MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.03

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019759	GCTTT	2	10	2688	2697	0 %	60 %	20 %	20 %	434408189
2	NC_019759	TCATT	2	10	3802	3811	20 %	60 %	0 %	20 %	434408189
3	NC_019759	GCAAA	2	10	4533	4542	60 %	0 %	20 %	20 %	434408189
4	NC_019759	AAATC	2	10	5388	5397	60 %	20 %	0 %	20 %	434408190
5	NC_019759	CAAGA	2	10	6982	6991	60 %	0 %	20 %	20 %	434408193
6	NC_019759	GTGAT	2	10	7297	7306	20 %	40 %	40 %	0 %	434408193
7	NC_019759	ATTTT	2	10	7432	7441	20 %	80 %	0 %	0 %	434408193
8	NC_019759	GTTGC	2	10	8987	8996	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019759	TGAAG	2	10	10250	10259	40 %	20 %	40 %	0 %	434408195
10	NC_019759	CAACA	2	10	10441	10450	60 %	0 %	0 %	40 %	434408195
11	NC_019759	CGAAC	2	10	11409	11418	40 %	0 %	20 %	40 %	434408195
12	NC_019759	CGCGG	2	10	12021	12030	0 %	0 %	60 %	40 %	434408195
13	NC_019759	AGCTA	2	10	12508	12517	40 %	20 %	20 %	20 %	434408196
14	NC_019759	AAACC	2	10	21295	21304	60 %	0 %	0 %	40 %	434408200
15	NC_019759	GAAAG	2	10	21543	21552	60 %	0 %	40 %	0 %	434408200
16	NC_019759	ACAAG	2	10	21639	21648	60 %	0 %	20 %	20 %	434408200
17	NC_019759	GCAAC	2	10	22838	22847	40 %	0 %	20 %	40 %	434408202
18	NC_019759	ATTGT	2	10	23228	23237	20 %	60 %	20 %	0 %	434408202
19	NC_019759	GCTTT	2	10	23698	23707	0 %	60 %	20 %	20 %	434408203
20	NC_019759	CGGGT	2	10	25175	25184	0 %	20 %	60 %	20 %	434408204
21	NC_019759	TTTTG	2	10	27875	27884	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019759	AATCA	2	10	28079	28088	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019759	TTCGA	2	10	28182	28191	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.