MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.04

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019774	ATTT	2	8	178	185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019774	ATTG	2	8	742	749	25 %	50 %	25 %	0 %	440685331
3	NC_019774	AATT	2	8	1046	1053	50 %	50 %	0 %	0 %	440685331
4	NC_019774	AATT	2	8	1754	1761	50 %	50 %	0 %	0 %	440685331
5	NC_019774	AAAT	2	8	1778	1785	75 %	25 %	0 %	0 %	440685331
6	NC_019774	ATTT	2	8	1805	1812	25 %	75 %	0 %	0 %	440685331
7	NC_019774	GCAA	2	8	1830	1837	50 %	0 %	25 %	25 %	440685331
8	NC_019774	ATTA	2	8	1872	1879	50 %	50 %	0 %	0 %	440685331
9	NC_019774	CTAT	2	8	2008	2015	25 %	50 %	0 %	25 %	440685331
10	NC_019774	CTTA	2	8	2072	2079	25 %	50 %	0 %	25 %	440685331
11	NC_019774	AAAC	2	8	2268	2275	75 %	0 %	0 %	25 %	440685331
12	NC_019774	GGGT	2	8	2701	2708	0 %	25 %	75 %	0 %	440685331
13	NC_019774	TCTT	2	8	2979	2986	0 %	75 %	0 %	25 %	440685331
14	NC_019774	TAAA	2	8	3203	3210	75 %	25 %	0 %	0 %	440685331
15	NC_019774	TGTT	2	8	3316	3323	0 %	75 %	25 %	0 %	440685331
16	NC_019774	GCAA	2	8	4310	4317	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019774	CATT	2	8	4646	4653	25 %	50 %	0 %	25 %	440685332
18	NC_019774	TAGT	2	8	4717	4724	25 %	50 %	25 %	0 %	440685332
19	NC_019774	AAAC	2	8	4931	4938	75 %	0 %	0 %	25 %	440685332
20	NC_019774	CCCA	2	8	5057	5064	25 %	0 %	0 %	75 %	440685332
21	NC_019774	CTTT	2	8	5602	5609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019774	GGAC	2	8	5833	5840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019774	CATA	2	8	5894	5901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019774	GAAA	2	8	6487	6494	75 %	0 %	25 %	0 %	440685333
25	NC_019774	TAAA	2	8	6938	6945	75 %	25 %	0 %	0 %	440685333
26	NC_019774	AAAG	2	8	6994	7001	75 %	0 %	25 %	0 %	440685333
27	NC_019774	TCTA	2	8	7415	7422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019774	TCTT	2	8	7966	7973	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019774	GTAG	2	8	8153	8160	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019774	TTGA	2	8	9094	9101	25 %	50 %	25 %	0 %	440685334
31	NC_019774	CACC	2	8	9356	9363	25 %	0 %	0 %	75 %	440685334
32	NC_019774	ACTC	2	8	9406	9413	25 %	25 %	0 %	50 %	440685334
33	NC_019774	AACC	2	8	10503	10510	50 %	0 %	0 %	50 %	440685335
34	NC_019774	ATTA	2	8	10655	10662	50 %	50 %	0 %	0 %	440685335
35	NC_019774	CCAA	2	8	11625	11632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019774	ACTT	2	8	11763	11770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019774	CCAA	2	8	11779	11786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019774	ATTC	2	8	11931	11938	25 %	50 %	0 %	25 %	440685336
39	NC_019774	AGCA	2	8	12157	12164	50 %	0 %	25 %	25 %	440685336
40	NC_019774	ATAG	2	8	12240	12247	50 %	25 %	25 %	0 %	440685336
41	NC_019774	TAGT	2	8	12415	12422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019774	CAAG	2	8	12855	12862	50 %	0 %	25 %	25 %	440685337
43	NC_019774	TGGG	2	8	12992	12999	0 %	25 %	75 %	0 %	440685338
44	NC_019774	AACC	2	8	13524	13531	50 %	0 %	0 %	50 %	440685339
45	NC_019774	TTTA	2	8	13562	13569	25 %	75 %	0 %	0 %	440685339
46	NC_019774	CTAC	2	8	14389	14396	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019774	AAAG	2	8	14575	14582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019774	CAGA	2	8	14937	14944	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019774	ATAG	2	8	15126	15133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019774	TTAT	2	8	15222	15229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019774	GTCC	2	8	15288	15295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019774	AAAG	2	8	15519	15526	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019774	TCAA	2	8	16301	16308	50 %	25 %	0 %	25 %	440685340
54	NC_019774	AGCA	2	8	16882	16889	50 %	0 %	25 %	25 %	440685340
55	NC_019774	TCAG	2	8	16991	16998	25 %	25 %	25 %	25 %	440685340
56	NC_019774	TCAG	2	8	18110	18117	25 %	25 %	25 %	25 %	440685340
57	NC_019774	TTGA	2	8	19134	19141	25 %	50 %	25 %	0 %	440685341
58	NC_019774	TATT	2	8	19327	19334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019774	TAAT	2	8	20305	20312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019774	ATAC	2	8	20371	20378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019774	GCCA	2	8	20654	20661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019774	TAAT	2	8	20884	20891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019774	AACT	2	8	20969	20976	50 %	25 %	0 %	25 %	440685343
64	NC_019774	TCAC	2	8	21045	21052	25 %	25 %	0 %	50 %	440685343
65	NC_019774	TGAA	2	8	21097	21104	50 %	25 %	25 %	0 %	440685343
66	NC_019774	ATTT	2	8	21335	21342	25 %	75 %	0 %	0 %	440685343
67	NC_019774	TAGA	2	8	21718	21725	50 %	25 %	25 %	0 %	440685343
68	NC_019774	TAAA	2	8	22927	22934	75 %	25 %	0 %	0 %	440685343
69	NC_019774	TGAC	2	8	23993	24000	25 %	25 %	25 %	25 %	440685344
70	NC_019774	AATT	2	8	24086	24093	50 %	50 %	0 %	0 %	440685344
71	NC_019774	ATTT	2	8	24375	24382	25 %	75 %	0 %	0 %	440685344
72	NC_019774	TGGT	2	8	24768	24775	0 %	50 %	50 %	0 %	440685344
73	NC_019774	CTAA	2	8	25666	25673	50 %	25 %	0 %	25 %	440685344
74	NC_019774	CTTG	2	8	25991	25998	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019774	ATTT	2	8	26385	26392	25 %	75 %	0 %	0 %	440685345
76	NC_019774	TATT	2	8	26603	26610	25 %	75 %	0 %	0 %	440685345
77	NC_019774	TTAA	2	8	27929	27936	50 %	50 %	0 %	0 %	440685346
78	NC_019774	TATT	2	8	28306	28313	25 %	75 %	0 %	0 %	440685347
79	NC_019774	CTAA	2	8	28658	28665	50 %	25 %	0 %	25 %	440685347
80	NC_019774	TACT	2	8	29059	29066	25 %	50 %	0 %	25 %	440685347
81	NC_019774	ATTT	2	8	29277	29284	25 %	75 %	0 %	0 %	440685347
82	NC_019774	ATCT	2	8	29812	29819	25 %	50 %	0 %	25 %	440685347
83	NC_019774	AAAC	2	8	31551	31558	75 %	0 %	0 %	25 %	440685349
84	NC_019774	TGAA	2	8	31739	31746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019774	AATC	2	8	31810	31817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019774	GCAC	2	8	32274	32281	25 %	0 %	25 %	50 %	440685350
87	NC_019774	TGAA	2	8	32687	32694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019774	AATG	2	8	33562	33569	50 %	25 %	25 %	0 %	440685351
89	NC_019774	CCTT	2	8	33575	33582	0 %	50 %	0 %	50 %	440685351
90	NC_019774	CTGA	2	8	34034	34041	25 %	25 %	25 %	25 %	440685352
91	NC_019774	ACAA	2	8	34455	34462	75 %	0 %	0 %	25 %	440685352
92	NC_019774	GAAA	2	8	34582	34589	75 %	0 %	25 %	0 %	440685352
93	NC_019774	CAAT	2	8	35080	35087	50 %	25 %	0 %	25 %	440685353
94	NC_019774	TGAG	2	8	35620	35627	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019774	AAAC	2	8	35739	35746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019774	TCAA	2	8	35748	35755	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019774	TTAT	2	8	35886	35893	25 %	75 %	0 %	0 %	440685354
98	NC_019774	TTCA	2	8	35931	35938	25 %	50 %	0 %	25 %	440685354
99	NC_019774	AGCA	2	8	36843	36850	50 %	0 %	25 %	25 %	440685354
100	NC_019774	TCGT	2	8	37605	37612	0 %	50 %	25 %	25 %	440685355
101	NC_019774	TCAC	2	8	38447	38454	25 %	25 %	0 %	50 %	440685355
102	NC_019774	TTCC	2	8	38781	38788	0 %	50 %	0 %	50 %	440685356
103	NC_019774	CAGA	2	8	39297	39304	50 %	0 %	25 %	25 %	440685356
104	NC_019774	GTTG	2	8	39756	39763	0 %	50 %	50 %	0 %	440685356
105	NC_019774	TTAA	2	8	40205	40212	50 %	50 %	0 %	0 %	440685356
106	NC_019774	GTTT	2	8	40241	40248	0 %	75 %	25 %	0 %	440685356
107	NC_019774	AAAT	2	8	40542	40549	75 %	25 %	0 %	0 %	440685356
108	NC_019774	AAGT	2	8	40800	40807	50 %	25 %	25 %	0 %	440685356
109	NC_019774	AGTT	2	8	41218	41225	25 %	50 %	25 %	0 %	440685357
110	NC_019774	ATTT	2	8	41488	41495	25 %	75 %	0 %	0 %	440685357
111	NC_019774	TTGT	2	8	41635	41642	0 %	75 %	25 %	0 %	440685357
112	NC_019774	TCTT	2	8	42524	42531	0 %	75 %	0 %	25 %	440685358
113	NC_019774	AAAT	2	8	42697	42704	75 %	25 %	0 %	0 %	440685358
114	NC_019774	AATA	2	8	42946	42953	75 %	25 %	0 %	0 %	440685358
115	NC_019774	TTTG	2	8	43596	43603	0 %	75 %	25 %	0 %	440685358
116	NC_019774	TCTT	2	8	43920	43927	0 %	75 %	0 %	25 %	440685358
117	NC_019774	AATC	2	8	44041	44048	50 %	25 %	0 %	25 %	440685358
118	NC_019774	TTGA	2	8	44276	44283	25 %	50 %	25 %	0 %	440685358
119	NC_019774	TGAT	2	8	44306	44313	25 %	50 %	25 %	0 %	440685358
120	NC_019774	AATT	2	8	44907	44914	50 %	50 %	0 %	0 %	440685359
121	NC_019774	CATC	2	8	44931	44938	25 %	25 %	0 %	50 %	440685359
122	NC_019774	CTTT	2	8	45112	45119	0 %	75 %	0 %	25 %	440685359
123	NC_019774	GTTG	2	8	45287	45294	0 %	50 %	50 %	0 %	440685359
124	NC_019774	AAAT	2	8	45570	45577	75 %	25 %	0 %	0 %	440685359
125	NC_019774	ATTG	2	8	46782	46789	25 %	50 %	25 %	0 %	440685359
126	NC_019774	AAAG	2	8	47377	47384	75 %	0 %	25 %	0 %	440685359
127	NC_019774	CTAT	2	8	47980	47987	25 %	50 %	0 %	25 %	440685359
128	NC_019774	AATT	2	8	48104	48111	50 %	50 %	0 %	0 %	440685359
129	NC_019774	AAAT	2	8	48384	48391	75 %	25 %	0 %	0 %	440685359
130	NC_019774	AAAT	2	8	48552	48559	75 %	25 %	0 %	0 %	440685359
131	NC_019774	AACA	2	8	48796	48803	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019774	TCTA	2	8	49305	49312	25 %	50 %	0 %	25 %	440685360
133	NC_019774	GTTA	2	8	49812	49819	25 %	50 %	25 %	0 %	440685360
134	NC_019774	GTTA	2	8	49885	49892	25 %	50 %	25 %	0 %	440685360
135	NC_019774	GAAA	2	8	50133	50140	75 %	0 %	25 %	0 %	440685360
136	NC_019774	TTGG	2	8	51236	51243	0 %	50 %	50 %	0 %	440685361
137	NC_019774	TTAC	2	8	51374	51381	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019774	AACT	2	8	51394	51401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019774	AATC	2	8	51528	51535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019774	ATTG	2	8	52507	52514	25 %	50 %	25 %	0 %	440685362
141	NC_019774	TATG	2	8	52541	52548	25 %	50 %	25 %	0 %	440685362
142	NC_019774	GATT	2	8	52573	52580	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019774	TCAT	2	8	53316	53323	25 %	50 %	0 %	25 %	440685363
144	NC_019774	TTAA	2	8	54147	54154	50 %	50 %	0 %	0 %	440685364
145	NC_019774	ATTT	2	8	54324	54331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.