MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecalis str. Symbioflor 1

Total Repeats: 369

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019770	ATATA	2	10	1535	1544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019770	TAAAA	2	10	16428	16437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019770	AAATA	2	10	31638	31647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019770	TGTAA	2	10	40744	40753	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019770	AATTT	2	10	41134	41143	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019770	GATAA	2	10	45919	45928	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019770	GGAGA	2	10	46953	46962	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019770	ATGCT	2	10	58596	58605	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019770	TCCAT	2	10	64434	64443	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_019770	GTATT	2	10	73701	73710	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019770	ACAAA	2	10	73760	73769	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019770	AAATG	2	10	80909	80918	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019770	TAAAA	2	10	91822	91831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019770	GTAAA	2	10	104579	104588	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019770	AGGGC	2	10	114587	114596	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019770	AGTAT	2	10	119645	119654	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019770	AAAAG	2	10	141230	141239	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019770	TTTCT	2	10	148548	148557	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019770	AGTTT	2	10	158505	158514	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019770	TAGAA	2	10	165862	165871	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019770	GATTT	2	10	167412	167421	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019770	TGTCT	2	10	175243	175252	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019770	GAAAA	2	10	190410	190419	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019770	AAACA	2	10	200144	200153	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019770	GTAAA	2	10	200182	200191	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019770	AAGAG	2	10	213329	213338	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019770	ATTCA	2	10	217407	217416	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019770	TCGTG	2	10	218585	218594	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019770	CCGTA	2	10	220924	220933	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_019770	AGGGA	2	10	222024	222033	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019770	AAAAG	2	10	223636	223645	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019770	CTTTT	2	10	223796	223805	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019770	TTGGT	2	10	224222	224231	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019770	AAGTC	2	10	230507	230516	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019770	TCCTT	2	10	233075	233084	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_019770	TATCA	2	10	243804	243813	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_019770	GGAAG	2	10	262809	262818	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019770	TTAGA	2	10	279036	279045	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019770	AGGAA	2	10	279077	279086	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019770	CAAGA	2	10	295262	295271	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019770	ATTTT	2	10	302959	302968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019770	TTGTA	2	10	318943	318952	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019770	TAGTT	2	10	319713	319722	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019770	AAATT	2	10	325345	325354	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019770	AAGGA	2	10	325427	325436	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019770	CTAAA	2	10	330448	330457	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019770	TTCAA	2	10	340815	340824	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019770	CTTTT	2	10	363283	363292	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_019770	TTTTA	2	10	365152	365161	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019770	AATTT	2	10	380010	380019	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019770	TAACT	2	10	380093	380102	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019770	TTTCG	2	10	380541	380550	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019770	AAAGA	2	10	380749	380758	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019770	ACAAA	2	10	380771	380780	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_019770	TTTAT	2	10	380873	380882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019770	AGTTT	2	10	381911	381920	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019770	GAGCA	2	10	395144	395153	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019770	AACGA	2	10	398090	398099	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019770	TCCCC	2	10	415779	415788	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
60	NC_019770	AGAAT	2	10	419812	419821	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019770	CTTTT	2	10	419978	419987	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019770	TTAGA	2	10	434527	434536	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019770	TATCA	2	10	436549	436558	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019770	TTAAA	2	10	439911	439920	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019770	AAATG	2	10	442425	442434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019770	AAATG	2	10	452243	452252	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019770	ATTAA	2	10	452324	452333	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019770	CATTT	3	15	460152	460166	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019770	ATTTA	2	10	463082	463091	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019770	TAAAA	2	10	467865	467874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019770	TATAG	2	10	470811	470820	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019770	AATGG	2	10	473043	473052	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019770	TTTCT	2	10	477168	477177	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019770	AAAGA	2	10	481636	481645	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019770	TTATT	2	10	483333	483342	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019770	GAAGA	2	10	485123	485132	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019770	TAACA	2	10	492228	492237	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019770	ACGAT	2	10	521510	521519	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019770	TAAAA	2	10	528466	528475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019770	ATAGA	2	10	529533	529542	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019770	ATGAT	2	10	532435	532444	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019770	CTTTA	2	10	539389	539398	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019770	GATAT	2	10	548049	548058	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019770	CTTTA	2	10	548103	548112	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_019770	ATAAA	2	10	549283	549292	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019770	ATGAT	2	10	565838	565847	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019770	TAAAG	2	10	565974	565983	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019770	TTTTA	2	10	586305	586314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019770	AATAG	2	10	598737	598746	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019770	ATAAA	2	10	613065	613074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019770	ATAAA	2	10	631742	631751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019770	CACTA	2	10	635702	635711	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_019770	TAAAA	2	10	647915	647924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019770	AAACA	2	10	667143	667152	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019770	GGGAA	2	10	670335	670344	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019770	GAAAA	2	10	672105	672114	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019770	TTTTG	2	10	676617	676626	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019770	GTTCG	2	10	692116	692125	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_019770	CTTTT	2	10	695539	695548	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_019770	GATAA	2	10	702595	702604	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019770	AATAA	2	10	708885	708894	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019770	TAAAC	2	10	715723	715732	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019770	CTAAA	2	10	718618	718627	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019770	AATAA	2	10	726195	726204	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019770	GAAGA	2	10	755743	755752	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019770	AATGA	2	10	773417	773426	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019770	TTAAA	2	10	778254	778263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019770	AAAAT	2	10	779021	779030	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019770	CTTTT	2	10	785573	785582	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019770	TATAA	2	10	785714	785723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019770	AAATA	2	10	786225	786234	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019770	GGATG	2	10	786268	786277	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019770	GTTTT	2	10	786379	786388	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019770	AGTAA	2	10	808042	808051	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019770	TAATT	2	10	824794	824803	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019770	TTAAT	2	10	824804	824813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019770	TTCTT	2	10	826373	826382	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_019770	AGGAA	2	10	853400	853409	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019770	GTTTT	2	10	858070	858079	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019770	TTGAT	2	10	865934	865943	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019770	GTTTT	2	10	865948	865957	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019770	TCTAT	2	10	880100	880109	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019770	ACTTT	2	10	880165	880174	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_019770	GAAAA	2	10	884235	884244	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019770	TTTTA	2	10	887834	887843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019770	AAGAG	2	10	892709	892718	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019770	TATAT	2	10	896232	896241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019770	ATTCA	2	10	904762	904771	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_019770	TCGTG	2	10	905940	905949	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_019770	CCGTA	2	10	908381	908390	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_019770	AGGGA	2	10	909482	909491	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019770	ATATT	2	10	911234	911243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019770	TATTC	2	10	914532	914541	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_019770	ATTGG	2	10	925047	925056	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019770	ATCAA	2	10	925735	925744	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019770	TAAAA	2	10	925766	925775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019770	ATTGT	2	10	927242	927251	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019770	CTTTA	2	10	943135	943144	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019770	TTTAT	2	10	954218	954227	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019770	ATAGC	2	10	959822	959831	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_019770	TAAAC	2	10	974100	974109	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_019770	AAATG	2	10	974275	974284	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019770	TAAAT	2	10	981170	981179	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019770	AAAAC	2	10	984992	985001	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_019770	ACATC	2	10	996603	996612	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_019770	TATAT	2	10	1000885	1000894	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019770	AGAAT	2	10	1001564	1001573	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019770	CTTTT	2	10	1023623	1023632	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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289	NC_019770	AAAGT	2	10	2192546	2192555	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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344	NC_019770	AGCAT	2	10	2633705	2633714	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.