MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.07

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019762	AGGTA	2	10	1859	1868	40 %	20 %	40 %	0 %	428314810
2	NC_019762	AAGAA	2	10	6516	6525	80 %	0 %	20 %	0 %	428314814
3	NC_019762	GGAGT	2	10	7379	7388	20 %	20 %	60 %	0 %	428314815
4	NC_019762	AGGGC	2	10	8603	8612	20 %	0 %	60 %	20 %	428314815
5	NC_019762	TTTTC	2	10	10914	10923	0 %	80 %	0 %	20 %	428314815
6	NC_019762	TGAGC	2	10	10998	11007	20 %	20 %	40 %	20 %	428314815
7	NC_019762	TGATG	2	10	11346	11355	20 %	40 %	40 %	0 %	428314815
8	NC_019762	ATTGA	2	10	11799	11808	40 %	40 %	20 %	0 %	428314816
9	NC_019762	CTCAA	2	10	12913	12922	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_019762	AAGAC	2	10	13092	13101	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019762	TAAAT	2	10	13410	13419	60 %	40 %	0 %	0 %	428314818
12	NC_019762	AACTC	2	10	13923	13932	40 %	20 %	0 %	40 %	428314818
13	NC_019762	CAATC	2	10	14899	14908	40 %	20 %	0 %	40 %	428314819
14	NC_019762	ATTAT	2	10	17035	17044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019762	GCTGA	2	10	17696	17705	20 %	20 %	40 %	20 %	428314820
16	NC_019762	TTGGT	2	10	17786	17795	0 %	60 %	40 %	0 %	428314820
17	NC_019762	GATGC	2	10	19524	19533	20 %	20 %	40 %	20 %	428314820
18	NC_019762	ATCTA	2	10	21884	21893	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019762	AAGGG	2	10	22942	22951	40 %	0 %	60 %	0 %	428314823
20	NC_019762	GGCAG	2	10	24041	24050	20 %	0 %	60 %	20 %	428314824
21	NC_019762	GGTTT	2	10	24782	24791	0 %	60 %	40 %	0 %	428314825
22	NC_019762	TTGAT	2	10	25179	25188	20 %	60 %	20 %	0 %	428314825

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.