MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.04

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019761	TGTT	2	8	415	422	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019761	TCGC	2	8	551	558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019761	CACT	2	8	616	623	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019761	GCTG	2	8	785	792	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019761	GTTG	2	8	1471	1478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019761	CCCA	2	8	1660	1667	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_019761	GTCA	2	8	1862	1869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019761	CTGG	2	8	2492	2499	0 %	25 %	50 %	25 %	428314545
9	NC_019761	ATCG	2	8	2659	2666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019761	TTTC	2	8	3361	3368	0 %	75 %	0 %	25 %	428314547
11	NC_019761	TCAT	2	8	3685	3692	25 %	50 %	0 %	25 %	428314547
12	NC_019761	ATTG	2	8	4252	4259	25 %	50 %	25 %	0 %	428314548
13	NC_019761	TAAA	2	8	4410	4417	75 %	25 %	0 %	0 %	428314548
14	NC_019761	AGCA	2	8	4956	4963	50 %	0 %	25 %	25 %	428314549
15	NC_019761	CGAG	2	8	5271	5278	25 %	0 %	50 %	25 %	428314549
16	NC_019761	TAGT	2	8	5635	5642	25 %	50 %	25 %	0 %	428314550
17	NC_019761	AATT	2	8	5876	5883	50 %	50 %	0 %	0 %	428314550
18	NC_019761	CTAA	2	8	6487	6494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019761	AATT	2	8	6896	6903	50 %	50 %	0 %	0 %	428314552
20	NC_019761	TTGT	3	12	6959	6970	0 %	75 %	25 %	0 %	428314552
21	NC_019761	TCCT	2	8	7171	7178	0 %	50 %	0 %	50 %	428314553
22	NC_019761	GATA	2	8	8216	8223	50 %	25 %	25 %	0 %	428314555
23	NC_019761	AAAG	2	8	8286	8293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019761	TTAG	2	8	8369	8376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019761	CGAA	2	8	8806	8813	50 %	0 %	25 %	25 %	428314556
26	NC_019761	GCTT	2	8	8928	8935	0 %	50 %	25 %	25 %	428314557
27	NC_019761	ATCG	2	8	9506	9513	25 %	25 %	25 %	25 %	428314557
28	NC_019761	ACTG	2	8	9602	9609	25 %	25 %	25 %	25 %	428314557
29	NC_019761	GACC	2	8	9768	9775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019761	TTGC	2	8	9891	9898	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019761	CGGA	2	8	10101	10108	25 %	0 %	50 %	25 %	428314558
32	NC_019761	GAAA	2	8	10397	10404	75 %	0 %	25 %	0 %	428314558
33	NC_019761	CTTT	2	8	10621	10628	0 %	75 %	0 %	25 %	428314558
34	NC_019761	TGAA	2	8	10746	10753	50 %	25 %	25 %	0 %	428314558
35	NC_019761	TGGA	2	8	11312	11319	25 %	25 %	50 %	0 %	428314558
36	NC_019761	TTGG	2	8	12590	12597	0 %	50 %	50 %	0 %	428314560
37	NC_019761	AAGC	2	8	12823	12830	50 %	0 %	25 %	25 %	428314560
38	NC_019761	TGAT	2	8	13948	13955	25 %	50 %	25 %	0 %	428314562
39	NC_019761	GACT	2	8	14129	14136	25 %	25 %	25 %	25 %	428314562
40	NC_019761	CCAT	2	8	14273	14280	25 %	25 %	0 %	50 %	428314562
41	NC_019761	ATTT	2	8	14976	14983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019761	CCTC	2	8	16111	16118	0 %	25 %	0 %	75 %	428314564
43	NC_019761	CTAT	2	8	16394	16401	25 %	50 %	0 %	25 %	428314564
44	NC_019761	GCCA	2	8	16462	16469	25 %	0 %	25 %	50 %	428314564
45	NC_019761	TGTT	2	8	16550	16557	0 %	75 %	25 %	0 %	428314564
46	NC_019761	TTAT	2	8	16665	16672	25 %	75 %	0 %	0 %	428314564
47	NC_019761	CACT	2	8	16809	16816	25 %	25 %	0 %	50 %	428314564
48	NC_019761	AGAT	2	8	17889	17896	50 %	25 %	25 %	0 %	428314564
49	NC_019761	CTGT	2	8	18146	18153	0 %	50 %	25 %	25 %	428314565
50	NC_019761	TTCC	2	8	18159	18166	0 %	50 %	0 %	50 %	428314565
51	NC_019761	TGAT	2	8	19352	19359	25 %	50 %	25 %	0 %	428314566
52	NC_019761	GAGT	2	8	19689	19696	25 %	25 %	50 %	0 %	428314566
53	NC_019761	TTTC	2	8	20103	20110	0 %	75 %	0 %	25 %	428314566
54	NC_019761	CGAT	2	8	20877	20884	25 %	25 %	25 %	25 %	428314568
55	NC_019761	TGTT	2	8	21198	21205	0 %	75 %	25 %	0 %	428314568
56	NC_019761	TCCT	2	8	21309	21316	0 %	50 %	0 %	50 %	428314568
57	NC_019761	GCTA	2	8	21748	21755	25 %	25 %	25 %	25 %	428314569
58	NC_019761	GGGA	2	8	23020	23027	25 %	0 %	75 %	0 %	428314572
59	NC_019761	GGAC	2	8	23731	23738	25 %	0 %	50 %	25 %	428314573
60	NC_019761	GGTT	2	8	23818	23825	0 %	50 %	50 %	0 %	428314573
61	NC_019761	AGAA	2	8	24391	24398	75 %	0 %	25 %	0 %	428314573
62	NC_019761	AGCA	2	8	24471	24478	50 %	0 %	25 %	25 %	428314573
63	NC_019761	GAAG	2	8	24503	24510	50 %	0 %	50 %	0 %	428314573
64	NC_019761	AGAA	2	8	25005	25012	75 %	0 %	25 %	0 %	428314573
65	NC_019761	ACAA	2	8	25083	25090	75 %	0 %	0 %	25 %	428314573
66	NC_019761	TCAA	2	8	25302	25309	50 %	25 %	0 %	25 %	428314573
67	NC_019761	TTTA	2	8	25720	25727	25 %	75 %	0 %	0 %	428314573
68	NC_019761	ATTG	2	8	26416	26423	25 %	50 %	25 %	0 %	428314575
69	NC_019761	ACAA	2	8	26927	26934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019761	CCAT	2	8	27103	27110	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019761	CAAC	2	8	27437	27444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019761	CTGA	2	8	27801	27808	25 %	25 %	25 %	25 %	428314576
73	NC_019761	GGCT	2	8	28244	28251	0 %	25 %	50 %	25 %	428314576
74	NC_019761	CGTT	2	8	29164	29171	0 %	50 %	25 %	25 %	428314576
75	NC_019761	TGAG	2	8	29755	29762	25 %	25 %	50 %	0 %	428314576
76	NC_019761	CACG	2	8	30703	30710	25 %	0 %	25 %	50 %	428314576
77	NC_019761	CCAG	2	8	31376	31383	25 %	0 %	25 %	50 %	428314577
78	NC_019761	CTGC	2	8	31653	31660	0 %	25 %	25 %	50 %	428314577
79	NC_019761	GATT	2	8	32756	32763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019761	ATCC	2	8	32860	32867	25 %	25 %	0 %	50 %	428314580
81	NC_019761	AAAT	2	8	33298	33305	75 %	25 %	0 %	0 %	428314580
82	NC_019761	AGTT	2	8	33757	33764	25 %	50 %	25 %	0 %	428314580
83	NC_019761	CTAA	2	8	34333	34340	50 %	25 %	0 %	25 %	428314580
84	NC_019761	GGTA	2	8	34343	34350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019761	TGGG	2	8	34892	34899	0 %	25 %	75 %	0 %	428314581
86	NC_019761	CCAA	2	8	35653	35660	50 %	0 %	0 %	50 %	428314583
87	NC_019761	TTGA	2	8	35754	35761	25 %	50 %	25 %	0 %	428314583
88	NC_019761	ATTT	2	8	35914	35921	25 %	75 %	0 %	0 %	428314583
89	NC_019761	TTCA	2	8	36293	36300	25 %	50 %	0 %	25 %	428314583
90	NC_019761	TTGC	2	8	36398	36405	0 %	50 %	25 %	25 %	428314583
91	NC_019761	AATC	2	8	36418	36425	50 %	25 %	0 %	25 %	428314583
92	NC_019761	ATTC	2	8	36505	36512	25 %	50 %	0 %	25 %	428314583
93	NC_019761	CTAA	2	8	37629	37636	50 %	25 %	0 %	25 %	428314583
94	NC_019761	CCTC	2	8	37935	37942	0 %	25 %	0 %	75 %	428314583
95	NC_019761	GTCT	2	8	38474	38481	0 %	50 %	25 %	25 %	428314583
96	NC_019761	GCTT	2	8	38520	38527	0 %	50 %	25 %	25 %	428314583
97	NC_019761	GTGA	2	8	39355	39362	25 %	25 %	50 %	0 %	428314583
98	NC_019761	CAGC	2	8	40321	40328	25 %	0 %	25 %	50 %	428314584
99	NC_019761	TCCG	2	8	40462	40469	0 %	25 %	25 %	50 %	428314584
100	NC_019761	GCTT	2	8	40646	40653	0 %	50 %	25 %	25 %	428314584
101	NC_019761	TTGT	2	8	40846	40853	0 %	75 %	25 %	0 %	428314584
102	NC_019761	CACG	2	8	42135	42142	25 %	0 %	25 %	50 %	428314584
103	NC_019761	CTGT	2	8	43283	43290	0 %	50 %	25 %	25 %	428314585
104	NC_019761	TGTA	2	8	43574	43581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019761	CAAC	2	8	43985	43992	50 %	0 %	0 %	50 %	428314586
106	NC_019761	AGGG	2	8	44275	44282	25 %	0 %	75 %	0 %	428314586
107	NC_019761	GTCA	2	8	44607	44614	25 %	25 %	25 %	25 %	428314586
108	NC_019761	ACCG	2	8	45100	45107	25 %	0 %	25 %	50 %	428314587
109	NC_019761	ACAA	2	8	45281	45288	75 %	0 %	0 %	25 %	428314587
110	NC_019761	CAGC	2	8	45798	45805	25 %	0 %	25 %	50 %	428314587
111	NC_019761	ATAA	2	8	46144	46151	75 %	25 %	0 %	0 %	428314587
112	NC_019761	TCAA	2	8	46157	46164	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019761	TAGA	2	8	46168	46175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019761	TCAC	2	8	46506	46513	25 %	25 %	0 %	50 %	428314588
115	NC_019761	TAAA	2	8	46688	46695	75 %	25 %	0 %	0 %	428314588
116	NC_019761	ATTA	2	8	47673	47680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019761	ATTG	2	8	47703	47710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019761	TCTT	2	8	47796	47803	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019761	TGAG	2	8	47833	47840	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019761	ATTT	2	8	47849	47856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019761	GTTG	2	8	48035	48042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019761	CGAC	2	8	48068	48075	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019761	GACT	2	8	48362	48369	25 %	25 %	25 %	25 %	428314589
124	NC_019761	TCCT	2	8	48521	48528	0 %	50 %	0 %	50 %	428314589
125	NC_019761	GGTG	2	8	48601	48608	0 %	25 %	75 %	0 %	428314590
126	NC_019761	CAAT	2	8	48924	48931	50 %	25 %	0 %	25 %	428314591
127	NC_019761	GGCA	2	8	49119	49126	25 %	0 %	50 %	25 %	428314591
128	NC_019761	CTTT	2	8	49525	49532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019761	GGCT	2	8	49655	49662	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019761	CTCA	2	8	49672	49679	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_019761	CTCA	2	8	50272	50279	25 %	25 %	0 %	50 %	428314592

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.