	NC_019774	TAACT	2	10	52735	52744	40 %	40 %	0 %	20 %	440685363
32	NC_019774	CTAAA	2	10	54884	54893	60 %	20 %	0 %	20 %	440685365
33	NC_019774	GTTGT	2	10	56763	56772	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019774	AGTCA	2	10	57784	57793	40 %	20 %	20 %	20 %	440685367
35	NC_019774	AAACC	2	10	59352	59361	60 %	0 %	0 %	40 %	440685368
36	NC_019774	GGATT	2	10	63474	63483	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019774	ATGCT	2	10	64961	64970	20 %	40 %	20 %	20 %	440685370
38	NC_019774	TGGTA	2	10	66069	66078	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019774	GATTG	2	10	70276	70285	20 %	40 %	40 %	0 %	440685377
40	NC_019774	GATTG	2	10	71421	71430	20 %	40 %	40 %	0 %	440685378
41	NC_019774	GCCTT	2	10	78530	78539	0 %	40 %	20 %	40 %	440685382
42	NC_019774	GTTTG	2	10	79754	79763	0 %	60 %	40 %	0 %	440685382
43	NC_019774	ATCGT	2	10	80192	80201	20 %	40 %	20 %	20 %	440685382
44	NC_019774	AATTT	2	10	80794	80803	40 %	60 %	0 %	0 %	440685383
45	NC_019774	TGTAA	2	10	81272	81281	40 %	40 %	20 %	0 %	440685383
46	NC_019774	TACCG	2	10	85364	85373	20 %	20 %	20 %	40 %	440685386
47	NC_019774	GCCTT	2	10	86847	86856	0 %	40 %	20 %	40 %	440685386
48	NC_019774	AAAAT	2	10	88695	88704	80 %	20 %	0 %	0 %	440685386
49	NC_019774	CGCCA	2	10	90125	90134	20 %	0 %	20 %	60 %	440685386
50	NC_019774	GCTGA	2	10	91652	91661	20 %	20 %	40 %	20 %	440685386
51	NC_019774	GCTGC	2	10	91722	91731	0 %	20 %	40 %	40 %	440685386
52	NC_019774	GCTGT	2	10	95581	95590	0 %	40 %	40 %	20 %	440685387
53	NC_019774	GGTTT	2	10	95736	95745	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019774	CTTTC	2	10	95760	95769	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_019774	TGATC	2	10	97050	97059	20 %	40 %	20 %	20 %	440685389

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.