MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.01

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019772	ACAAT	2	10	2308	2317	60 %	20 %	0 %	20 %	440685054
2	NC_019772	CAAAT	2	10	2833	2842	60 %	20 %	0 %	20 %	440685054
3	NC_019772	AAAAT	2	10	6755	6764	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019772	TGCAG	2	10	7949	7958	20 %	20 %	40 %	20 %	440685058
5	NC_019772	GATAG	2	10	9505	9514	40 %	20 %	40 %	0 %	440685060
6	NC_019772	TTTCT	2	10	13333	13342	0 %	80 %	0 %	20 %	440685065
7	NC_019772	TTTGA	2	10	14935	14944	20 %	60 %	20 %	0 %	440685065
8	NC_019772	GGATG	2	10	16587	16596	20 %	20 %	60 %	0 %	440685068
9	NC_019772	TAAAG	2	10	16739	16748	60 %	20 %	20 %	0 %	440685068
10	NC_019772	AAAAC	2	10	18571	18580	80 %	0 %	0 %	20 %	440685068
11	NC_019772	AAAGA	2	10	18598	18607	80 %	0 %	20 %	0 %	440685068
12	NC_019772	TAATT	2	10	19151	19160	40 %	60 %	0 %	0 %	440685068
13	NC_019772	AGGAG	2	10	21011	21020	40 %	0 %	60 %	0 %	440685069
14	NC_019772	AAATA	2	10	21283	21292	80 %	20 %	0 %	0 %	440685069
15	NC_019772	ATCCA	2	10	21557	21566	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_019772	CATGA	2	10	23374	23383	40 %	20 %	20 %	20 %	440685071
17	NC_019772	TTGAG	2	10	27256	27265	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019772	GCGTT	2	10	27564	27573	0 %	40 %	40 %	20 %	440685074
19	NC_019772	TAAAA	2	10	28989	28998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019772	GAACT	2	10	31192	31201	40 %	20 %	20 %	20 %	440685077
21	NC_019772	GGGTT	2	10	31347	31356	0 %	40 %	60 %	0 %	440685077
22	NC_019772	TTTTG	2	10	32093	32102	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019772	AACTA	2	10	32655	32664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019772	AATTA	2	10	32888	32897	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019772	GCAAA	2	10	40114	40123	60 %	0 %	20 %	20 %	440685080
26	NC_019772	GCCAC	2	10	41736	41745	20 %	0 %	20 %	60 %	440685082
27	NC_019772	CGAAC	2	10	42227	42236	40 %	0 %	20 %	40 %	440685082
28	NC_019772	GAAAA	2	10	44497	44506	80 %	0 %	20 %	0 %	440685084
29	NC_019772	GAAAA	2	10	46108	46117	80 %	0 %	20 %	0 %	440685085
30	NC_019772	AAATC	2	10	48952	48961	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019772	TAAAA	2	10	49715	49724	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019772	TTTAG	2	10	52146	52155	20 %	60 %	20 %	0 %	440685087
33	NC_019772	CAATA	2	10	55039	55048	60 %	20 %	0 %	20 %	440685090
34	NC_019772	CAAAA	2	10	56082	56091	80 %	0 %	0 %	20 %	440685091
35	NC_019772	CTACA	2	10	57321	57330	40 %	20 %	0 %	40 %	440685093
36	NC_019772	GTTTC	2	10	58111	58120	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_019772	TTACT	2	10	61511	61520	20 %	60 %	0 %	20 %	440685094
38	NC_019772	ATACT	2	10	63018	63027	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019772	CAAAC	2	10	66241	66250	60 %	0 %	0 %	40 %	440685101
40	NC_019772	AGTTG	2	10	69172	69181	20 %	40 %	40 %	0 %	440685103
41	NC_019772	AACTC	2	10	70805	70814	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_019772	AGCAA	2	10	70980	70989	60 %	0 %	20 %	20 %	440685105
43	NC_019772	AAATA	2	10	71879	71888	80 %	20 %	0 %	0 %	440685105
44	NC_019772	TGGGA	2	10	73802	73811	20 %	20 %	60 %	0 %	440685107
45	NC_019772	TGCTT	2	10	74977	74986	0 %	60 %	20 %	20 %	440685107
46	NC_019772	CTAAA	2	10	80199	80208	60 %	20 %	0 %	20 %	440685110
47	NC_019772	ACTTT	2	10	80224	80233	20 %	60 %	0 %	20 %	440685110
48	NC_019772	TGGGA	2	10	83740	83749	20 %	20 %	60 %	0 %	440685114
49	NC_019772	GCATG	2	10	84359	84368	20 %	20 %	40 %	20 %	440685114
50	NC_019772	GACTA	2	10	85926	85935	40 %	20 %	20 %	20 %	440685115
51	NC_019772	TTTGT	2	10	92212	92221	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019772	ATTGT	2	10	92556	92565	20 %	60 %	20 %	0 %	440685118
53	NC_019772	TTCTA	2	10	95107	95116	20 %	60 %	0 %	20 %	440685122
54	NC_019772	ATTTT	2	10	96117	96126	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019772	CAGAA	2	10	98543	98552	60 %	0 %	20 %	20 %	440685126
56	NC_019772	ATTTG	2	10	98669	98678	20 %	60 %	20 %	0 %	440685126
57	NC_019772	AGGCT	2	10	99035	99044	20 %	20 %	40 %	20 %	440685126
58	NC_019772	AAATC	2	10	99817	99826	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019772	GTCAA	2	10	100538	100547	40 %	20 %	20 %	20 %	440685127
60	NC_019772	TTGCT	2	10	101139	101148	0 %	60 %	20 %	20 %	440685127
61	NC_019772	AAATG	2	10	101998	102007	60 %	20 %	20 %	0 %	440685127
62	NC_019772	TTGAC	2	10	102635	102644	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_019772	AAGGA	2	10	103866	103875	60 %	0 %	40 %	0 %	440685128
64	NC_019772	TAATT	2	10	105510	105519	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019772	GTTGT	2	10	106143	106152	0 %	60 %	40 %	0 %	440685133
66	NC_019772	TTGAG	2	10	106718	106727	20 %	40 %	40 %	0 %	440685134
67	NC_019772	AAATT	2	10	109260	109269	60 %	40 %	0 %	0 %	440685138
68	NC_019772	CAACT	2	10	114022	114031	40 %	20 %	0 %	40 %	440685139
69	NC_019772	CCAAA	2	10	114315	114324	60 %	0 %	0 %	40 %	440685139
70	NC_019772	TTGTT	2	10	116098	116107	0 %	80 %	20 %	0 %	440685141
71	NC_019772	GCTTC	2	10	116771	116780	0 %	40 %	20 %	40 %	440685141
72	NC_019772	CGAAT	2	10	119876	119885	40 %	20 %	20 %	20 %	440685144
73	NC_019772	GTTTG	2	10	119965	119974	0 %	60 %	40 %	0 %	440685144
74	NC_019772	TCAAA	2	10	120156	120165	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019772	GATTG	2	10	120462	120471	20 %	40 %	40 %	0 %	440685145
76	NC_019772	ATGGA	2	10	121853	121862	40 %	20 %	40 %	0 %	440685146
77	NC_019772	TTGAT	2	10	122224	122233	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019772	AATTT	2	10	124361	124370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019772	TATGA	2	10	125796	125805	40 %	40 %	20 %	0 %	440685151
80	NC_019772	ATTAA	2	10	127937	127946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019772	TCAAT	2	10	130904	130913	40 %	40 %	0 %	20 %	440685159
82	NC_019772	AGACC	2	10	132973	132982	40 %	0 %	20 %	40 %	440685161
83	NC_019772	AAATA	2	10	133589	133598	80 %	20 %	0 %	0 %	440685161
84	NC_019772	TTGTA	2	10	136575	136584	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019772	GAAAG	2	10	137408	137417	60 %	0 %	40 %	0 %	440685165
86	NC_019772	AATTA	2	10	137660	137669	60 %	40 %	0 %	0 %	440685166
87	NC_019772	AATAA	2	10	137712	137721	80 %	20 %	0 %	0 %	440685166
88	NC_019772	TAAAG	2	10	140079	140088	60 %	20 %	20 %	0 %	440685169
89	NC_019772	TAAAT	2	10	146217	146226	60 %	40 %	0 %	0 %	440685175
90	NC_019772	TTCTG	2	10	146491	146500	0 %	60 %	20 %	20 %	440685175
91	NC_019772	AAATG	2	10	148396	148405	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019772	TTTAC	2	10	148498	148507	20 %	60 %	0 %	20 %	440685176
93	NC_019772	TAGAT	2	10	149039	149048	40 %	40 %	20 %	0 %	440685176
94	NC_019772	GCTTT	2	10	150030	150039	0 %	60 %	20 %	20 %	440685177
95	NC_019772	CGGTG	2	10	150755	150764	0 %	20 %	60 %	20 %	440685177
96	NC_019772	TAGCC	2	10	151811	151820	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_019772	TATTC	2	10	153315	153324	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_019772	TAACA	2	10	153476	153485	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_019772	AGAGA	2	10	155308	155317	60 %	0 %	40 %	0 %	440685178
100	NC_019772	AAGGC	2	10	158757	158766	40 %	0 %	40 %	20 %	440685184
101	NC_019772	AAGGC	2	10	158769	158778	40 %	0 %	40 %	20 %	440685184
102	NC_019772	TGGTG	2	10	161417	161426	0 %	40 %	60 %	0 %	440685185
103	NC_019772	CTCTT	2	10	163424	163433	0 %	60 %	0 %	40 %	440685187
104	NC_019772	GTTTG	2	10	163536	163545	0 %	60 %	40 %	0 %	440685187
105	NC_019772	TTACC	2	10	168674	168683	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_019772	CAGGA	2	10	170471	170480	40 %	0 %	40 %	20 %	440685193
107	NC_019772	TACCG	2	10	170867	170876	20 %	20 %	20 %	40 %	440685193
108	NC_019772	AGTCC	2	10	172746	172755	20 %	20 %	20 %	40 %	440685193
109	NC_019772	TACTA	2	10	173058	173067	40 %	40 %	0 %	20 %	440685193
110	NC_019772	CCTGA	2	10	173667	173676	20 %	20 %	20 %	40 %	440685193
111	NC_019772	ATTGA	2	10	177324	177333	40 %	40 %	20 %	0 %	440685193
112	NC_019772	CTGGA	2	10	177857	177866	20 %	20 %	40 %	20 %	440685193
113	NC_019772	ACAGT	2	10	178549	178558	40 %	20 %	20 %	20 %	440685193
114	NC_019772	ATTTA	2	10	181702	181711	40 %	60 %	0 %	0 %	440685193
115	NC_019772	CTTTG	2	10	190697	190706	0 %	60 %	20 %	20 %	440685193
116	NC_019772	CCCAG	2	10	192008	192017	20 %	0 %	20 %	60 %	440685193
117	NC_019772	AGGTA	2	10	192254	192263	40 %	20 %	40 %	0 %	440685193
118	NC_019772	GCAAC	2	10	192925	192934	40 %	0 %	20 %	40 %	440685193
119	NC_019772	ATTAT	2	10	194257	194266	40 %	60 %	0 %	0 %	440685193
120	NC_019772	ACCCC	2	10	199024	199033	20 %	0 %	0 %	80 %	440685193
121	NC_019772	CTCCC	2	10	199329	199338	0 %	20 %	0 %	80 %	440685193
122	NC_019772	AACTA	2	10	206630	206639	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019772	GAGCA	2	10	207380	207389	40 %	0 %	40 %	20 %	440685195
124	NC_019772	GGTGG	2	10	208085	208094	0 %	20 %	80 %	0 %	440685195
125	NC_019772	AAATT	2	10	209304	209313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019772	GGCAA	2	10	210964	210973	40 %	0 %	40 %	20 %	440685196
127	NC_019772	ATTTA	2	10	211965	211974	40 %	60 %	0 %	0 %	440685196
128	NC_019772	TTGAA	2	10	212238	212247	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019772	TTTGA	2	10	214082	214091	20 %	60 %	20 %	0 %	440685197
130	NC_019772	TAACG	2	10	214557	214566	40 %	20 %	20 %	20 %	440685197
131	NC_019772	CAGTG	2	10	218628	218637	20 %	20 %	40 %	20 %	440685200

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.