MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.04

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019774	CT	3	6	1638	1643	0 %	50 %	0 %	50 %	440685331
2	NC_019774	GA	3	6	1854	1859	50 %	0 %	50 %	0 %	440685331
3	NC_019774	GT	3	6	3228	3233	0 %	50 %	50 %	0 %	440685331
4	NC_019774	AT	3	6	3474	3479	50 %	50 %	0 %	0 %	440685331
5	NC_019774	TA	3	6	5183	5188	50 %	50 %	0 %	0 %	440685332
6	NC_019774	AT	3	6	6063	6068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019774	AG	3	6	6881	6886	50 %	0 %	50 %	0 %	440685333
8	NC_019774	TA	3	6	8298	8303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019774	AG	3	6	8619	8624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019774	GA	3	6	8629	8634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019774	CT	3	6	10196	10201	0 %	50 %	0 %	50 %	440685334
12	NC_019774	CA	3	6	10229	10234	50 %	0 %	0 %	50 %	440685334
13	NC_019774	TA	3	6	11149	11154	50 %	50 %	0 %	0 %	440685335
14	NC_019774	AG	3	6	12352	12357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019774	AG	3	6	12532	12537	50 %	0 %	50 %	0 %	440685337
16	NC_019774	GA	3	6	12561	12566	50 %	0 %	50 %	0 %	440685337
17	NC_019774	CA	3	6	17349	17354	50 %	0 %	0 %	50 %	440685340
18	NC_019774	AT	3	6	17460	17465	50 %	50 %	0 %	0 %	440685340
19	NC_019774	CT	3	6	17704	17709	0 %	50 %	0 %	50 %	440685340
20	NC_019774	AC	3	6	18196	18201	50 %	0 %	0 %	50 %	440685340
21	NC_019774	AT	3	6	18375	18380	50 %	50 %	0 %	0 %	440685340
22	NC_019774	TG	3	6	18591	18596	0 %	50 %	50 %	0 %	440685340
23	NC_019774	AT	3	6	19312	19317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019774	TA	3	6	20544	20549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019774	AC	3	6	22270	22275	50 %	0 %	0 %	50 %	440685343
26	NC_019774	AT	3	6	24431	24436	50 %	50 %	0 %	0 %	440685344
27	NC_019774	TA	3	6	26771	26776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019774	CT	3	6	28140	28145	0 %	50 %	0 %	50 %	440685347
29	NC_019774	TC	3	6	28490	28495	0 %	50 %	0 %	50 %	440685347
30	NC_019774	AG	3	6	29002	29007	50 %	0 %	50 %	0 %	440685347
31	NC_019774	AT	4	8	29681	29688	50 %	50 %	0 %	0 %	440685347
32	NC_019774	TC	3	6	30376	30381	0 %	50 %	0 %	50 %	440685347
33	NC_019774	TC	3	6	31237	31242	0 %	50 %	0 %	50 %	440685348
34	NC_019774	AG	3	6	31693	31698	50 %	0 %	50 %	0 %	440685349
35	NC_019774	TA	3	6	32561	32566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019774	TA	3	6	32665	32670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019774	CT	3	6	34278	34283	0 %	50 %	0 %	50 %	440685352
38	NC_019774	AT	3	6	34668	34673	50 %	50 %	0 %	0 %	440685352
39	NC_019774	AT	3	6	34797	34802	50 %	50 %	0 %	0 %	440685352
40	NC_019774	TA	4	8	34854	34861	50 %	50 %	0 %	0 %	440685353
41	NC_019774	CT	3	6	35651	35656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019774	AT	3	6	35699	35704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019774	TA	3	6	35813	35818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019774	AT	3	6	35953	35958	50 %	50 %	0 %	0 %	440685354
45	NC_019774	AT	3	6	36463	36468	50 %	50 %	0 %	0 %	440685354
46	NC_019774	TC	4	8	36536	36543	0 %	50 %	0 %	50 %	440685354
47	NC_019774	AT	3	6	37632	37637	50 %	50 %	0 %	0 %	440685355
48	NC_019774	TC	4	8	38314	38321	0 %	50 %	0 %	50 %	440685355
49	NC_019774	TA	3	6	38877	38882	50 %	50 %	0 %	0 %	440685356
50	NC_019774	GA	3	6	39613	39618	50 %	0 %	50 %	0 %	440685356
51	NC_019774	AT	3	6	40049	40054	50 %	50 %	0 %	0 %	440685356
52	NC_019774	CT	3	6	41067	41072	0 %	50 %	0 %	50 %	440685356
53	NC_019774	TA	3	6	43294	43299	50 %	50 %	0 %	0 %	440685358
54	NC_019774	GA	4	8	44413	44420	50 %	0 %	50 %	0 %	440685358
55	NC_019774	AC	3	6	44815	44820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019774	AG	3	6	47466	47471	50 %	0 %	50 %	0 %	440685359
57	NC_019774	AT	3	6	48026	48031	50 %	50 %	0 %	0 %	440685359
58	NC_019774	CT	3	6	49066	49071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019774	AT	3	6	49186	49191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019774	TG	3	6	49519	49524	0 %	50 %	50 %	0 %	440685360
61	NC_019774	AT	3	6	50079	50084	50 %	50 %	0 %	0 %	440685360
62	NC_019774	CA	3	6	51248	51253	50 %	0 %	0 %	50 %	440685361
63	NC_019774	GT	3	6	52187	52192	0 %	50 %	50 %	0 %	440685362
64	NC_019774	AT	3	6	52356	52361	50 %	50 %	0 %	0 %	440685362
65	NC_019774	TA	3	6	53772	53777	50 %	50 %	0 %	0 %	440685364
66	NC_019774	AT	3	6	54665	54670	50 %	50 %	0 %	0 %	440685365
67	NC_019774	AT	3	6	55460	55465	50 %	50 %	0 %	0 %	440685365
68	NC_019774	TC	3	6	55790	55795	0 %	50 %	0 %	50 %	440685365
69	NC_019774	CT	3	6	58424	58429	0 %	50 %	0 %	50 %	440685367
70	NC_019774	AG	3	6	60124	60129	50 %	0 %	50 %	0 %	440685368
71	NC_019774	CA	3	6	61292	61297	50 %	0 %	0 %	50 %	440685368
72	NC_019774	GT	3	6	61840	61845	0 %	50 %	50 %	0 %	440685368
73	NC_019774	AT	3	6	62374	62379	50 %	50 %	0 %	0 %	440685368
74	NC_019774	AC	3	6	62730	62735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019774	TA	3	6	62778	62783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019774	TC	3	6	63199	63204	0 %	50 %	0 %	50 %	440685369
77	NC_019774	CT	3	6	63214	63219	0 %	50 %	0 %	50 %	440685369
78	NC_019774	CA	3	6	64866	64871	50 %	0 %	0 %	50 %	440685370
79	NC_019774	AT	3	6	65937	65942	50 %	50 %	0 %	0 %	440685371
80	NC_019774	TC	3	6	66058	66063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019774	TG	3	6	66954	66959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019774	TA	3	6	66995	67000	50 %	50 %	0 %	0 %	440685374
83	NC_019774	GA	3	6	67211	67216	50 %	0 %	50 %	0 %	440685374
84	NC_019774	CT	3	6	69334	69339	0 %	50 %	0 %	50 %	440685376
85	NC_019774	CT	3	6	69684	69689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019774	TG	3	6	69757	69762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019774	TG	3	6	70189	70194	0 %	50 %	50 %	0 %	440685377
88	NC_019774	AT	3	6	72808	72813	50 %	50 %	0 %	0 %	440685379
89	NC_019774	TG	3	6	73119	73124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019774	TG	3	6	73126	73131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019774	TC	3	6	73347	73352	0 %	50 %	0 %	50 %	440685380
92	NC_019774	TA	3	6	73916	73921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019774	GA	3	6	75484	75489	50 %	0 %	50 %	0 %	440685381
94	NC_019774	AC	4	8	75842	75849	50 %	0 %	0 %	50 %	440685381
95	NC_019774	GA	3	6	80369	80374	50 %	0 %	50 %	0 %	440685382
96	NC_019774	CG	3	6	80391	80396	0 %	0 %	50 %	50 %	440685382
97	NC_019774	TC	3	6	80930	80935	0 %	50 %	0 %	50 %	440685383
98	NC_019774	AT	3	6	81088	81093	50 %	50 %	0 %	0 %	440685383
99	NC_019774	CT	3	6	81645	81650	0 %	50 %	0 %	50 %	440685383
100	NC_019774	GT	3	6	88003	88008	0 %	50 %	50 %	0 %	440685386
101	NC_019774	CT	3	6	88050	88055	0 %	50 %	0 %	50 %	440685386
102	NC_019774	GT	3	6	88489	88494	0 %	50 %	50 %	0 %	440685386
103	NC_019774	GC	3	6	88710	88715	0 %	0 %	50 %	50 %	440685386
104	NC_019774	AC	3	6	88777	88782	50 %	0 %	0 %	50 %	440685386
105	NC_019774	GC	3	6	90017	90022	0 %	0 %	50 %	50 %	440685386
106	NC_019774	CT	3	6	90171	90176	0 %	50 %	0 %	50 %	440685386
107	NC_019774	GT	3	6	93201	93206	0 %	50 %	50 %	0 %	440685386
108	NC_019774	AT	3	6	93761	93766	50 %	50 %	0 %	0 %	440685386
109	NC_019774	TA	3	6	94484	94489	50 %	50 %	0 %	0 %	440685386
110	NC_019774	GC	3	6	94616	94621	0 %	0 %	50 %	50 %	440685386
111	NC_019774	GC	3	6	94797	94802	0 %	0 %	50 %	50 %	440685386
112	NC_019774	CA	3	6	95451	95456	50 %	0 %	0 %	50 %	440685387
113	NC_019774	TA	3	6	95654	95659	50 %	50 %	0 %	0 %	440685387
114	NC_019774	TC	4	8	97128	97135	0 %	50 %	0 %	50 %	440685389

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.