MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.07

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019762	TGAC	2	8	18	25	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019762	TAGG	2	8	135	142	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019762	CTCA	2	8	876	883	25 %	25 %	0 %	50 %	428314810
4	NC_019762	TCTG	2	8	995	1002	0 %	50 %	25 %	25 %	428314810
5	NC_019762	GCTC	2	8	1180	1187	0 %	25 %	25 %	50 %	428314810
6	NC_019762	ACGA	2	8	1548	1555	50 %	0 %	25 %	25 %	428314810
7	NC_019762	TTGA	2	8	2846	2853	25 %	50 %	25 %	0 %	428314810
8	NC_019762	CTGG	2	8	2957	2964	0 %	25 %	50 %	25 %	428314811
9	NC_019762	CTCG	2	8	3039	3046	0 %	25 %	25 %	50 %	428314811
10	NC_019762	CGAT	2	8	3221	3228	25 %	25 %	25 %	25 %	428314811
11	NC_019762	AGCC	2	8	3318	3325	25 %	0 %	25 %	50 %	428314811
12	NC_019762	TAAA	2	8	3923	3930	75 %	25 %	0 %	0 %	428314812
13	NC_019762	TCGT	2	8	4020	4027	0 %	50 %	25 %	25 %	428314812
14	NC_019762	AATC	3	12	4229	4240	50 %	25 %	0 %	25 %	428314812
15	NC_019762	ACTA	2	8	4446	4453	50 %	25 %	0 %	25 %	428314812
16	NC_019762	GATT	2	8	4812	4819	25 %	50 %	25 %	0 %	428314812
17	NC_019762	CTTC	2	8	5012	5019	0 %	50 %	0 %	50 %	428314812
18	NC_019762	ACTG	2	8	5345	5352	25 %	25 %	25 %	25 %	428314813
19	NC_019762	CAAT	2	8	5454	5461	50 %	25 %	0 %	25 %	428314813
20	NC_019762	CCGT	2	8	5847	5854	0 %	25 %	25 %	50 %	428314813
21	NC_019762	GGTG	2	8	6800	6807	0 %	25 %	75 %	0 %	428314815
22	NC_019762	CAGC	2	8	8582	8589	25 %	0 %	25 %	50 %	428314815
23	NC_019762	TTAC	2	8	9405	9412	25 %	50 %	0 %	25 %	428314815
24	NC_019762	GTTC	2	8	9622	9629	0 %	50 %	25 %	25 %	428314815
25	NC_019762	TGCG	2	8	10187	10194	0 %	25 %	50 %	25 %	428314815
26	NC_019762	TTCA	2	8	10556	10563	25 %	50 %	0 %	25 %	428314815
27	NC_019762	ACCC	2	8	11645	11652	25 %	0 %	0 %	75 %	428314816
28	NC_019762	TGGG	2	8	11779	11786	0 %	25 %	75 %	0 %	428314816
29	NC_019762	ATTG	2	8	12146	12153	25 %	50 %	25 %	0 %	428314816
30	NC_019762	TCTG	2	8	13001	13008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019762	CTCA	2	8	13271	13278	25 %	25 %	0 %	50 %	428314818
32	NC_019762	ACTG	2	8	13936	13943	25 %	25 %	25 %	25 %	428314818
33	NC_019762	TGGT	2	8	13958	13965	0 %	50 %	50 %	0 %	428314818
34	NC_019762	CCAA	2	8	14722	14729	50 %	0 %	0 %	50 %	428314819
35	NC_019762	ATCC	2	8	15418	15425	25 %	25 %	0 %	50 %	428314819
36	NC_019762	AGTA	2	8	15487	15494	50 %	25 %	25 %	0 %	428314819
37	NC_019762	TTGA	2	8	15821	15828	25 %	50 %	25 %	0 %	428314819
38	NC_019762	GATT	2	8	16736	16743	25 %	50 %	25 %	0 %	428314819
39	NC_019762	TTGG	2	8	16748	16755	0 %	50 %	50 %	0 %	428314819
40	NC_019762	TTTG	2	8	17808	17815	0 %	75 %	25 %	0 %	428314820
41	NC_019762	GATG	2	8	17971	17978	25 %	25 %	50 %	0 %	428314820
42	NC_019762	GATG	2	8	17993	18000	25 %	25 %	50 %	0 %	428314820
43	NC_019762	CATC	2	8	18083	18090	25 %	25 %	0 %	50 %	428314820
44	NC_019762	CATC	2	8	18092	18099	25 %	25 %	0 %	50 %	428314820
45	NC_019762	CCAA	2	8	18486	18493	50 %	0 %	0 %	50 %	428314820
46	NC_019762	TAGG	2	8	18628	18635	25 %	25 %	50 %	0 %	428314820
47	NC_019762	ATCA	2	8	19270	19277	50 %	25 %	0 %	25 %	428314820
48	NC_019762	AATC	2	8	19282	19289	50 %	25 %	0 %	25 %	428314820
49	NC_019762	AACA	2	8	19991	19998	75 %	0 %	0 %	25 %	428314820
50	NC_019762	AGCG	2	8	20252	20259	25 %	0 %	50 %	25 %	428314820
51	NC_019762	CTTG	2	8	20333	20340	0 %	50 %	25 %	25 %	428314820
52	NC_019762	GCAG	2	8	20802	20809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019762	GTTT	2	8	21749	21756	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019762	CAAG	2	8	22346	22353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019762	CTGG	2	8	23226	23233	0 %	25 %	50 %	25 %	428314823
56	NC_019762	GATT	2	8	23325	23332	25 %	50 %	25 %	0 %	428314823
57	NC_019762	ATCA	2	8	23544	23551	50 %	25 %	0 %	25 %	428314824
58	NC_019762	AGAT	2	8	23764	23771	50 %	25 %	25 %	0 %	428314824
59	NC_019762	GGCT	2	8	23913	23920	0 %	25 %	50 %	25 %	428314824
60	NC_019762	TCAA	2	8	24154	24161	50 %	25 %	0 %	25 %	428314824
61	NC_019762	GCCA	2	8	24213	24220	25 %	0 %	25 %	50 %	428314824
62	NC_019762	GAGG	2	8	24407	24414	25 %	0 %	75 %	0 %	428314825
63	NC_019762	TTGA	2	8	25943	25950	25 %	50 %	25 %	0 %	428314826

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.