MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122

Total Repeats: 4188

< Previous123456789Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019771	GGAC	2	8	6061018	6061025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_019771	GATT	2	8	6066737	6066744	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_019771	ATTT	2	8	6075356	6075363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_019771	GATG	2	8	6077009	6077016	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_019771	AATA	2	8	6077041	6077048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_019771	ATTA	2	8	6082269	6082276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_019771	TTAT	2	8	6091147	6091154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_019771	GCTT	2	8	6098355	6098362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_019771	AGAT	2	8	6099712	6099719	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_019771	TTTA	2	8	6099934	6099941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_019771	AGTT	2	8	6101058	6101065	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_019771	TGAT	2	8	6101230	6101237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_019771	TGAA	2	8	6101267	6101274	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_019771	TTTA	2	8	6105230	6105237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_019771	AGTT	2	8	6105335	6105342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_019771	AGAT	2	8	6105689	6105696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_019771	AACT	2	8	6108629	6108636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4018	NC_019771	CTAA	2	8	6112233	6112240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4019	NC_019771	AGAT	2	8	6113603	6113610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_019771	TGAT	2	8	6116951	6116958	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_019771	AAAT	2	8	6118522	6118529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_019771	AGGT	2	8	6118687	6118694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_019771	AAAT	2	8	6119416	6119423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_019771	ATTT	2	8	6119430	6119437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_019771	TTGC	2	8	6119612	6119619	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4026	NC_019771	TAAT	2	8	6119650	6119657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_019771	TCTA	2	8	6119783	6119790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4028	NC_019771	AAAC	2	8	6120619	6120626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_019771	ATTA	2	8	6123614	6123621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_019771	TCAA	2	8	6125200	6125207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_019771	CAAT	2	8	6126819	6126826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4032	NC_019771	GATA	2	8	6126868	6126875	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_019771	CAAC	2	8	6127564	6127571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_019771	CAAA	2	8	6127847	6127854	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_019771	TCGT	2	8	6131232	6131239	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_019771	TACC	2	8	6131296	6131303	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_019771	TATC	2	8	6131342	6131349	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_019771	ATCT	2	8	6131351	6131358	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4039	NC_019771	TTTA	2	8	6131484	6131491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_019771	AAAT	2	8	6131670	6131677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_019771	TAAA	2	8	6131880	6131887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_019771	CTTT	2	8	6136962	6136969	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_019771	TAAA	2	8	6137769	6137776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_019771	CTCA	2	8	6142815	6142822	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4045	NC_019771	ATTT	2	8	6143795	6143802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_019771	AGAT	2	8	6143918	6143925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_019771	TAGA	2	8	6144183	6144190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_019771	ATTT	2	8	6152136	6152143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_019771	TTAT	3	12	6154795	6154806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_019771	AGTA	2	8	6154882	6154889	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_019771	CTAT	2	8	6157552	6157559	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_019771	GTAA	2	8	6157565	6157572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_019771	TACA	2	8	6157608	6157615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_019771	ACTA	2	8	6163291	6163298	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4055	NC_019771	GAAG	2	8	6164698	6164705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_019771	AATT	2	8	6164735	6164742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_019771	AGTA	2	8	6165128	6165135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_019771	AGGG	2	8	6165628	6165635	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_019771	CAGA	2	8	6166000	6166007	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4060	NC_019771	CATC	2	8	6167131	6167138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_019771	GAAC	2	8	6170762	6170769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4062	NC_019771	GAAG	2	8	6170812	6170819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_019771	TGAT	2	8	6172945	6172952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_019771	TAAT	2	8	6174471	6174478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_019771	ATTA	2	8	6176838	6176845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_019771	CACT	2	8	6177992	6177999	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_019771	AGTT	2	8	6214075	6214082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_019771	ATTT	2	8	6214311	6214318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_019771	AAGC	2	8	6214352	6214359	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4070	NC_019771	GATA	2	8	6214372	6214379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_019771	ATCT	2	8	6214690	6214697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4072	NC_019771	ATTG	2	8	6214772	6214779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_019771	AATT	2	8	6214787	6214794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_019771	ATTA	2	8	6214835	6214842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_019771	TTGT	2	8	6214855	6214862	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_019771	AAAT	2	8	6216948	6216955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_019771	TTCA	2	8	6220027	6220034	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4078	NC_019771	AGTA	2	8	6223905	6223912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_019771	CAGG	2	8	6225516	6225523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_019771	CGGA	2	8	6227114	6227121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_019771	TGAA	2	8	6230580	6230587	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_019771	GGTT	2	8	6230588	6230595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_019771	ATTA	2	8	6230618	6230625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_019771	AAAT	2	8	6230904	6230911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_019771	ACCC	2	8	6236519	6236526	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4086	NC_019771	GACA	2	8	6236556	6236563	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_019771	TGAT	2	8	6237218	6237225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_019771	ATGG	2	8	6240183	6240190	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_019771	TAAT	2	8	6241887	6241894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_019771	GGAA	2	8	6242729	6242736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_019771	AGAA	2	8	6242822	6242829	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_019771	GCTT	2	8	6247007	6247014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4093	NC_019771	AGTA	2	8	6247907	6247914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_019771	CTAT	2	8	6247965	6247972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_019771	ATTA	2	8	6250146	6250153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_019771	ATTG	2	8	6252549	6252556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_019771	TGGC	2	8	6252597	6252604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_019771	CTCA	2	8	6252755	6252762	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_019771	TATT	2	8	6252818	6252825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_019771	CAGT	2	8	6256675	6256682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4101	NC_019771	TTAT	2	8	6262011	6262018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_019771	AACT	2	8	6262906	6262913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4103	NC_019771	ATAA	2	8	6267257	6267264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_019771	ATAA	2	8	6267283	6267290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_019771	AAAC	2	8	6272218	6272225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_019771	GATT	2	8	6276778	6276785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_019771	ATCA	2	8	6277912	6277919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4108	NC_019771	AATC	2	8	6277932	6277939	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_019771	TGTC	2	8	6278523	6278530	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_019771	TAAA	2	8	6278557	6278564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_019771	TCTG	2	8	6278579	6278586	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_019771	AATA	2	8	6278713	6278720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_019771	ATTG	2	8	6278741	6278748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_019771	TTAA	2	8	6278836	6278843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_019771	ACTA	2	8	6278881	6278888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_019771	ATTG	2	8	6279824	6279831	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_019771	TTCA	2	8	6279913	6279920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_019771	ATTA	2	8	6286651	6286658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_019771	TTAA	2	8	6291526	6291533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_019771	CAAC	2	8	6291573	6291580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_019771	CAAC	2	8	6292125	6292132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_019771	CTAA	2	8	6293437	6293444	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_019771	ATTA	2	8	6294326	6294333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_019771	AACA	2	8	6298171	6298178	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4125	NC_019771	AATT	2	8	6305929	6305936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_019771	ATTA	2	8	6306364	6306371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_019771	TTTA	2	8	6307644	6307651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_019771	ATTT	2	8	6307696	6307703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_019771	CCAG	2	8	6309487	6309494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_019771	TTTA	2	8	6309501	6309508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_019771	AATT	2	8	6309566	6309573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_019771	ATAA	2	8	6312391	6312398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_019771	GTAA	2	8	6316739	6316746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_019771	GGAA	2	8	6316884	6316891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_019771	CAAA	2	8	6317168	6317175	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4136	NC_019771	GCCC	2	8	6317442	6317449	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4137	NC_019771	AATA	2	8	6318664	6318671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_019771	TGAT	2	8	6318802	6318809	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_019771	TTCA	2	8	6318847	6318854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4140	NC_019771	TTAA	2	8	6320334	6320341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_019771	GCAA	2	8	6320500	6320507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4142	NC_019771	ACCC	2	8	6320561	6320568	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4143	NC_019771	TCAC	2	8	6322446	6322453	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4144	NC_019771	ATCA	2	8	6322737	6322744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4145	NC_019771	TTAG	2	8	6323256	6323263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_019771	CAAT	2	8	6325795	6325802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4147	NC_019771	AATA	2	8	6330371	6330378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_019771	ATTT	2	8	6331678	6331685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_019771	ATTT	2	8	6338175	6338182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_019771	TTTA	2	8	6338853	6338860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_019771	TATT	2	8	6341089	6341096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_019771	GAAC	2	8	6343108	6343115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4153	NC_019771	GAAG	2	8	6343136	6343143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_019771	AACT	3	12	6345784	6345795	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4155	NC_019771	CTAG	2	8	6348010	6348017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4156	NC_019771	AAGA	2	8	6348070	6348077	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4157	NC_019771	GAAT	2	8	6348288	6348295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4158	NC_019771	ATTA	2	8	6354103	6354110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_019771	AATA	2	8	6354151	6354158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4160	NC_019771	AAAT	2	8	6355487	6355494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4161	NC_019771	AGGC	2	8	6355646	6355653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4162	NC_019771	AAAT	2	8	6355686	6355693	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_019771	CTAT	2	8	6356851	6356858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4164	NC_019771	ATCA	2	8	6357220	6357227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4165	NC_019771	AAAT	2	8	6357287	6357294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_019771	TGAG	2	8	6362333	6362340	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_019771	AATT	2	8	6362500	6362507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4168	NC_019771	ATAA	2	8	6362623	6362630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4169	NC_019771	CTAT	2	8	6362965	6362972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4170	NC_019771	CAAA	2	8	6369339	6369346	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4171	NC_019771	TCTT	2	8	6369518	6369525	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4172	NC_019771	TACT	2	8	6370086	6370093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4173	NC_019771	TCGG	2	8	6372277	6372284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4174	NC_019771	ACTT	2	8	6372394	6372401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4175	NC_019771	CTTG	2	8	6377455	6377462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4176	NC_019771	GTAA	2	8	6377626	6377633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4177	NC_019771	TGAG	2	8	6377802	6377809	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4178	NC_019771	TTCA	2	8	6377863	6377870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4179	NC_019771	GAAA	2	8	6377894	6377901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4180	NC_019771	AATA	2	8	6382415	6382422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4181	NC_019771	ATAA	2	8	6382460	6382467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4182	NC_019771	TAAA	2	8	6386077	6386084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4183	NC_019771	TGAA	2	8	6387887	6387894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4184	NC_019771	TCTT	2	8	6387976	6387983	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4185	NC_019771	TATC	2	8	6388613	6388620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4186	NC_019771	TGAA	2	8	6390732	6390739	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4187	NC_019771	TAAA	2	8	6390909	6390916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4188	NC_019771	ATTA	2	8	6395817	6395824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous123456789Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.