MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.01

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019765	TGGTTT	2	12	218	229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019765	CAATAC	2	12	1469	1480	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434408266
3	NC_019765	ATGGGC	2	12	2496	2507	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	434408266
4	NC_019765	CCTACT	2	12	6292	6303	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	434408270
5	NC_019765	TGATTG	2	12	9783	9794	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434408271
6	NC_019765	CTTCTC	2	12	11424	11435	0 %	50 %	0 %	50 %	434408273
7	NC_019765	CCAAAC	2	12	17142	17153	50 %	0 %	0 %	50 %	434408280
8	NC_019765	CTAAAA	2	12	18404	18415	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434408281
9	NC_019765	TACCAC	2	12	24143	24154	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434408286
10	NC_019765	TAATGC	2	12	25440	25451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434408287
11	NC_019765	ACAATT	2	12	26527	26538	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434408289
12	NC_019765	AGTTTG	2	12	29214	29225	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434408289
13	NC_019765	CCCATA	2	12	37376	37387	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434408294
14	NC_019765	TCCATT	2	12	38449	38460	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434408295
15	NC_019765	ATCTTT	3	18	38998	39015	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434408296
16	NC_019765	TCGGTA	2	12	41037	41048	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408297
17	NC_019765	GCATAG	2	12	41298	41309	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408297
18	NC_019765	ATCGCG	2	12	46480	46491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434408300
19	NC_019765	TTTACA	2	12	46666	46677	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019765	CAGGTA	2	12	50911	50922	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408303
21	NC_019765	TCCCAA	2	12	50979	50990	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434408303
22	NC_019765	TCAGAA	2	12	52209	52220	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434408304
23	NC_019765	GCCGAA	2	12	53192	53203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408305
24	NC_019765	TTGAGC	2	12	56105	56116	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408308
25	NC_019765	TGTTGA	2	12	58549	58560	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434408309
26	NC_019765	TGATGG	2	12	58759	58770	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434408309
27	NC_019765	AGTACA	2	12	59432	59443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434408309
28	NC_019765	GTTATG	2	12	62835	62846	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019765	AAAATT	2	12	67920	67931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408317
30	NC_019765	TCAATT	2	12	68099	68110	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434408317
31	NC_019765	TCTACT	2	12	69941	69952	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434408318
32	NC_019765	TTTAAC	2	12	70752	70763	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019765	TAGAAA	2	12	74154	74165	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434408321
34	NC_019765	TTTTCT	2	12	75519	75530	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434408323
35	NC_019765	TCTTTT	2	12	78260	78271	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434408325
36	NC_019765	TTTAGT	2	12	79859	79870	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434408327
37	NC_019765	GTTTTT	2	12	80503	80514	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	434408328
38	NC_019765	CCTCAA	2	12	80655	80666	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019765	ATCTTC	2	12	84859	84870	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434408333
40	NC_019765	TGGTAA	2	12	86843	86854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408336
41	NC_019765	AAAATA	2	12	94830	94841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434408343
42	NC_019765	GTTTCT	2	12	101851	101862	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	434408351
43	NC_019765	TAACAG	2	12	102616	102627	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434408351
44	NC_019765	TGTCTA	2	12	106800	106811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434408355
45	NC_019765	GGGGTA	2	12	112566	112577	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	434408361
46	NC_019765	GCGATT	2	12	117199	117210	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408364
47	NC_019765	AACTAA	2	12	120242	120253	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434408366
48	NC_019765	TAAATA	2	12	121947	121958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408367
49	NC_019765	TCTTCA	2	12	122005	122016	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434408367
50	NC_019765	ATTTTT	2	12	124008	124019	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434408370
51	NC_019765	GTTTTG	2	12	124877	124888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434408372
52	NC_019765	CCAATC	2	12	127972	127983	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434408377
53	NC_019765	TTTGAC	2	12	128418	128429	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434408377
54	NC_019765	GAAGAT	2	12	129375	129386	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434408378
55	NC_019765	TCTAAA	2	12	140684	140695	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434408389
56	NC_019765	TAGATG	2	12	143290	143301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408392
57	NC_019765	TAAAGC	2	12	144181	144192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434408393
58	NC_019765	TAACTC	2	12	147772	147783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019765	ATCAAA	2	12	150231	150242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434408400
60	NC_019765	CCCGTT	2	12	153799	153810	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	434408408
61	NC_019765	ACGGCT	2	12	154718	154729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434408409
62	NC_019765	GTAGCG	2	12	157207	157218	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	434408412
63	NC_019765	GTTAAA	2	12	163548	163559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434408415
64	NC_019765	AATGGC	2	12	164702	164713	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408416
65	NC_019765	GCTTAT	2	12	168765	168776	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434408420
66	NC_019765	TGCCTT	2	12	170552	170563	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	434408420
67	NC_019765	TAGTGG	2	12	175916	175927	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434408426
68	NC_019765	GATCGC	2	12	180581	180592	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434408430
69	NC_019765	ATCGCG	2	12	181743	181754	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019765	TTCAGT	2	12	184713	184724	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434408435
71	NC_019765	TCGCGA	2	12	185209	185220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434408435
72	NC_019765	AAGGCT	2	12	189845	189856	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408441
73	NC_019765	ACTGAA	2	12	190226	190237	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434408441
74	NC_019765	TTATTT	2	12	192964	192975	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019765	AAAATA	2	12	196429	196440	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019765	CTTTGA	2	12	198572	198583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019765	TGTCAC	2	12	201392	201403	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434408451
78	NC_019765	CAAATA	2	12	205668	205679	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019765	GGTATT	2	12	207702	207713	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434408456
80	NC_019765	ACGGAT	2	12	209439	209450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408456
81	NC_019765	ACAGCA	2	12	212646	212657	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	434408459
82	NC_019765	CTCGAT	2	12	212677	212688	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434408459
83	NC_019765	TGGCGG	2	12	218819	218830	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	434408465
84	NC_019765	CAGGTA	2	12	221369	221380	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_019765	ATCGCG	2	12	222351	222362	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019765	GCTTTT	2	12	225125	225136	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	434408469
87	NC_019765	TAATCC	2	12	225824	225835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019765	TTCTCT	2	12	226358	226369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019765	GTTGAT	2	12	230273	230284	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434408470
90	NC_019765	ACCATC	2	12	233207	233218	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434408470
91	NC_019765	AGATCG	2	12	233385	233396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408470
92	NC_019765	ACTATT	2	12	234632	234643	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434408470
93	NC_019765	TTTAAC	2	12	238582	238593	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434408470
94	NC_019765	TGTAAT	2	12	241522	241533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434408472
95	NC_019765	TTACTT	2	12	245333	245344	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019765	ATCTAA	2	12	245766	245777	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434408477
97	NC_019765	ACAGAA	2	12	245854	245865	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	434408477
98	NC_019765	CATAAA	2	12	246941	246952	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434408477
99	NC_019765	ATTACT	2	12	250419	250430	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434408477
100	NC_019765	TTACTT	2	12	252972	252983	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019765	GGTAAC	2	12	253363	253374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408483
102	NC_019765	AAGATA	2	12	254616	254627	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019765	CAACTC	2	12	255215	255226	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434408486
104	NC_019765	GGATTC	2	12	256124	256135	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408488
105	NC_019765	CTTTAG	2	12	256381	256392	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434408488
106	NC_019765	CGATCG	2	12	261804	261815	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434408495
107	NC_019765	CTTATC	2	12	262795	262806	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019765	ATCGGC	2	12	268917	268928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434408502
109	NC_019765	TTTAAA	2	12	271602	271613	50 %	50 %	0 %	0 %	434408503
110	NC_019765	CTATTT	2	12	271636	271647	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434408503
111	NC_019765	ACTGTG	2	12	276220	276231	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408507
112	NC_019765	GATAAA	2	12	276687	276698	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019765	TGGCAT	2	12	276866	276877	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408508
114	NC_019765	CTACAG	2	12	277129	277140	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434408508
115	NC_019765	CATTGC	2	12	277148	277159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434408508
116	NC_019765	ACGGTA	2	12	278045	278056	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408509
117	NC_019765	TGCTAA	2	12	282430	282441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434408513
118	NC_019765	ATGAAG	2	12	286252	286263	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434408516
119	NC_019765	TGCTAC	2	12	289984	289995	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434408521
120	NC_019765	GTTCGA	2	12	291608	291619	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408523
121	NC_019765	TGGACT	2	12	292190	292201	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408523
122	NC_019765	CGATCT	2	12	292609	292620	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434408523
123	NC_019765	CTTCTA	2	12	293736	293747	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434408524
124	NC_019765	TCGCTC	2	12	297213	297224	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	434408529
125	NC_019765	AAATCC	2	12	300723	300734	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434408532
126	NC_019765	ACAAGA	2	12	303028	303039	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	434408535
127	NC_019765	TTCGGT	2	12	305017	305028	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434408535
128	NC_019765	GCCGAT	2	12	306425	306436	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434408537
129	NC_019765	ATTCTC	2	12	307035	307046	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434408538
130	NC_019765	CGCAGA	2	12	308683	308694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408540

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.