MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.03

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019773	CAGTG	2	10	504	513	20 %	20 %	40 %	20 %	440685203
2	NC_019773	ATGAC	2	10	3348	3357	40 %	20 %	20 %	20 %	440685206
3	NC_019773	ATTGA	2	10	4194	4203	40 %	40 %	20 %	0 %	440685208
4	NC_019773	ATACT	2	10	7555	7564	40 %	40 %	0 %	20 %	440685211
5	NC_019773	AAGTT	2	10	7813	7822	40 %	40 %	20 %	0 %	440685211
6	NC_019773	CAAAA	2	10	7907	7916	80 %	0 %	0 %	20 %	440685211
7	NC_019773	TGGTA	2	10	8035	8044	20 %	40 %	40 %	0 %	440685212
8	NC_019773	TAAAC	2	10	10540	10549	60 %	20 %	0 %	20 %	440685215
9	NC_019773	AAACT	2	10	17780	17789	60 %	20 %	0 %	20 %	440685222
10	NC_019773	TTGTT	2	10	19533	19542	0 %	80 %	20 %	0 %	440685224
11	NC_019773	TGTTC	2	10	21540	21549	0 %	60 %	20 %	20 %	440685225
12	NC_019773	TAAAG	2	10	22293	22302	60 %	20 %	20 %	0 %	440685225
13	NC_019773	ATAAA	2	10	25966	25975	80 %	20 %	0 %	0 %	440685226
14	NC_019773	ACATA	2	10	26288	26297	60 %	20 %	0 %	20 %	440685227
15	NC_019773	AGTTT	2	10	28863	28872	20 %	60 %	20 %	0 %	440685230
16	NC_019773	ATTTT	2	10	31972	31981	20 %	80 %	0 %	0 %	440685236
17	NC_019773	ATGGG	2	10	32072	32081	20 %	20 %	60 %	0 %	440685236
18	NC_019773	TCCAG	2	10	34381	34390	20 %	20 %	20 %	40 %	440685239
19	NC_019773	ATTAT	2	10	35465	35474	40 %	60 %	0 %	0 %	440685240
20	NC_019773	AGATA	2	10	35827	35836	60 %	20 %	20 %	0 %	440685241
21	NC_019773	GAATT	2	10	38301	38310	40 %	40 %	20 %	0 %	440685244
22	NC_019773	GCAAT	2	10	39954	39963	40 %	20 %	20 %	20 %	440685245
23	NC_019773	AAAAG	2	10	49839	49848	80 %	0 %	20 %	0 %	440685250
24	NC_019773	ATGGG	2	10	50141	50150	20 %	20 %	60 %	0 %	440685250
25	NC_019773	AAAGA	2	10	50504	50513	80 %	0 %	20 %	0 %	440685250
26	NC_019773	AGGAG	2	10	51240	51249	40 %	0 %	60 %	0 %	440685252
27	NC_019773	ATGAC	2	10	52665	52674	40 %	20 %	20 %	20 %	440685253
28	NC_019773	ACTCA	2	10	53112	53121	40 %	20 %	0 %	40 %	440685254
29	NC_019773	ATTGG	2	10	55089	55098	20 %	40 %	40 %	0 %	440685258
30	NC_019773	TAATT	2	10	55887	55896	40 %	60 %	0 %	0 %	440685258
31	NC_019773	TAATT	2	10	56022	56031	40 %	60 %	0 %	0 %	440685258
32	NC_019773	TAATT	2	10	56067	56076	40 %	60 %	0 %	0 %	440685258
33	NC_019773	TAAAT	2	10	56619	56628	60 %	40 %	0 %	0 %	440685259
34	NC_019773	CATTT	2	10	57075	57084	20 %	60 %	0 %	20 %	440685260
35	NC_019773	CGCTG	2	10	59026	59035	0 %	20 %	40 %	40 %	440685261
36	NC_019773	AAAAG	2	10	61793	61802	80 %	0 %	20 %	0 %	440685265
37	NC_019773	CTATA	2	10	63408	63417	40 %	40 %	0 %	20 %	440685267
38	NC_019773	CCCTG	2	10	63727	63736	0 %	20 %	20 %	60 %	440685267
39	NC_019773	TTAAT	2	10	67545	67554	40 %	60 %	0 %	0 %	440685274
40	NC_019773	TTCCT	2	10	69652	69661	0 %	60 %	0 %	40 %	440685277
41	NC_019773	ACGGT	2	10	70444	70453	20 %	20 %	40 %	20 %	440685278
42	NC_019773	AATCA	2	10	72135	72144	60 %	20 %	0 %	20 %	440685280
43	NC_019773	TTACA	2	10	75676	75685	40 %	40 %	0 %	20 %	440685283
44	NC_019773	AAATT	2	10	76154	76163	60 %	40 %	0 %	0 %	440685283
45	NC_019773	TTGTG	2	10	77957	77966	0 %	60 %	40 %	0 %	440685285
46	NC_019773	TTGGC	2	10	82596	82605	0 %	40 %	40 %	20 %	440685290
47	NC_019773	AAATC	2	10	84696	84705	60 %	20 %	0 %	20 %	440685291
48	NC_019773	AATCA	2	10	86074	86083	60 %	20 %	0 %	20 %	440685292
49	NC_019773	GTGGC	2	10	88677	88686	0 %	20 %	60 %	20 %	440685295
50	NC_019773	CATTT	2	10	97501	97510	20 %	60 %	0 %	20 %	440685305
51	NC_019773	TTGTC	2	10	97541	97550	0 %	60 %	20 %	20 %	440685305
52	NC_019773	ATTGT	2	10	97625	97634	20 %	60 %	20 %	0 %	440685305
53	NC_019773	TCTTG	2	10	99614	99623	0 %	60 %	20 %	20 %	440685308
54	NC_019773	CCCAC	2	10	105336	105345	20 %	0 %	0 %	80 %	440685313
55	NC_019773	AAGCA	2	10	106016	106025	60 %	0 %	20 %	20 %	440685314
56	NC_019773	TTAAA	2	10	106240	106249	60 %	40 %	0 %	0 %	440685314
57	NC_019773	TTACA	2	10	111872	111881	40 %	40 %	0 %	20 %	440685318
58	NC_019773	AAATT	2	10	112350	112359	60 %	40 %	0 %	0 %	440685318
59	NC_019773	AGTTC	2	10	112946	112955	20 %	40 %	20 %	20 %	440685319
60	NC_019773	AGTTT	2	10	113043	113052	20 %	60 %	20 %	0 %	440685319
61	NC_019773	ATCAA	2	10	113510	113519	60 %	20 %	0 %	20 %	440685319
62	NC_019773	CAACA	2	10	115662	115671	60 %	0 %	0 %	40 %	440685320
63	NC_019773	CATTA	2	10	116754	116763	40 %	40 %	0 %	20 %	440685320
64	NC_019773	AATAT	2	10	117318	117327	60 %	40 %	0 %	0 %	440685320
65	NC_019773	CCAAG	2	10	119251	119260	40 %	0 %	20 %	40 %	440685320
66	NC_019773	TTATC	2	10	119366	119375	20 %	60 %	0 %	20 %	440685320
67	NC_019773	AAAAT	2	10	120417	120426	80 %	20 %	0 %	0 %	440685320
68	NC_019773	TTGCT	2	10	122047	122056	0 %	60 %	20 %	20 %	440685322
69	NC_019773	ATTGA	2	10	122665	122674	40 %	40 %	20 %	0 %	440685322
70	NC_019773	CGGCG	2	10	123565	123574	0 %	0 %	60 %	40 %	440685323
71	NC_019773	AATAT	2	10	124342	124351	60 %	40 %	0 %	0 %	440685324
72	NC_019773	AAATC	2	10	124516	124525	60 %	20 %	0 %	20 %	440685324
73	NC_019773	TTTGA	2	10	125189	125198	20 %	60 %	20 %	0 %	440685325

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.