MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.03

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019759	CCAA	2	8	110	117	50 %	0 %	0 %	50 %	434408187
2	NC_019759	CAAC	2	8	249	256	50 %	0 %	0 %	50 %	434408187
3	NC_019759	CTGC	2	8	334	341	0 %	25 %	25 %	50 %	434408187
4	NC_019759	AAAG	2	8	406	413	75 %	0 %	25 %	0 %	434408187
5	NC_019759	TGAT	2	8	449	456	25 %	50 %	25 %	0 %	434408187
6	NC_019759	CAAG	2	8	953	960	50 %	0 %	25 %	25 %	434408188
7	NC_019759	CCAG	2	8	981	988	25 %	0 %	25 %	50 %	434408188
8	NC_019759	CTAG	2	8	1406	1413	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019759	TACA	2	8	1869	1876	50 %	25 %	0 %	25 %	434408189
10	NC_019759	TGTC	2	8	2047	2054	0 %	50 %	25 %	25 %	434408189
11	NC_019759	GGGA	2	8	3336	3343	25 %	0 %	75 %	0 %	434408189
12	NC_019759	TCAC	2	8	3885	3892	25 %	25 %	0 %	50 %	434408189
13	NC_019759	AGCA	2	8	4237	4244	50 %	0 %	25 %	25 %	434408189
14	NC_019759	ATTA	2	8	4481	4488	50 %	50 %	0 %	0 %	434408189
15	NC_019759	AATT	2	8	5816	5823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019759	ACTC	2	8	6185	6192	25 %	25 %	0 %	50 %	434408192
17	NC_019759	TTAG	2	8	6403	6410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019759	AAAG	2	8	7014	7021	75 %	0 %	25 %	0 %	434408193
19	NC_019759	CTTT	2	8	7496	7503	0 %	75 %	0 %	25 %	434408193
20	NC_019759	AATT	2	8	7507	7514	50 %	50 %	0 %	0 %	434408193
21	NC_019759	AGAT	2	8	8099	8106	50 %	25 %	25 %	0 %	434408194
22	NC_019759	TATT	2	8	8374	8381	25 %	75 %	0 %	0 %	434408194
23	NC_019759	TTAA	2	8	8785	8792	50 %	50 %	0 %	0 %	434408194
24	NC_019759	AATC	2	8	8898	8905	50 %	25 %	0 %	25 %	434408194
25	NC_019759	TTTC	2	8	8933	8940	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019759	TCAA	2	8	9868	9875	50 %	25 %	0 %	25 %	434408195
27	NC_019759	TCAA	2	8	10052	10059	50 %	25 %	0 %	25 %	434408195
28	NC_019759	AAGC	2	8	10191	10198	50 %	0 %	25 %	25 %	434408195
29	NC_019759	AATC	2	8	10996	11003	50 %	25 %	0 %	25 %	434408195
30	NC_019759	ACAA	2	8	11176	11183	75 %	0 %	0 %	25 %	434408195
31	NC_019759	TATT	2	8	11267	11274	25 %	75 %	0 %	0 %	434408195
32	NC_019759	CAAA	2	8	11282	11289	75 %	0 %	0 %	25 %	434408195
33	NC_019759	CATC	2	8	11461	11468	25 %	25 %	0 %	50 %	434408195
34	NC_019759	GCGT	2	8	11680	11687	0 %	25 %	50 %	25 %	434408195
35	NC_019759	ATGA	2	8	12242	12249	50 %	25 %	25 %	0 %	434408196
36	NC_019759	TGGA	2	8	12470	12477	25 %	25 %	50 %	0 %	434408196
37	NC_019759	AGAC	2	8	12876	12883	50 %	0 %	25 %	25 %	434408197
38	NC_019759	ACAA	2	8	13042	13049	75 %	0 %	0 %	25 %	434408197
39	NC_019759	ACCT	2	8	13293	13300	25 %	25 %	0 %	50 %	434408197
40	NC_019759	CCTG	2	8	13714	13721	0 %	25 %	25 %	50 %	434408197
41	NC_019759	CGCC	2	8	13748	13755	0 %	0 %	25 %	75 %	434408197
42	NC_019759	CGAA	2	8	13844	13851	50 %	0 %	25 %	25 %	434408197
43	NC_019759	AGTT	2	8	14120	14127	25 %	50 %	25 %	0 %	434408197
44	NC_019759	CATC	2	8	14156	14163	25 %	25 %	0 %	50 %	434408197
45	NC_019759	ACGC	2	8	14216	14223	25 %	0 %	25 %	50 %	434408197
46	NC_019759	TGCC	2	8	14296	14303	0 %	25 %	25 %	50 %	434408197
47	NC_019759	GATG	2	8	14312	14319	25 %	25 %	50 %	0 %	434408197
48	NC_019759	GGTT	2	8	14827	14834	0 %	50 %	50 %	0 %	434408197
49	NC_019759	ACTA	2	8	15267	15274	50 %	25 %	0 %	25 %	434408197
50	NC_019759	GATT	2	8	16030	16037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019759	CTAG	2	8	16208	16215	25 %	25 %	25 %	25 %	434408198
52	NC_019759	TCCT	2	8	16216	16223	0 %	50 %	0 %	50 %	434408198
53	NC_019759	CTAG	2	8	16310	16317	25 %	25 %	25 %	25 %	434408198
54	NC_019759	AAAG	2	8	16377	16384	75 %	0 %	25 %	0 %	434408198
55	NC_019759	CAAA	2	8	16584	16591	75 %	0 %	0 %	25 %	434408198
56	NC_019759	TTCT	2	8	16780	16787	0 %	75 %	0 %	25 %	434408198
57	NC_019759	CCAG	2	8	17234	17241	25 %	0 %	25 %	50 %	434408198
58	NC_019759	TTCC	2	8	18129	18136	0 %	50 %	0 %	50 %	434408198
59	NC_019759	TTGC	2	8	18288	18295	0 %	50 %	25 %	25 %	434408198
60	NC_019759	AAAC	2	8	18651	18658	75 %	0 %	0 %	25 %	434408198
61	NC_019759	GTTT	2	8	18797	18804	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019759	AGCC	2	8	18832	18839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019759	ATAA	2	8	19406	19413	75 %	25 %	0 %	0 %	434408199
64	NC_019759	TTTG	2	8	19658	19665	0 %	75 %	25 %	0 %	434408199
65	NC_019759	AATC	2	8	19677	19684	50 %	25 %	0 %	25 %	434408199
66	NC_019759	TAAC	2	8	19831	19838	50 %	25 %	0 %	25 %	434408199
67	NC_019759	ATTG	2	8	20235	20242	25 %	50 %	25 %	0 %	434408199
68	NC_019759	GAAT	2	8	20305	20312	50 %	25 %	25 %	0 %	434408199
69	NC_019759	GAGT	2	8	21054	21061	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019759	TTAC	2	8	21076	21083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019759	AAGA	2	8	21529	21536	75 %	0 %	25 %	0 %	434408200
72	NC_019759	AAGT	2	8	21807	21814	50 %	25 %	25 %	0 %	434408200
73	NC_019759	GAGT	2	8	21849	21856	25 %	25 %	50 %	0 %	434408200
74	NC_019759	AAAG	2	8	22428	22435	75 %	0 %	25 %	0 %	434408201
75	NC_019759	GTGA	2	8	22667	22674	25 %	25 %	50 %	0 %	434408202
76	NC_019759	GCGG	2	8	23246	23253	0 %	0 %	75 %	25 %	434408202
77	NC_019759	TGAA	2	8	24104	24111	50 %	25 %	25 %	0 %	434408203
78	NC_019759	CAAT	2	8	24170	24177	50 %	25 %	0 %	25 %	434408203
79	NC_019759	GTTT	2	8	24322	24329	0 %	75 %	25 %	0 %	434408203
80	NC_019759	AATC	2	8	25157	25164	50 %	25 %	0 %	25 %	434408204
81	NC_019759	CTTG	2	8	27032	27039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019759	ATAA	2	8	28120	28127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019759	AATG	2	8	28395	28402	50 %	25 %	25 %	0 %	434408207
84	NC_019759	GCAA	2	8	28936	28943	50 %	0 %	25 %	25 %	434408207
85	NC_019759	GCAA	2	8	29058	29065	50 %	0 %	25 %	25 %	434408207
86	NC_019759	CATA	3	12	29767	29778	50 %	25 %	0 %	25 %	434408208
87	NC_019759	CAAG	2	8	30082	30089	50 %	0 %	25 %	25 %	434408209
88	NC_019759	CCTG	2	8	30669	30676	0 %	25 %	25 %	50 %	434408210
89	NC_019759	TTAC	2	8	30724	30731	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.