MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.01

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019772	CTTAGA	2	12	193	204	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440685052
2	NC_019772	CTCAAT	2	12	3761	3772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685055
3	NC_019772	CTTATT	2	12	4645	4656	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440685056
4	NC_019772	ACCTTC	2	12	4864	4875	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	440685056
5	NC_019772	CTAATC	2	12	6213	6224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685057
6	NC_019772	ATACCT	2	12	6777	6788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019772	TTCTGG	2	12	10642	10653	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	440685061
8	NC_019772	CTGTTC	2	12	13315	13326	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440685065
9	NC_019772	TAAATA	2	12	15379	15390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019772	TATCTA	2	12	15437	15448	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440685066
11	NC_019772	GAAATT	2	12	18402	18413	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440685068
12	NC_019772	TGATAG	2	12	18785	18796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685068
13	NC_019772	AAGAAA	2	12	20322	20333	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	440685069
14	NC_019772	TGGTTA	2	12	21034	21045	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440685069
15	NC_019772	TCCAAA	2	12	21681	21692	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	440685070
16	NC_019772	TTAGGT	2	12	24739	24750	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440685072
17	NC_019772	CTTTCT	2	12	25642	25653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685073
18	NC_019772	TCTTCA	2	12	27592	27603	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	440685074
19	NC_019772	TCCTAG	2	12	28338	28349	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440685074
20	NC_019772	TTGCAG	2	12	31249	31260	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440685077
21	NC_019772	TTCCCT	2	12	34146	34157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019772	TTTGAT	2	12	36367	36378	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	440685078
23	NC_019772	CAGACT	2	12	39991	40002	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440685080
24	NC_019772	CGGGGT	2	12	40834	40845	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	440685081
25	NC_019772	TAGCCA	2	12	42242	42253	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440685082
26	NC_019772	GCTTTA	2	12	43111	43122	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440685083
27	NC_019772	ACTAGA	2	12	43851	43862	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440685083
28	NC_019772	AAACAG	2	12	44589	44600	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	440685084
29	NC_019772	CAGAAA	2	12	48451	48462	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019772	AACTTT	2	12	49957	49968	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019772	TCAATT	2	12	52930	52941	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440685088
32	NC_019772	CAGAAT	2	12	55281	55292	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440685090
33	NC_019772	TATGGG	2	12	55565	55576	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	440685090
34	NC_019772	CTGCTA	2	12	61325	61336	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019772	GATCGC	2	12	64832	64843	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019772	ATCTGT	2	12	66831	66842	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440685102
37	NC_019772	GAAATT	2	12	72308	72319	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440685106
38	NC_019772	GAATTT	2	12	73105	73116	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440685106
39	NC_019772	TGTCAT	2	12	75132	75143	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440685107
40	NC_019772	GTCCTA	2	12	79691	79702	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019772	AATTGC	2	12	81042	81053	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440685112
42	NC_019772	TCTACT	2	12	83835	83846	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	440685114
43	NC_019772	CCACAG	2	12	85899	85910	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	440685115
44	NC_019772	TAGAAA	2	12	86911	86922	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440685116
45	NC_019772	GTAAAA	2	12	87190	87201	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440685116
46	NC_019772	GAAAAT	2	12	87324	87335	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440685116
47	NC_019772	TATGAA	2	12	88038	88049	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440685116
48	NC_019772	TGTTTG	2	12	92090	92101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019772	AGCAAA	2	12	92275	92286	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019772	ATGGCG	2	12	92736	92747	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440685118
51	NC_019772	TCGTTC	2	12	94045	94056	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440685121
52	NC_019772	CTGTTA	2	12	95778	95789	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440685122
53	NC_019772	TTGAAT	2	12	95871	95882	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440685122
54	NC_019772	GCTGTT	2	12	97193	97204	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	440685124
55	NC_019772	TTGATG	2	12	98822	98833	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440685126
56	NC_019772	AGACCA	2	12	101785	101796	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	440685127
57	NC_019772	GCGATC	2	12	102354	102365	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440685127
58	NC_019772	AATTCA	2	12	108448	108459	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440685137
59	NC_019772	CTCCTA	2	12	109139	109150	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019772	ACCAGC	2	12	111415	111426	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	440685138
61	NC_019772	AGCTTG	2	12	113519	113530	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_019772	TCCAAT	2	12	113682	113693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019772	TAAAAC	2	12	113926	113937	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440685139
64	NC_019772	CAAGAA	2	12	119439	119450	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	440685143
65	NC_019772	AATAGT	2	12	120029	120040	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440685144
66	NC_019772	GGTCTA	2	12	121077	121088	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019772	AAAAGT	2	12	122358	122369	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440685147
68	NC_019772	GTTTCC	2	12	123379	123390	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440685148
69	NC_019772	TCATCT	2	12	123672	123683	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	440685149
70	NC_019772	TTCATC	2	12	124672	124683	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	440685150
71	NC_019772	ACTAGC	2	12	127659	127670	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019772	AAGCTC	2	12	128604	128615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440685155
73	NC_019772	CAAAAG	2	12	133406	133417	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	440685161
74	NC_019772	AGCAAT	2	12	133827	133838	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440685161
75	NC_019772	TAAGGC	2	12	134864	134875	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019772	CTATAT	2	12	138870	138881	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440685167
77	NC_019772	TTGGAT	2	12	139418	139429	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440685168
78	NC_019772	AAATCA	2	12	139898	139909	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440685169
79	NC_019772	TGCTCT	2	12	142628	142639	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440685171
80	NC_019772	TAAATG	2	12	142845	142856	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440685172
81	NC_019772	AATTTG	2	12	143611	143622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440685173
82	NC_019772	AAATCA	2	12	145327	145338	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440685175
83	NC_019772	TGAGGT	2	12	151571	151582	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	440685177
84	NC_019772	AGACTG	2	12	152648	152659	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_019772	TGAATT	2	12	154171	154182	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019772	CAATGG	2	12	163579	163590	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440685187
87	NC_019772	ATTTCT	2	12	166694	166705	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440685190
88	NC_019772	GGAATT	2	12	169368	169379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685193
89	NC_019772	AGTAAT	2	12	169629	169640	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440685193
90	NC_019772	CTGGGA	2	12	170386	170397	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440685193
91	NC_019772	CTATTT	2	12	171356	171367	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440685193
92	NC_019772	GCTAAT	2	12	173766	173777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440685193
93	NC_019772	CATCAC	2	12	174371	174382	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	440685193
94	NC_019772	ACAGCA	2	12	183369	183380	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	440685193
95	NC_019772	GATTTT	2	12	184140	184151	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	440685193
96	NC_019772	TCCCAG	2	12	185628	185639	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	440685193
97	NC_019772	CAACGC	2	12	187289	187300	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	440685193
98	NC_019772	TAATGG	2	12	187580	187591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685193
99	NC_019772	CAGATG	2	12	189301	189312	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440685193
100	NC_019772	TTACGG	2	12	189588	189599	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440685193
101	NC_019772	AAACTG	2	12	189682	189693	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440685193
102	NC_019772	TTTACA	2	12	189921	189932	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440685193
103	NC_019772	GGTAGC	2	12	192234	192245	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440685193
104	NC_019772	GAATGG	2	12	196766	196777	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	440685193
105	NC_019772	CACTGC	2	12	201047	201058	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	440685193
106	NC_019772	CACAGC	2	12	201629	201640	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	440685193
107	NC_019772	GCTGGT	2	12	202025	202036	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	440685193
108	NC_019772	TTATAT	2	12	204257	204268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685194
109	NC_019772	TTCTGT	2	12	204355	204366	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	440685194
110	NC_019772	TTGGGG	2	12	205130	205141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440685194
111	NC_019772	TGTCTA	2	12	205365	205376	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440685194
112	NC_019772	CTGCTC	2	12	211133	211144	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	440685196
113	NC_019772	AATCCA	2	12	214784	214795	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019772	GTTTAA	2	12	217042	217053	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019772	CACAGG	2	12	217096	217107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685200

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.