MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.01

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019765	CAATAC	2	12	1469	1480	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434408266
2	NC_019765	ATGGGC	2	12	2496	2507	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	434408266
3	NC_019765	CCTACT	2	12	6292	6303	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	434408270
4	NC_019765	TGATTG	2	12	9783	9794	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434408271
5	NC_019765	CTTCTC	2	12	11424	11435	0 %	50 %	0 %	50 %	434408273
6	NC_019765	CCAAAC	2	12	17142	17153	50 %	0 %	0 %	50 %	434408280
7	NC_019765	CTAAAA	2	12	18404	18415	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434408281
8	NC_019765	TACCAC	2	12	24143	24154	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434408286
9	NC_019765	TAATGC	2	12	25440	25451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434408287
10	NC_019765	ACAATT	2	12	26527	26538	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434408289
11	NC_019765	AGTTTG	2	12	29214	29225	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434408289
12	NC_019765	CCCATA	2	12	37376	37387	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434408294
13	NC_019765	TCCATT	2	12	38449	38460	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434408295
14	NC_019765	ATCTTT	3	18	38998	39015	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434408296
15	NC_019765	TCGGTA	2	12	41037	41048	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408297
16	NC_019765	GCATAG	2	12	41298	41309	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408297
17	NC_019765	ATCGCG	2	12	46480	46491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434408300
18	NC_019765	CAGGTA	2	12	50911	50922	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408303
19	NC_019765	TCCCAA	2	12	50979	50990	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434408303
20	NC_019765	TCAGAA	2	12	52209	52220	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434408304
21	NC_019765	GCCGAA	2	12	53192	53203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408305
22	NC_019765	TTGAGC	2	12	56105	56116	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408308
23	NC_019765	TGTTGA	2	12	58549	58560	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434408309
24	NC_019765	TGATGG	2	12	58759	58770	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434408309
25	NC_019765	AGTACA	2	12	59432	59443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434408309
26	NC_019765	AAAATT	2	12	67920	67931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408317
27	NC_019765	TCAATT	2	12	68099	68110	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434408317
28	NC_019765	TCTACT	2	12	69941	69952	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434408318
29	NC_019765	TAGAAA	2	12	74154	74165	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434408321
30	NC_019765	TTTTCT	2	12	75519	75530	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434408323
31	NC_019765	TCTTTT	2	12	78260	78271	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434408325
32	NC_019765	TTTAGT	2	12	79859	79870	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434408327
33	NC_019765	GTTTTT	2	12	80503	80514	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	434408328
34	NC_019765	ATCTTC	2	12	84859	84870	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434408333
35	NC_019765	TGGTAA	2	12	86843	86854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408336
36	NC_019765	AAAATA	2	12	94830	94841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434408343
37	NC_019765	GTTTCT	2	12	101851	101862	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	434408351
38	NC_019765	TAACAG	2	12	102616	102627	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434408351
39	NC_019765	TGTCTA	2	12	106800	106811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434408355
40	NC_019765	GGGGTA	2	12	112566	112577	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	434408361
41	NC_019765	GCGATT	2	12	117199	117210	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408364
42	NC_019765	AACTAA	2	12	120242	120253	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434408366
43	NC_019765	TAAATA	2	12	121947	121958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408367
44	NC_019765	TCTTCA	2	12	122005	122016	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434408367
45	NC_019765	ATTTTT	2	12	124008	124019	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434408370
46	NC_019765	GTTTTG	2	12	124877	124888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434408372
47	NC_019765	CCAATC	2	12	127972	127983	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434408377
48	NC_019765	TTTGAC	2	12	128418	128429	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434408377
49	NC_019765	GAAGAT	2	12	129375	129386	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434408378
50	NC_019765	TCTAAA	2	12	140684	140695	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434408389
51	NC_019765	TAGATG	2	12	143290	143301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408392
52	NC_019765	TAAAGC	2	12	144181	144192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434408393
53	NC_019765	ATCAAA	2	12	150231	150242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434408400
54	NC_019765	CCCGTT	2	12	153799	153810	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	434408408
55	NC_019765	ACGGCT	2	12	154718	154729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434408409
56	NC_019765	GTAGCG	2	12	157207	157218	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	434408412
57	NC_019765	GTTAAA	2	12	163548	163559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434408415
58	NC_019765	AATGGC	2	12	164702	164713	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408416
59	NC_019765	GCTTAT	2	12	168765	168776	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434408420
60	NC_019765	TGCCTT	2	12	170552	170563	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	434408420
61	NC_019765	TAGTGG	2	12	175916	175927	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434408426
62	NC_019765	GATCGC	2	12	180581	180592	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434408430
63	NC_019765	TTCAGT	2	12	184713	184724	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434408435
64	NC_019765	TCGCGA	2	12	185209	185220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434408435
65	NC_019765	AAGGCT	2	12	189845	189856	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408441
66	NC_019765	ACTGAA	2	12	190226	190237	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434408441
67	NC_019765	TGTCAC	2	12	201392	201403	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434408451
68	NC_019765	GGTATT	2	12	207702	207713	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434408456
69	NC_019765	ACGGAT	2	12	209439	209450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408456
70	NC_019765	ACAGCA	2	12	212646	212657	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	434408459
71	NC_019765	CTCGAT	2	12	212677	212688	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434408459
72	NC_019765	TGGCGG	2	12	218819	218830	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	434408465
73	NC_019765	GCTTTT	2	12	225125	225136	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	434408469
74	NC_019765	GTTGAT	2	12	230273	230284	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434408470
75	NC_019765	ACCATC	2	12	233207	233218	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434408470
76	NC_019765	AGATCG	2	12	233385	233396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408470
77	NC_019765	ACTATT	2	12	234632	234643	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434408470
78	NC_019765	TTTAAC	2	12	238582	238593	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434408470
79	NC_019765	TGTAAT	2	12	241522	241533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434408472
80	NC_019765	ATCTAA	2	12	245766	245777	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434408477
81	NC_019765	ACAGAA	2	12	245854	245865	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	434408477
82	NC_019765	CATAAA	2	12	246941	246952	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434408477
83	NC_019765	ATTACT	2	12	250419	250430	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434408477
84	NC_019765	GGTAAC	2	12	253363	253374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408483
85	NC_019765	CAACTC	2	12	255215	255226	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434408486
86	NC_019765	GGATTC	2	12	256124	256135	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408488
87	NC_019765	CTTTAG	2	12	256381	256392	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434408488
88	NC_019765	CGATCG	2	12	261804	261815	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434408495
89	NC_019765	ATCGGC	2	12	268917	268928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434408502
90	NC_019765	TTTAAA	2	12	271602	271613	50 %	50 %	0 %	0 %	434408503
91	NC_019765	CTATTT	2	12	271636	271647	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434408503
92	NC_019765	ACTGTG	2	12	276220	276231	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408507
93	NC_019765	TGGCAT	2	12	276866	276877	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408508
94	NC_019765	CTACAG	2	12	277129	277140	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434408508
95	NC_019765	CATTGC	2	12	277148	277159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434408508
96	NC_019765	ACGGTA	2	12	278045	278056	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434408509
97	NC_019765	TGCTAA	2	12	282430	282441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434408513
98	NC_019765	ATGAAG	2	12	286252	286263	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434408516
99	NC_019765	TGCTAC	2	12	289984	289995	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434408521
100	NC_019765	GTTCGA	2	12	291608	291619	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408523
101	NC_019765	TGGACT	2	12	292190	292201	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434408523
102	NC_019765	CGATCT	2	12	292609	292620	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434408523
103	NC_019765	CTTCTA	2	12	293736	293747	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434408524
104	NC_019765	TCGCTC	2	12	297213	297224	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	434408529
105	NC_019765	AAATCC	2	12	300723	300734	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434408532
106	NC_019765	ACAAGA	2	12	303028	303039	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	434408535
107	NC_019765	TTCGGT	2	12	305017	305028	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434408535
108	NC_019765	GCCGAT	2	12	306425	306436	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434408537
109	NC_019765	ATTCTC	2	12	307035	307046	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434408538
110	NC_019765	CGCAGA	2	12	308683	308694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408540

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.