MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecalis str. Symbioflor 1

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019770	TTTTTC	2	12	86305	86316	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019770	TAAAAA	2	12	132796	132807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019770	ACCTCT	2	12	193820	193831	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019770	GTTATT	2	12	200123	200134	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019770	TAGGCG	2	12	220684	220695	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019770	TGGAAG	2	12	222133	222144	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019770	TCATAT	2	12	222571	222582	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019770	TTTTAT	2	12	223399	223410	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019770	AAAAAG	2	12	275509	275520	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019770	AAAAAG	2	12	305429	305440	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019770	GTCCTC	2	12	341836	341847	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019770	TACAAA	2	12	356840	356851	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_019770	TAAAAA	2	12	382341	382352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019770	CACCGC	2	12	392187	392198	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_019770	AGGAGA	2	12	420919	420930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019770	TGAAAT	2	12	452276	452287	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019770	TTCTAC	2	12	455098	455109	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019770	CTTTTG	2	12	476460	476471	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019770	AAATAT	2	12	495809	495820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019770	AATAAA	2	12	549306	549317	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019770	ATTAAA	2	12	555080	555091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019770	AAAAAG	2	12	573717	573728	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019770	TTTTCA	2	12	578601	578612	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019770	TGAAAA	2	12	578764	578775	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019770	AAACAA	2	12	586532	586543	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_019770	TTACAT	2	12	654822	654833	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019770	AAAGGA	2	12	670323	670334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019770	GAATAA	2	12	676642	676653	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019770	CTTTTT	2	12	689868	689879	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019770	ATATAA	2	12	692205	692216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019770	TTTTAT	2	12	730734	730745	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019770	TTAAAA	2	12	786983	786994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019770	AGTCTA	2	12	814954	814965	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019770	TTCATT	2	12	851371	851382	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019770	ATTGTT	2	12	877826	877837	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019770	AATAAA	2	12	883534	883545	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019770	CTTTTT	2	12	889436	889447	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019770	TAGGCG	2	12	908141	908152	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_019770	TGGAAG	2	12	909591	909602	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019770	AAAAAG	2	12	939472	939483	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019770	AAAAAT	2	12	941599	941610	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019770	AGAAAA	2	12	954118	954129	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019770	AATGAA	2	12	961343	961354	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019770	AAAGGA	2	12	966268	966279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019770	GTTATT	2	12	997751	997762	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019770	ACTATC	2	12	1054927	1054938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019770	TTTGTA	2	12	1063881	1063892	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019770	TTTTTC	2	12	1076205	1076216	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019770	ATGAGA	2	12	1076262	1076273	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019770	TTTAAA	2	12	1080425	1080436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019770	AAAAAG	2	12	1129728	1129739	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019770	AAATTA	2	12	1184350	1184361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019770	AAGAAA	2	12	1210620	1210631	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019770	GAGATA	2	12	1270617	1270628	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019770	ATACTA	2	12	1276076	1276087	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019770	AGATGA	2	12	1412874	1412885	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019770	ATCTCT	2	12	1463879	1463890	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019770	ATAAAA	2	12	1587714	1587725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019770	TAAAAC	2	12	1601798	1601809	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019770	TGGTTA	2	12	1614197	1614208	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019770	TAAAAA	2	12	1625832	1625843	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019770	ATTGTA	2	12	1636240	1636251	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019770	TGTTAC	2	12	1645957	1645968	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019770	TTTTAT	2	12	1651063	1651074	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019770	TTTCAT	2	12	1691034	1691045	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019770	GAAAAA	2	12	1711667	1711678	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019770	TATAAA	2	12	1714345	1714356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019770	CTTTCA	2	12	1726868	1726879	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019770	CGAAAA	2	12	1747435	1747446	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_019770	TCCCTA	2	12	1776541	1776552	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019770	TATAAG	2	12	1808963	1808974	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019770	TTCATA	2	12	1863378	1863389	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019770	CATGAA	2	12	1887340	1887351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019770	TATACT	2	12	2001626	2001637	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019770	TTTTAA	2	12	2021328	2021339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019770	CTTTTT	2	12	2053649	2053660	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019770	TTATTT	2	12	2072368	2072379	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019770	TCATTC	2	12	2197439	2197450	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019770	CCCTTC	2	12	2220345	2220356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_019770	TCTTTT	2	12	2250797	2250808	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_019770	TATTTT	2	12	2262510	2262521	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019770	TTTTGC	2	12	2341198	2341209	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019770	CTTCCA	2	12	2341557	2341568	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019770	CGCCTA	2	12	2343007	2343018	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019770	AGTGTA	2	12	2489403	2489414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019770	AAATAA	2	12	2546173	2546184	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019770	TCCTAA	2	12	2572104	2572115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019770	TTTTTA	2	12	2613648	2613659	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019770	TTTTTA	2	12	2621667	2621678	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019770	TTTTTC	2	12	2627749	2627760	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_019770	AAGACG	2	12	2654944	2654955	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_019770	AAAAGA	2	12	2658615	2658626	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019770	AAATGT	2	12	2701639	2701650	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019770	CAACGT	2	12	2703092	2703103	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019770	TCCTCA	2	12	2704444	2704455	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019770	ATATGA	2	12	2757826	2757837	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019770	CTTCCA	2	12	2758264	2758275	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019770	CGCCTA	2	12	2759714	2759725	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.