MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.01

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019772	ACAAT	2	10	2308	2317	60 %	20 %	0 %	20 %	440685054
2	NC_019772	CAAAT	2	10	2833	2842	60 %	20 %	0 %	20 %	440685054
3	NC_019772	TGCAG	2	10	7949	7958	20 %	20 %	40 %	20 %	440685058
4	NC_019772	GATAG	2	10	9505	9514	40 %	20 %	40 %	0 %	440685060
5	NC_019772	TTTCT	2	10	13333	13342	0 %	80 %	0 %	20 %	440685065
6	NC_019772	TTTGA	2	10	14935	14944	20 %	60 %	20 %	0 %	440685065
7	NC_019772	GGATG	2	10	16587	16596	20 %	20 %	60 %	0 %	440685068
8	NC_019772	TAAAG	2	10	16739	16748	60 %	20 %	20 %	0 %	440685068
9	NC_019772	AAAAC	2	10	18571	18580	80 %	0 %	0 %	20 %	440685068
10	NC_019772	AAAGA	2	10	18598	18607	80 %	0 %	20 %	0 %	440685068
11	NC_019772	TAATT	2	10	19151	19160	40 %	60 %	0 %	0 %	440685068
12	NC_019772	AGGAG	2	10	21011	21020	40 %	0 %	60 %	0 %	440685069
13	NC_019772	AAATA	2	10	21283	21292	80 %	20 %	0 %	0 %	440685069
14	NC_019772	CATGA	2	10	23374	23383	40 %	20 %	20 %	20 %	440685071
15	NC_019772	GCGTT	2	10	27564	27573	0 %	40 %	40 %	20 %	440685074
16	NC_019772	GAACT	2	10	31192	31201	40 %	20 %	20 %	20 %	440685077
17	NC_019772	GGGTT	2	10	31347	31356	0 %	40 %	60 %	0 %	440685077
18	NC_019772	GCAAA	2	10	40114	40123	60 %	0 %	20 %	20 %	440685080
19	NC_019772	GCCAC	2	10	41736	41745	20 %	0 %	20 %	60 %	440685082
20	NC_019772	CGAAC	2	10	42227	42236	40 %	0 %	20 %	40 %	440685082
21	NC_019772	GAAAA	2	10	44497	44506	80 %	0 %	20 %	0 %	440685084
22	NC_019772	GAAAA	2	10	46108	46117	80 %	0 %	20 %	0 %	440685085
23	NC_019772	TTTAG	2	10	52146	52155	20 %	60 %	20 %	0 %	440685087
24	NC_019772	CAATA	2	10	55039	55048	60 %	20 %	0 %	20 %	440685090
25	NC_019772	CAAAA	2	10	56082	56091	80 %	0 %	0 %	20 %	440685091
26	NC_019772	CTACA	2	10	57321	57330	40 %	20 %	0 %	40 %	440685093
27	NC_019772	TTACT	2	10	61511	61520	20 %	60 %	0 %	20 %	440685094
28	NC_019772	CAAAC	2	10	66241	66250	60 %	0 %	0 %	40 %	440685101
29	NC_019772	AGTTG	2	10	69172	69181	20 %	40 %	40 %	0 %	440685103
30	NC_019772	AGCAA	2	10	70980	70989	60 %	0 %	20 %	20 %	440685105
31	NC_019772	AAATA	2	10	71879	71888	80 %	20 %	0 %	0 %	440685105
32	NC_019772	TGGGA	2	10	73802	73811	20 %	20 %	60 %	0 %	440685107
33	NC_019772	TGCTT	2	10	74977	74986	0 %	60 %	20 %	20 %	440685107
34	NC_019772	CTAAA	2	10	80199	80208	60 %	20 %	0 %	20 %	440685110
35	NC_019772	ACTTT	2	10	80224	80233	20 %	60 %	0 %	20 %	440685110
36	NC_019772	TGGGA	2	10	83740	83749	20 %	20 %	60 %	0 %	440685114
37	NC_019772	GCATG	2	10	84359	84368	20 %	20 %	40 %	20 %	440685114
38	NC_019772	GACTA	2	10	85926	85935	40 %	20 %	20 %	20 %	440685115
39	NC_019772	ATTGT	2	10	92556	92565	20 %	60 %	20 %	0 %	440685118
40	NC_019772	TTCTA	2	10	95107	95116	20 %	60 %	0 %	20 %	440685122
41	NC_019772	CAGAA	2	10	98543	98552	60 %	0 %	20 %	20 %	440685126
42	NC_019772	ATTTG	2	10	98669	98678	20 %	60 %	20 %	0 %	440685126
43	NC_019772	AGGCT	2	10	99035	99044	20 %	20 %	40 %	20 %	440685126
44	NC_019772	GTCAA	2	10	100538	100547	40 %	20 %	20 %	20 %	440685127
45	NC_019772	TTGCT	2	10	101139	101148	0 %	60 %	20 %	20 %	440685127
46	NC_019772	AAATG	2	10	101998	102007	60 %	20 %	20 %	0 %	440685127
47	NC_019772	AAGGA	2	10	103866	103875	60 %	0 %	40 %	0 %	440685128
48	NC_019772	GTTGT	2	10	106143	106152	0 %	60 %	40 %	0 %	440685133
49	NC_019772	TTGAG	2	10	106718	106727	20 %	40 %	40 %	0 %	440685134
50	NC_019772	AAATT	2	10	109260	109269	60 %	40 %	0 %	0 %	440685138
51	NC_019772	CAACT	2	10	114022	114031	40 %	20 %	0 %	40 %	440685139
52	NC_019772	CCAAA	2	10	114315	114324	60 %	0 %	0 %	40 %	440685139
53	NC_019772	TTGTT	2	10	116098	116107	0 %	80 %	20 %	0 %	440685141
54	NC_019772	GCTTC	2	10	116771	116780	0 %	40 %	20 %	40 %	440685141
55	NC_019772	CGAAT	2	10	119876	119885	40 %	20 %	20 %	20 %	440685144
56	NC_019772	GTTTG	2	10	119965	119974	0 %	60 %	40 %	0 %	440685144
57	NC_019772	GATTG	2	10	120462	120471	20 %	40 %	40 %	0 %	440685145
58	NC_019772	ATGGA	2	10	121853	121862	40 %	20 %	40 %	0 %	440685146
59	NC_019772	TATGA	2	10	125796	125805	40 %	40 %	20 %	0 %	440685151
60	NC_019772	TCAAT	2	10	130904	130913	40 %	40 %	0 %	20 %	440685159
61	NC_019772	AGACC	2	10	132973	132982	40 %	0 %	20 %	40 %	440685161
62	NC_019772	AAATA	2	10	133589	133598	80 %	20 %	0 %	0 %	440685161
63	NC_019772	GAAAG	2	10	137408	137417	60 %	0 %	40 %	0 %	440685165
64	NC_019772	AATTA	2	10	137660	137669	60 %	40 %	0 %	0 %	440685166
65	NC_019772	AATAA	2	10	137712	137721	80 %	20 %	0 %	0 %	440685166
66	NC_019772	TAAAG	2	10	140079	140088	60 %	20 %	20 %	0 %	440685169
67	NC_019772	TAAAT	2	10	146217	146226	60 %	40 %	0 %	0 %	440685175
68	NC_019772	TTCTG	2	10	146491	146500	0 %	60 %	20 %	20 %	440685175
69	NC_019772	TTTAC	2	10	148498	148507	20 %	60 %	0 %	20 %	440685176
70	NC_019772	TAGAT	2	10	149039	149048	40 %	40 %	20 %	0 %	440685176
71	NC_019772	GCTTT	2	10	150030	150039	0 %	60 %	20 %	20 %	440685177
72	NC_019772	CGGTG	2	10	150755	150764	0 %	20 %	60 %	20 %	440685177
73	NC_019772	AGAGA	2	10	155308	155317	60 %	0 %	40 %	0 %	440685178
74	NC_019772	AAGGC	2	10	158757	158766	40 %	0 %	40 %	20 %	440685184
75	NC_019772	AAGGC	2	10	158769	158778	40 %	0 %	40 %	20 %	440685184
76	NC_019772	TGGTG	2	10	161417	161426	0 %	40 %	60 %	0 %	440685185
77	NC_019772	CTCTT	2	10	163424	163433	0 %	60 %	0 %	40 %	440685187
78	NC_019772	GTTTG	2	10	163536	163545	0 %	60 %	40 %	0 %	440685187
79	NC_019772	CAGGA	2	10	170471	170480	40 %	0 %	40 %	20 %	440685193
80	NC_019772	TACCG	2	10	170867	170876	20 %	20 %	20 %	40 %	440685193
81	NC_019772	AGTCC	2	10	172746	172755	20 %	20 %	20 %	40 %	440685193
82	NC_019772	TACTA	2	10	173058	173067	40 %	40 %	0 %	20 %	440685193
83	NC_019772	CCTGA	2	10	173667	173676	20 %	20 %	20 %	40 %	440685193
84	NC_019772	ATTGA	2	10	177324	177333	40 %	40 %	20 %	0 %	440685193
85	NC_019772	CTGGA	2	10	177857	177866	20 %	20 %	40 %	20 %	440685193
86	NC_019772	ACAGT	2	10	178549	178558	40 %	20 %	20 %	20 %	440685193
87	NC_019772	ATTTA	2	10	181702	181711	40 %	60 %	0 %	0 %	440685193
88	NC_019772	CTTTG	2	10	190697	190706	0 %	60 %	20 %	20 %	440685193
89	NC_019772	CCCAG	2	10	192008	192017	20 %	0 %	20 %	60 %	440685193
90	NC_019772	AGGTA	2	10	192254	192263	40 %	20 %	40 %	0 %	440685193
91	NC_019772	GCAAC	2	10	192925	192934	40 %	0 %	20 %	40 %	440685193
92	NC_019772	ATTAT	2	10	194257	194266	40 %	60 %	0 %	0 %	440685193
93	NC_019772	ACCCC	2	10	199024	199033	20 %	0 %	0 %	80 %	440685193
94	NC_019772	CTCCC	2	10	199329	199338	0 %	20 %	0 %	80 %	440685193
95	NC_019772	GAGCA	2	10	207380	207389	40 %	0 %	40 %	20 %	440685195
96	NC_019772	GGTGG	2	10	208085	208094	0 %	20 %	80 %	0 %	440685195
97	NC_019772	GGCAA	2	10	210964	210973	40 %	0 %	40 %	20 %	440685196
98	NC_019772	ATTTA	2	10	211965	211974	40 %	60 %	0 %	0 %	440685196
99	NC_019772	TTTGA	2	10	214082	214091	20 %	60 %	20 %	0 %	440685197
100	NC_019772	TAACG	2	10	214557	214566	40 %	20 %	20 %	20 %	440685197
101	NC_019772	CAGTG	2	10	218628	218637	20 %	20 %	40 %	20 %	440685200

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.