MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.04

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019761	AAG	2	6	93	98	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019761	CAA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019761	TGA	2	6	158	163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019761	ATT	2	6	183	188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019761	CGT	2	6	207	212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019761	TTC	2	6	233	238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019761	ACT	2	6	273	278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019761	ACC	2	6	300	305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_019761	GCA	2	6	449	454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019761	CTC	2	6	462	467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_019761	CGA	2	6	505	510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019761	TAG	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019761	AGA	2	6	797	802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019761	CAG	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019761	AAG	2	6	835	840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019761	CCG	2	6	962	967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_019761	GGT	2	6	1157	1162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019761	AGT	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019761	AAC	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019761	AAC	2	6	1504	1509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019761	AAT	2	6	1760	1765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019761	AGT	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019761	CAT	2	6	1836	1841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019761	TAC	2	6	2600	2605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019761	AGA	2	6	2627	2632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019761	ACT	2	6	2677	2682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019761	ACA	2	6	2686	2691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019761	CTT	2	6	2699	2704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019761	GCG	2	6	2707	2712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019761	GAA	2	6	2721	2726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019761	AGA	2	6	2736	2741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019761	TGC	2	6	2777	2782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019761	CAA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019761	CTC	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_019761	TAA	2	6	2974	2979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019761	ATT	2	6	5332	5337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019761	CTT	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019761	CTC	2	6	7259	7264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_019761	CAC	2	6	7335	7340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_019761	CTG	2	6	7346	7351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019761	ATC	2	6	7388	7393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019761	TAT	2	6	7420	7425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019761	GAT	2	6	7588	7593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019761	CAT	2	6	8248	8253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019761	CAG	2	6	9643	9648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019761	GAA	2	6	9701	9706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019761	TAC	2	6	9991	9996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019761	TAA	2	6	13015	13020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019761	TAC	2	6	13071	13076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019761	GTT	2	6	13544	13549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019761	ATG	2	6	13645	13650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019761	TAA	2	6	13673	13678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019761	TGC	2	6	13766	13771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019761	TTG	2	6	14869	14874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019761	CCT	2	6	20170	20175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_019761	ACT	3	9	20619	20627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019761	CGT	2	6	22431	22436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019761	TGC	2	6	22456	22461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019761	GAG	2	6	22486	22491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019761	GAA	2	6	22556	22561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019761	AGG	2	6	22587	22592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019761	GCG	2	6	23146	23151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019761	AGC	2	6	23197	23202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019761	ACT	2	6	23226	23231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019761	AGG	2	6	25926	25931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019761	ACC	2	6	26726	26731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_019761	GGA	2	6	26845	26850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019761	ACC	2	6	26970	26975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_019761	TTC	2	6	26984	26989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019761	CAA	2	6	27078	27083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019761	ACC	2	6	27135	27140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_019761	TCT	2	6	27351	27356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019761	CAG	2	6	27526	27531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019761	TGG	2	6	27635	27640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019761	CTT	2	6	32408	32413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019761	AAG	2	6	32454	32459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019761	CAG	2	6	32549	32554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019761	TCT	3	9	32574	32582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019761	AAG	2	6	32781	32786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019761	TGT	2	6	40014	40019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019761	CTA	2	6	40101	40106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019761	CAA	2	6	42331	42336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019761	ATT	2	6	42368	42373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019761	CAA	2	6	42411	42416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019761	TGA	2	6	42583	42588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019761	TCT	2	6	42695	42700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019761	AGA	2	6	42820	42825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019761	GAT	2	6	42854	42859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019761	AGC	2	6	42888	42893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019761	GCA	2	6	42971	42976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019761	CAT	2	6	43630	43635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019761	CTC	2	6	47752	47757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_019761	GCC	2	6	47938	47943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_019761	ACA	2	6	48095	48100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019761	TTC	2	6	48752	48757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019761	TCA	2	6	48794	48799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019761	GGT	2	6	48892	48897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019761	GTT	2	6	49196	49201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019761	TGA	2	6	49262	49267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019761	AGC	2	6	49300	49305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019761	TCT	2	6	49393	49398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019761	ATT	2	6	49485	49490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019761	TTC	2	6	50428	50433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.