MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.04

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019761	CTGTC	2	10	331	340	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019761	TTAAA	2	10	2980	2989	60 %	40 %	0 %	0 %	428314547
3	NC_019761	AAATT	2	10	4094	4103	60 %	40 %	0 %	0 %	428314548
4	NC_019761	CTGAC	2	10	4388	4397	20 %	20 %	20 %	40 %	428314548
5	NC_019761	AGTAA	2	10	6663	6672	60 %	20 %	20 %	0 %	428314552
6	NC_019761	ACTAT	2	10	7520	7529	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019761	CCGTA	2	10	8315	8324	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_019761	GTTGG	2	10	10139	10148	0 %	40 %	60 %	0 %	428314558
9	NC_019761	CCAAG	2	10	11806	11815	40 %	0 %	20 %	40 %	428314558
10	NC_019761	TCAGC	2	10	12959	12968	20 %	20 %	20 %	40 %	428314560
11	NC_019761	TTCTT	2	10	13130	13139	0 %	80 %	0 %	20 %	428314561
12	NC_019761	GTCCT	2	10	15209	15218	0 %	40 %	20 %	40 %	428314563
13	NC_019761	ACCGA	2	10	15539	15548	40 %	0 %	20 %	40 %	428314563
14	NC_019761	AAAGA	2	10	17473	17482	80 %	0 %	20 %	0 %	428314564
15	NC_019761	GGATG	2	10	17833	17842	20 %	20 %	60 %	0 %	428314564
16	NC_019761	AGAAA	2	10	18110	18119	80 %	0 %	20 %	0 %	428314565
17	NC_019761	GATTG	2	10	18262	18271	20 %	40 %	40 %	0 %	428314565
18	NC_019761	TACCT	2	10	26512	26521	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_019761	ACACC	2	10	29230	29239	40 %	0 %	0 %	60 %	428314576
20	NC_019761	CTGGT	2	10	29242	29251	0 %	40 %	40 %	20 %	428314576
21	NC_019761	CCTAA	2	10	32014	32023	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_019761	GGACA	2	10	32461	32470	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019761	GGTCA	2	10	33193	33202	20 %	20 %	40 %	20 %	428314580
24	NC_019761	AGTTC	2	10	33366	33375	20 %	40 %	20 %	20 %	428314580
25	NC_019761	TTCAA	2	10	33396	33405	40 %	40 %	0 %	20 %	428314580
26	NC_019761	TGAAG	2	10	34706	34715	40 %	20 %	40 %	0 %	428314581
27	NC_019761	AACTT	2	10	35403	35412	40 %	40 %	0 %	20 %	428314583
28	NC_019761	ATGAA	2	10	35543	35552	60 %	20 %	20 %	0 %	428314583
29	NC_019761	TTTCT	2	10	35608	35617	0 %	80 %	0 %	20 %	428314583
30	NC_019761	TTCCA	2	10	37378	37387	20 %	40 %	0 %	40 %	428314583
31	NC_019761	TTGAT	2	10	43599	43608	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019761	TCGCC	2	10	44892	44901	0 %	20 %	20 %	60 %	428314587
33	NC_019761	AACCG	2	10	45056	45065	40 %	0 %	20 %	40 %	428314587
34	NC_019761	TCACC	2	10	46216	46225	20 %	20 %	0 %	60 %	428314588
35	NC_019761	AGGGT	2	10	48211	48220	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019761	CTGTC	2	10	48867	48876	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_019761	GCAGA	2	10	49763	49772	40 %	0 %	40 %	20 %	428314592
38	NC_019761	AGTGG	2	10	50110	50119	20 %	20 %	60 %	0 %	428314592

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.