MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.01

Total Repeats: 228

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019765	CTAGA	2	10	279	288	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019765	GATAG	2	10	1867	1876	40 %	20 %	40 %	0 %	434408266
3	NC_019765	AGATT	2	10	1885	1894	40 %	40 %	20 %	0 %	434408266
4	NC_019765	AGAAA	2	10	2158	2167	80 %	0 %	20 %	0 %	434408266
5	NC_019765	ACTAA	2	10	3742	3751	60 %	20 %	0 %	20 %	434408268
6	NC_019765	GATGA	2	10	4688	4697	40 %	20 %	40 %	0 %	434408269
7	NC_019765	GAACG	2	10	5294	5303	40 %	0 %	40 %	20 %	434408269
8	NC_019765	ACCTA	2	10	6784	6793	40 %	20 %	0 %	40 %	434408271
9	NC_019765	TGGGG	2	10	7112	7121	0 %	20 %	80 %	0 %	434408271
10	NC_019765	GGGAT	2	10	7270	7279	20 %	20 %	60 %	0 %	434408271
11	NC_019765	AATTC	2	10	9505	9514	40 %	40 %	0 %	20 %	434408271
12	NC_019765	GATTG	2	10	10526	10535	20 %	40 %	40 %	0 %	434408272
13	NC_019765	AGTTT	2	10	13434	13443	20 %	60 %	20 %	0 %	434408275
14	NC_019765	TTAAA	2	10	15851	15860	60 %	40 %	0 %	0 %	434408278
15	NC_019765	ATTCG	2	10	16920	16929	20 %	40 %	20 %	20 %	434408280
16	NC_019765	GAATT	2	10	17852	17861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019765	AGAAA	2	10	18258	18267	80 %	0 %	20 %	0 %	434408281
18	NC_019765	GAAAA	2	10	21471	21480	80 %	0 %	20 %	0 %	434408283
19	NC_019765	TGCTT	2	10	21967	21976	0 %	60 %	20 %	20 %	434408284
20	NC_019765	AGTGA	2	10	22489	22498	40 %	20 %	40 %	0 %	434408285
21	NC_019765	GTTTT	2	10	24600	24609	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019765	TAAAT	2	10	25800	25809	60 %	40 %	0 %	0 %	434408287
23	NC_019765	AAGTT	2	10	30110	30119	40 %	40 %	20 %	0 %	434408290
24	NC_019765	TTCAA	2	10	32594	32603	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019765	CCTAC	2	10	35405	35414	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_019765	CATCT	2	10	36711	36720	20 %	40 %	0 %	40 %	434408292
27	NC_019765	GTATT	2	10	37966	37975	20 %	60 %	20 %	0 %	434408294
28	NC_019765	TGTAA	2	10	39022	39031	40 %	40 %	20 %	0 %	434408296
29	NC_019765	AATAG	2	10	39583	39592	60 %	20 %	20 %	0 %	434408296
30	NC_019765	GTTGT	2	10	41858	41867	0 %	60 %	40 %	0 %	434408297
31	NC_019765	TCAAA	2	10	43429	43438	60 %	20 %	0 %	20 %	434408297
32	NC_019765	TAACT	2	10	43853	43862	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019765	TTTAA	2	10	46209	46218	40 %	60 %	0 %	0 %	434408299
34	NC_019765	AAACC	2	10	47777	47786	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_019765	AGATT	2	10	47842	47851	40 %	40 %	20 %	0 %	434408302
36	NC_019765	TGGCA	2	10	50414	50423	20 %	20 %	40 %	20 %	434408303
37	NC_019765	AGGAA	2	10	50612	50621	60 %	0 %	40 %	0 %	434408303
38	NC_019765	AAACT	2	10	53777	53786	60 %	20 %	0 %	20 %	434408306
39	NC_019765	CAAAT	2	10	54193	54202	60 %	20 %	0 %	20 %	434408306
40	NC_019765	GATTA	2	10	55905	55914	40 %	40 %	20 %	0 %	434408307
41	NC_019765	GTTCT	2	10	55977	55986	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019765	CCCAA	2	10	56236	56245	40 %	0 %	0 %	60 %	434408308
43	NC_019765	GACGG	2	10	56564	56573	20 %	0 %	60 %	20 %	434408308
44	NC_019765	TAAAA	2	10	60289	60298	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019765	CTCAA	2	10	61031	61040	40 %	20 %	0 %	40 %	434408311
46	NC_019765	TAATC	2	10	62128	62137	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019765	TAAAT	2	10	62182	62191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019765	CGATC	2	10	63276	63285	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019765	GGGAA	2	10	63387	63396	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019765	CTGGT	2	10	64869	64878	0 %	40 %	40 %	20 %	434408313
51	NC_019765	TTTAC	2	10	66476	66485	20 %	60 %	0 %	20 %	434408314
52	NC_019765	GCAGA	2	10	67298	67307	40 %	0 %	40 %	20 %	434408316
53	NC_019765	TCTCG	2	10	67426	67435	0 %	40 %	20 %	40 %	434408316
54	NC_019765	AAATT	2	10	68008	68017	60 %	40 %	0 %	0 %	434408317
55	NC_019765	AACTA	2	10	69085	69094	60 %	20 %	0 %	20 %	434408318
56	NC_019765	CTAAA	2	10	70095	70104	60 %	20 %	0 %	20 %	434408318
57	NC_019765	TAAAA	2	10	70408	70417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019765	AAAAG	2	10	71241	71250	80 %	0 %	20 %	0 %	434408319
59	NC_019765	AAAAT	2	10	71897	71906	80 %	20 %	0 %	0 %	434408319
60	NC_019765	CATCT	2	10	73486	73495	20 %	40 %	0 %	40 %	434408321
61	NC_019765	GTATC	2	10	73898	73907	20 %	40 %	20 %	20 %	434408321
62	NC_019765	TAACT	2	10	74555	74564	40 %	40 %	0 %	20 %	434408322
63	NC_019765	TTCCA	2	10	75166	75175	20 %	40 %	0 %	40 %	434408323
64	NC_019765	ATGTT	2	10	75701	75710	20 %	60 %	20 %	0 %	434408323
65	NC_019765	TAAAT	2	10	76907	76916	60 %	40 %	0 %	0 %	434408324
66	NC_019765	TTTTC	2	10	78457	78466	0 %	80 %	0 %	20 %	434408325
67	NC_019765	ATTCA	2	10	79204	79213	40 %	40 %	0 %	20 %	434408326
68	NC_019765	CCCTA	2	10	79665	79674	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_019765	TTTTA	2	10	81148	81157	20 %	80 %	0 %	0 %	434408329
70	NC_019765	CCCGT	2	10	85197	85206	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
71	NC_019765	TCAAC	2	10	85704	85713	40 %	20 %	0 %	40 %	434408334
72	NC_019765	CTTCT	2	10	89476	89485	0 %	60 %	0 %	40 %	434408337
73	NC_019765	TCGGG	2	10	89863	89872	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019765	ATTTA	2	10	89996	90005	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019765	GTTAG	2	10	90807	90816	20 %	40 %	40 %	0 %	434408338
76	NC_019765	TCGGT	2	10	96922	96931	0 %	40 %	40 %	20 %	434408345
77	NC_019765	AACTC	2	10	97521	97530	40 %	20 %	0 %	40 %	434408346
78	NC_019765	CCAAT	2	10	97531	97540	40 %	20 %	0 %	40 %	434408346
79	NC_019765	TAAAA	2	10	98347	98356	80 %	20 %	0 %	0 %	434408347
80	NC_019765	TAAAG	2	10	98508	98517	60 %	20 %	20 %	0 %	434408347
81	NC_019765	TTTTA	2	10	99378	99387	20 %	80 %	0 %	0 %	434408348
82	NC_019765	TTTAA	2	10	101200	101209	40 %	60 %	0 %	0 %	434408349
83	NC_019765	TCATC	2	10	101337	101346	20 %	40 %	0 %	40 %	434408350
84	NC_019765	AAGCA	2	10	107000	107009	60 %	0 %	20 %	20 %	434408355
85	NC_019765	TTTAG	2	10	107635	107644	20 %	60 %	20 %	0 %	434408355
86	NC_019765	GACAA	2	10	108350	108359	60 %	0 %	20 %	20 %	434408355
87	NC_019765	AGGCA	2	10	108877	108886	40 %	0 %	40 %	20 %	434408355
88	NC_019765	AAATT	2	10	109514	109523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019765	ATTTT	2	10	115949	115958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019765	AGTTA	2	10	117948	117957	40 %	40 %	20 %	0 %	434408365
91	NC_019765	TTTAC	2	10	118651	118660	20 %	60 %	0 %	20 %	434408365
92	NC_019765	TTATT	2	10	119365	119374	20 %	80 %	0 %	0 %	434408366
93	NC_019765	TTTGT	2	10	119970	119979	0 %	80 %	20 %	0 %	434408366
94	NC_019765	AGCAA	2	10	122809	122818	60 %	0 %	20 %	20 %	434408369
95	NC_019765	AGTTA	2	10	128453	128462	40 %	40 %	20 %	0 %	434408377
96	NC_019765	AAATA	2	10	128567	128576	80 %	20 %	0 %	0 %	434408377
97	NC_019765	ATTGA	2	10	128586	128595	40 %	40 %	20 %	0 %	434408377
98	NC_019765	TTTGT	2	10	130301	130310	0 %	80 %	20 %	0 %	434408379
99	NC_019765	AGTTT	2	10	131146	131155	20 %	60 %	20 %	0 %	434408380
100	NC_019765	TATTT	2	10	132915	132924	20 %	80 %	0 %	0 %	434408382
101	NC_019765	CCCCG	2	10	134112	134121	0 %	0 %	20 %	80 %	434408383
102	NC_019765	CCCAA	2	10	136077	136086	40 %	0 %	0 %	60 %	434408384
103	NC_019765	CACTC	2	10	136256	136265	20 %	20 %	0 %	60 %	434408384
104	NC_019765	GAATG	2	10	136458	136467	40 %	20 %	40 %	0 %	434408385
105	NC_019765	AGCGA	2	10	137957	137966	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_019765	AATCC	2	10	140412	140421	40 %	20 %	0 %	40 %	434408389
107	NC_019765	TTGCT	2	10	140776	140785	0 %	60 %	20 %	20 %	434408389
108	NC_019765	TTCAG	2	10	141075	141084	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_019765	AATTC	2	10	141350	141359	40 %	40 %	0 %	20 %	434408390
110	NC_019765	ACGGC	2	10	143984	143993	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_019765	TACTT	2	10	146430	146439	20 %	60 %	0 %	20 %	434408395
112	NC_019765	ATCTC	2	10	148504	148513	20 %	40 %	0 %	40 %	434408398
113	NC_019765	AATTC	2	10	148734	148743	40 %	40 %	0 %	20 %	434408398
114	NC_019765	GATTT	2	10	148795	148804	20 %	60 %	20 %	0 %	434408398
115	NC_019765	AGTTA	2	10	148884	148893	40 %	40 %	20 %	0 %	434408398
116	NC_019765	ACCCG	2	10	149173	149182	20 %	0 %	20 %	60 %	434408399
117	NC_019765	TTAAT	2	10	149599	149608	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019765	CCAAT	2	10	151198	151207	40 %	20 %	0 %	40 %	434408403
119	NC_019765	TTTAA	2	10	151861	151870	40 %	60 %	0 %	0 %	434408404
120	NC_019765	CTTCT	2	10	151937	151946	0 %	60 %	0 %	40 %	434408405
121	NC_019765	ATGCC	2	10	152584	152593	20 %	20 %	20 %	40 %	434408405
122	NC_019765	TAGTT	2	10	155235	155244	20 %	60 %	20 %	0 %	434408409
123	NC_019765	TAATT	2	10	156896	156905	40 %	60 %	0 %	0 %	434408411
124	NC_019765	TGTGG	2	10	156932	156941	0 %	40 %	60 %	0 %	434408411
125	NC_019765	CCATT	2	10	156976	156985	20 %	40 %	0 %	40 %	434408411
126	NC_019765	TGTCC	2	10	157726	157735	0 %	40 %	20 %	40 %	434408413
127	NC_019765	GGTAA	2	10	158245	158254	40 %	20 %	40 %	0 %	434408413
128	NC_019765	AAGTT	2	10	160901	160910	40 %	40 %	20 %	0 %	434408413
129	NC_019765	AAATT	2	10	161297	161306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019765	AAACA	2	10	161662	161671	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_019765	AGTTT	2	10	161758	161767	20 %	60 %	20 %	0 %	434408414
132	NC_019765	TAGAT	2	10	162180	162189	40 %	40 %	20 %	0 %	434408414
133	NC_019765	CGACC	2	10	162902	162911	20 %	0 %	20 %	60 %	434408414
134	NC_019765	CTTGT	2	10	163230	163239	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_019765	GTTAA	2	10	163385	163394	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019765	TAATT	2	10	165453	165462	40 %	60 %	0 %	0 %	434408417
137	NC_019765	TTTTA	2	10	167827	167836	20 %	80 %	0 %	0 %	434408418
138	NC_019765	CCAAA	2	10	170129	170138	60 %	0 %	0 %	40 %	434408420
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227	NC_019765	ACTTA	2	10	308732	308741	40 %	40 %	0 %	20 %	434408540
228	NC_019765	AAATT	2	10	309226	309235	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.