MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122

Total Repeats: 2246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019771	GTATTG	2	12	2087	2098	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440679732
2	NC_019771	AATTTT	2	12	7466	7477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440679736
3	NC_019771	ACTCAA	2	12	19035	19046	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	440679745
4	NC_019771	ATATCT	2	12	20201	20212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440679746
5	NC_019771	TTTTGA	2	12	22768	22779	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	440679747
6	NC_019771	CCATCA	2	12	22941	22952	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	440679747
7	NC_019771	AGATAT	2	12	26206	26217	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440679750
8	NC_019771	TGGTAG	2	12	28346	28357	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	440679754
9	NC_019771	CTAATT	2	12	31589	31600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440679757
10	NC_019771	GAAAGT	2	12	37223	37234	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440679762
11	NC_019771	TACTCC	2	12	38176	38187	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	440679764
12	NC_019771	ATGGCT	2	12	43024	43035	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440679768
13	NC_019771	CCATTT	2	12	43992	44003	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	440679768
14	NC_019771	TGGTTC	2	12	44529	44540	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	440679770
15	NC_019771	TTTATC	2	12	45188	45199	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440679771
16	NC_019771	ACCCAC	2	12	51219	51230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440679776
17	NC_019771	ATTGGC	2	12	55689	55700	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440679778
18	NC_019771	TGGGTT	2	12	57227	57238	0 %	50 %	50 %	0 %	440679779
19	NC_019771	TGGATG	2	12	63709	63720	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	440679784
20	NC_019771	GGGTTG	2	12	66784	66795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440679787
21	NC_019771	CTACCC	2	12	73454	73465	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	440679793
22	NC_019771	TAGCTT	2	12	74537	74548	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440679794
23	NC_019771	GAACCA	2	12	74860	74871	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	440679794
24	NC_019771	CTGTTG	2	12	76400	76411	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	440679795
25	NC_019771	GAAATT	2	12	85034	85045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440679803
26	NC_019771	ATATTT	2	12	85557	85568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440679805
27	NC_019771	ATGGCT	2	12	89157	89168	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440679807
28	NC_019771	ATTGGT	2	12	89208	89219	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440679807
29	NC_019771	ATCTCT	2	12	92490	92501	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	440679810
30	NC_019771	TGTTCT	2	12	93445	93456	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	440679811
31	NC_019771	ATTTGA	2	12	96545	96556	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440679814
32	NC_019771	TTGTTC	2	12	103749	103760	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	440679820
33	NC_019771	GTAAAG	2	12	104570	104581	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440679822
34	NC_019771	ACCTAA	2	12	104721	104732	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	440679822
35	NC_019771	CCATAT	2	12	105629	105640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440679822
36	NC_019771	ATCCTC	2	12	107816	107827	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	440679824
37	NC_019771	CCAGTA	2	12	108084	108095	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440679825
38	NC_019771	AATCTA	2	12	114581	114592	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440679829
39	NC_019771	GTGCAA	2	12	122690	122701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440679837
40	NC_019771	TCTGAT	2	12	128637	128648	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440679840
41	NC_019771	AATGGT	2	12	129734	129745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440679841
42	NC_019771	GTTTAG	2	12	132620	132631	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440679843
43	NC_019771	ACAACC	2	12	141633	141644	50 %	0 %	0 %	50 %	440679851
44	NC_019771	AAGAAC	2	12	143272	143283	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	440679853
45	NC_019771	CAGAAT	2	12	144808	144819	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440679854
46	NC_019771	ACGGTA	2	12	146512	146523	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440679856
47	NC_019771	ACCAAA	2	12	148696	148707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440679859
48	NC_019771	ATATTG	2	12	151611	151622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440679863
49	NC_019771	CTAAAT	2	12	152378	152389	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440679863
50	NC_019771	CCAACG	2	12	155475	155486	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	440679866
51	NC_019771	GGAAGA	2	12	160647	160658	50 %	0 %	50 %	0 %	440679870
52	NC_019771	GGCTAC	2	12	161966	161977	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440679873
53	NC_019771	ATTGAA	2	12	164057	164068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440679876
54	NC_019771	AAAATT	2	12	165527	165538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440679877
55	NC_019771	GTAATT	2	12	167413	167424	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440679879
56	NC_019771	CTAAAA	2	12	168869	168880	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440679880
57	NC_019771	GGCGTT	2	12	169058	169069	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	440679880
58	NC_019771	TGAGAT	2	12	172248	172259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440679881
59	NC_019771	GTAATT	2	12	177910	177921	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440679884
60	NC_019771	ACCCAC	2	12	188863	188874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440679891
61	NC_019771	GGTTAC	2	12	190036	190047	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440679892
62	NC_019771	AGATCA	2	12	190059	190070	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440679892
63	NC_019771	CACAAA	2	12	190843	190854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440679893
64	NC_019771	CTGATT	2	12	192182	192193	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440679894
65	NC_019771	TTGACA	2	12	192821	192832	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440679894
66	NC_019771	AGGAAA	2	12	193379	193390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440679895
67	NC_019771	CAACAC	2	12	200046	200057	50 %	0 %	0 %	50 %	440679898
68	NC_019771	ATTGCC	2	12	202363	202374	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440679899
69	NC_019771	CTGTAA	2	12	202661	202672	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440679899
70	NC_019771	TTTGAG	2	12	209331	209342	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440679902
71	NC_019771	AAGTTA	2	12	209690	209701	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440679902
72	NC_019771	AGGTTT	2	12	216926	216937	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440679905
73	NC_019771	AATTGA	2	12	219775	219786	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440679908
74	NC_019771	GGAAAT	2	12	225440	225451	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440679910
75	NC_019771	TACCTG	2	12	225792	225803	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440679910
76	NC_019771	TCAGAT	2	12	228326	228337	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440679912
77	NC_019771	GCTTCA	2	12	228893	228904	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440679912
78	NC_019771	TTCCAG	2	12	230412	230423	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440679913
79	NC_019771	TTCTAT	2	12	231280	231291	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440679914
80	NC_019771	AAATAT	2	12	232916	232927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440679915
81	NC_019771	TGACGG	2	12	233351	233362	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440679915
82	NC_019771	TCATCT	2	12	238229	238240	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	440679918
83	NC_019771	CATCAA	2	12	240175	240186	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	440679921
84	NC_019771	ATTTTC	2	12	240638	240649	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440679921
85	NC_019771	AATTTA	2	12	240772	240783	50 %	50 %	0 %	0 %	440679921
86	NC_019771	AATTTA	2	12	240952	240963	50 %	50 %	0 %	0 %	440679921
87	NC_019771	AATTTA	2	12	241159	241170	50 %	50 %	0 %	0 %	440679921
88	NC_019771	AATTTA	2	12	241366	241377	50 %	50 %	0 %	0 %	440679921
89	NC_019771	AATTTA	2	12	241546	241557	50 %	50 %	0 %	0 %	440679921
90	NC_019771	AATTTA	2	12	241726	241737	50 %	50 %	0 %	0 %	440679921
91	NC_019771	AATTTA	2	12	241933	241944	50 %	50 %	0 %	0 %	440679921
92	NC_019771	AATTTA	2	12	242320	242331	50 %	50 %	0 %	0 %	440679921
93	NC_019771	TTTAAG	2	12	242529	242540	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440679921
94	NC_019771	ACCAAA	2	12	243485	243496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440679922
95	NC_019771	TGTTTT	2	12	247567	247578	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	440679928
96	NC_019771	GCTATT	2	12	248374	248385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440679928
97	NC_019771	TAATTT	2	12	254780	254791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440679934
98	NC_019771	AATGGT	2	12	255997	256008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440679935
99	NC_019771	GGGTGC	2	12	257113	257124	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	440679936
100	NC_019771	AATTTA	2	12	258985	258996	50 %	50 %	0 %	0 %	440679940
101	NC_019771	AAATCT	2	12	268246	268257	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440679948
102	NC_019771	CTGGGA	2	12	281882	281893	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440679954
103	NC_019771	GATTTG	2	12	282291	282302	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440679954
104	NC_019771	GGAACG	2	12	292155	292166	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	440679960
105	NC_019771	AGCATT	2	12	295668	295679	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440679963
106	NC_019771	AAATTC	2	12	296717	296728	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440679964
107	NC_019771	TGTTGG	2	12	299119	299130	0 %	50 %	50 %	0 %	440679966
108	NC_019771	AAACCA	2	12	315346	315357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440679980
109	NC_019771	GTTGAA	2	12	315856	315867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440679981
110	NC_019771	TATGGA	2	12	326420	326431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440679989
111	NC_019771	TGTCTT	2	12	329414	329425	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	440679992
112	NC_019771	CATAGC	2	12	330640	330651	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440679993
113	NC_019771	AATTAG	2	12	334798	334809	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440679996
114	NC_019771	ACAAGC	2	12	335670	335681	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	440679997
115	NC_019771	AGCAAT	2	12	336860	336871	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440679998
116	NC_019771	CCACTA	2	12	367141	367152	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	440680021
117	NC_019771	TTCTAA	2	12	369213	369224	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440680021
118	NC_019771	ATCAGC	2	12	369906	369917	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440680021
119	NC_019771	TTTCTT	2	12	370583	370594	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	440680021
120	NC_019771	GAACCA	2	12	375977	375988	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	440680026
121	NC_019771	CCCAAC	2	12	377447	377458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440680027
122	NC_019771	TAACCA	2	12	398521	398532	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	440680044
123	NC_019771	ACTTCT	2	12	398857	398868	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	440680044
124	NC_019771	CTCGAA	2	12	400755	400766	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440680045
125	NC_019771	ATACAG	2	12	401019	401030	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440680045
126	NC_019771	ATATTT	2	12	402254	402265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440680046
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130	NC_019771	CTTGTT	2	12	412257	412268	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	440680054
131	NC_019771	CTTCTG	2	12	412347	412358	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440680054
132	NC_019771	TCACCA	2	12	416934	416945	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	440680058
133	NC_019771	TGGTGC	2	12	427170	427181	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	440680067
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136	NC_019771	GGTAAA	2	12	445183	445194	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440680084
137	NC_019771	TGGTTG	2	12	454256	454267	0 %	50 %	50 %	0 %	440680092
138	NC_019771	ATTTTT	2	12	459395	459406	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	440680094
139	NC_019771	AAATAA	2	12	473906	473917	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	440680103
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141	NC_019771	GTCAAA	2	12	481669	481680	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440680105
142	NC_019771	ACCACT	2	12	483221	483232	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	440680106
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145	NC_019771	ATAATT	2	12	487894	487905	50 %	50 %	0 %	0 %	440680110
146	NC_019771	ACTGAA	2	12	491331	491342	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440680114
147	NC_019771	TGGCTG	2	12	497260	497271	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	440680120
148	NC_019771	AAAGTC	2	12	504401	504412	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440680126
149	NC_019771	GCATTT	2	12	504894	504905	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440680127
150	NC_019771	TCTTTT	2	12	505532	505543	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	440680129
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152	NC_019771	CCATAG	2	12	508954	508965	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440680133
153	NC_019771	ACATCA	3	18	510138	510155	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	440680135
154	NC_019771	TCGTAG	2	12	510225	510236	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440680135
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169	NC_019771	ACCCAA	2	12	552548	552559	50 %	0 %	0 %	50 %	440680159
170	NC_019771	TGGTGA	2	12	561299	561310	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	440680166
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183	NC_019771	AGGCTG	2	12	590362	590373	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440680195
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186	NC_019771	CTATCC	2	12	596453	596464	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	440680201
187	NC_019771	ATTTAG	2	12	600605	600616	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440680204
188	NC_019771	TCTAAC	2	12	601440	601451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440680204
189	NC_019771	GGCAAC	2	12	606860	606871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440680207
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200	NC_019771	TGGAAA	2	12	629955	629966	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440680225
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204	NC_019771	TAAAAT	2	12	638480	638491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440680232
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207	NC_019771	CTTCAT	2	12	650572	650583	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	440680243
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209	NC_019771	AGCTTC	2	12	653514	653525	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440680246
210	NC_019771	AGCTTC	2	12	655056	655067	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440680246
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216	NC_019771	GCTATG	2	12	673825	673836	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440680261
217	NC_019771	TCAGGT	2	12	686988	686999	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440680273
218	NC_019771	TTGTAA	2	12	694422	694433	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440680279
219	NC_019771	GAAAAA	2	12	698708	698719	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	440680281
220	NC_019771	TCAAAA	2	12	701524	701535	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440680284
221	NC_019771	AAATCC	2	12	702160	702171	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	440680285
222	NC_019771	TGAAGC	2	12	706321	706332	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440680289
223	NC_019771	TGAATC	2	12	713500	713511	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440680296
224	NC_019771	AGTTTT	2	12	715476	715487	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	440680296
225	NC_019771	AGCTTG	2	12	716184	716195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440680296
226	NC_019771	GCTTTA	2	12	718127	718138	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440680297
227	NC_019771	TATTGA	2	12	719317	719328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440680298
228	NC_019771	AAAGGC	2	12	720577	720588	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440680299
229	NC_019771	ATTGCC	2	12	722975	722986	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440680300
230	NC_019771	ATTGCC	2	12	724416	724427	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440680301
231	NC_019771	CATCCT	2	12	724736	724747	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	440680302
232	NC_019771	TATCCT	2	12	726111	726122	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	440680303
233	NC_019771	TTGGAT	2	12	729161	729172	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440680304
234	NC_019771	AACCTA	2	12	730833	730844	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	440680306
235	NC_019771	CCAAAA	2	12	733356	733367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440680307
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237	NC_019771	CCTGAT	2	12	741732	741743	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440680313
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342	NC_019771	TGCAAG	2	12	1032782	1032793	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440680552
343	NC_019771	TAACAG	2	12	1032812	1032823	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440680552
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345	NC_019771	AGTGAT	2	12	1034647	1034658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440680554
346	NC_019771	GTAGAA	2	12	1044744	1044755	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440680564
347	NC_019771	CAGATA	2	12	1049673	1049684	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440680568
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457	NC_019771	AGCCGC	2	12	1364428	1364439	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440680825
458	NC_019771	TGGATC	2	12	1364474	1364485	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440680825
459	NC_019771	GATCGC	2	12	1367114	1367125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440680827
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464	NC_019771	TTAAAT	2	12	1391937	1391948	50 %	50 %	0 %	0 %	440680843
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