MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.03

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019773	CAGTG	2	10	504	513	20 %	20 %	40 %	20 %	440685203
2	NC_019773	CCTAC	2	10	2871	2880	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_019773	ATGAC	2	10	3348	3357	40 %	20 %	20 %	20 %	440685206
4	NC_019773	AACCA	2	10	4026	4035	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_019773	ATTGA	2	10	4194	4203	40 %	40 %	20 %	0 %	440685208
6	NC_019773	ATACT	2	10	7555	7564	40 %	40 %	0 %	20 %	440685211
7	NC_019773	AAGTT	2	10	7813	7822	40 %	40 %	20 %	0 %	440685211
8	NC_019773	CAAAA	2	10	7907	7916	80 %	0 %	0 %	20 %	440685211
9	NC_019773	TGGTA	2	10	8035	8044	20 %	40 %	40 %	0 %	440685212
10	NC_019773	TAAAC	2	10	10540	10549	60 %	20 %	0 %	20 %	440685215
11	NC_019773	AAACT	2	10	17780	17789	60 %	20 %	0 %	20 %	440685222
12	NC_019773	TTGTT	2	10	19533	19542	0 %	80 %	20 %	0 %	440685224
13	NC_019773	TGTTC	2	10	21540	21549	0 %	60 %	20 %	20 %	440685225
14	NC_019773	TAAAG	2	10	22293	22302	60 %	20 %	20 %	0 %	440685225
15	NC_019773	TGTAT	2	10	23359	23368	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019773	ATAAA	2	10	25966	25975	80 %	20 %	0 %	0 %	440685226
17	NC_019773	ACATA	2	10	26288	26297	60 %	20 %	0 %	20 %	440685227
18	NC_019773	AGTTT	2	10	28863	28872	20 %	60 %	20 %	0 %	440685230
19	NC_019773	AGGAG	2	10	31038	31047	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019773	ATTTT	2	10	31972	31981	20 %	80 %	0 %	0 %	440685236
21	NC_019773	ATGGG	2	10	32072	32081	20 %	20 %	60 %	0 %	440685236
22	NC_019773	TCCAG	2	10	34381	34390	20 %	20 %	20 %	40 %	440685239
23	NC_019773	ATTAT	2	10	35465	35474	40 %	60 %	0 %	0 %	440685240
24	NC_019773	AGATA	2	10	35827	35836	60 %	20 %	20 %	0 %	440685241
25	NC_019773	ATCGC	2	10	37743	37752	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_019773	GAATT	2	10	38301	38310	40 %	40 %	20 %	0 %	440685244
27	NC_019773	GCAAT	2	10	39954	39963	40 %	20 %	20 %	20 %	440685245
28	NC_019773	AATTA	2	10	40766	40775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019773	TGATT	2	10	46605	46614	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019773	TGTAA	2	10	47557	47566	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019773	TAGTT	2	10	48579	48588	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019773	ACGAA	2	10	49169	49178	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019773	ATTTT	2	10	49336	49345	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019773	AAAAG	2	10	49839	49848	80 %	0 %	20 %	0 %	440685250
35	NC_019773	ATGGG	2	10	50141	50150	20 %	20 %	60 %	0 %	440685250
36	NC_019773	AAAGA	2	10	50504	50513	80 %	0 %	20 %	0 %	440685250
37	NC_019773	AGGAG	2	10	51240	51249	40 %	0 %	60 %	0 %	440685252
38	NC_019773	ATGAC	2	10	52665	52674	40 %	20 %	20 %	20 %	440685253
39	NC_019773	ACTCA	2	10	53112	53121	40 %	20 %	0 %	40 %	440685254
40	NC_019773	ATTGG	2	10	55089	55098	20 %	40 %	40 %	0 %	440685258
41	NC_019773	TAATT	2	10	55887	55896	40 %	60 %	0 %	0 %	440685258
42	NC_019773	TAATT	2	10	56022	56031	40 %	60 %	0 %	0 %	440685258
43	NC_019773	TAATT	2	10	56067	56076	40 %	60 %	0 %	0 %	440685258
44	NC_019773	TAAAT	2	10	56619	56628	60 %	40 %	0 %	0 %	440685259
45	NC_019773	CATTT	2	10	57075	57084	20 %	60 %	0 %	20 %	440685260
46	NC_019773	CGCTG	2	10	59026	59035	0 %	20 %	40 %	40 %	440685261
47	NC_019773	AAAAG	2	10	61793	61802	80 %	0 %	20 %	0 %	440685265
48	NC_019773	GCTTT	2	10	62720	62729	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_019773	TCGCT	2	10	63132	63141	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_019773	CTATA	2	10	63408	63417	40 %	40 %	0 %	20 %	440685267
51	NC_019773	CCCTG	2	10	63727	63736	0 %	20 %	20 %	60 %	440685267
52	NC_019773	TTAAT	2	10	67545	67554	40 %	60 %	0 %	0 %	440685274
53	NC_019773	TTCCT	2	10	69652	69661	0 %	60 %	0 %	40 %	440685277
54	NC_019773	ACGGT	2	10	70444	70453	20 %	20 %	40 %	20 %	440685278
55	NC_019773	AATCA	2	10	72135	72144	60 %	20 %	0 %	20 %	440685280
56	NC_019773	TTACA	2	10	75676	75685	40 %	40 %	0 %	20 %	440685283
57	NC_019773	AAATT	2	10	76154	76163	60 %	40 %	0 %	0 %	440685283
58	NC_019773	TTGTG	2	10	77957	77966	0 %	60 %	40 %	0 %	440685285
59	NC_019773	TTGGC	2	10	82596	82605	0 %	40 %	40 %	20 %	440685290
60	NC_019773	TTTTA	2	10	83965	83974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019773	TTTGT	2	10	84065	84074	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019773	AAATC	2	10	84696	84705	60 %	20 %	0 %	20 %	440685291
63	NC_019773	AGCCA	2	10	85260	85269	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_019773	AATCA	2	10	86074	86083	60 %	20 %	0 %	20 %	440685292
65	NC_019773	AGCAT	2	10	88166	88175	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_019773	GTGGC	2	10	88677	88686	0 %	20 %	60 %	20 %	440685295
67	NC_019773	ACCCA	2	10	93610	93619	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_019773	CATTT	2	10	97501	97510	20 %	60 %	0 %	20 %	440685305
69	NC_019773	TTGTC	2	10	97541	97550	0 %	60 %	20 %	20 %	440685305
70	NC_019773	ATTGT	2	10	97625	97634	20 %	60 %	20 %	0 %	440685305
71	NC_019773	TCTTG	2	10	99614	99623	0 %	60 %	20 %	20 %	440685308
72	NC_019773	CCCAC	2	10	105336	105345	20 %	0 %	0 %	80 %	440685313
73	NC_019773	AAGCA	2	10	106016	106025	60 %	0 %	20 %	20 %	440685314
74	NC_019773	TTAAA	2	10	106240	106249	60 %	40 %	0 %	0 %	440685314
75	NC_019773	GAAAG	2	10	108421	108430	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019773	GACTC	2	10	108810	108819	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_019773	TTACA	2	10	111872	111881	40 %	40 %	0 %	20 %	440685318
78	NC_019773	AAATT	2	10	112350	112359	60 %	40 %	0 %	0 %	440685318
79	NC_019773	AGTTC	2	10	112946	112955	20 %	40 %	20 %	20 %	440685319
80	NC_019773	AGTTT	2	10	113043	113052	20 %	60 %	20 %	0 %	440685319
81	NC_019773	ATCAA	2	10	113510	113519	60 %	20 %	0 %	20 %	440685319
82	NC_019773	CCAAA	2	10	113815	113824	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_019773	CAACA	2	10	115662	115671	60 %	0 %	0 %	40 %	440685320
84	NC_019773	CATTA	2	10	116754	116763	40 %	40 %	0 %	20 %	440685320
85	NC_019773	AATAT	2	10	117318	117327	60 %	40 %	0 %	0 %	440685320
86	NC_019773	CCAAG	2	10	119251	119260	40 %	0 %	20 %	40 %	440685320
87	NC_019773	TTATC	2	10	119366	119375	20 %	60 %	0 %	20 %	440685320
88	NC_019773	AAAAT	2	10	120417	120426	80 %	20 %	0 %	0 %	440685320
89	NC_019773	TTGCT	2	10	122047	122056	0 %	60 %	20 %	20 %	440685322
90	NC_019773	ATTGA	2	10	122665	122674	40 %	40 %	20 %	0 %	440685322
91	NC_019773	CGGCG	2	10	123565	123574	0 %	0 %	60 %	40 %	440685323
92	NC_019773	AATAT	2	10	124342	124351	60 %	40 %	0 %	0 %	440685324
93	NC_019773	AAATC	2	10	124516	124525	60 %	20 %	0 %	20 %	440685324
94	NC_019773	TTTGA	2	10	125189	125198	20 %	60 %	20 %	0 %	440685325

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.