MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.01

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019765	CTTT	2	8	95	102	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019765	ATTC	2	8	121	128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019765	GATA	2	8	308	315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019765	TATC	2	8	3461	3468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019765	TTGA	2	8	3650	3657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019765	TTAT	2	8	3995	4002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019765	AATA	2	8	4098	4105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019765	AATT	2	8	10683	10690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019765	AAAT	2	8	16657	16664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019765	TAAA	2	8	16749	16756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019765	CTAA	2	8	17763	17770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019765	CAAC	2	8	19321	19328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019765	ATAA	2	8	24908	24915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019765	TGAA	2	8	24989	24996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019765	CATT	2	8	25043	25050	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019765	TCAT	2	8	30065	30072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019765	TCAA	2	8	32058	32065	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019765	ATAA	2	8	32584	32591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019765	ATAA	2	8	32654	32661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019765	GTAG	2	8	33510	33517	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019765	ATTT	2	8	33957	33964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019765	CAAT	2	8	34338	34345	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019765	TGGC	2	8	34840	34847	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019765	TTCA	2	8	34902	34909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019765	TAAA	2	8	35130	35137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019765	TTGC	2	8	35342	35349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019765	TTTA	2	8	46561	46568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019765	TAAT	2	8	60342	60349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019765	CGAG	2	8	62428	62435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019765	GTTT	2	8	63115	63122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019765	ATTT	2	8	63779	63786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019765	ACAA	2	8	63920	63927	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019765	ACTG	2	8	63933	63940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019765	AAAT	2	8	63944	63951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019765	TAAT	2	8	64298	64305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019765	GCCA	2	8	64457	64464	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019765	ATAA	2	8	65244	65251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019765	GACG	2	8	65839	65846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019765	ATAA	2	8	70421	70428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019765	TTAT	2	8	80059	80066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019765	ATTT	2	8	84371	84378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019765	GCGA	2	8	85330	85337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019765	TAAA	3	12	85984	85995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019765	CCAA	2	8	89718	89725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019765	TTGA	2	8	89914	89921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019765	TGTT	2	8	95006	95013	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019765	GCAA	2	8	97269	97276	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019765	TTTA	2	8	104029	104036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019765	ATTA	2	8	105300	105307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019765	TGTT	2	8	106059	106066	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019765	AAAC	2	8	109351	109358	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019765	AGAT	2	8	109981	109988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019765	AGTT	2	8	113281	113288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019765	ATCT	2	8	113583	113590	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019765	AAAT	2	8	113637	113644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019765	CGAT	2	8	115832	115839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019765	TAAA	2	8	120598	120605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019765	CAAT	2	8	122232	122239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019765	TTTG	2	8	123474	123481	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019765	ATAA	2	8	123520	123527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019765	AATC	2	8	124304	124311	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019765	CGCT	2	8	125264	125271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019765	ATTT	2	8	125750	125757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019765	ATAA	2	8	126781	126788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019765	TTAA	2	8	128686	128693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019765	TAAT	2	8	128742	128749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019765	TAAA	2	8	129441	129448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019765	AATG	2	8	136340	136347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019765	GCGG	2	8	137902	137909	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019765	CCGC	2	8	137928	137935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_019765	TAAT	2	8	139699	139706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019765	AATT	2	8	139716	139723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019765	ATTA	2	8	140917	140924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019765	TTAG	2	8	140936	140943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019765	CAAA	2	8	141138	141145	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019765	TAAT	2	8	141193	141200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019765	TAAT	2	8	142926	142933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019765	AGCA	2	8	143927	143934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019765	TAAA	2	8	149645	149652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019765	AACA	2	8	149723	149730	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019765	CAAC	2	8	149772	149779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019765	TCGA	2	8	153693	153700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019765	ATTA	2	8	161054	161061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019765	AGCA	2	8	161091	161098	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019765	TATT	2	8	161222	161229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019765	AAAT	2	8	161349	161356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019765	GATT	2	8	163484	163491	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019765	AAAT	2	8	165312	165319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019765	AACT	2	8	165349	165356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019765	ACGG	2	8	165781	165788	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019765	GTAA	2	8	168298	168305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019765	CTTT	2	8	171130	171137	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019765	AGTA	2	8	173435	173442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019765	ATCG	2	8	173530	173537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019765	TACA	2	8	177537	177544	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019765	TAAA	2	8	177625	177632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019765	AGCA	2	8	177897	177904	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019765	AAAT	2	8	178856	178863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019765	ATTT	2	8	181931	181938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019765	CTGT	2	8	181942	181949	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019765	AAAT	2	8	183504	183511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019765	TCTT	2	8	185442	185449	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019765	AATT	2	8	185498	185505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019765	AAAT	2	8	186126	186133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019765	GTTA	2	8	189080	189087	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019765	TTTA	2	8	189147	189154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019765	TTAA	2	8	189196	189203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019765	TTCG	2	8	190561	190568	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019765	AGCT	2	8	190680	190687	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019765	CTAG	2	8	192056	192063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019765	ATTG	2	8	192205	192212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019765	GCTG	2	8	192297	192304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019765	ATTA	2	8	192344	192351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019765	AGCT	2	8	193003	193010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019765	ATTT	2	8	193247	193254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019765	AGAT	2	8	193275	193282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019765	AGCT	2	8	193306	193313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019765	AATT	2	8	193319	193326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019765	CCTT	2	8	198373	198380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019765	ATCC	2	8	198448	198455	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019765	TTAC	2	8	198805	198812	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019765	TCCT	2	8	199089	199096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019765	AAGA	3	12	199242	199253	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019765	TTAT	2	8	199290	199297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019765	AAGG	2	8	200341	200348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019765	GAAG	2	8	200468	200475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019765	ATCA	2	8	200630	200637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019765	CTTC	2	8	201223	201230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019765	ATTG	2	8	202328	202335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019765	TTTA	2	8	205718	205725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019765	GACA	2	8	205963	205970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019765	CAGA	2	8	206199	206206	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019765	ACAA	2	8	206351	206358	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019765	CCAT	2	8	206711	206718	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019765	TTAC	2	8	206987	206994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019765	ATAA	2	8	207297	207304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019765	TAAA	2	8	207366	207373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019765	TATT	2	8	211123	211130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019765	CGAT	2	8	211159	211166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019765	CGAT	2	8	211969	211976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019765	TAAA	2	8	211982	211989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019765	ATTT	2	8	215463	215470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019765	TCGG	2	8	215544	215551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019765	TAAG	2	8	215707	215714	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019765	TAAC	2	8	216873	216880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019765	CTTT	2	8	217169	217176	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019765	CTTT	2	8	217187	217194	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_019765	GGTC	2	8	217441	217448	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_019765	AATT	2	8	217980	217987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019765	ACAA	2	8	218519	218526	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019765	TTTA	2	8	219817	219824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019765	ATAA	2	8	219874	219881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.